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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11601 | 2025-10-07 |
Ly6Chi Monocytes Are Metabolically Reprogrammed in the Blood during Inflammatory Stimulation and Require Intact OxPhos for Chemotaxis and Monocyte to Macrophage Differentiation
2024-05-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13110916
PMID:38891050
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Ly6Chi单核细胞在炎症刺激过程中的代谢重编程机制 | 发现单核细胞在血液中经历代谢重编程,且氧化磷酸化对其趋化性和向巨噬细胞分化至关重要 | 研究基于小鼠模型和体外实验,人类体内的直接证据仍需进一步验证 | 探究单核细胞在急性炎症过程中的代谢重编程机制 | 小鼠和人类单核细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞转录组学,细胞趋化实验,细胞分化实验 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11602 | 2025-10-07 |
25-Hydroxycholesterol regulates lysosome AMP kinase activation and metabolic reprogramming to educate immunosuppressive macrophages
2024-05-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.021
PMID:38640930
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研究论文 | 本研究揭示了25-羟基胆固醇通过调控溶酶体AMPK激活和代谢重编程来诱导免疫抑制性巨噬细胞形成的机制 | 首次发现IL-4/IL-13通过STAT6诱导Ch25h表达产生25HC,并阐明25HC通过竞争性结合GPR155抑制mTORC1、激活AMPKα的分子机制 | NA | 探究胆固醇代谢物在肿瘤微环境中调控巨噬细胞免疫抑制功能的机制 | 巨噬细胞、CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 免疫代谢 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11603 | 2025-10-07 |
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07015-2
PMID:38326622
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研究论文 | 研究发现循环髓系细胞来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中起关键作用 | 首次揭示外周免疫细胞来源的MMP8蛋白能够直接渗透到大脑伏隔核区域并调控细胞外空间超微结构 | 机制研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索应激相关精神疾病中外周免疫系统与中枢神经系统功能的关联机制 | 重度抑郁症患者和经历慢性社交挫败应激的小鼠 | 神经免疫学 | 抑郁症 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 血清样本,脑组织样本,行为学数据 | 人类MDD患者和应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11604 | 2025-10-07 |
Metabolic reprogramming and macrophage expansion define ACPA-negative rheumatoid arthritis: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512483
PMID:39830504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示ACPA阴性类风湿关节炎的代谢重编程和巨噬细胞扩增特征 | 首次在单细胞水平系统揭示ACPA阴性类风湿关节炎的独特代谢特征和免疫细胞相互作用 | 样本量有限,需要更大规模验证 | 阐明ACPA阴性类风湿关节炎的细胞和代谢特征以寻找诊断标志物和治疗靶点 | ACPA阴性和阳性类风湿关节炎患者及健康对照的外周血单核细胞和滑膜组织 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞转录组数据 | ACPA阴性RA患者、ACPA阳性RA患者和健康对照的PBMC和滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11605 | 2025-10-07 |
Myeloid dendritic cells and periodontal disease association: integrated study of single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522281
PMID:39830509
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研究论文 | 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析研究髓系树突状细胞与牙周病的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示LIMA1基因在牙周病进展中的因果作用 | 研究依赖于公共数据集,样本来源有限 | 探索牙周病发病机制中的关键细胞类型和基因 | 牙周病患者免疫细胞亚型 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | Seurat, CellChat, ClusterProfilerR | 单细胞转录组数据, GWAS数据 | GSE152042数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11606 | 2025-10-07 |
scRNA-seq reveals elevated interferon responses and TNF-α signaling via NFkB in monocytes in children with uncomplicated malaria
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10233
PMID:39830896
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童非复杂性疟疾患者单核细胞的免疫反应特征 | 首次在儿童非复杂性疟疾中发现单核细胞中干扰素反应和TNF-α/NFκB信号通路上调 | 样本量有限(仅11名参与者进行单细胞测序),仅针对非复杂性疟疾 | 确定与症状性疟疾相关的宿主-寄生虫因素和免疫反应差异 | 224名疟疾感染者(134名患者和90名无症状对照) | 单细胞基因组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 224名参与者,其中11名进行单细胞测序(18,176个外周血单核细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11607 | 2025-10-07 |
Unveiling and validating biomarkers related to the IL-10 family in chronic sinusitis with nasal polyps: insights from transcriptomics and single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1513951
PMID:39830981
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞RNA测序分析识别并验证与IL-10家族相关的慢性鼻窦炎伴鼻息肉生物标志物 | 首次系统探索IL-10家族在CRSwNP中的生物学作用,通过多算法筛选和单细胞测序验证发现四个新型生物标志物 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 识别和验证与IL-10家族相关的慢性鼻窦炎伴鼻息肉生物标志物 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO, SVM-RFE, Boruta算法 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE136825, GSE179265, GSE196169) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11608 | 2025-10-07 |
Identification and validation of five ferroptosis-related molecular signatures in keloids based on multiple transcriptome data analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1490745
PMID:39834787
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研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析鉴定并验证了与瘢痕疙瘩相关的五个铁死亡相关分子标志物 | 首次系统性地识别了瘢痕疙瘩中与铁死亡相关的关键基因,并通过单细胞测序等多重分析验证了这些基因在纤维化过程中的作用 | 样本量相对有限(24个瘢痕疙瘩和17个正常皮肤样本),需要更大规模的研究验证 | 探索铁死亡在瘢痕疙瘩形成机制中的作用,并识别相关关键基因 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | 转录组测序, qRT-PCR, Western blot, 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 24个瘢痕疙瘩样本和17个正常皮肤样本(转录组数据),外加5个瘢痕疙瘩和5个正常皮肤活检(实验验证) | NCBI | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | GEO数据库 | NCBI GEO数据库中的GSE145725、GSE7890、GSE44270和GSE181316数据集 |
11609 | 2025-10-07 |
Epigenetic Induction of Smooth Muscle Cell Phenotypic Alterations in Aortic Aneurysms and Dissections
2023-09-19, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的表观遗传调控机制 | 首次发现IRF3通过STING-TBK1信号通路调控平滑肌细胞表型转变的表观遗传机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 小鼠主动脉平滑肌细胞和人类升主动脉瘤组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 小鼠模型和人类主动脉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
11610 | 2025-10-07 |
Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2452701
PMID:39829399
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研究论文 | 本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因构建儿童急性淋巴细胞白血病的预后模型 | 首次将中性粒细胞胞外诱捕网相关基因与儿童急性淋巴细胞白血病预后关联,并通过多组学分析和体外实验验证 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 转录组测序, 单细胞转录组测序, RT-qPCR, 多组学分析 | LASSO回归, Cox回归, 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自TARGET-ALL-P2、TARGET-ALL-P3队列和GSE26713、GSE130116数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
11611 | 2025-10-07 |
Identification of circadian rhythm-related biomarkers and development of diagnostic models for Crohn's disease using machine learning algorithms
2025-Jan-21, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453922
PMID:39836385
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别克罗恩病的昼夜节律相关生物标志物并开发诊断模型 | 首次将昼夜节律相关基因与克罗恩病诊断相结合,并利用单细胞测序技术验证基因表达特征 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发克罗恩病的诊断模型并预测生物疗法疗效 | 克罗恩病患者和对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析 | 机器学习算法, 回归技术 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11612 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Small-Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025-Jan, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70183
PMID:39831355
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞起源和演化过程 | 首次在单细胞分辨率下提供宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞组成、HPV感染特征和基因表达谱的全面见解 | 仅基于两名患者的样本数据,样本量较小 | 探究宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞异质性、起源和肿瘤发生轨迹 | 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和邻近正常宫颈组织 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,全外显子测序 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 2名患者 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子测序 | NA | NA |
11613 | 2025-10-07 |
The transcription factor TCF21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607910
PMID:39211232
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研究论文 | 本研究探讨转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的调控作用 | 首次揭示TCF21缺失导致肾脏基质细胞亚群特异性耗竭并诱导血管内皮标志物Emcn异常表达的新型细胞群体 | 研究仅聚焦于胚胎期14.5天的时间点,未涵盖肾脏发育全过程 | 解析TCF21在肾脏发育过程中调控Foxd1+基质祖细胞分化的分子机制 | 小鼠胚胎肾脏中的Foxd1+基质祖细胞 | 发育生物学 | 先天性肾脏异常 | 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 32,461个GFP+细胞来自E14.5胚胎肾脏 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11614 | 2025-10-07 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-Nov, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
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研究论文 | 通过综合基因组学分析研究人类多能干细胞在体外培养过程中获得'培养适应性表型'的分子机制 | 首次在等基因hESC模型中系统分析培养诱导异常的表观遗传机制,揭示20q11.21拷贝数增加和表观遗传变化共同驱动培养适应性表型 | 研究基于特定hESC模型,结果可能不适用于所有人类多能干细胞系 | 探索人类多能干细胞在体外培养过程中遗传和表观遗传变化的分子机制 | 人类胚胎干细胞(hESCs)和人类多能干细胞(hPSCs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 单细胞ATAC-seq, 基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
11615 | 2025-10-07 |
Continuous cell type diversification throughout the embryonic and postnatal mouse visual cortex development
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616246
PMID:39829740
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研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育过程中的全面单细胞转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 提供了胚胎期和出生后发育阶段最详细的小鼠视觉皮层细胞类型动态分子图谱,揭示了细胞类型在不同发育阶段的连续多样化过程 | 研究仅限于小鼠视觉皮层,结果可能无法直接推广到其他脑区或其他物种 | 揭示视觉皮层发育过程中细胞类型多样化的分子机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,单核多组学测序 | 发育轨迹重建 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 | 568,674个高质量单细胞转录组和194,545个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | 10x Chromium | 单核Multiome测序技术,提供转录组和染色质可及性联合分析 |
11616 | 2025-01-22 |
An Integrative Approach to Precision Pre-implantation Genetic Diagnosis by Investigating Single-cell Sequencing, Polygenic Risk Assessment, Artificial Intelligence-guided Embryo Selection and Genome Editing in Embryos with COL4A1 c.1537G>A Mutation
2024 Oct-Dec, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/jhrs.jhrs_145_24
PMID:39831092
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11617 | 2025-10-07 |
Adhesion G Protein-Coupled Receptor Gpr126 (Adgrg6) Expression Profiling in Diseased Mouse, Rat, and Human Kidneys
2024-05-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100874
PMID:38786096
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研究论文 | 本研究系统分析了黏附G蛋白偶联受体Gpr126在小鼠、大鼠和人类肾脏疾病中的表达谱 | 首次在多种肾脏疾病模型中详细表征Gpr126的表达变化,并发现其在肾小管和肾小球损伤中的差异表达模式 | 研究主要关注表达谱分析,功能机制研究相对有限 | 探索Gpr126在肾脏疾病中的表达变化及其潜在治疗价值 | 小鼠、大鼠和人类肾脏组织样本 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | RT-PCR, RNAscope定量分析, 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织样本 | 多种肾脏疾病患者样本(狼疮性肾炎、IgA肾病、FSGS、高血压、糖尿病、急性肾损伤、慢性肾脏病) | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列分析 | NA | NA |
11618 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Unveils Dynamic Immune Cell Responses during Haemonchus contortus Infection
2024-05-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100842
PMID:38786064
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示山羊在捻转血矛线虫感染期间外周血单个核细胞的动态免疫细胞反应 | 首次在单细胞水平上系统解析捻转血矛线虫感染期间宿主外周血单个核细胞的转录组特征和细胞通讯网络 | 样本量较小(仅4只山羊),需要更大规模研究验证 | 探究山羊对捻转血矛线虫感染的免疫应答机制 | 波尔山羊的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序,qPCR,粪便虫卵计数 | NA | 单细胞转录组数据 | 4只波尔山羊(2只感染组,2只对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11619 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cardiac Fibroblast-Specific Transcriptomic Changes in Dilated Cardiomyopathy
2024-04-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090752
PMID:38727290
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示扩张型心肌病中心脏成纤维细胞特异性转录组变化 | 采用更新的生物信息学流程结合无监督聚类和参考标签转移,更全面注释单细胞数据集,发现心脏成纤维细胞特异性基因表达改变 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,功能验证部分基因功能评估尚未完成 | 检测扩张型心肌病中细胞特异性转录组改变 | 人类扩张型心肌病心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
11620 | 2025-10-07 |
Differentiation route determines the functional outputs of adult megakaryopoiesis
2024-03-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.02.006
PMID:38447571
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研究论文 | 本研究通过命运示踪系统比较了巨核细胞生成的两种分化途径的功能差异 | 首次开发命运示踪系统区分巨核细胞的直接和逐步分化途径,并揭示它们产生功能不同的巨核细胞亚群 | NA | 探究巨核细胞生成的两种分化途径的功能重要性 | 成年小鼠的巨核细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 命运示踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |