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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2026-06-18 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and cystic fibrosis disease
2025-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00082.2025
PMID:41005986
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究,确认人类肠道中的BEST4+细胞是CFTR高表达细胞(CHE),并进一步揭示其为pH感应神经足细胞,在肠道生理和囊性纤维化疾病中具有新意义 | 首次确定大鼠小肠中的CFTR高表达细胞为能够感应和响应腔内pH的神经足细胞,并证实BEST4细胞是近端小肠中的CHE,同时首次在CF大鼠模型中表征CHE中的CFTR及相关mRNA和蛋白 | NA | 探究BEST4+细胞作为CFTR高表达细胞的性质及其在肠道pH感应和囊性纤维化疾病中的作用 | 人类和大鼠肠道上皮细胞,特别是BEST4+和CFTR高表达细胞亚群 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠肠道组织样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | scRNA-Seq使用10x Chromium平台进行 |
| 1142 | 2026-06-18 |
IL-6+ fibroblasts contribute to shaping the pro-inflammatory microenvironment in severe periodontitis after non-surgical periodontal therapy
2025-Oct-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07132-8
PMID:41094591
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研究论文 | 揭示非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋中IL-6+成纤维细胞促进促炎微环境形成的作用 | 首次发现非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋中IL-6+成纤维细胞富集,并揭示其与FCN1+巨噬细胞的相互作用通过缺氧微环境驱动持续性炎症和骨吸收,为靶向治疗提供新见解 | 未明确提及 | 探索非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋的细胞组成和分子环境,为靶向治疗提供关键见解 | 重度牙周炎患者(非手术牙周治疗后)和健康捐赠者的牙周组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组化免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1143 | 2026-06-18 |
Human deep subcutaneous adipose tissue is enriched for inflammatory and tissue remodeling pathways
2025-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00463.2025
PMID:40833844
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研究论文 | 本研究通过批量与单细胞RNA测序揭示了人类深层皮下脂肪组织与浅层脂肪组织在炎症和组织重塑通路上的差异 | 首次系统比较浅层和深层皮下脂肪组织在转录组水平上的差异,发现深层脂肪组织富含炎症和组织重塑相关基因,并鉴定出特异性细胞亚型,如氧化应激相关Mox巨噬细胞和应激反应性成纤维细胞 | 未提及 | 比较浅层和深层皮下脂肪组织的转录组差异,揭示其在炎症和组织重塑中的不同作用 | 人类浅层和深层皮下脂肪组织 | 机器学习和生物信息学 | 代谢性疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未提及样本数量 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1144 | 2026-06-18 |
In Vivo Reprogramming Dysfunctional Retinal Ganglion Cells and Visual-phototransduction via Wireless Charging Nanogold for Leber's Hereditary Optic Neuropathy
2025-10, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504509
PMID:40852879
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研究论文 | 利用无线充电纳米金颗粒在体内重编程功能障碍的视网膜神经节细胞并恢复视觉光转导,用于治疗莱伯遗传性视神经病变 | 提出了一种线粒体靶向的无线充电金纳米颗粒,兼具基因递送平台和电刺激恢复光转导的双重功能 | 该研究仅在小鼠模型和患者来源的类器官中验证,未在人体临床试验中评估疗效和安全性 | 开发一种新型基因治疗策略,通过无线充电纳米颗粒促进视网膜神经节细胞再生和视觉功能恢复,用于治疗莱伯遗传性视神经病变 | 莱伯遗传性视神经病变患者来源的诱导多能干细胞分化的视网膜类器官和LHON小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学 | NA | 转录组数据 | LHON小鼠模型和患者来源的视网膜类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1145 | 2026-06-18 |
Embracing the heterogeneity of neural stem cells in the subventricular zone
2025-09-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102452
PMID:40118056
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研究论文 | 通过整合六个已发表的小鼠脑室下区单细胞RNA测序数据集,分析不同神经干细胞标记物和分离方法对细胞状态选择性的影响 | 首次系统比较不同神经干细胞标记物(Gfap、Nestin、Sox2)和分离方法对特定神经干细胞亚群的选择性偏好,为优化细胞富集策略提供了框架 | 低基因表达细胞可能被错误分配到簇中,影响数据分析的准确性 | 评估现有神经干细胞标记物和分离方法对不同激活状态神经干细胞的选择性,提供最佳富集策略 | 成年小鼠脑室下区的神经干细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 六个已发表的公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1146 | 2026-06-18 |
Computationally resolved neuroprogenitor cell biomarkers associate with human disorders
2025-09-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102606
PMID:40845852
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研究论文 | 利用计算数字排序算法解析神经祖细胞生物标志物,并关联人类疾病 | 首次通过计算数字排序算法(DSA)从小鼠神经祖细胞中识别129个新基因,结合单细胞RNA-seq验证及人类疾病数据库分析,发现25个人类直系同源基因与遗传性神经系统疾病相关,并鉴定15个携带新发致病变异的新基因,揭示了神经祖细胞在脑发育与疾病中的分子基础 | 依赖计算模型与现有数据库,可能遗漏低表达或罕见细胞亚群标志物;小鼠与人类间的物种差异未完全克服 | 识别神经祖细胞特异性基因并探讨其与人类神经系统疾病的关联 | 小鼠海马齿状回神经干细胞与祖细胞(NPCs) | 机器学习 | 神经系统疾病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,数字排序算法(DSA) | 数字排序算法(DSA) | 基因表达数据,临床与人群数据库 | 小鼠神经祖细胞样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1147 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptome and surfaceome profiling of the adult human retinal pigment epithelium
2025-09-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102611
PMID:40882639
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研究论文 | 利用CITE-seq技术对成人视网膜色素上皮细胞进行单细胞转录组和表面组分析,揭示其亚群多样性与空间分布特征 | 首次通过CITE-seq技术对成人RPE细胞进行单细胞转录组与表面蛋白联合分析,发现具有空间分布差异的RPE亚群,并证明培养过程中大部分亚群得以保留 | 未提及 | 探索成人视网膜色素上皮细胞的细胞异质性及亚群功能差异 | 成人视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 老年性黄斑变性 | CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据、表面蛋白数据 | 成人RPE组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | CITE-seq(细胞索引转录组和表位测序) |
| 1148 | 2026-06-18 |
Methyl-CpG-binding domain as a protein interaction partner in promoter regulation and neurodevelopment through evolutionary expanded entanglement
2025-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00749.2024
PMID:40712661
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研究论文 | 甲基结合域(MBD)作为蛋白质相互作用基序,在启动子调控和神经发育中发挥进化保守作用,通过扩展的缠绕机制独立于DNA甲基化结合 | 揭示了MBD基序作为蛋白质-蛋白质相互作用关键模块的进化保守性,发现其非DNA结合功能在多种物种中独立丢失但维持相互作用残基,提出MBD在增强子和启动子调控中的未充分探索作用 | 主要基于计算分析和现有数据集,缺乏直接的体外或体内功能验证实验来确认MBD蛋白相互作用的具体机制 | 探究甲基结合域(MBD)在基因调控中的蛋白质相互作用功能及其进化保守性,特别是在神经发育中的作用 | MBD蛋白家族(包括MBD1-6、MECP2、BAZ2A/B、SETDB1/2)、NuRD复合物、启动子区域、脑发育相关基因 | 机器学习 | 智力残疾综合征 | ChIP-seq、单细胞RNA-seq、全组织转录组分析 | NA | ChIP-seq数据、单细胞RNA-seq数据、批量组织表达谱 | 超过1.15亿个单细胞(来自HepG2细胞系、人诱导多能干细胞及其衍生肝细胞)及数千批次组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、ChIP-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA-seq平台用于>115 million细胞的表达谱分析 |
| 1149 | 2026-06-18 |
Maternal-Fetal Interface Cell Dysfunction in Patients With Preeclampsia Revealed via Single-Cell RNA Sequencing
2025-09, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70101
PMID:40924867
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示子痫前期患者母胎界面细胞功能障碍 | 首次通过单细胞测序解析子痫前期中绒毛细胞滋养层和T细胞的分化偏向性,发现VCT倾向于分化为SCT而非EVT,且T细胞分化偏向CD8+T细胞而非Treg细胞 | 样本量较小(PE组3例,NP组3例),且仅基于剖宫产组织样本,可能限制结果的普适性 | 探究子痫前期中胎盘和蜕膜组织细胞类型的异质性变化及其发病机制 | 子痫前期患者和正常妊娠女性的胎盘和蜕膜组织细胞 | 单细胞组学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例子痫前期患者和3例正常妊娠女性,共32,279个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1150 | 2026-06-18 |
Developmental cues from epicardial cells simultaneously promote cardiomyocyte proliferation and electrochemical maturation
2025-08-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102572
PMID:40614731
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研究论文 | 通过共培养人心肌细胞与心外膜细胞,发现心外膜细胞能同时促进心肌细胞增殖和电化学成熟 | 首次证明心外膜细胞可同时促进心肌细胞增殖和电化学成熟,挑战了成熟限制增殖的传统观点 | 未明确心外膜细胞促进增殖和成熟的具体分子机制,3D工程心脏组织中增殖效果有限 | 探讨心外膜细胞对心肌细胞增殖与成熟的影响及两者关系 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞、心外膜细胞、心外膜源性成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、共培养技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1151 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptomics reveal individual and cooperative effects of trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2025-08-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102577
PMID:40680731
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析三体21和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 | 首次结合同基因人类诱导多能干细胞、原代人类胎儿和新生儿细胞以及单细胞转录组学,系统解析三体21和GATA1s在造血过程中的独立和协同效应,揭示了早期多能造血祖细胞中意想不到的异质性和谱系启动 | 未明确提及具体局限性,但可能包括体外模型与体内环境的差异、样本量有限或功能验证不足 | 探究三体21和GATA1s突变对造血发育的独立和协同影响,特别是早期谱系偏斜和成熟障碍的机制 | 造血祖细胞,包括来自同基因人类诱导多能干细胞、原代人类胎儿和新生儿细胞的不同染色体21和/或GATA1状态 | 单细胞转录组学 | 唐氏综合征相关血液疾病(如短暂性异常髓系造血和髓系白血病) | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 同基因人类诱导多能干细胞系、原代人类胎儿和新生儿细胞样本(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 1152 | 2026-06-18 |
Combined angiogenic and hypertrophic gene therapy enhances skeletal muscle growth
2025-08-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00966.2024
PMID:40622896
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研究论文 | 联合使用肌生成抑制蛋白前肽和血管内皮生长因子B基因治疗可促进骨骼肌生长,改善身体组成和肌肉功能 | 首次研究联合诱导血管生成和肌肉肥大的基因治疗,克服了当前肥大治疗中血管化和氧化代谢的副作用;通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞周细胞在治疗响应中的关键作用 | 主要在健康小鼠和糖尿病小鼠模型中验证;未说明在人类或其他动物模型中的长期效果和安全性 | 探索联合血管生成和肌肉肥大的基因疗法能否促进生理性肌肉生长并改善肌肉功能 | 健康小鼠和糖尿病小鼠的骨骼肌 | 基因治疗、单细胞组学 | 肌肉萎缩、糖尿病相关肌肉流失 | 腺相关病毒递送、单细胞RNA测序 | 小鼠模型(健康及糖尿病) | 基因表达与细胞通信数据 | 健康小鼠和糖尿病小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1153 | 2026-06-18 |
Cholinergic neuron-to-glioblastoma synapses in a human iPSC-derived co-culture model
2025-07-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102534
PMID:40541171
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研究论文 | 利用人类iPSC来源的胆碱能神经元与胶质母细胞瘤类器官的共培养模型,揭示胆碱能神经元通过突触连接和CHRM3受体促进胶质母细胞瘤进展 | 首次在完全人类细胞系统中建立胆碱能神经元与胶质母细胞瘤的共培养模型,并证明结构性人类胆碱能突触输入的存在及代谢型受体CHRM3的功能作用 | 未明确提及局限性 | 研究胆碱能神经回路对胶质母细胞瘤生物学的影响 | 患者来源的胶质母细胞瘤类器官和人类诱导多能干细胞来源的胆碱能神经元 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 1154 | 2026-06-18 |
Integrin β1 activity controls colony morphology during human pluripotent stem cell state transitions
2025-07-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102538
PMID:40541174
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研究论文 | 研究了整合素β1活性在人多能干细胞状态转变过程中对集落形态的控制作用 | 首次发现整合素β1活性可调控人多能干细胞从致敏状态向初始样状态的转变,揭示其依赖性的集落形态变化及ERK信号通路参与 | 研究主要基于体外实验,体内功能验证尚未进行 | 阐明整合素β1在调控人多能干细胞初始样(naive-like)与致敏状态(primed)中的作用机制 | 人多能干细胞(hiPSCs)的初始样与致敏状态 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组学(single-cell transcriptomics) | NA | 单细胞转录组数据 | 多个hiPSC细胞系及单细胞RNA-seq数据(具体样本量未详细说明) | NA | 单细胞RNA-seq | 未指定具体平台 | NA |
| 1155 | 2026-06-18 |
S-Propargyl-Cysteine Attenuates Stroke Heterogeneity via Promoting Protective Autophagy Across Multiple Neural Cell Types: Insights From Single-Cell Sequencing
2025-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70399
PMID:40702904
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示S-炔丙基半胱氨酸(SPRC)通过促进多种神经细胞类型的保护性自噬减轻脑卒中异质性的机制 | 首次发现SPRC通过不依赖经典酶CBS/3-MST的机制,促进保护性自噬,从而减轻脑缺血再灌注损伤的神经保护作用 | 未提及 | 研究SPRC在缺血性卒中中的神经保护潜力及其机制,重点关注硫化氢(H2S)与自噬在调节卒中后脑微环境中的相互作用 | 缺血性脑组织中的神经细胞(特别是神经元)以及大鼠和CBS/3-MST敲除小鼠 | 机器学习和数字病理 | 脑血管疾病(缺血性卒中) | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 从GEO数据集GSE174574获取的缺血性脑组织样本,以及大鼠和敲除小鼠模型(具体样本数量未明确) | 不适用(平台信息未在标题或摘要中提供) | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 使用Harmony R包进行批次效应校正和JASMINE包计算评分 |
| 1156 | 2026-06-18 |
Two types of regenerative cell populations appear in acute liver injury
2025-06-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102503
PMID:40345206
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研究论文 | 通过对对乙酰氨基酚处理小鼠的公开单细胞RNA测序数据分析,发现急性肝损伤中出现两种再生细胞群体 | 在同一个再生过程中发现两种不同的再生细胞群体同时出现,且其中一种由坏死组织接触诱导,具有去分化特征和更高增殖能力 | NA | 研究急性肝损伤中肝脏再生的机制 | 对乙酰氨基酚处理的小鼠肝脏再生过程中的细胞 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开数据中的对乙酰氨基酚处理小鼠样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 公开单细胞RNA测序数据 |
| 1157 | 2026-06-18 |
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-06-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102532
PMID:40499510
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综述 | 本文回顾了人类多能干细胞占据不同亚稳态亚状态对其分化结果影响的研究,并基于荧光标记动力学模型提出亚状态转换可能受确定性混沌和随机波动共同调控 | 提出亚状态转换可能受确定性混沌和随机波动共同驱动的新模型,超越了传统仅考虑随机性的观点 | 未明确说明具体局限性,但模型基于荧光标记分布序列,可能受限于实验观测的时空分辨率 | 理解干细胞命运决定中基因表达异质性的机制 | 人类多能干细胞及其亚稳态亚状态 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1158 | 2026-06-18 |
Identification and Validation of Potential Immune-Related Genes for Endometriosis
2025-05, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70091
PMID:40367358
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研究论文 | 通过生物信息学分析和免疫组化验证,识别并验证子宫内膜异位症中的潜在免疫相关基因 | 综合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合机器学习算法,首次识别出TGFBR1和GIMAP4分别为在位和异位子宫内膜的特征免疫基因 | 研究主要基于公共数据库数据,样本量有限,且免疫组化验证仅针对两个基因,可能需要更多临床样本和功能实验进一步验证 | 识别并验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 | 子宫内膜异位症患者的在位内膜和异位内膜组织样本 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化 | 机器学习模型(未具体说明类型) | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,使用了GEO数据库中的公共数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1159 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptomics reveals the immune mechanisms by which tonsillectomy improves clinical outcomes of recurrent Immuoglobulin A nephropathy after kidney transplant
2025-04, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.02.010
PMID:39985963
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示扁桃体切除改善肾移植后复发性IgA肾病患者临床结局的免疫机制 | 首次利用单细胞mRNA测序和流式细胞术,系统分析了扁桃体组织及外周血单核细胞在扁桃体切除治疗复发性IgA肾病中的细胞类型和基因表达变化,发现了TCL1A和PI3k-Akt通路在B细胞介导的免疫调节中的关键作用 | 样本量较小,仅包含29例患者、1份扁桃体组织和3份PBMC样本,可能限制结论的普适性;且未包含未接受扁桃体切除的对照患者,难以完全排除其他因素对结果的影响 | 探究扁桃体切除在治疗肾移植后复发性IgA肾病中的细胞和分子机制,尤其是B细胞相关的免疫调节作用 | 复发性IgA肾病患者的扁桃体组织及外周血单核细胞 | 数字病理学 | IgA肾病 | 单细胞mRNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 | 29例复发性IgA肾病患者,包括1份扁桃体组织和3份PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞mRNA测序采用10x Genomics平台?但文中未明确提及,仅说明单细胞mRNA测序,因此输出NA |
| 1160 | 2026-06-18 |
Leveraging programmed cell death patterns to predict prognosis and therapeutic sensitivity in OSCC
2025-02, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15139
PMID:39315471
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研究论文 | 整合12种程序性细胞死亡模式构建细胞死亡指数,用于口腔鳞状细胞癌的预后和治疗预测 | 首次整合12种程序性细胞死亡模式构建新型生物标志物细胞死亡指数,用于口腔鳞状细胞癌的预后和治疗反应预测 | 未明确提及局限性 | 构建基于程序性细胞死亡模式的新型生物标志物,预测口腔鳞状细胞癌预后和治疗敏感性 | 口腔鳞状细胞癌患者样本及单细胞RNA测序数据 | 计算机视觉 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq | LASSO回归 | 转录组数据 | 多个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |