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当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2026-04-23 |
Latent epigenetic programs in Müller glia contribute to stress and disease response in the retina
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.014
PMID:39753128
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了人类和小鼠视网膜发育过程中细胞类型特异性的染色质结构变化，并发现了Müller胶质细胞中的“可塑性基因”程序 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，识别出Müller胶质细胞中转录沉默但染色质可及的“可塑性基因”，这些基因在视网膜应激和疾病响应中起关键作用 | 研究主要基于发育过程，对成年或疾病状态下的可塑性基因功能验证可能不足，且样本量未明确说明 | 探究视网膜发育过程中细胞类型特异性的染色质结构变化及其在应激和疾病响应中的作用 | 人类和小鼠的视网膜细胞，特别是Müller胶质细胞 | 表观遗传学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq），批量测序 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1142 | 2026-04-23 |
Genome-coverage single-cell histone modifications for embryo lineage tracing
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08656-1
PMID:40011786
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研究论文 | 本研究开发了TACIT方法，用于在小鼠早期胚胎中进行基因组覆盖的单细胞组蛋白修饰分析，并结合单细胞RNA测序数据，揭示了胚胎发育中的表观遗传重编程和细胞命运决定机制 | 开发了TACIT方法，首次实现了小鼠早期胚胎中七种组蛋白修饰的基因组覆盖单细胞分析，并结合机器学习识别了全能性基因调控网络 | 研究仅针对小鼠模型，未涉及人类或其他物种，且方法可能受技术限制影响覆盖深度或准确性 | 探究小鼠早期胚胎发育中的单细胞表观遗传重编程和细胞异质性形成机制 | 小鼠早期胚胎（从受精到囊胚形成阶段） | 发育生物学 | NA | 靶向染色质索引和标签化（TACIT）、单细胞RNA测序、CRISPR激活 | 机器学习模型 | 表观遗传数据（组蛋白修饰）、转录组数据（RNA-seq） | 未明确指定样本数量，但涉及小鼠早期胚胎的多阶段分析 | NA | 单细胞组蛋白修饰分析、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1143 | 2026-04-23 |
Mathematical Modeling Predicts Optimal Immune Checkpoint Inhibitor and Radiotherapy Combinations and Timing of Administration
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0610
PMID:39666379
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，结合数学模型，预测了放疗联合免疫检查点抑制剂的最佳组合与给药时机 | 首次通过单细胞和空间转录组技术动态解析食管癌患者放疗期间淋巴细胞介导的分子相互作用变化，并构建数学模型预测五种ICI在四个不同时间点给药的效果 | 研究基于食管癌患者样本，模型预测结果需在临床试验中进一步验证 | 探索放疗联合免疫检查点抑制剂的最佳治疗方案与给药时机 | 食管癌患者的组织样本 | 计算生物学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 数学建模 | 数学模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 食管癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1144 | 2026-04-23 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学元分析，开发了一种细胞类型无关的转录组特征模型，用于统一比较神经发育过程 | 提出了一种细胞类型无关的模型，能够跨细胞类型、数据集和物种（如人类和小鼠）准确预测发育年龄，并成功应用于神经类器官和疾病模型 | 模型主要基于转录组数据，可能未涵盖其他生物学层面（如表观遗传或蛋白质组）的发育信息，且样本来源和预处理差异可能影响泛化能力 | 开发一个统一框架，以比较不同背景、模型系统和物种中的神经发育过程 | 人类和小鼠的发育中大脑细胞，以及人类神经类器官 | 单细胞转录组学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA-seq | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1145 | 2026-04-23 |
An immune-focused supplemental alignment pipeline captures information missed from dominant single-cell RNA-seq analyses, including allele-specific MHC-I regulation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596760
PMID:40861433
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研究论文 | 本文介绍了一种名为nimble的补充对齐工具，用于增强标准RNA-seq分析流程，特别关注免疫相关基因数据的捕获 | 开发了nimble工具，通过自定义基因空间和可定制的评分标准，补充标准RNA-seq分析，有效恢复因遗传多态性或基因组注释不准确而丢失的免疫基因数据 | 未明确提及具体的技术限制或样本量不足等问题 | 提高RNA-seq数据分析的准确性和完整性，特别是在免疫学研究中捕获标准分析可能遗漏的信息 | RNA-seq数据，包括bulk和单细胞RNA-seq数据，重点关注免疫相关基因如MHC和KIR | 自然语言处理 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1146 | 2026-04-23 |
Revealing tissue architecture through the hypercomplex Fourier analysis of spatial transcriptomics data
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf191
PMID:41195088
|
研究论文 | 本文提出了一种使用四元数域离散傅里叶变换分析空间转录组学数据的方法 | 首次将四元数表示应用于空间转录组学数据，实现多维特征整合和傅里叶分析 | 方法主要针对Visium HD数据，在其他平台或单细胞RNA测序数据中的应用需进一步验证 | 开发新的数学框架以增强空间转录组学数据的分析和可视化能力 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 四元数域离散傅里叶变换 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组学平台 |
| 1147 | 2026-04-23 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies CCR6-Driven Immune Landscape Changes in RM1 Prostate Cancer Bone Metastasis
2025 Jan-Dec, DNA and cell biology reports
DOI:10.1089/dcbr.2025.0001
PMID:42004296
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了CCR6缺失如何影响RM1前列腺癌骨转移模型中骨髓免疫细胞的通讯与动态变化 | 首次在RM1前列腺癌骨转移模型中，通过单细胞RNA测序系统揭示了CCR6驱动的免疫微环境重塑机制，并识别了关键的转录因子网络和细胞通讯通路变化 | 研究基于小鼠模型，虽然与人类去势抵抗性前列腺癌骨转移数据有保守性验证，但直接临床转化仍需进一步人体实验确认 | 探究CCR6在前列腺癌骨转移免疫微环境中的作用机制，以寻找免疫治疗新靶点 | RM1前列腺癌骨转移模型中的骨髓免疫细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型与CCR6敲除C57BL/6小鼠注射RM1-BoM3细胞后的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1148 | 2026-04-23 |
Unraveling the connection between Hashimoto's Thyroiditis and non-alcoholic fatty liver disease: exploring the role of CD4+central memory T cells through integrated genetic approaches
2024-08, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03745-z
PMID:38400881
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研究论文 | 本研究通过整合遗传学方法探讨了桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的潜在联系 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化等方法，揭示了CD4+中央记忆T细胞在两种疾病中的上调，并鉴定出MAGI3等关键基因的因果关联 | 研究依赖于现有单细胞RNA测序数据，样本量可能有限，且功能验证不足 | 探索桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的遗传学联系 | 桥本甲状腺炎患者、非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的CD4+中央记忆T细胞 | 生物信息学 | 桥本甲状腺炎, 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 细胞通讯分析, 代谢分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 桥本甲状腺炎患者、非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1149 | 2026-04-23 |
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320797
PMID:38695172
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研究论文 | 本研究探讨了Trem2激动剂抗体AL002a在动脉粥样硬化小鼠模型中如何通过重编程泡沫巨噬细胞来促进斑块稳定性 | 首次在动脉粥样硬化模型中测试Trem2激动剂抗体的治疗潜力，并揭示其通过调节泡沫巨噬细胞转录组改善斑块稳定性的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验，且长期安全性和疗效未知 | 验证Trem2激动剂能否通过增强巨噬细胞存活和功能来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 | 动脉粥样硬化易感小鼠（Ldlr-/-）及其主动脉斑块中的泡沫巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、体外细胞功能验证 | 动物疾病模型（小鼠） | 基因表达数据、组织病理学图像 | 未明确说明具体数量，但涉及治疗组和对照组小鼠的主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1150 | 2026-04-23 |
A vagal reflex evoked by airway closure
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07144-2
PMID:38448588
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研究论文 | 本研究鉴定了一种由气道闭合触发的迷走神经反射，该反射会导致喘息，并揭示了表达PVALB的迷走神经元和表达PIEZO2的神经上皮小体在这一过程中的关键作用 | 首次描述了由气道闭合特异性触发的迷走神经反射通路，并确定了表达PVALB的迷走神经元和表达PIEZO2的神经上皮小体作为该反射的关键感受器 | 研究主要在小鼠模型中进行，其在人类中的直接适用性尚需验证；神经上皮小体在其他呼吸反射中的作用尚未完全阐明 | 揭示在气道闭合时维持呼吸功能的神经反射机制 | 小鼠的迷走神经感觉神经元、肺神经上皮小体 | 神经科学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序、体内迷走神经节成像、基因敲除 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1151 | 2026-04-23 |
Single-cell transcriptomics reveals long noncoding RNAs associated with tumor biology and the microenvironment in pancreatic cancer
2023-Dec, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad055
PMID:38023733
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了胰腺导管腺癌中与肿瘤生物学和微环境相关的长链非编码RNA | 首次在单细胞分辨率下全面评估了PDAC中的lncRNA景观，揭示了在批量分析中被掩盖的、与肿瘤异质性、突变、治疗反应及肿瘤微环境相关的lncRNA | 研究主要基于转录组数据，lncRNA的功能机制仍需后续实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中长链非编码RNA在单细胞水平上的表达特征及其与肿瘤生物学和微环境的关系 | 21名胰腺导管腺癌患者的73个多区域样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21名患者的73个多区域样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1152 | 2026-04-23 |
High-dimensional deconstruction of pancreatic cancer identifies tumor microenvironmental and developmental stemness features that predict survival
2023-Oct-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00455-z
PMID:37857854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维基因表达分析，揭示了胰腺导管腺癌肿瘤微环境的细胞状态组成、发育干性特征及其与患者生存的关联 | 首次在诊断时内镜超声引导下细针穿刺活检样本中，结合单细胞和批量RNA测序，系统描绘了PDAC的肿瘤微环境细胞群落和发育干性连续体，并发现其与预后的强相关性 | 样本量相对有限，且依赖于公开数据集进行补充；EUS-FNB样本的细胞获取量和质量可能存在变异 | 解析胰腺导管腺癌肿瘤微环境的高维特征，识别与患者生存相关的细胞状态和发育干性标志 | 胰腺导管腺癌患者组织样本，包括诊断时EUS-FNB样本和手术切除样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | Ecotyper工具（定制版） | 基因表达数据 | 单细胞RNA-seq样本80例（含25例新采集EUS-FNB样本和6例手术样本），批量RNA-seq样本268例 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1153 | 2026-04-23 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 本文开发了一种名为dual perturb-seq的方法，结合CRISPR敲除筛选与宿主-微生物单细胞RNA测序，用于识别弓形虫效应蛋白及其在宿主细胞转录调控中的作用 | 首次将CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序结合，创建dual perturb-seq方法，直接从未知效应蛋白推断其功能 | 方法可能受限于特定病原体-宿主系统，未明确讨论技术适用范围或样本多样性限制 | 研究细胞内病原体如何通过效应蛋白调控宿主细胞转录，以揭示感染和免疫逃避机制 | 弓形虫（Toxoplasma gondii）及其与宿主细胞的相互作用 | 自然语言处理 | NA | CRISPR敲除筛选，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1154 | 2026-04-23 |
Autologous humanized PDX modeling for immuno-oncology recapitulates features of the human tumor microenvironment
2023-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006921
PMID:37487666
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研究论文 | 本研究开发了一种利用患者自体骨髓造血干细胞和祖细胞在MISTRG6小鼠中重建患者造血系统，并移植患者来源的异种移植组织，以建立完全基因匹配的模型来模拟个体肿瘤微环境的方法 | 开发了一种自体人源化PDX模型，利用患者自身的造血干细胞和肿瘤组织在MISTRG6小鼠中重建个体化的肿瘤微环境，克服了传统异种移植模型中的物种差异和个体间变异问题 | 模型依赖于小鼠宿主环境，可能无法完全模拟人体内所有的免疫-肿瘤相互作用；研究样本量未明确说明 | 建立一种能够更准确模拟人类肿瘤微环境并用于临床前药物测试的平台 | 实体瘤患者的骨髓造血干细胞和祖细胞以及患者来源的异种移植组织 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学 | PDX模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1155 | 2026-04-23 |
Molecular Characterization of Membranous Nephropathy
2022-06, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021060784
PMID:35477557
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研究论文 | 本研究通过机器学习框架分析膜性肾病（MN）患者肾组织基因表达，识别其分子特征并揭示与足细胞相关的病理机制 | 首次结合机器学习、跨队列基因差异分析和单细胞测序数据，系统鉴定MN的独特分子特征，并发现其与转录因子NF-κB靶点及足细胞基因表达上调的关联 | 研究依赖于现有队列数据，未涉及MN亚型或治疗反应的分子分层，且样本来源可能受限于特定人群 | 揭示膜性肾病的分子通路和病理机制，为疾病分类和靶向治疗提供依据 | 膜性肾病患者的肾组织样本 | 机器学习 | 膜性肾病 | 基因表达分析、单细胞测序 | 机器学习框架 | 基因表达数据 | 来自NEPTUNE和ERCB队列的参与者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1156 | 2026-04-23 |
Multiplexed droplet single-cell sequencing (Mux-Seq) of normal and transplant kidney
2022-03, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1111/ajt.16871
PMID:34687145
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研究论文 | 本文介绍了多重液滴单细胞测序（Mux-Seq）在正常和移植肾脏中的应用，验证了其可行性 | 提出Mux-Seq方法，通过样本池化减少实验批次偏差和变异，适用于小样本输入 | 研究为初步概念验证，样本量较小（仅6个正常和2个移植肾脏），且仅针对肾脏移植排斥场景 | 开发并验证Mux-Seq技术，以优化珍贵和低输入人类肾脏活检组织的处理，用于大规模研究 | 正常和移植肾脏组织样本，包括免疫细胞和实质细胞 | 单细胞测序 | 肾脏移植排斥 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），多重液滴单细胞测序（Mux-Seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 6个正常肾脏和2个移植肾脏的切除组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1157 | 2026-04-23 |
TRUST4: immune repertoire reconstruction from bulk and single-cell RNA-seq data
2021-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01142-2
PMID:33986545
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研究论文 | 本文介绍了TRUST4开源算法，用于从RNA测序数据重建αβ/γδ T细胞和B细胞的免疫受体库 | TRUST4支持FASTQ和BAM格式，速度更快、灵敏度更高，能组装更长甚至全长的受体库，并能从单细胞RNA测序数据中调用库序列而无需V(D)J富集 | NA | 开发一种算法以重建免疫受体库 | αβ/γδ T细胞和B细胞的免疫受体 | 自然语言处理 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台 | 5' 10x Genomics平台 |
| 1158 | 2026-04-22 |
Organelle symphony: Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 and nuclear factor-kappa B in stroke pathobiology
2026-Apr-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01404
PMID:40146002
|
综述 | 本文综述了核因子红细胞2相关因子2和核因子κB在缺血性和出血性中风病理生物学中的作用机制，重点关注它们在氧化应激、炎症和神经保护中的功能 | 强调了Nrf2和NF-κB在细胞器间相互作用中的潜在串扰，并指出单细胞测序和空间转录组学技术为理解中风发病机制和开发靶向治疗提供了新视角 | NA | 探讨Nrf2和NF-κB在中风病理生理学中的核心作用及其在氧化应激、炎症和神经保护中的机制 | 中风（包括缺血性中风和出血性中风）的病理生物学过程 | NA | 中风 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1159 | 2026-04-22 |
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644194
PMID:40166168
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研究论文 | 本文提出了一种基于最优传输的轨迹推断方法SOCS，用于时间序列空间转录组学数据，以保持生物结构单元的完整性 | SOCS方法在时间序列空间转录组学中引入结构约束，确保生物结构单元在时间上的空间连贯性，这是现有方法所缺乏的 | NA | 开发一种能够准确推断时间序列空间转录组学数据中发育轨迹的方法 | 时间序列空间转录组学数据，特别是卵巢滤泡和肾小管等空间连续区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1160 | 2026-04-22 |
The forkhead transcription factor FKH-7/FOXP acts in chemosensory neurons to regulate developmental decision-making
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638733
PMID:40027766
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研究论文 | 本研究揭示了叉头转录因子FKH-7/FOXP在化学感应神经元中调控发育决策的功能，并建立了连接自闭症相关基因的分子病理研究框架 | 首次发现FKH-7/FOXP在化学感应神经元中调控幼虫进入发育停滞期（dauer阶段）的决策功能，并证明人类FOXP1可在该功能上替代FKH-7 | 研究基于线虫模型，在哺乳动物系统中的直接适用性需要进一步验证 | 探究自闭症相关转录因子FOXP1及其同源物在发育决策中的分子机制 | 线虫（C. elegans）的化学感应神经元及发育决策过程 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |