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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2026-05-02 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes to reveal prognostic and immunological features of ecDNA-related genes in osteosarcoma
2026-Apr-28, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04383-2
PMID:42047819
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研究论文 | 整合单细胞和 bulk 转录组揭示骨肉瘤中 ecDNA 相关基因的预后和免疫特征 | 首次系统探索 ecDNA 相关基因在骨肉瘤中的预后和免疫微环境作用,并利用 101 种机器学习算法构建新型预后评分模型(EGPSM) | 未提及,推测可能包括单细胞数据样本量有限或缺乏多中心验证 | 研究 ecDNA 相关基因与骨肉瘤预后及肿瘤微环境(TME)的关联 | 骨肉瘤患者 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 集成机器学习框架(含101种算法) | 基因表达数据 | 多组GEO数据集及单细胞RNA-seq数据,具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1142 | 2026-05-02 |
Endothelial-perivascular mural partitioning and multicellular signaling in injury-associated corneal neovascularization
2026-Apr-28, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111039
PMID:42055274
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研究论文 | 研究揭示损伤相关角膜新生血管中内皮-血管周壁细胞分区与多细胞信号传导机制 | 通过单细胞RNA测序分析首次表征创伤后角膜新生血管中内皮细胞与血管周壁细胞两种主要血管状态及其基因表达差异,并构建配体-受体信号网络解析多细胞间通讯 | 仅使用2周时间点的兔角膜样本,未涵盖新生血管形成的完整时间动态;动物模型向人类转化的适用性需进一步验证 | 阐明角膜损伤后新生血管形成的细胞异质性与多细胞信号相互作用机制 | 兔角膜组织(正常与碱烧伤后2周创伤模型) | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 基因表达数据 | 正常与创伤兔角膜各1组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1143 | 2026-05-02 |
Unveiling Novel Macrophage-Specific Biomarkers in MASH through Single-Cell Sequencing for Diagnostic Modeling
2026-Apr-28, Journal of lipid research
IF:5.0Q1
DOI:10.1016/j.jlr.2026.101048
PMID:42061510
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示巨噬细胞特异性生物标志物,构建代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的诊断模型 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,鉴定出五个核心巨噬细胞特异性差异表达基因,并构建高精度诊断模型,同时通过孟德尔随机化分析发现CPM的因果保护作用 | 未提及明显局限性 | 识别代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中巨噬细胞特异性生物标志物,并构建诊断模型 | 人类巨噬细胞和MASH肝脏样本 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、孟德尔随机化分析 | 诊断模型(具体类型未明确) | 基因表达数据 | 独立队列验证(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1144 | 2026-05-02 |
SIRT7-mediated H3K79 desuccinylation modulates functional activities of goat ovarian granulosa cells
2026-Apr-27, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与分子功能实验结合,探索SIRT7介导的H3K79去琥珀酰化对山羊卵巢颗粒细胞功能活性的调控作用 | 首次发现SIRT7通过调控组蛋白H3K79琥珀酰化水平影响颗粒细胞自噬与凋亡,并鉴定TMEM74为潜在关键下游因子 | 具体分子机制仍需进一步深入研究 | 揭示SIRT7相关组蛋白琥珀酰化在山羊卵巢颗粒细胞功能稳态维持中的表观遗传机制 | 山羊卵巢颗粒细胞 | 机器学学习 | 生殖衰老 | 单细胞RNA测序、转录组分析、位点特异性组蛋白突变体 | NA | 单细胞基因表达数据、转录组数据 | 山羊卵巢颗粒细胞(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1145 | 2026-05-02 |
Multi-omics integration identifies PFOS-associated immune signatures in Kawasaki disease
2026-Apr-26, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2026.110279
PMID:42061194
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研究论文 | 采用多组学整合方法分析全氟辛烷磺酸暴露与川崎病免疫转录组特征的关联 | 首次通过多组学整合分析系统性地揭示PFOS暴露与川崎病免疫炎症通路的潜在关联,并利用机器学习、SHAP分析和单细胞RNA测序鉴定出关键枢纽基因及其细胞特异性表达 | 主要基于计算预测,缺乏体内外实验验证和流行病学数据支持 | 探索全氟辛烷磺酸暴露与川崎病免疫转录组特征之间的潜在关联 | 川崎病患者的转录组数据、PFOS毒理学靶点基因、独立队列的验证数据 | 数字病理学, 机器学习 | 川崎病 | 多组学整合分析, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习模型, SHAP分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 分子对接数据 | 多个独立队列(具体数量未在摘要中明确给出) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1146 | 2026-05-02 |
A macrophage co-expression signature enables robust prognostic prediction in glioblastoma
2026-Apr-25, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102784
PMID:42035563
|
研究论文 | 通过整合单细胞巨噬细胞异质性与共表达网络模型,构建了针对胶质母细胞瘤的巨噬细胞共表达衍生风险评分,并揭示SPP1作为关键巨噬细胞效应分子的作用 | 首次结合单细胞转录组数据与共表达网络分析,构建了巨噬细胞共表达衍生风险评分,并系统验证了该评分在多个独立队列中的预后分层能力及免疫治疗相关意义 | 未提及具体局限性,但基于方法学可推测可能包括单细胞数据整合的批次效应、虚拟敲除分析的预测性而非验证性、及功能验证仅限于细胞系层面 | 阐明巨噬细胞状态特异性转录程序与共表达网络如何整合影响胶质母细胞瘤患者预后及免疫治疗相关表型 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的巨噬细胞亚群及其相关调控程序和共表达网络 | 机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 多算法机器学习框架(具体模型未明确) | 基因表达数据 | 多个独立队列,包括TCGA、CGGA和GEO数据库(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1147 | 2026-05-02 |
Translating brain anatomy and disease from mouse to human in latent gene expression space
2026-Apr-24, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106259
PMID:42034047
|
研究论文 | 利用小鼠和人类基因表达数据构建潜在空间,实现脑解剖和疾病翻译 | 提出一个定量框架,通过变分自编码器将小鼠空间转录组学嵌入潜在空间,实现跨物种的脑区域翻译,并预测阿尔茨海默病和帕金森病中的人类脑变化模式 | 未明确提及,但可能包括潜在空间简化可能丢失部分生物学细节,以及仅依赖基因表达数据可能忽略其他因素 | 建立小鼠和人类大脑之间的定量共同空间,并应用于神经退行性疾病模型 | 小鼠和人类大脑基因表达数据及神经退行性疾病模型 | 机器学习 | 老年疾病 | 空间转录组学 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1148 | 2026-05-02 |
Comprehensive single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and immune interactions in colorectal cancer
2026-Apr-22, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102761
PMID:42024995
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序对结直肠癌组织进行综合分析,揭示了细胞异质性和免疫相互作用 | 通过单细胞RNA测序识别了六个主要细胞群,并在T_NK细胞中定义了四个不同亚群,使用CytoTRACE和Monocle伪时间分析揭示了分化潜力差异,结合年龄相关基因构建预后模型,并通过免疫算法和肿瘤突变负荷分析揭示了免疫复杂性 | 未说明 | 研究结直肠癌的细胞异质性和免疫相互作用,以支持靶向和个性化治疗 | 结直肠癌组织中的18,741个单个细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,741个单个细胞来自结直肠癌组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1149 | 2026-05-02 |
Endothelial MerTK impairment promotes cardiac dysfunction in the condition of high fat diet
2026-Apr-21, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104184
PMID:42030645
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研究论文 | 该研究探讨了在高脂饮食条件下,内皮细胞MerTK功能受损对心脏功能障碍的促进作用 | 发现内皮细胞MerTK在调节高脂饮食诱导的心脏功能障碍中的新角色,并利用多组学方法结合人类标本揭示其机制 | 未提及具体局限性 | 研究内皮细胞MerTK在高脂饮食条件下调节心脏功能障碍的新作用 | 内皮细胞MerTK缺陷小鼠及人类扩张型心肌病和肥厚型心肌病患者标本 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | 多组学分析(蛋白质组学、单细胞RNA测序、单核RNA测序)、免疫染色 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、免疫染色图像 | 小鼠模型及人类心脏标本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | NA |
| 1150 | 2026-05-02 |
Characterization of a pancreatic cancer GWAS signal suggests PDX1 buffers stress in the exocrine pancreas
2026-Apr-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.13.26350790
PMID:42064940
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研究论文 | 该研究表征了胰腺癌GWAS信号,发现PDX1在胰腺外分泌部分中缓冲压力的作用 | 首次将chr13q12.2 GWAS风险位点中的rs9581943变异与PDX1表达调控联系起来,阐明PDX1在减轻外分泌胰腺细胞压力及维持上皮细胞稳态中的作用 | 基于细胞系和单细胞转录组分析,缺乏体内或动物模型的功能验证 | 功能表征胰腺导管腺癌GWAS风险位点chr13q12.2的因果变异及其生物学机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)相关的遗传风险位点 | 机器学习 | 胰腺癌 | GWAS, CRISPR/Cas9编辑, 荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率变动分析, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 新生儿、成年及慢性胰腺炎供体的胰腺外分泌细胞;胰腺肿瘤样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序及单细胞RNA测序 |
| 1151 | 2026-05-02 |
TopClust: Topological-based analysis of scRNA-seq data for data-driven identification of clusters and core cluster cells
2026-Apr-14, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.04.010
PMID:41981916
|
研究论文 | 提出基于拓扑数据分析的scRNA-seq聚类方法TopClust,实现无偏且可重复的细胞聚类 | 利用拓扑数据分析自动识别峰细胞和峰顶细胞,无需主观参数选择,通过方向向量投影鉴定簇特异性基因 | 未明确提及局限性,可能需在高维大数据集上验证计算效率 | 开发数据驱动的scRNA-seq聚类方法,减少人工偏差并提高细胞类型注释准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类与细胞类型鉴定 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 拓扑数据分析,共享最近邻模型 | 单细胞基因表达数据 | 基准数据集(肺癌细胞系和流式分选免疫细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1152 | 2026-05-02 |
Aged automobile cabin air filters as secondary pollution sources: mechanistic insights into NLRP3 inflammasome activation and discovery of a natural inhibitor
2026-Apr-13, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-026-00674-9
PMID:41975463
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研究论文 | 本研究系统调查了汽车空调滤清器沉积颗粒物的差异毒性,揭示内侧颗粒因富集超细颗粒而毒性更强,并发现天然环二肽Cyclo-(Tyr-Phe)可作为NLRP3炎症小体抑制剂 | 首次揭示汽车空调滤清器内外侧颗粒物的差异化毒性机制,发现超细颗粒物通过非活性氧途径激活NLRP3炎症小体并诱发细胞焦亡,并通过虚拟筛选发现天然环二肽Cyclo-(Tyr-Phe)作为新型NLRP3抑制剂 | 未提及具体局限性 | 探究汽车空调滤清器沉积颗粒物内外侧的差异毒性及其分子机制,并寻找天然抑制剂 | 汽车空调滤清器内外膜沉积颗粒物 | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1153 | 2026-05-02 |
Disrupted glial-mediated synaptic refinement in Fragile X syndrome
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717772
PMID:41993264
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研究论文 | 该研究揭示了在脆性X综合征中,胶质细胞介导的突触修剪过程被破坏的机制 | 首次通过多组学框架系统阐明FMRP缺失如何通过胶质细胞(小胶质细胞和星形胶质细胞)异常信号导致突触修剪失调,并发现EphA和semaphorin通路及脂质代谢变化在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;且仅聚焦于出生后第7天的关键窗口期,未探讨长期发育效应 | 探究FMRP缺失如何影响胶质细胞介导的突触修剪及其在脆性X综合征神经发育中的作用 | Fmr1基因敲除小鼠(FXS模型)的视网膜-膝状体通路 | 机器学习 | 脆性X综合征 | NGS, RNA-seq, 脂质组学 | 神经网络 | 图像, 文本 | 未明确说明样本量,涉及Fmr1敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | NA |
| 1154 | 2026-05-02 |
Multimodal profiling reveals Mycobacterium tuberculosis restricts lung mitochondrial immunometabolism to promote pathogenesis
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717012
PMID:41993288
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研究论文 | 通过多组学分析揭示结核分枝杆菌通过限制肺部线粒体免疫代谢促进致病机制 | 首次发现结核分枝杆菌通过丝氨酸蛋白酶Hip1抑制肺部线粒体氧化磷酸化,诱导持续糖酵解,破坏线粒体功能,从而促进致病性免疫;同时鉴定出与保护性结局相关的新型线粒体免疫代谢肺部特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证范围有限;早期事件的详细分子机制仍有待进一步探索 | 阐明结核分枝杆菌感染后早期肺部免疫环境如何决定保护性还是致病性结局 | 小鼠和人类受试者 | 机器学习 | 结核病 | 高维流式细胞术、单细胞转录组学、非靶向代谢组学 | NA | 多模态数据(流式细胞术数据、单细胞转录组数据、代谢组数据) | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠和人类样本 | NA | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 1155 | 2026-05-02 |
Local IFNγ signaling contributes to the regenerative decline of aged alveolar progenitor cells
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716929
PMID:41993319
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研究论文 | 研究发现老年肺泡干细胞再生能力下降与局部IFNγ信号传导有关,通过中和IFNγ或敲除免疫蛋白酶体可部分恢复其再生功能 | 首次揭示老年肺中局部IFNγ信号主动抑制肺泡再生,证明慢性炎性信号是年龄相关肺功能衰退的原因 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证不足,且未完全阐明IFNγ下游具体分子机制 | 探究老年肺泡II型细胞再生能力下降的机制 | 老年小鼠肺泡II型细胞及CD8+ T细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞测序、类器官培养、基因敲除小鼠 | NA | 单细胞转录组数据、类器官图像数据 | 不同年龄小鼠模型(老年组与年轻组)的肺泡组织和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1156 | 2026-05-02 |
Serial Thermal Ablation Induces Abscopal Antitumor Immunity and Reveals Targetable CSF1R-Dependent Resistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.713683
PMID:41993287
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研究论文 | 本研究探讨了连续热消融在胰腺导管腺癌中诱导的远隔抗肿瘤免疫效应及CSF1R依赖性耐药机制 | 首次揭示了连续射频消融能诱导全身性远隔抗肿瘤免疫应答,并识别出CSF1驱动的髓系免疫抵抗程序,提出联合免疫治疗策略可增强消融的系统性疗效 | 研究仅基于双侧肿瘤小鼠模型,尚未在人体中验证;CD8 T细胞耗竭实验虽证实关键作用,但其他免疫机制可能未被完全涵盖 | 探究热消融诱导全身抗肿瘤免疫的能力及限制该反应的机制,并开发有效的联合免疫治疗策略 | 双侧flank肿瘤小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 射频消融, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 双侧flank肿瘤小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1157 | 2026-05-02 |
Spatially Anchored Regulatory State Inference in Melanoma
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716552
PMID:41993479
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研究论文 | 提出一种空间锚定的调控状态推断框架,整合空间转录组与单细胞多组学数据,推断黑色素瘤组织中的空间分辨调控程序 | 首次将空间转录组与单细胞多组学数据结合,实现空间锚定的调控状态推断,并通过空间正则化细胞-点映射传播染色质可及性和转录因子基序活性 | 未提及具体局限性 | 开发一种模块化方法,整合空间转录组和单细胞多组学数据,以推断组织空间中的调控程序并评估其稳定性 | 黑色素瘤组织切片 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、单细胞多组学 | GraphST | 空间转录组数据、单细胞多组学数据(染色质可及性、转录因子基序活性) | 黑色素瘤组织切片样本 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞多组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1158 | 2026-05-02 |
Emergent latent neurotoxic effects of manganese following nominal chronic exposures in human stem cell and Caenorhabditis elegans models
2026-Apr-07, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag040
PMID:42033779
|
研究论文 | 本文通过人诱导多能干细胞和秀丽隐杆线虫模型,揭示了慢性锰暴露后出现的潜在神经毒性效应 | 首次在两种遗传和机制可操作的系统中证实,慢性锰暴露停止后会出现此前未检测到的潜在神经毒性效应,且其程度远超慢性锰暴露本身的影响 | 尚未明确潜在效应的具体分子机制,且需要进一步验证其在人体中的相关性 | 研究慢性锰暴露后潜在神经毒性效应的存在及机制 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物和秀丽隐杆线虫 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和行为数据 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物(具体数量未明确)和秀丽隐杆线虫(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1159 | 2026-05-02 |
Human Lymph Node Cellular Senescence Atlas Reveals Age-Dependent Alteration in Germinal Center B Cell Function and Niches
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716161
PMID:41993351
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research paper | 通过整合单细胞和空间多组学技术,系统描绘了人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老图谱,揭示了衰老过程中生发中心B细胞功能及生态位的年龄依赖性变化 | 首次构建人类淋巴结衰老相关免疫状态的空间多组学图谱,结合单细胞转录组、空间蛋白质组、转录组、表观基因组和代谢成像,揭示了衰老细胞类型的空间异质性和从滤泡外到生发中心的逐步定位转变 | 未提供具体局限性信息 | 系统描述人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老状态及其对免疫微环境的影响 | 人类淋巴结组织,来自18至100岁供体 | digital pathology | geriatric disease | 单细胞转录组学、高多重免疫荧光、空间转录组学、空间表观基因组学、代谢成像 | NA | 单细胞转录组数据、空间蛋白质组数据、空间转录组数据、空间表观基因组数据、代谢成像数据 | 单细胞转录组:来自18-100岁供体;空间蛋白质组:51名供体(18-86岁)的99个淋巴结切片,约2000万个细胞 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1160 | 2026-05-02 |
Thymic stromal lymphopoietin promotes ozone-induced inflammation in the airway
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
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research paper | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现TSLP通过调节cDC1细胞中Fscn1的表达促进臭氧诱导的中性粒细胞性气道炎症 | 未涉及人体样本验证,且具体分子通路细节尚需进一步探索 | 阐明TSLP在臭氧诱导的2型低炎症表型气道高反应性和中性粒细胞炎症中的作用 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、Batf3缺陷小鼠以及骨髓来源的cDC1细胞 | machine learning | 哮喘、气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多组小鼠(如BALB/c、TSLP受体缺陷、Batf3缺陷)每组至少6只,具体数量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞转录组分析 |