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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11561 - 11580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11561 | 2025-10-07 |
BIOTIC: a Bayesian framework to integrate single-cell multi-omics for transcription factor activity inference and improve identity characterization of cells
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf013
PMID:39833103
|
研究论文 | 提出一种名为BIOTIC的贝叶斯框架，通过整合单细胞多组学数据推断转录因子活性并改善细胞身份表征 | 开发了首个基于生物机制的贝叶斯模型，通过变分推理整合单细胞多组学数据来推断转录因子活性 | NA | 在基因调控水平推断转录因子活性并阐明细胞身份状态 | 细胞身份表征和基因调控机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学测序，单细胞转录组测序 | 贝叶斯模型，变分推理 | 单细胞多组学数据，基因表达数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞多组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11562 | 2025-10-07 |
Comparative analysis of rhesus macaque and human placental organoids highlights evolutionary differences in placentation
2024-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.11.617873
PMID:39416122
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研究论文 | 通过建立猕猴和人类胎盘类器官模型，比较分析两者在胎盘形成过程中的进化差异 | 首次建立猕猴胎盘类器官模型，并通过单细胞RNA测序揭示猕猴与人类滋养细胞转录特征的异同 | 仅比较了猕猴和人类两个物种，可能无法完全代表所有灵长类的胎盘进化特征 | 探究灵长类胎盘进化的分子机制和物种间差异 | 猕猴和人类的胎盘组织及衍生的类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 猕猴和人类胎盘类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11563 | 2025-10-07 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-Oct, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
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综述 | 探讨细胞间接触介导的通讯机制及其对细胞功能调控的前沿研究方法 | 整合单细胞测序与空间转录组学等新兴技术，系统揭示细胞接触对基因表达的影响机制 | NA | 解析细胞间接触如何调控复杂的细胞反应网络 | 多细胞生物中的细胞间相互作用 | 空间生物学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 生物工程技术 | NA | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11564 | 2025-10-07 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了人类先天样T细胞与传统T细胞的转录特征 | 揭示了人类先天样T细胞不分化成多个效应亚群而是发展混合型1/型17效应潜能的独特特征，并发现人类缺乏2型T细胞的物种特异性差异 | 研究主要关注人类和小鼠的比较，可能不适用于其他物种的免疫机制 | 探索先天样T细胞与传统T细胞的转录特征差异及其发育途径 | 人类胸腺和血液中的先天样T细胞和传统T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11565 | 2025-10-07 |
Molecular and spatial signatures of human and rat corpus cavernosum physiopathological processes at single-cell resolution
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760
PMID:39299236
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组测序，绘制了人类和大鼠阴茎海绵体在正常和疾病状态下的空间细胞图谱 | 首次在分子水平揭示了人类和大鼠阴茎海绵体的空间异质性，并发现了机械力信号在不同区域的分布差异 | 研究仅涉及人类和大鼠两个物种，且体外实验条件可能与体内环境存在差异 | 探究阴茎海绵体在生理和病理状态下的分子解剖结构和细胞异质性 | 人类和大鼠的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类和大鼠阴茎海绵体样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 11566 | 2025-10-07 |
Bioinformatics and machine learning approaches reveal key genes and underlying molecular mechanisms of atherosclerosis: A review
2024-Aug-02, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038744
PMID:39093811
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综述 | 通过生物信息学和机器学习方法探索动脉粥样硬化的关键基因及分子机制 | 整合多种生物信息学工具和机器学习算法识别动脉粥样硬化的关键基因，并首次分析其与铁死亡基因的关联 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 揭示动脉粥样硬化的遗传调控机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化相关基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因表达分析 | LASSO回归，随机森林 | 基因表达数据 | GSE20129和GSE90074数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11567 | 2025-10-07 |
Cell-cell communication and initial population composition shape the structure of potato spindle tuber viroid quasispecies
2024-Mar-29, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae012
PMID:38252648
|
研究论文 | 本研究探讨细胞间通讯和初始种群组成如何影响马铃薯纺锤块茎类病毒准种结构的形成 | 首次通过比较缺乏胞间连丝的成熟保卫细胞和离体培养的叶肉原生质体，揭示细胞间通讯对类病毒准种结构的影响 | 研究仅针对马铃薯纺锤块茎类病毒中间株系，结果可能不适用于其他类病毒或病毒 | 阐明类病毒准种结构的形成机制 | 马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)及其变异体 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞测序,共感染实验 | NA | 基因组序列数据 | 番茄植株的保卫细胞和叶肉原生质体 | NA | NA | NA | NA |
| 11568 | 2025-10-07 |
Magnetically functionalized hydrogels for high-throughput genomic applications
2024-Jan-22, Advanced materials technologies
IF:6.4Q1
DOI:10.1002/admt.202301155
PMID:38645306
|
研究论文 | 本研究开发了一种磁功能化水凝胶珠用于简化单细胞基因组学中的分池方法 | 首次实现水凝胶珠的磁功能化，显著提高分池方法的纯化效率和自动化潜力 | 未明确说明磁功能化珠在长期稳定性或大规模生产中的表现 | 开发自动化单细胞基因组学工作流程的新方法 | 磁功能化水凝胶珠 | 单细胞基因组学 | NA | BAG-Seq单细胞测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11569 | 2025-10-07 |
GMFGRN: a matrix factorization and graph neural network approach for gene regulatory network inference
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad529
PMID:38261340
|
研究论文 | 提出一种基于矩阵分解和图神经网络的基因调控网络推断新方法GMFGRN | 结合图神经网络进行矩阵分解学习基因表征嵌入，能有效消除传递性相互作用且计算资源需求低 | NA | 从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 矩阵分解 | 基因表达数据 | 8个静态单细胞RNA测序数据集和4个时间序列数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11570 | 2025-10-07 |
The lysosome-related characteristics affects the prognosis and tumor microenvironment of lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1497312
PMID:39839650
|
研究论文 | 本研究通过构建溶酶体风险特征来预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次系统研究溶酶体相关基因在肺腺癌中的作用，构建了7个关键基因的风险特征，并在单细胞水平验证其功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索溶酶体相关基因在肺腺癌预后和肿瘤微环境中的作用 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11571 | 2025-10-07 |
Comparative evaluation of ACetic - MEthanol high salt dissociation approach for single-cell transcriptomics of frozen human tissues
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1469955
PMID:39839668
|
研究论文 | 评估ACME HS方法在冷冻人体组织中单细胞转录组学的应用效果 | 首次将ACME方法优化应用于人类内分泌组织，并使用高盐洗涤缓冲液替代标准PBS以稳定RNA | 主要针对人类内分泌组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 开发适用于冷冻组织的单细胞分离方法，提高单细胞RNA测序质量 | 人类内分泌组织样本 | 单细胞转录组学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11572 | 2025-10-07 |
Exploring the shared gene signatures and mechanism among three autoimmune diseases by bulk RNA sequencing integrated with single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1520050
PMID:39840076
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研究论文 | 通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析探索三种自身免疫疾病的共享基因特征和机制 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析三种自身免疫疾病的共享基因特征，并利用机器学习算法筛选诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎三种自身免疫疾病的共享基因特征，识别早期诊断生物标志物 | 多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎患者及EAE小鼠模型 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习算法, Cibersort算法 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11573 | 2025-10-07 |
Using single-cell RNA sequencing to generate predictive cell-type-specific split-GAL4 reagents throughout development
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307451120
PMID:37523539
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的预测性管道，用于在发育过程中生成细胞类型特异性的split-GAL4试剂 | 利用发育单细胞RNA测序数据集选择基因对用于split-GAL4系统，创建了高效预测性管道scMarco，能够基于天然基因调控元件在发育任何时期生成细胞类型特异性工具 | NA | 开发细胞类型特异性遗传工具用于神经环路功能研究 | 果蝇视觉系统发育过程中的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR敲入 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11574 | 2025-10-07 |
Therapy-associated remodeling of pancreatic cancer revealed by single-cell spatial transcriptomics and optimal transport analysis
2023-Jun-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.28.546848
PMID:37425692
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学结合最优输运分析揭示了胰腺癌治疗相关的肿瘤微环境重塑 | 开发了空间约束最优输运相互作用分析(SCOTIA)模型，整合空间距离和配体-受体基因表达来解析细胞间相互作用 | NA | 解析胰腺癌治疗过程中肿瘤微环境的多细胞区域和细胞间相互作用的重塑机制 | 人类胰腺癌组织 | 空间生物学 | 胰腺癌 | 单细胞空间转录组学，最优输运分析，肿瘤类器官共培养系统 | 最优输运模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 11575 | 2025-10-07 |
Differential transcriptomic profiling of lipid metabolism and collagen remodeling in fast- and slow-twitch skeletal muscles in aging
2025-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402294R
PMID:39831549
|
研究论文 | 本研究通过比较分析老年小鼠快慢肌纤维的转录组差异，揭示了衰老过程中脂质代谢和胶原重塑的分子变化 | 首次整合小鼠bulk RNA测序和人类单细胞RNA测序数据，进行跨物种比较分析衰老对快慢肌纤维的影响 | 仅使用20月龄小鼠模型，缺乏更广泛的年龄阶段数据；样本量未明确说明 | 探究衰老过程中快慢肌纤维的转录组差异及其分子机制 | 老年小鼠的快慢骨骼肌纤维和人类单细胞RNA测序数据 | 转录组学 | 老年疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11576 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-21, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11577 | 2025-10-07 |
Fibrocyte enrichment and myofibroblastic adaptation causes nucleus pulposus fibrosis and associates with disc degeneration severity
2025-Jan-20, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00372-2
PMID:39828732
|
研究论文 | 本研究通过整合分析多个单细胞RNA测序数据集，揭示了髓核纤维化与椎间盘退变严重程度相关的细胞机制 | 首次发现髓核纤维化与髓系来源的纤维细胞富集相关，并证实这些细胞通过转化为肌成纤维细胞表型促进椎间盘退变 | 研究主要基于单细胞测序数据和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的临床相关性 | 探究椎间盘退变过程中髓核纤维化的细胞机制和关键细胞类型 | 人类退变性髓核标本和损伤诱导的小鼠椎间盘退变模型 | 单细胞基因组学 | 椎间盘退变疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11578 | 2025-10-07 |
The Expression of the LDLR, LDLRAP1, and PCSK9 Genes has Prognostic Significance in Triple-negative Breast Cancer
2025-Jan-20, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究探讨胆固醇摄取基因在三阴性乳腺癌中的预后意义 | 首次系统评估LDLR、LDLRAP1和PCSK9等胆固醇摄取基因在不同乳腺癌亚型中的预后价值差异 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 评估胆固醇摄取基因对乳腺癌患者总生存期的预后意义及其在不同亚型间的差异 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 乳腺癌 | mRNA测序，单细胞测序 | DESeq2，Fisher检验 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的乳腺癌肿瘤样本 | NA | mRNA测序，单细胞测序 | NA | NA |
| 11579 | 2025-10-07 |
TLR7/8/9 agonists and low-dose cisplatin synergistically promotes tertiary lymphatic structure formation and antitumor immunity
2025-Jan-19, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-024-01055-z
PMID:39827246
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研究论文 | 本研究开发了一种新型联合疗法，通过低剂量顺铂与TLR7/8/9激动剂CR108协同促进三级淋巴结构形成和抗肿瘤免疫 | 首次发现低剂量顺铂与TLR7/8/9激动剂CR108联合使用可协同促进三级淋巴结构形成，并揭示其作为功能性抗肿瘤效应T细胞储备库的新机制 | 研究仅限于小鼠模型（4T1和B16肿瘤），尚未在人体临床试验中验证 | 开发新型原位疫苗接种联合疗法以增强抗肿瘤免疫反应 | 小鼠肿瘤模型（4T1和B16肿瘤细胞系） | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞测序数据、血清细胞因子检测数据 | 小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11580 | 2025-10-07 |
ERG mediates the differentiation of hepatic progenitor cells towards immunosuppressive PDGFRα+ cancer-associated fibroblasts during hepatocarcinogenesis
2025-Jan-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07270-9
PMID:39827226
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研究论文 | 本研究揭示肝祖细胞通过TLR4/MAPK/ERG通路分化为免疫抑制性PDGFRα+癌症相关成纤维细胞的机制 | 首次发现ERG转录因子介导肝祖细胞向PDGFRα+ CAFs的分化过程，并阐明其在肝癌免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 研究主要基于大鼠原发肝癌模型，人类临床样本验证相对有限 | 探究肝癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其在免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肝祖细胞、PDGFRα+癌症相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 大鼠原发肝癌模型不同时间点样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |