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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11541 | 2025-10-07 |
Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.016
PMID:39317200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示Notch-RBPJ信号通路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中调控单核细胞向巨噬细胞转化的关键作用 | 首次揭示Notch-RBPJ信号通路在MASH中控制单核细胞-巨噬细胞转化的时空动态机制,发现Rbpj缺陷通过上调CD36表达促进保护性Ly6C单核细胞的脂质摄取 | 巨噬细胞分化和功能的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎中巨噬细胞分化和功能的调控机制 | 肝脏巨噬细胞群体(包括驻留库普弗细胞和单核来源巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序,命运图谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11542 | 2025-10-07 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对胰岛素衍生表位的反应动态和致病性 | 发现InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向独特的Th1效应表型且具有致病性,而其他胰岛素表位特异性T细胞主要呈现调节表型 | 研究仅限于NOD小鼠模型,未在人类患者中验证 | 探究自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对不同胰岛素衍生表位的反应特性和致病机制 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序, 四聚体分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从胰腺中分选的CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11543 | 2025-10-07 |
Cryo-PRO facilitates whole blood cryopreservation for single-cell RNA sequencing of immune cells from clinical samples
2024-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.18.24313760
PMID:39371152
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研究论文 | 开发了一种名为Cryo-PRO的全血冷冻保存方法,用于临床样本免疫细胞的单细胞RNA测序 | 首次提出直接从冷冻保存的全血中分离PBMC的方法,将现场处理时间从2小时以上缩短至15分钟以内 | 仅在23名脓毒症患者中进行了验证,样本量相对较小 | 开发更便捷的临床样本处理方法以促进单细胞RNA测序在多中心研究中的应用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞(PBMC) | 单细胞测序 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 23名脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11544 | 2025-10-07 |
Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606465
PMID:39149311
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研究论文 | 开发了一种无需成像的空间转录组学方法,通过分子扩散模式和计算重建获得空间基因组学数据 | 利用分子扩散模式计算重建空间数据,无需依赖成像或直接配准设备 | NA | 开发可扩展的无成像空间基因组学技术 | 组织中的细胞及其分子程序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,分子扩散分析,计算重建 | UMAP算法 | 空间转录组数据,分子相互作用矩阵 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seq, Slide-tags | 二维条形码阵列 |
11545 | 2025-10-07 |
LMNA-Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-Derived iPSC Differentiation Support Cell Type and Lineage-Specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-09-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171479
PMID:39273049
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC通过单细胞转录组学分析LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 首次在患者来源的iPSC分化过程中通过单细胞RNA测序揭示LMNA单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞基因表达和发育的细胞类型特异性调控紊乱 | 方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 研究LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 来自携带LMNA c.357-2A>G剪接位点突变家族的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),涵盖7个时间点,共110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11546 | 2025-10-07 |
Keratin 8/18a.1 Expression Influences Embryonic Neural Crest Cell Dynamics and Contributes to Postnatal Corneal Regeneration in Zebrafish
2024-09-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171473
PMID:39273043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现角蛋白中间丝基因K8和K18a.1在斑马鱼眼部发育和角膜再生中的重要作用 | 首次揭示K8和K18a.1在斑马鱼神经嵴细胞迁移和角膜再生中的功能,并发现K18a.1受视黄酸调控 | 使用吗啉代寡核苷酸进行基因敲降可能存在脱靶效应,研究主要聚焦于斑马鱼模型 | 探究神经嵴细胞在眼部发育和角膜再生中的分子机制 | 斑马鱼胚胎神经嵴细胞和成年斑马鱼角膜组织 | 发育生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光显微镜, 吗啉代寡核苷酸敲降 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11547 | 2025-10-07 |
circRNAs as Epigenetic Regulators of Integrity in Blood-Brain Barrier Architecture: Mechanisms and Therapeutic Strategies in Multiple Sclerosis
2024-08-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13161316
PMID:39195206
