单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 11601 - 11620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11601 | 2024-08-05 |
Phospholipids of APOE lipoproteins activate microglia in an isoform-specific manner in preclinical models of Alzheimer's disease
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23762-0
PMID:34099706
|
研究论文 | 本研究探讨了APOE脂蛋白的磷脂如何以同种型特异性影响阿尔茨海默病中微胶质细胞的反应。 | 发现人类APOEε3和APOEε4在阿尔茨海默病大脑中存在特异性的磷脂特征，并揭示了APOE3脂蛋白与APOE4在微胶质细胞响应Aβ方面的显著差异 | 尚需进一步研究以明确APOE和TREM2在真实生物体中的复杂相互作用 | 阐明APOE同种型在阿尔茨海默病微胶质细胞反应中的作用 | 使用预临床阿尔茨海默病鼠模型研究APOE3和APOE4对微胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用APOE3和APOE4小鼠的脂蛋白和微胶质细胞样本 |
| 11602 | 2024-08-05 |
Overexpressed Trophoblast Glycoprotein Contributes to Preeclampsia Development by Inducing Abnormal Trophoblast Migration and Invasion Toward the Uterine Spiral Artery
2024-Jul, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究揭示了TPBG过表达如何通过影响子宫螺旋动脉重塑，促进子痫前症的发展 | 首次表明TPBG过表达与子痫前症发展之间的因果关系 | 研究重点在于TPBG的作用，未深入探讨其他可能的影响因素 | 探讨TPBG在子痫前症发展中的作用及其潜在机制 | 健康个体和子痫前症患者的胎盘组织及妊娠小鼠模型 | 数字病理学 | 子痫前症 | RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 收集了妊娠妇女的胎盘和血浆样本 |
| 11603 | 2024-08-04 |
Protocol to detect immune levels, abnormal metabolism, and signaling pathways in tumor tissue based on scRNA-seq obtained from patient databases
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103065
PMID:38753488
|
研究论文 | 本文介绍了一种评估肿瘤组织中的免疫水平、异常代谢和信号通路的协议 | 创新性地基于患者数据库的单细胞测序来评估肿瘤免疫微环境和代谢途径 | 未提及具体的样本量和可能的实验限制 | 研究肿瘤组织中的免疫微环境及其代谢特征 | 基于单细胞测序的数据来分析肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 11604 | 2024-08-04 |
Protocol for high-quality single-cell RNA-seq from tissue sections with DRaqL
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103050
PMID:38703368
|
研究论文 | 本文介绍了用于从组织切片中提取高质量单细胞RNA测序的详细协议 | 开发了结合DRaqL和Smart-seq2的新协议，以提高从酒精固定小鼠卵巢切片中获得的单细胞RNA测序的质量 | 未提及具体样本数量和适用场景的限制 | 研究旨在提供一种高效的单细胞RNA测序方法 | 研究对象为酒精固定的小鼠卵巢切片中的单细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 11605 | 2024-08-04 |
Protocol for preparing formalin-fixed paraffin-embedded musculoskeletal tissue samples from mice for spatial transcriptomics
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102986
PMID:38555590
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研究论文 | 本研究提供了一种用于小鼠肌肉骨骼组织固定石蜡包埋样本的空间转录组学的制备方案 | 本方案详细描述了组织收集、样本制备、石蜡嵌入等步骤的创新性方法 | 该协议的完整执行时间长达18天，且对矿化组织的脱钙要求超过50%的时间 | 研究目的在于为小鼠骨骼及多组织肌肉骨骼样本提供标准化的空间转录组学处理方法 | 研究对象为固定石蜡包埋的小鼠肌肉骨骼组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 小鼠的股骨及相邻肌肉样本 |
| 11606 | 2024-08-05 |
GoT-Splice protocol for multi-omics profiling of gene expression, cell-surface proteins, mutational status, and RNA splicing in human cells
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102966
PMID:38512867
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研究论文 | 本文介绍了GoT-Splice协议用于对人类细胞中基因表达、细胞表面蛋白、突变状态和RNA剪接进行多组学分析 | 该协议结合了GoT和增强的单细胞转录组及细胞表面蛋白质组分析，克服了区分野生型和突变细胞的挑战 | 仍然需要处理复杂人类组织中的细胞变异和短读片测序数据带来的重构剪接信号的不准确性 | 研究RNA剪接因子突变及其在细胞中的表现 | 人类细胞中的基因表达和细胞表面蛋白 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据和蛋白质组数据 | NA |
| 11607 | 2024-08-05 |
Protocol for quantifying stem-cell-derived cardiomyocyte maturity using transcriptomic entropy score
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103083
PMID:38781077
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研究论文 | 本文提出了一种量化干细胞来源心肌细胞成熟度的协议 | 通过单细胞RNA测序基础上的熵评分指标来量化心肌细胞成熟度 | 未提及具体的实验限制 | 旨在评估从多能干细胞生成的成人样心肌细胞的成熟度 | 干细胞来源的心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11608 | 2024-08-05 |
A deep learning framework for denoising and ordering scRNA-seq data using adversarial autoencoder with dynamic batching
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103067
PMID:38748883
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研究论文 | 本文介绍了一种用于去噪和排序单细胞RNA测序数据的深度学习框架 | 提出了一种动态批处理对抗自编码器(DB-AAE)来去噪scRNA-seq数据 | 未提及具体的局限性 | 研究如何通过深度学习提高单细胞RNA测序数据的质量 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 对抗自编码器 | RNA测序数据 | NA |
| 11609 | 2024-08-04 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Verification Define Different Angiogenesis Subtypes in Endometrial Carcinoma and Identify a Prognostic Signature
2024-Jun-18, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c03034
PMID:38911819
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，定义了子宫内膜癌的不同血管生成亚型，并识别了预后标志。 | 发现了子宫内膜癌患者的五种血管生成亚型，并构建了与血管生成相关的预后风险评分（APRS），提供了个体化的预后评估。 | 本研究的特定分子介导的血管生成对肿瘤免疫微环境的影响尚未清楚说明。 | 探讨血管生成在子宫内膜癌中的作用，并评估其对个体预后的影响。 | 研究了506例子宫内膜癌患者的血管生成模式及其相关的预后因素。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | qRT-PCR、免疫组化和单细胞测序数据分析 | NA | 转录组信息 | 506名子宫内膜癌患者 |
| 11610 | 2024-08-05 |
Anti-PD-1 cancer immunotherapy induces central nervous system immune-related adverse events by microglia activation
2024-Jun-12, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj9672
PMID:38865481
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研究论文 | 本研究探讨了抗PD-1免疫疗法引发的中枢神经系统免疫相关不良事件（CNS-irAEs）中小胶质细胞的作用 | 揭示了小胶质细胞在抗PD-1治疗引发CNS-irAEs中的促进作用，并识别了溶脾酪氨酸激酶作为潜在靶点 | 本研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探讨抗PD-1免疫疗法对小胶质细胞的影响及其在CNS-irAEs中的作用机制 | 研究对象包括接受抗PD-1治疗的鼠类模型及临床患者样本 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序和成像质谱细胞术 | NA | 小鼠模型数据和患者组织样本数据 | 小鼠模型和患者队列的具体样本量未明确说明 |
| 11611 | 2024-08-04 |
Single-cell multi-ome and immune profiles of the Inspiration4 crew reveal conserved, cell-type, and sex-specific responses to spaceflight
2024-Jun-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49211-2
PMID:38862516
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研究论文 | 本研究揭示了宇航员在太空飞行中出现的免疫反应。 | 文章首次系统性绘制了太空飞行对免疫系统影响的单细胞多组学特征，并确认了与多个独立数据集的相符性。 | 研究可能受限于样本大小和只涵盖了特定太空任务的宇航员健康数据。 | 研究太空飞行对宇航员免疫反应的影响。 | SpaceX Inspiration4 (I4) 任务的宇航员。 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学、cfRNA、biochemical 数据及血液学数据 | NA | 基因表达数据 | SpaceX Inspiration4 任务的宇航员数据以及 NASA Twins Study 和其他独立数据集 |
| 11612 | 2024-08-05 |
A body-brain circuit that regulates body inflammatory responses
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07469-y
PMID:38692285
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研究论文 | 该文章展示了一个调节身体炎症反应的身体-大脑回路 | 本研究首次揭示了外周免疫损伤如何激活身体-大脑轴以调节免疫反应 | 尚未探讨该回路在所有免疫疾病中的普遍适用性 | 研究身体-大脑轴在调节免疫反应中的作用 | 主要研究外周免疫刺激下的身体-大脑回路及其对炎症反应的影响 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 功能成像数据 | NA |
| 11613 | 2024-08-07 |
Uncovering intestinal macrophages through the integration of single-cell and spatial transcriptomics
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00242-7
PMID:38142267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11614 | 2024-08-04 |
Comparative single-cell transcriptomic profile of hybrid immunity induced by adenovirus vector-based COVID-19 vaccines
2024-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00270-x
PMID:38570727
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研究论文 | 本研究比较了不同COVID-19疫苗诱导的混合免疫的单细胞转录组特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析探讨了不同COVID-19疫苗对B细胞和T细胞亚群的影响 | 样本量相对较小，仅在五个不同组别中进行比较 | 研究不同COVID-19疫苗诱导的免疫应答特征 | 来自疫苗接种者和COVID-19恢复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 五个不同组别的外周血单核细胞 |
| 11615 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals transcriptional and cell subpopulation differences between human and pig immune cells
2024-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01456-9
PMID:37979077
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人类与猪免疫细胞之间的转录和细胞亚群差异 | 首次研究了人类和猪免疫细胞亚群之间的基因转录谱差异 | 样本量较小，仅包含两只猪和两位健康人类PBMCs | 评估猪和人类之间基因转录的相似性和差异 | 研究对象为猪和人类的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 10×基因组单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2只猪和2位健康人类的PBMC |
| 11616 | 2024-08-04 |
From patient tissue correlates to molecular mechanisms of cancer immune evasion: the emerging role of CD58 and PD-L1 co-regulation via CMTM6
2024-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00224-9
PMID:38082156
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研究论文 | 本文探讨了CD58和PD-L1的共同调节在癌症免疫逃逸中的作用 | 揭示了CD58损失导致免疫逃逸的机制，并发现CMTM6在CD58和PD-L1的双重调节中的关键作用 | 仅在黑色素瘤患者样本中进行研究，可能不适用于所有类型癌症 | 研究癌细胞内在的免疫逃逸机制 | 黑色素瘤患者的组织样本和衍生的共同培养模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 共同培养模型 | 组织样本 | 患者样本与肿瘤浸润性淋巴细胞的联合样本 |
| 11617 | 2024-08-04 |
DDIT3 is associated with breast cancer prognosis and immune microenvironment: an integrative bioinformatic and immunohistochemical analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96491
PMID:38911383
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研究论文 | 本研究探讨了DDIT3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 采用新型多组学整合策略，揭示DDIT3与乳腺癌差预后的关联及其在肿瘤微环境中的空间表达模式 | 尚未明确DDIT3在乳腺癌进展中的具体作用 | 研究DDIT3在乳腺癌中的作用及其在免疫微环境中的角色 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的DDIT3表现 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序、单细胞测序、空间转录组学、免疫组化 | NA | NA | 涉及乳腺癌患者多组学数据 |
| 11618 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Investigations Illuminate Theragnostic value and Immune Landscape of Mitochondrial Dynamin-Like GTPase in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96100
PMID:38911373
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体动态蛋白OPA1/3在乳腺癌中的治疗诊断价值及其免疫微环境 | 揭示了OPA1/3在乳腺癌肿瘤发生和进展中的复杂角色及其作为潜在生物标志物的价值 | 未提及具体的实验设计与样本处理的局限性 | 研究OPA1/3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 乳腺癌中线粒体蛋白OPA1/3的表达和功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、药物基因组学 | NA | 数据集、临床样本 | 涉及来自多个数据库的乳腺癌样本 |
| 11619 | 2024-08-04 |
Experimental Validation and Multi-omics Analysis Identified ARPC1A as a Novel Oncogene and Potential Therapeutic Target in Glioblastoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94552
PMID:38911374
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研究论文 | 这项研究探讨了ARPC1A在胶质母细胞瘤中的生物学作用及其作为新的肿瘤基因和潜在治疗靶点的可能性 | 确立了ARPC1A在多种癌症中的预后价值并揭示其在胶质母细胞瘤耐药性中的调节机制 | 文章未详细探讨ARPC1A在其他癌症中的作用机制 | 研究ARPC1A在胼胶质瘤和其他多种癌症中的作用及机制 | 研究对象为ARPC1A在多种癌症中的表达、突变及其免疫微环境作用 | 数字病理 | NA | 基因组分析，基因集富集分析(GSEA)，单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 在多种癌症组织中分析了ARPC1A的表达与突变 |
| 11620 | 2024-08-04 |
Transcriptional and functional remodeling of lung-resident T cells and macrophages by Simian varicella virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408212
PMID:38887303
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研究论文 | 这篇文章探讨了猿水痘病毒感染如何重塑肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组和功能 | 提出了SVV感染后肺部细胞转录组的变化以及适应性反应的见解 | 未明确阐述SVV与人类VZV感染的所有潜在差异 | 研究SVV感染对肺部免疫反应的影响 | 肺部常驻T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 猕猴实验模型 | 转录组数据 | 未提供样本量信息 |