单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1141	2025-05-01	Spatial Organization of Macrophages in CTL-Rich Hepatocellular Carcinoma Influences CTL Antitumor Activity 2025-Mar-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0589 PMID:39745778	research paper	研究探讨了巨噬细胞在CTL丰富的肝细胞癌中的空间组织如何影响CTL的抗肿瘤活性	揭示了巨噬细胞空间聚集作为CTL丰富肝细胞癌中免疫抑制微环境和不良预后的独特空间模式	样本量相对较小（20例CTL丰富的HCC），且需要进一步验证巨噬细胞空间分布的功能机制	探究CTL丰富肝细胞癌中空间免疫变异对临床结果的影响	肝细胞癌（HCC）患者	肿瘤免疫学	肝细胞癌	多重原位染色、单细胞转录组学、空间转录组学	随机森林模型、Cox回归模型	单细胞数据、空间转录组数据、临床数据	20例CTL丰富的HCC（探索队列），386例患者（验证队列）
1142	2025-05-01	A Phase I Clinical Trial Adding OX40 Agonism to In Situ Therapeutic Cancer Vaccination in Patients with Low-Grade B-cell Lymphoma Highlights Challenges in Translation from Mouse to Human Studies 2025-Mar-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2770 PMID:39745391	研究论文	一项I期临床试验，评估在低级别B细胞淋巴瘤患者中，将OX40激动剂加入原位治疗性癌症疫苗的效果	首次在人体试验中测试OX40激动剂与TLR9激动剂SD101联合使用的效果	临床结果不如预期的临床前结果，且样本量较小	评估OX40激动剂与SD101联合治疗低级别B细胞淋巴瘤的安全性和有效性	低级别B细胞淋巴瘤患者	癌症免疫治疗	B细胞淋巴瘤	流式细胞术和单细胞RNA测序	NA	临床数据和生物标志物数据	14名患者
1143	2025-05-01	A3AR antagonism mitigates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease by exploiting monocyte-derived Kupffer cell necroptosis and inflammation resolution 2025-Mar, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2024.156114 PMID:39732364	研究论文	本研究探讨了选择性A3AR拮抗剂FM101通过诱导单核细胞来源的Kupffer细胞坏死性凋亡和炎症消退，改善代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的机制	揭示了A3AR拮抗通过β-arrestin2介导的受体降解途径诱导线粒体功能障碍和坏死性凋亡的新机制，并首次证明FM101在MASLD治疗中的潜在应用价值	研究主要基于小鼠模型，人类临床转化效果需进一步验证	探究A3AR拮抗剂对单核细胞来源Kupffer细胞的调控作用及其在MASLD治疗中的应用	MASLD患者样本、FFD喂养小鼠模型、A3AR基因敲除小鼠	肝脏疾病治疗	代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）	空间转录组学、基因敲除技术	动物模型（小鼠）	基因表达数据、组织病理学数据	MASLD患者样本和FFD喂养小鼠模型（具体数量未明确说明）
1144	2025-05-01	Integrative approaches to m6A and m5C RNA modifications in autism spectrum disorder revealing potential causal variants 2025-Mar, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s00335-024-10095-8 PMID:39738578	研究论文	本研究通过整合基因组分析，探讨了m6A和m5C RNA修饰在自闭症谱系障碍(ASD)中的潜在因果变异	首次整合m6A和m5C变异、cis-eQTL、基因差异表达和基因富集分析来识别ASD的因果变异	需要进一步的实验验证来确认这些变异在细胞系中的功能影响	识别与ASD相关的潜在因果RNA修饰变异	自闭症谱系障碍(ASD)相关的RNA修饰变异	基因组学	自闭症谱系障碍	整合基因组分析、cis-eQTL分析、基因差异表达分析、基因富集分析、单细胞RNA-seq	NA	基因组数据、基因表达数据	NA
1145	2025-05-01	Single-cell RNA-seq offer new insights into the cell fate decision of the primordial germ cells 2025-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139136 PMID:39740725	research paper	单细胞RNA测序揭示了原始生殖细胞（PGCs）命运决定的新机制	发现了细胞周期驱动细胞异质性，并识别了参与PGC自我更新的活跃群体及衰老细胞命运特征	PGCs培养条件在不同实验室或品种间的可重复性仍是一个挑战	研究培养PGCs系网络逐步建立的分子动力学	原始生殖细胞（PGCs）	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA-seq数据	NA
1146	2025-05-01	Follicular cytotoxic T cells is dysfunctional in chronic hepatitis B patients with non-alcoholic fatty liver disease 2025-Mar, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167646 PMID:39743024	研究论文	本研究探讨了慢性乙型肝炎(CHB)合并非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者中滤泡细胞毒性T细胞(Tfc)的异质性及其功能异常	首次揭示了CHB合并NAFLD患者中Tfc细胞的记忆特性和功能受损机制，并发现通过维持氧化还原平衡可部分恢复其效应记忆表型	样本量相对较小(共87例)，且未探讨其他类型免疫细胞的变化	探究CHB合并NAFLD患者中Tfc细胞的功能状态和分子机制	慢性乙型肝炎患者(36例)和CHB合并NAFLD患者(19例)以及健康对照(32例)	免疫学	慢性乙型肝炎,非酒精性脂肪性肝病	多色流式细胞术,单细胞RNA测序,体外共培养实验	NA	流式细胞数据,单细胞转录组数据	87例(32例健康对照+36例CHB患者+19例CHB+NAFLD患者)
1147	2025-05-01	Immune Cell Biology in Peripheral Nervous System Injury 2025-Mar, Neurorehabilitation and neural repair IF:3.7Q1 DOI:10.1177/15459683241304325 PMID:39744962	review	本文总结了免疫细胞在外周神经系统（PNS）损伤和修复过程中的关键作用	通过单细胞测序分析为巨噬细胞在损伤过程中的表型提供新见解，并探讨了不同免疫细胞在PNS损伤中的作用	巨噬细胞在损伤过程中的表型仍存在争议，且淋巴细胞在PNS损伤后的作用研究较少	探讨免疫细胞在外周神经系统损伤和修复过程中的作用机制	外周神经系统（PNS）损伤后的免疫细胞（如巨噬细胞、中性粒细胞、淋巴细胞等）	免疫学	神经系统损伤	单细胞测序分析	NA	NA	NA
1148	2025-05-01	The relationship between a high-fat diet, gut microbiome, and systemic chronic inflammation: insights from integrated multiomics analysis 2025-Mar, The American journal of clinical nutrition DOI:10.1016/j.ajcnut.2024.12.026 PMID:39746397	research paper	该研究通过孟德尔随机化和多组学分析探讨了高脂饮食、肠道微生物组与系统性慢性炎症之间的关系	结合孟德尔随机化、转录组和单细胞测序分析，揭示了高脂饮食通过改变特定肠道菌群导致系统性慢性炎症的机制	研究主要基于欧洲人群数据，可能不适用于其他人群	探究高脂饮食如何通过改变肠道微生物组导致系统性慢性炎症	高脂饮食、肠道微生物组、系统性慢性炎症	生物医学	代谢性疾病	孟德尔随机化(MR)、转录组测序、单细胞测序	NA	基因组数据、转录组数据、单细胞数据	欧洲人群GWAS数据和小鼠实验数据
1149	2025-05-01	Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway 2025-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.) DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829 PMID:39746460	研究论文	研究PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡和生育能力下降的机制	首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路导致卵母细胞凋亡和生育能力下降的具体机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究PFOA和PFOS混合物对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响机制	雌性小鼠及其卵母细胞	生殖毒理学	生育障碍	单细胞转录组分析	小鼠模型	基因表达数据	未明确说明小鼠数量
1150	2025-05-01	Lymphocytes-Associated Extracellular Vesicles Activate Natural Killer Cells in HNSCC 2025-Mar, Cancer science IF:4.5Q1 DOI:10.1111/cas.16440 PMID:39749376	研究论文	研究头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中淋巴细胞相关的小细胞外囊泡（sEVs）如何激活自然杀伤细胞（NK细胞）	揭示了sEVs中RNA货物的异质性，并发现T细胞通过sEVs间接增强NK细胞的细胞毒性能力	研究结果基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和算法限制的影响	探索HNSCC中sEVs的异质性及其在抗肿瘤免疫中的作用	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的小细胞外囊泡（sEVs）和自然杀伤细胞（NK细胞）	肿瘤免疫学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	SEVtras算法	RNA测序数据	NA
1151	2025-05-01	Persistent pre-exhausted CD8+ T cells shape the tumor immune microenvironment in anaplastic thyroid cancer 2025-Mar-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2 DOI:10.1530/ERC-24-0169 PMID:39752183	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析未分化甲状腺癌(ATC)和乳头状甲状腺癌(PTC)的肿瘤免疫微环境，重点关注预耗竭CD8+ T细胞的流行情况及生物标志物	发现预耗竭CD8+ T细胞在ATC中普遍存在，并鉴定出GNLY作为其潜在生物标志物	未来研究需要探索GNLY及其他已鉴定生物标志物在调节甲状腺癌免疫反应中的功能意义	了解甲状腺癌肿瘤免疫微环境的细胞和基因表达动态，为开发靶向免疫疗法提供依据	未分化甲状腺癌(ATC)和乳头状甲状腺癌(PTC)的肿瘤免疫微环境	肿瘤免疫学	甲状腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光染色, 共培养实验	NA	单细胞转录组数据	多个独立的ATC和PTC单细胞转录组数据集
1152	2025-05-01	Longitudinal single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response of plasma cells to colonic inflammation 2025-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139307 PMID:39753172	研究论文	通过纵向单细胞RNA测序揭示了浆细胞在结肠炎症中的异质性反应	首次使用单细胞RNA测序技术分析了浆细胞在炎症不同阶段的动态变化，并鉴定了关键基因和转录因子	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类	探究浆细胞在结肠炎症中的动态变化及其分子机制	DSS诱导的小鼠结肠炎模型中的浆细胞	单细胞测序	结肠炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	6周龄雄性C57BL/6小鼠
1153	2025-05-01	Analysis of multi-condition single-cell data with latent embedding multivariate regression 2025-Mar, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-01996-0 PMID:39753773	研究论文	本文介绍了一种名为潜在嵌入多元回归（LEMUR）的模型，用于分析多条件单细胞RNA测序数据，无需预先进行离散分类	LEMUR模型能够在无需预先进行离散分类的情况下，整合不同条件下的数据，预测细胞基因表达变化，并识别具有一致差异表达的细胞邻域	未明确提及具体局限性	开发一种新的分析方法，用于识别异质组织中不同条件下的基因表达差异	单细胞RNA测序数据	生物信息学	癌症、阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（RNA-seq）	潜在嵌入多元回归（LEMUR）	基因表达数据	NA
1154	2025-05-01	LncRNA-MEG3/miR-93-5p/SMAD7 axis mediates proliferative and inflammatory phenotypes of fibroblast-like synoviocytes in rheumatoid arthritis 2025-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139390 PMID:39755314	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA和批量RNA测序数据集，揭示了类风湿性关节炎（RA）滑膜的细胞景观、分化轨迹、转录组特征和免疫浸润特征，并探讨了MEG3在RA加重和逆转中的作用及机制	首次揭示了MEG3/miR-93-5p/SMAD7轴在RA滑膜成纤维细胞增殖和炎症表型中的调控作用	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证	探讨RA的发病机制及潜在治疗靶点	RA滑膜组织和滑膜成纤维细胞	分子生物学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1155	2025-05-01	Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies 2025-Mar, Glia IF:5.4Q1 DOI:10.1002/glia.24666 PMID:39760224	综述	本文回顾了关于小胶质细胞在阿尔茨海默病(AD)病理中反应的研究，特别是通过多种'组学'技术在小鼠模型中的应用	综合分析了多种'组学'技术在小胶质细胞表型和分子模式研究中的应用，为AD病理机制提供了新的见解	主要基于小鼠模型研究，可能无法完全反映人类AD的复杂性	阐明小胶质细胞在AD发病机制中的作用	小胶质细胞在AD中的反应	神经科学	阿尔茨海默病	转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学和代谢组学	小鼠AD模型	组学数据	NA
1156	2025-05-01	Single-cell RNA sequencing in ovarian cancer: Current progress and future prospects 2025-Mar, Progress in biophysics and molecular biology DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2025.01.002 PMID:39778630	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在卵巢癌研究中的应用、进展及未来前景	填补了现有研究中缺乏对多篇利用scRNA-seq技术研究卵巢癌的文献进行综合比较和总结的空白	讨论了scRNA-seq在卵巢癌研究中的局限性及未来发展方向	总结和比较不同研究中使用scRNA-seq技术探索卵巢癌发展、异质性、肿瘤微环境和治疗抵抗的结果	卵巢癌	数字病理学	卵巢癌	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	NA
1157	2025-05-01	Deciphering key roles of B cells in prognostication and tailored therapeutic strategies for lung adenocarcinoma: a multi-omics and machine learning approach towards predictive, preventive, and personalized treatment strategies 2025-Mar, The EPMA journal DOI:10.1007/s13167-024-00390-4 PMID:39991096	研究论文	本研究利用多组学和机器学习方法揭示了B细胞在肺腺癌中的预后作用，并开发了一个预测模型以支持个性化治疗策略	首次整合多组学数据和机器学习算法，开发了Scissor+相关B细胞评分（SRBS），用于预测肺腺癌患者的预后和个性化治疗反应	研究结果需要在更大规模的患者队列中进行验证，且实验验证部分仅限于LDHA基因	探索B细胞在肺腺癌预后中的作用，并开发个性化治疗策略	肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的B细胞	数字病理学	肺腺癌	多组学分析（包括bulk RNA、ATAC-seq、单细胞RNA和空间转录组测序）和机器学习	多种机器学习算法的集成模型	多组学数据（RNA-seq、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组）	训练集和验证集中的肺腺癌患者样本（具体数量未明确说明）
1158	2025-05-01	Modeling GATA2 deficiency in mice: the R396Q mutation disrupts normal hematopoiesis 2025-Mar, Leukemia IF:12.8Q1 DOI:10.1038/s41375-024-02508-z PMID:39774796	研究论文	本研究描述了一种模拟GATA2缺陷的小鼠模型，探讨了R396Q突变对正常造血功能的破坏作用	首次建立了与GATA2缺陷相关白血病进展的Gata2突变小鼠模型，揭示了该突变在造血干细胞功能和亚群分布上的特异性影响	研究仅针对R396Q这一特定突变，可能无法完全代表所有GATA2缺陷的病理机制	探究GATA2缺陷导致白血病转化的分子机制	Gata2 R396Q突变小鼠模型	血液病学	白血病	单细胞RNA测序	小鼠疾病模型	基因表达数据	未明确说明具体数量，使用突变小鼠模型进行研究
1159	2025-05-01	Droplet microfluidics: unveiling the hidden complexity of the human microbiome 2025-Feb-25, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d4lc00877d PMID:39775305	综述	本文综述了微滴微流控技术在人类微生物组研究中的应用及其潜力	强调了微滴微流控技术在单细胞测序、不可培养微生物的分离与培养以及微生物活动与相互作用研究中的关键作用	未具体提及该技术的局限性	探讨微滴微流控技术在微生物组研究中的应用及其对健康和疾病理解的潜在影响	人类微生物组	微生物组学	NA	微滴微流控技术、单细胞测序技术、基因组和RNA测序	NA	微生物组数据	NA
1160	2025-05-01	Spatial proteomics reveals sirtuin 1 to be a determinant of T-cell infiltration in human melanoma 2025-Feb-18, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljae433 PMID:39739311	research paper	该研究通过空间蛋白质组学技术揭示了SIRT1在人类黑色素瘤中作为T细胞浸润的决定因素	结合多种技术手段（显微镜、质谱成像、液相色谱-质谱联用及计算数据挖掘）首次系统解析了黑色素瘤中T细胞浸润区的蛋白质组特征，并发现SIRT1的关键调控作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床样本验证仍需进一步开展	揭示免疫检查点抑制剂治疗反应的肿瘤微环境调控机制	人类黑色素瘤组织样本及小鼠黑色素瘤模型	digital pathology	melanoma	显微镜技术、MALDI质谱成像、LC-MS、单细胞RNA测序	小鼠同源移植模型	蛋白质组数据、转录组数据、影像数据	未明确说明人类样本量，使用两种小鼠黑色素瘤模型