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综述 | 本文综述了环状RNA通过调节血脑屏障完整性在多发性硬化症中的作用机制及治疗策略 | 首次系统阐述circRNAs通过表观遗传调控血脑屏障完整性的机制,为多发性硬化症治疗提供新靶点 | 目前仍处于机制探索阶段,缺乏临床验证数据 | 探讨circRNAs在维持血脑屏障完整性中的作用及其在多发性硬化症治疗中的应用潜力 | 血脑屏障内皮细胞、紧密连接和粘附连接蛋白、环状RNA | 神经科学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11548 | 2025-10-07 |
Regulatory B Cells Expressing Granzyme B from Tolerant Renal Transplant Patients: Highly Differentiated B Cells with a Unique Pathway with a Specific Regulatory Profile and Strong Interactions with Immune System Cells
2024-07-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13151287
PMID:39120317
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肾移植耐受患者中表达颗粒酶B的调节性B细胞特征 | 首次发现肾移植耐受患者中GZMB B细胞是高度分化的B细胞,具有独特的发育轨迹和特异性转录组特征 | 样本量较小(每组3例患者),需要更大规模研究验证 | 确定表达颗粒酶B的调节性B细胞在肾移植耐受患者外周血中是否富集 | 肾移植患者的外周血单个核细胞和体外诱导的GZMB B细胞 | 单细胞组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | 伪时序轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 9例肾移植患者(3例稳定功能,3例药物耐受,3例抗体介导排斥) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11549 | 2025-10-07 |
Transition of signal requirement in hematopoietic stem cell development from hemogenic endothelial cells
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404193121
PMID:39042698
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞从生血内皮细胞发育过程中信号需求的变化 | 首次阐明了干细胞因子和血小板生成素在不同发育阶段对造血干细胞诱导的关键作用,并建立了无血清无饲养层的培养系统 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索造血干细胞从生血内皮细胞发育过程中的信号需求机制 | 小鼠胚胎期的生血内皮细胞、前造血干细胞-I和前造血干细胞-II | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E10.5至E11.5小鼠胚胎的背主动脉及周围组织、胎肝 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11550 | 2025-10-07 |
Markers of Dermal Fibroblast Subpopulations for Viable Cell Isolation via Cell Sorting: A Comprehensive Review
2024-07-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13141206
PMID:39056788
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综述 | 本文全面综述了用于细胞分选的真皮成纤维细胞亚群表面标志物 | 系统分析了3000多篇研究文献,首次全面鉴定和比较了不同成纤维细胞亚群的表面标志物特征 | 基于文献综述,缺乏原始实验验证 | 鉴定适用于细胞分选和功能研究的成纤维细胞表面标志物 | 人体真皮成纤维细胞及其亚群 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 文献数据 | 3000多篇研究文章 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11551 | 2025-10-07 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49565-7
PMID:38898078
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制模式的建立机制及其与基因组不稳定性的关联 | 首次证明晚期复制区域在受精后第一个细胞周期就与B区室和核纤层共同建立,且这种模式先于胚胎基因组激活 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎,在人类胚胎中的直接证据有限 | 探索哺乳动物发育过程中DNA复制程序的建立时机和机制 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 牛和小鼠早期胚胎单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11552 | 2025-10-07 |
LMNA -Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-derived iPSC Differentiation Support Cell type and Lineage-specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.12.598335
PMID:38915555
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC进行单细胞转录组测序,探索LMNA相关扩张型心肌病在心肌细胞和心外膜来源细胞中的基因表达和发育失调机制 | 首次在LMNA单倍体不足背景下,通过单细胞转录组测序分析iPSC分化过程中多种细胞类型的基因表达失调,揭示了细胞类型和谱系特异性的发育异常 | 研究方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 探索LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 携带LMNA剪接位点突变的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),包含110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11553 | 2025-10-07 |
Hyperoxia impairs induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells and drives an atherosclerosis-like transcriptional phenotype
2024, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2024.100193
PMID:38770110
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研究论文 | 本研究探讨高氧条件对诱导多能干细胞来源内皮细胞功能的影响及其与动脉粥样硬化表型的关联 | 首次发现高氧培养的晚期iPSC-ECs会发展为内皮-间质转化表型,且其转录表型与动脉粥样硬化内皮细胞存在重叠 | 生理氧条件虽能改善线粒体功能,但单独使用不足以保持血管生成能力 | 研究不同氧浓度条件下iPSC-ECs的功能特性和分子表型变化 | 诱导多能干细胞来源的内皮细胞 | 干细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11554 | 2025-10-07 |
SGSM2 in Uveal Melanoma: Implications for Survival, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity
2024, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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研究论文 | 本研究探讨SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与预后、免疫浸润和药物敏感性的关系 | 首次系统研究SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达模式及其临床意义,揭示了其与免疫浸润和药物敏感性的新关联 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验,需要更多临床样本验证 | 阐明SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的作用机制及其临床价值 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系和TCGA数据库中的患者数据 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | qRT-PCR, 生物信息学分析, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据库中的葡萄膜黑色素瘤患者样本和细胞系 | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
11555 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptomics and bulk transcriptomics to explore prognostic and immunotherapeutic characteristics of nucleotide metabolism in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1466249
PMID:39845190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和批量转录组数据,探索核苷酸代谢在肺腺癌中的预后和免疫治疗特征 | 首次构建基于核苷酸代谢相关基因的预后风险评分模型,并发现其能准确预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索核苷酸代谢在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用机制 | 肺腺癌患者和肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序,批量转录组测序,体外细胞实验 | Lasso + Stepcox机器学习组合模型 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
11556 | 2025-10-07 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2023-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.25.573304
PMID:38234839
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式化特征及其与染色体脆弱性的关联 | 首次发现哺乳动物胚胎在受精后第一个细胞周期就建立了早期和晚期复制区域,并证明这种模式导致核纤层相关区域易于发生染色体断裂 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎,在人类胚胎中的验证仍需进一步研究 | 探索哺乳动物发育过程中DNA复制程序的建立机制及其生物学意义 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 牛和小鼠早期胚胎单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11557 | 2025-10-07 |
Mural cell-derived chemokines provide a protective niche to safeguard vascular macrophages and limit chronic inflammation
2023-10-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.08.002
PMID:37652021
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研究论文 | 本研究揭示了血管壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF为巨噬细胞提供保护性微环境,维持其稳态功能并限制慢性炎症 | 首次发现血管壁细胞通过分泌特定趋化因子构建巨噬细胞保护性微环境,这一机制在动脉粥样硬化中具有关键保护作用 | 研究主要聚焦于动脉粥样硬化模型,在其他慢性炎症疾病中的普适性需要进一步验证 | 探究维持血管巨噬细胞稳态的分子机制及其在慢性炎症疾病中的作用 | 血管巨噬细胞、血管壁细胞(周细胞和平滑肌细胞) | 细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 活体成像、单细胞转录组测序、共培养实验、基因敲除 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11558 | 2025-10-07 |
Endothelial CCRL2 induced by disturbed flow promotes atherosclerosis via chemerin-dependent β2 integrin activation in monocytes
2023-08-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad085
PMID:37279540
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研究论文 | 本研究揭示了血流扰动诱导的内皮细胞CCRL2通过chemerin依赖性β2整合素激活促进动脉粥样硬化的新机制 | 发现CCRL2-chemerin-β2整合素轴这一新型动脉粥样硬化形成通路,chemerin具有蛋白二硫键异构酶样活性 | 主要基于小鼠模型研究,临床样本数量有限 | 探究CCRL2及其配体chemerin在动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-小鼠、内皮细胞、单核细胞、动脉粥样硬化患者 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、Di-E-GSSG测定、邻近连接测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、临床血清数据 | ApoE-/-小鼠模型、急性动脉粥样硬化血栓性卒中患者与健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11559 | 2024-08-07 |
RNA visualization and single-cell transcriptomics: methods and applications
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2286761
PMID:38047544
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11560 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA sequencing investigation of female-male differences under PAD conditions
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1251141
PMID:37745110
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究了在周围动脉疾病条件下内皮细胞性别差异对促动脉粥样硬化通路的影响 | 首次结合血流紊乱和基质硬度两种机械环境因素,系统研究性别差异对PAD中内皮细胞表型的影响 | 当前PAD模型缺乏对血流和硬度参数的全面考虑,且研究尚未完全阐明d-flow和硬度共同作用对内皮细胞表型的影响机制 | 探索性别对暴露于血流紊乱和僵硬环境的内皮细胞促动脉粥样硬化通路的影响 | 内皮细胞(ECs)和鼠颈动脉 | 单细胞组学 | 周围动脉疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |