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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11621 | 2025-10-07 |
An atlas of cells in the human tonsil
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.01.006
PMID:38301653
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研究论文 | 构建了包含超过55.6万个细胞的人类扁桃体细胞图谱,整合了五种数据模态 | 首次整合单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组、免疫组库测序和空间转录组学五种数据模态构建人类扁桃体细胞图谱 | NA | 建立人类扁桃体细胞图谱并解析其免疫功能 | 人类扁桃体细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序, 单细胞蛋白质组测序, 免疫组库测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 超过556,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
11622 | 2025-10-07 |
An exhausted-like microglial population accumulates in aged and APOE4 genotype Alzheimer's brains
2024-01-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.001
PMID:38159571
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现阿尔茨海默病大脑中积累了一种类似耗竭状态的炎症性小胶质细胞群 | 首次鉴定出在衰老和APOE4基因型阿尔茨海默病大脑中积累的终末炎症性小胶质细胞(TIM)群体 | 研究主要基于AD模型小鼠,人类样本验证有限 | 探究年龄和APOE4基因变异如何改变神经免疫功能 | 携带三种常见人类APOE等位基因的AD模型小鼠和人类AD患者脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | AD模型小鼠和人类AD患者脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
11623 | 2025-10-07 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和成像技术揭示了COVID-19后遗症中免疫细胞与上皮祖细胞相互作用的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人类患者中进一步验证 | 阐明呼吸道COVID-19后遗症的病理生理机制 | PASC患者和小鼠模型中的肺组织 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学, 成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据, 图像数据 | 三个独立的PASC患者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11624 | 2025-10-07 |
Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.012
PMID:34508661
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术鉴定人类皮肤中两种稳态和两种激活状态的朗格汉斯细胞亚群 | 首次发现人类朗格汉斯细胞存在功能迥异的LC1和LC2亚群,并揭示其不同的发育调控机制 | NA | 探究人类朗格汉斯细胞的异质性及其发育调控机制 | 人类皮肤表皮中的朗格汉斯细胞和CD34造血干细胞来源的朗格汉斯细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11625 | 2025-10-07 |
HapCNV: A Comprehensive Framework for CNV Detection in Low-input DNA Sequencing Data
2025-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629494
PMID:39763944
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研究论文 | 开发了一个用于单倍体低输入DNA测序数据中CNV检测的综合统计框架HapCNV | 构建了新型基因组位置特异性伪参考,通过初步细胞聚类方法选择无偏参考,有效保留常见CNV | NA | 开发针对单倍体低输入测序数据的CNV检测方法 | 单倍体和二倍体生物的低细胞和单细胞DNA测序数据 | 生物信息学 | 寄生虫病 | 低输入DNA测序,单细胞DNA测序 | 统计框架,聚类方法 | DNA测序数据 | NA | NA | DNA测序 | NA | NA |
11626 | 2025-10-07 |
Eosinophils Enhance Granuloma-Mediated Control of Persistent Salmonella Infection
2025-Jan-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5610725/v1
PMID:39801515
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现嗜酸性粒细胞在控制鼠伤寒沙门氏菌持续性感染中发挥宿主保护作用 | 首次揭示嗜酸性粒细胞通过CCL11依赖性机制被招募到肉芽肿中并增强其活化,从而限制沙门氏菌在关键持续部位的感染 | 研究仅使用小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究嗜酸性粒细胞在持续性沙门氏菌感染控制中的作用机制 | 鼠伤寒沙门氏菌感染的小鼠模型 | 感染免疫学 | 细菌感染 | 空间转录组学,实验操作 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11627 | 2025-10-07 |
TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400023
PMID:38828688
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研究论文 | 本研究揭示TRIM24通过与Ras突变协同作用,通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs驱动胶质瘤进展的分子机制 | 首次发现TRIM24与Ras突变协同驱动胶质瘤进展的新机制,阐明PHAX/U3 snoRNA/DNA-PKcs信号轴在表观遗传重编程中的作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质瘤进展的表观遗传调控机制 | 胶质瘤细胞、人类神经干细胞、临床Ep-GBM标本 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床Ep-GBM标本及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11628 | 2025-10-07 |
ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling
2024-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48285-2
PMID:38816354
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研究论文 | 本研究揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路维持间充质干细胞静息状态的新机制 | 首次发现ARID1B通过直接结合Bcl11b第三内含子抑制其表达,从而调控非经典Activin信号通路维持MSC静息状态 | 研究主要基于小鼠切牙模型,在人类系统中的验证尚需进一步研究 | 探究ARID1B在间充质干细胞静息维持中的调控功能和分子机制 | 小鼠GLI1+间充质干细胞谱系 | 干细胞生物学 | Coffin-Siris综合征 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
11629 | 2025-10-07 |
Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma
2024-05-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad257
PMID:38237157
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在胶质母细胞瘤中对髓系细胞吞噬功能的调控作用 | 首次发现TREM2在胶质瘤中与吞噬功能标志物正相关而非免疫抑制通路,并揭示其通过Syk信号通路介导吞噬作用 | 使用小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病,研究样本量未明确说明 | 探究TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用机制 | 人类胶质瘤样本和两种不同的小鼠胶质瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内吞噬追踪方法,体外实验 | 小鼠胶质瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11630 | 2024-08-13 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar
2025-Feb, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022
PMID:39128494
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11631 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Jan-14, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11632 | 2025-10-07 |
The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis
2024-01-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020895
PMID:37879046
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研究论文 | 本研究通过多种成像技术和单细胞RNA测序分析证实骨髓是血小板生成的主要场所 | 首次系统比较骨髓、脾脏和肺部巨核细胞的相对丰度及血小板生成能力,结合多种先进成像技术和单细胞测序数据分析 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于已发表的单细胞测序数据库,需要进一步实验验证 | 确定在稳态条件下血小板生成的主要器官及其相对贡献 | 成年小鼠的骨髓、脾脏和肺部巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 双光子活体成像, 光片显微镜, 定量组织成像 | NA | 图像, 测序数据, 流式数据 | 成年小鼠骨髓、脾脏和肺部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11633 | 2025-10-07 |
Targeting MXD1 sensitises pancreatic cancer to trametinib
2025-Jan-16, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333408
PMID:39819860
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌对trametinib耐药的分子机制,并发现MXD1可作为克服耐药性的潜在治疗靶点 | 首次发现trametinib治疗通过诱导MXD1表达激活转座元件转录和病毒模拟反应,导致耐药性产生 | NA | 阐明PDAC对trametinib耐药的机制并识别相关可成药靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源异种移植模型和原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
11634 | 2025-10-07 |
Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis
2025-Jan, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00582-1
PMID:39715784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,构建了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱 | 首次结合多研究单细胞RNA测序与12例不同阶段人类标本的空间转录组数据,揭示微血管系统在动脉粥样硬化中的新作用机制 | 样本量相对有限(12例人类标本),需要更大规模研究验证发现 | 揭示人类动脉粥样硬化中细胞类型特异性表达变化和空间受限的细胞间通讯 | 人类动脉粥样硬化斑块标本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 12例不同阶段人类动脉粥样硬化标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11635 | 2025-10-07 |
Identifying cell-type-specific spatially variable genes with ctSVG
2024-Dec-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5655066/v1
PMID:39764138
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研究论文 | 开发了一种名为ctSVG的计算方法,用于在单细胞分辨率下识别细胞类型特异性的空间可变基因 | 首次提出专门针对单细胞分辨率空间转录组数据的细胞类型特异性空间可变基因识别方法,相比传统方法能发现更多不重叠的新基因 | 目前主要针对Visium HD空间转录组技术,在其他平台上的适用性有待验证 | 解决传统空间可变基因识别方法未能充分利用空间位置信息的问题 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | ctSVG计算方法 | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组单细胞分辨率技术 |
11636 | 2025-10-07 |
Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis
2024-Oct, Rheumatology and therapy
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s40744-024-00699-6
PMID:39073510
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研究论文 | 本研究探讨IL-6/JAK/STAT3信号通路在幼年皮肌炎中的异常激活机制及其与肌肉损伤的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示JDM患者骨骼肌细胞、巨噬细胞和血管内皮细胞中JAK/STAT3通路的异常激活,并发现IL-6通过调节钙通道基因SLN和诱导ROS产生参与肌肉损伤 | 样本量有限(72例患者,仅2例进行scRNA-seq分析),亚组分析中TIF1γ阳性患者未显示IL-6显著升高 | 阐明IL-6激活JAK/STAT3通路在幼年皮肌炎发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者(新诊断72例,治疗缓解期同一队列)及健康对照 | 免疫学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RT-PCR, ROS检测 | NA | 血清样本, 肌肉活检组织, 细胞实验数据 | 72例JDM患者(含亚组分析),2例JDM患者肌肉活检scRNA-seq,体外骨骼肌细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11637 | 2025-10-07 |
The architecture of silk-secreting organs during the final larval stage of silkworms revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114460
PMID:38996068
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研究论文 | 通过单核和空间转录组学揭示家蚕末龄幼虫丝腺器官的细胞和空间组织结构 | 首次结合单核和空间转录组学系统绘制家蚕末龄幼虫丝腺的细胞组成和空间结构图谱 | NA | 阐明丝腺器官的细胞空间组织和高效丝蛋白合成机制 | 家蚕末龄幼虫的丝腺器官 | 空间转录组学 | NA | 单核转录组学, 空间转录组学, 转基因技术 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
11638 | 2025-10-07 |
The mechano-chemical circuit in fibroblasts and dendritic cells drives basal cell proliferation in psoriasis
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114513
PMID:39003736
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研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞通过机械-化学信号通路驱动成纤维细胞增强真皮硬度,从而促进银屑病基底细胞过度增殖的新机制 | 首次发现树突状细胞分泌的LGALS9可通过CD44受体作用于真皮成纤维细胞,建立机械-化学信号通路调控银屑病基底细胞增殖 | NA | 阐明银屑病发病机制中真皮成纤维细胞的作用及机械-化学信号通路 | 树突状细胞、真皮成纤维细胞、表皮基底细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、硬度测量 | NA | 基因表达数据、空间定位数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11639 | 2025-10-07 |
Identification and characterization of TM4SF1+ tumor self-seeded cells
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114512
PMID:39003738
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研究论文 | 本研究通过光转换标记技术识别并表征了TM4SF1+肿瘤自播种细胞,揭示了其在肿瘤生长和转移中的关键作用 | 首次建立准确追踪肿瘤自播种细胞的动物模型,发现TM4SF1作为TSCs特异性标志物,并证实其在癌症早期即可检测 | TSCs的追踪和分离技术仍存在挑战,需要进一步验证其临床应用的可行性 | 研究肿瘤自播种细胞的特性及其在癌症进展中的功能 | 循环肿瘤细胞和肿瘤自播种细胞 | 癌症生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,光转换标记技术 | 动物模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11640 | 2025-10-07 |
An atlas of GPCRs in dopamine neurons: Identification of the free fatty acid receptor 4 as a regulator of food and water intake
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114509
PMID:39003735
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研究论文 | 本研究通过构建多巴胺神经元中GPCR的图谱,发现游离脂肪酸受体4(FFAR4)是调节食物和水分摄入的关键因子 | 首次系统绘制了多巴胺神经元中GPCR的表达图谱,并鉴定出FFAR4作为连接高能量摄入与多巴胺奖赏通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要在其他物种中验证;部分受体的功能验证尚未完全完成 | 绘制中脑多巴胺神经元中G蛋白偶联受体的表达图谱,并探索其在代谢调节中的作用 | Dat-eGFP转基因小鼠的中脑多巴胺神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | qPCR阵列分析、单细胞RNA测序数据挖掘、离体钙成像、体内功能实验 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、行为学数据 | Dat-eGFP小鼠的多巴胺神经元,分析了377个GPCR的表达 | NA | 单细胞RNA-seq、qPCR | NA | NA |