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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2026-06-05 |
Loss of KLF15 expression characterizes proximal tubule injury in cisplatin-induced acute kidney injury: A multi-omics study
2026, Current research in toxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.crtox.2026.100300
PMID:42238184
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析发现KLF15表达缺失是顺铂诱导急性肾损伤中近端肾小管损伤的特征,并筛选出潜在治疗药物 | 首次通过整合转录组学、蛋白质组学和单细胞RNA-seq等多组学数据,系统鉴定KLF15为顺铂诱导AKI中关键转录因子,并利用分子对接筛选出靶向KLF15的FDA approved药物 | 未在临床样本中验证KLF15的调控作用及药物疗效,分子对接仅为虚拟筛选,缺乏体内外实验验证 | 鉴定顺铂诱导急性肾损伤中关键转录因子并探索靶向治疗药物 | 顺铂诱导急性肾损伤的小鼠模型及公开的多组学数据集 | 机器学习, 数字病理学 | 急性肾损伤 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, 分子对接 | 分子对接模型, 转录因子调控网络模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型:20mg/kg顺铂腹腔注射72小时 | NA | bulk RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1142 | 2026-06-05 |
MAIT Cells Maintain Intestinal Homeostasis Through IL-22 in an Experimental Colitis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S570529
PMID:42238773
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研究论文 | 本研究探讨黏膜相关恒定T细胞在实验性结肠炎中通过IL-22维持肠道稳态的作用机制 | 首次发现MAIT细胞通过CCL2-AHR-IL-22调控轴协调IL-22依赖性黏膜修复,揭示了MAIT细胞作为上游协调因子而非仅效应细胞的新角色 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证该调控轴 | 阐明MAIT细胞在肠道稳态维持中的功能及分子机制 | 野生型与MR1基因敲除小鼠的结肠组织和免疫细胞 | 免疫学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, DSS诱导结肠炎模型, FITC-葡聚糖通透性检测 | NA | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 涉及野生型和MR1-/-小鼠的实验性结肠炎模型,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1143 | 2026-06-05 |
Integrated multi-omics characterization of SPTBN2 overexpression reveals its pro-tumorigenic role and immune microenvironment remodeling in colorectal cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1795514
PMID:42238893
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研究论文 | 综合多组学特征分析显示SPTBN2在结直肠癌中过表达,揭示其促肿瘤作用和免疫微环境重塑 | 首次整合转录组学、DNA甲基化、单细胞RNA测序及空间转录组学等多组学数据,系统阐明SPTBN2在结直肠癌中的表达模式、表观遗传调控机制及其与免疫抑制微环境的潜在联系 | 缺乏SPTBN2的直接功能干扰实验和独立临床验证以建立因果机制及转化应用价值 | 探索SPTBN2在结直肠癌中的多组学特征及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 结直肠癌组织样本、TCGA和GEO数据库中的多组学数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 基于汇总数据的孟德尔随机化 | NA | 转录组数据、甲基化数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | 基于TCGA和GEO数据库中的公共数据集,具体样本数量未在摘要中明确提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 1144 | 2026-06-05 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定SLC12A7作为预后和免疫治疗生物标志物 | 首次系统揭示SLC12A7在多种癌症中的预后价值和免疫治疗潜力,尤其在肝细胞癌中通过体外实验验证其促癌功能 | 未明确说明具体局限性 | 评估SLC12A7在泛癌中的表达模式、预后意义及免疫相关性,并验证其在肝细胞癌中的致癌作用 | 多种癌症组织样本及肝细胞癌细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 肝细胞癌,多种癌症 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库中的多种癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1145 | 2026-06-04 |
Mechanisms, precision therapies, and technological frontiers in coronary atherosclerosis: a comprehensive review
2026-May, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01729-x
PMID:41593207
|
综述 | 全面综述冠状动脉粥样硬化的分子机制、精准治疗策略及前沿技术进展 | 系统整合了单细胞转录组学、多基因风险评分和人工智能斑块分析等前沿技术,并探讨了CRISPR-Cas9基因编辑、纳米药物递送和肠道菌群调节等新型治疗手段 | 技术可及性、健康公平性和临床实施方面仍存在挑战 | 综述冠状动脉粥样硬化的疾病机制及新兴治疗策略 | 冠状动脉粥样硬化患者及疾病模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1146 | 2026-06-04 |
Immunosuppressive immune microenvironment landscapes in VISTA-high gastric cancer
2026-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03290-0
PMID:41588173
|
研究论文 | 本研究探讨了VISTA高表达胃癌中的免疫抑制微环境特征 | 首次在胃癌中系统描绘VISTA高表达肿瘤微环境的免疫景观,并揭示VISTA+单核-巨噬细胞通过LGALS9-PTPRC信号轴促进T细胞耗竭的机制 | 缺乏大规模临床验证队列,空间转录组学样本量较小(n=3) | 阐明VISTA在胃癌中的表达模式及其对肿瘤微环境免疫调节功能的影响 | 172例胃癌患者的肿瘤样本(多重免疫组化)、17例样本(单细胞RNA测序)和3例样本(空间转录组学) | 数字病理学 | 胃癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组序列数据 | 172例肿瘤样本(免疫组化)、17例(单细胞测序)、3例(空间转录组) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1147 | 2026-06-04 |
Engineered ETS1-Nanoconjugate Restores Immune Homeostasis through Dual Immune-Vascular Modulation in Relapsing and Progressive Multiple Sclerosis
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504951
PMID:41589763
|
研究论文 | 本文开发了一种基于工程化ETS1纳米缀合物的双免疫-血管调节平台,用于恢复复发性和进行性多发性硬化症中的免疫稳态 | 首次通过单细胞RNA测序发现IL7R是内皮细胞和致病T细胞的共同靶点,并构建了多功能纳米递送平台(IMNP),实现同时调节内皮细胞和T淋巴细胞的双重血管-免疫调节 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够同时调节血管和免疫系统的新型纳米平台,用于治疗多发性硬化症 | 内皮细胞和致病T细胞,以及复发-缓解型多发性硬化症(RRMS)和继发性进行性多发性硬化症(SPMS)模型 | 纳米医学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1148 | 2026-06-04 |
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3658320
PMID:41591852
|
research paper | 提出HFFST算法,从H&E染色的病理图像中预测空间基因表达,利用层次化特征融合方法提高预测性能 | 提出层次化特征融合算法,采用粗到细的回归框架,充分利用全切片图像的多级特征来预测空间转录组谱 | 研究未提及具体局限性 | 从H&E染色病理图像预测空间基因表达,降低空间转录组学的高成本和技术复杂性 | H&E染色的病理图像及对应的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 层次化特征融合算法 | 图像 | 五个公开数据集和10X Genomics的高分辨率Visium数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 高分辨率Visium数据 |
| 1149 | 2026-06-04 |
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04177-6
PMID:41593194
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研究论文 | 本研究探讨了抗PD-1治疗肝细胞癌患者中IgG1浆细胞的体液免疫应答及其对临床结局的影响 | 首次揭示抗PD-1治疗诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,并与T细胞活性协同促进临床获益,建立了体液-细胞免疫轴的新机制 | 样本量较小(38例肝细胞癌患者),且主要基于新辅助治疗队列,可能无法完全代表晚期或不同治疗背景的患者群体 | 阐明抗PD-1免疫检查点抑制治疗中体液免疫应答(特别是IgG1浆细胞)的作用及其与临床结局的关系 | 接受新辅助抗PD-1治疗的肝细胞癌患者的肿瘤组织、血清及外周血样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、空间转录组学、血清学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 | 38例肝细胞癌患者(主要队列),额外7个独立队列共500例单细胞/批量测序数据、7例空间转录组数据及1582例生存分析数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1150 | 2026-06-04 |
A temporal and spatial atlas of adaptive immune responses in the lymph node following viral infection
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504742123
PMID:41587309
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研究论文 | 提出AIR-SPACE方法,结合高分辨率空间转录组学与配对长读长测序,构建病毒感染后淋巴结适应性免疫应答的时空图谱 | 同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库在其天然空间背景下的状态,揭示感染早期干扰素-γ产生的异质性激活生态位,以及抗体产生浆细胞通过生发中心暗区分化和迁出的新证据 | 该研究仅在鼠后膝窝淋巴结中对牛痘病毒感染进行分析,可能需在其他模型或人类样本中验证普遍性 | 理解病毒感染后淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态过程 | 小鼠后膝窝淋巴结(在牛痘病毒足垫感染后的五个时间点) | 数字病理学 | 病毒感染 | 空间转录组学, 长读长测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫受体库测序数据 | 多个小鼠后膝窝淋巴结,在感染后五个时间点采集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1151 | 2026-06-04 |
GCSH promotes colorectal cancer progression by inhibiting Cuproptosis through the PI3K/AKT-FDX1 axis
2026-Jan-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01808-6
PMID:41591502
|
研究论文 | GCSH通过PI3K/AKT-FDX1轴抑制铜凋亡促进结直肠癌进展 | 首次发现GCSH是铜凋亡的新型调节因子,并揭示其通过PI3K/AKT-GCSH/FDX1轴抑制铜凋亡以促进结直肠癌进展的机制 | 文章摘要未明确提及局限性 | 探究GCSH在结直肠癌中的作用及其对铜凋亡的调控机制 | 结直肠癌组织、血液样本及结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA数据集689例,4个独立GEO数据集共709例,以及临床组织、血液样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1152 | 2026-06-04 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
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研究论文 | 介绍SCITO-seq2,一种超高通量单细胞转录组与表位测序技术 | 结合探针基础RNA检测与超高通量蛋白分析,共享池条形码策略确保多液滴分子图谱精准匹配 | 未在摘要中明确提及 | 开发可扩展、高效、经济的下一代单细胞多组学工作流程 | 自身免疫疾病患者样本,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,表位测序 | NA | 单细胞转录组及蛋白数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞多组学 | SCITO-seq2 | SCITO-seq2技术,整合探针RNA检测和超高通量蛋白分析,使用共享池条形码策略 |
| 1153 | 2026-06-04 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 通过单细胞和转录组分析解析骨肉瘤基质细胞相互作用,发现CDKN2A和MMP14作为新型诊断和治疗生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和转录组数据,利用高维WGCNA和CellChat分析解析骨肉瘤基质细胞网络,并筛选出CDKN2A和MMP14作为潜在诊断和治疗靶点,同时预测白藜芦醇能稳定结合MMP14 | 依赖公开数据集,缺乏大规模临床样本验证;体外实验限于细胞系,未进行体内动物模型验证 | 揭示骨肉瘤基质细胞相互作用网络,识别新型诊断标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤基质细胞、巨噬细胞等其他细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | Seurat, CellChat, hdWGCNA, DESeq2 | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 公开数据集的样本量未具体说明,但包含来自GEO的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1154 | 2026-06-04 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
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研究论文 | 研究发现乳腺癌细胞通过外泌体传递RAB10至巨噬细胞,结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路,阻碍M1极化并促进M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸 | 首次揭示外泌体RAB10通过结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路调控巨噬细胞极化的新机制,并发现联合靶向RAB10与PD-L1可协同抑制肿瘤生长 | 未提及 | 探究外泌体RAB10对巨噬细胞极化和肿瘤生长的影响及机制 | 乳腺癌细胞系、巨噬细胞、单细胞RNA测序数据、荷瘤小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 乳腺癌细胞系及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1155 | 2026-06-04 |
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205047
PMID:41582829
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研究论文 | 通过斑马鱼胚胎头部结缔组织的单细胞RNA测序,揭示肌腱细胞和韧带细胞在发育过程中的异质性,并发现Wnt信号在肌腱附着中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出发育中肌腱细胞和韧带细胞的不同亚群,揭示了肌腱细胞在空间和功能上的异质性,并明确了经典Wnt信号通路在肌腱附着模式形成中的新作用 | 主要基于斑马鱼模型,可能无法完全代表人类肌腱发育;仅聚焦于胚胎阶段,未涉及成年或老化过程 | 探究肌腱和韧带发育过程中细胞异质性的遗传机制,以及Wnt信号在肌腱附着中的作用 | 斑马鱼胚胎头部的结缔组织,包括发育中的肌腱细胞和韧带细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤及年龄相关退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1156 | 2026-06-04 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Cervical Cancer Cell Lines Before and After Chemoradiotherapy
2026-Jan-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020115
PMID:41597190
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌细胞系在放化疗前后的转录组景观,揭示化疗耐药机制 | 首次建立来自同一宫颈癌患者在放疗前后的等基因原代细胞系对(AdMer35和AdMer43),并进行单细胞转录组比较分析,揭示了多层面细胞适应性在化疗耐药中的作用 | 仅基于一对患者来源的细胞系,样本量有限,需在更多样本和临床队列中验证 | 阐明宫颈癌化疗耐药的细胞和分子机制 | 一对等基因的原代宫颈癌细胞系(AdMer35和AdMer43),分别来自同一鳞状细胞癌患者放疗前后的组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 一对细胞系(AdMer35和AdMer43),来自一名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1157 | 2026-06-04 |
IPO9 Promotes Ovarian Cancer Progression by Suppressing HMOX1-Dependent Ferroptosis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8545131
PMID:41584724
|
研究论文 | 该研究整合多组学数据,发现MALAT1上皮细胞是卵巢癌核心细胞亚群,并揭示IPO9通过抑制HMOX1依赖性铁死亡促进肿瘤进展 | 首次将单细胞RNA测序、scPagwas、BayesPrism和WGCNA相结合,鉴定出MALAT1上皮细胞作为卵巢癌免疫抑制的关键驱动亚群,并发现IPO9作为治疗靶点调控铁死亡机制 | 未说明具体限制 | 探索卵巢癌的新型治疗靶点及免疫微环境动态 | 卵巢癌细胞、MALAT1上皮细胞亚群、IPO9基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 突变数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1158 | 2026-06-04 |
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013891
PMID:41592119
|
研究论文 | 该研究结合小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了库普弗细胞和树突状细胞在肝脏中驱动I型干扰素免疫应答以抵抗埃可病毒感染的细胞类型特异性机制 | 首次利用单细胞RNA测序在体内模型中准确定位了埃可病毒感染的肝细胞类型,并揭示了库普弗细胞和树突状细胞是早期I型干扰素应答的主要驱动者,而非肝细胞自身 | 该研究主要在转基因小鼠模型中进行,可能不完全反映人类新生儿的免疫反应;另外,I型干扰素对肝细胞的保护作用机制尚需进一步验证 | 阐明在埃可病毒感染肝脏过程中,不同类型固有免疫细胞对I型和III型干扰素抗病毒信号启动的相对贡献 | 表达人类新生儿Fc受体(hFcRn)且缺乏Ifnar1、Ifnlr1或两者的小鼠模型,以及肝细胞特异性Ifnar1基因敲除小鼠 | NA | 埃可病毒感染相关肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因敲除小鼠模型(具体样本量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1159 | 2026-06-04 |
The role of 5-methylcytosine regulator-related genes in diagnostic and immune regulatory functions in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636323
PMID:41583468
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研究论文 | 研究5-甲基胞嘧啶调控相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的作用 | 首次系统分析m5C修饰及其调控基因在AS中的诊断和免疫调控功能,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证NSUN3在巨噬细胞功能中的关键作用 | 研究主要基于公开微阵列数据集,样本量有限且缺乏大规模临床验证;ceRNA网络仅通过数据库预测,未进行实验验证 | 探究m5C修饰和相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的功能 | 动脉粥样硬化患者样本和THP-1巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,实时定量PCR,RNA干扰 | LASSO逻辑回归模型,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 四个GEO数据集(GSE90074、GSE27034、GSE59421、GSE159677) | NA | 转录组测序 | NA | 来自GEO数据库的微阵列平台相关数据 |
| 1160 | 2026-06-03 |
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115789
PMID:42002019
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研究论文 | 实验上调Lancl1促进视神经损伤后轴突再生 | 首次发现Lancl1作为一种新型轴突再生促进因子,在视神经损伤后通过AAV2载体靶向视网膜神经节细胞可促进神经保护和轴突再生 | 未发现Lancl1转基因激活mTOR通路的pS6标记,其下游机制需进一步研究 | 探究Lancl1是否直接修复受损的中枢神经系统轴突,并评估其治疗潜力 | 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)及视神经损伤模型 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、AAV2载体介导的基因过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |