单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 11541 - 11560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11541 | 2024-08-05 |
Retinal ganglion cell type-specific expression of synuclein family members revealed by scRNA-sequencing
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.95598
PMID:38903914
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了视网膜神经节细胞中突触素家族成员的表达模式和作用 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析视网膜细胞中突触素的表达，专注于视网膜神经节细胞亚型 | 对于突触素家族成员在视网膜中的确切位置和作用仍缺乏全面理解 | 研究突触素家族成员在视网膜神经节细胞中的表达模式 | 健康和受伤视网膜中的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 人类、鼠和鸡的视网膜样本 |
| 11542 | 2024-08-05 |
Immune cell related signature predicts prognosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk-RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1370801
PMID:38903709
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研究论文 | 该文章探讨了免疫细胞相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后作用。 | 文章创新性地提出了一个由免疫相关基因构成的预后模型，识别出CTSC、ALOX12和RMND5B作为与预后相关的基因。 | 文章没有详细说明样本的多样性和选择偏倚的可能性。 | 研究食管鳞状细胞癌中免疫细胞相关基因的作用及其对预后的影响。 | 主要研究对象为食管鳞状细胞癌患者的免疫细胞相关基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序与大规模RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 数据来源于多个公共数据库，总计分析了3915个DEGs |
| 11543 | 2024-08-04 |
Mapping visual functions onto molecular cell types in the mouse superior colliculus
2023-06-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.036
PMID:37086721
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠上丘的不同神经元亚型及其在视觉功能中的角色 | 研究首次通过单细胞转录组学识别了28种神经元亚型，并提出小鼠上丘内抑制性神经元分子亚型的功能组织逻辑 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果可能不适用于其他物种 | 探讨小鼠上丘神经元在视觉处理中的分子功能 | 成年小鼠的上丘神经元亚型及其对应的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因转录数据 | 数万个成年小鼠上丘神经元 |
| 11544 | 2024-08-04 |
Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis
2024-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198
PMID:38697449
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研究论文 | 这篇文章全面分析了磷酸烯醇丙酮酸羧化酶在癌症中的失调及其潜在机制 | 本研究揭示了PEPCK在不同癌症类型中的表达与临床预后、基因突变及免疫细胞浸润的相关性，并确定了可能的预测生物标志物 | 尚未深入探讨PEPCK的机制以及在所有癌种中的具体功能 | 研究PEPCK在不同癌症类型中的表达模式及其与临床相关性的关系 | 涉及33种不同类型癌症的PEPCK基因表达分析 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 33种不同类型癌症的数据集 |
| 11545 | 2024-08-04 |
Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts
2024-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202
PMID:38729323
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研究论文 | 本文探讨了MIR155HG/miR-155轴在增生性瘢痕成纤维细胞中调节细胞因子和α-SMA表达的机制 | 发现MIR155HG在增生性瘢痕组织中由于DNA甲基化降低而上调，并通过调控miR-155-5p/-3p及AZGP1影响细胞因子产生 | 研究主要集中在体外模型，可能无法完全反映体内的复杂生理环境 | 探讨MIR155HG在增生性瘢痕中的作用及其潜在的机制 | 增生性瘢痕成纤维细胞（HSFBs）及其在细胞因子产生中的作用 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 西方印迹法, ELISA | NA | RNA测序数据 | 使用临床样本和各种细胞类型的单细胞测序数据 |
| 11546 | 2024-08-05 |
CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis
2024-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212
PMID:38719020
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研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学方法识别与免疫相关的致病基因，并分析牙周炎中的免疫细胞浸润与功能 | 首次证明了CXCR4在牙周炎中的重要致病作用，以及其在调节中性粒细胞动态中的潜在功能 | 研究中主要依赖于生物信息学分析和动物模型，临床应用效果仍需进一步验证 | 识别与牙周炎相关的关键免疫致病基因 | 牙周炎中的中性粒细胞及其相关的免疫反应 | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 临床样本和小鼠牙周炎模型 |
| 11547 | 2024-08-05 |
Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679
PMID:38712557
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研究论文 | 研究进行了脾脏的非侵入性聚焦超声刺激对实验性肺动脉高血压的影响 | 首次探讨了通过超声神经调节抑制脾脏的抗炎途径来改善实验性肺动脉高血压的潜力 | 主要在动物模型中进行，结果是否适用于人类尚需进一步验证 | 旨在探索非侵入性超声刺激对肺动脉高血压的治疗潜力 | 大鼠实验模型，包括Sugen/hypoxia模型和单克痕模型 | 数字病理学 | 肺动脉高血压 | 聚焦超声刺激 | NA | 组织学、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 大鼠样本，具体数量未提供 |
| 11548 | 2024-08-05 |
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-Jun-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028
PMID:38593801
|
研究论文 | 本文探讨了小鼠耳蜗的三维重建，并提出了形态发生因子在耳蜗自顶到基底特征中的作用 | 创新之处在于通过scRNA-seq数据重建耳蜗，揭示了形态发生因子在空间身份赋予中的重要作用 | 无法完全明确调控小鼠耳蜗音调基因表达的分子机制 | 研究小鼠耳蜗中音调基因表达的分子机制 | 小鼠耳蜗的发育和相关的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | E12.5和E14.5时间点的数据 |
| 11549 | 2024-08-05 |
Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination
2024-Jun-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92844
PMID:38873887
|
研究论文 | 该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态 | 首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态，并在体内定位 | 目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚 | 探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态 | 小鼠胚胎中的神经脊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎 |
| 11550 | 2024-08-05 |
Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure
2024-Jun, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2024.03.001
PMID:38899223
|
研究论文 | 本文探讨了肾脏特定细胞类型在调节人类血压中的作用 | 首次确认肌成纤维细胞在血压调节中的重要性，并通过多组独立数据进行了验证 | 研究仅集中于特定成人群体，可能不适用于其他人群 | 探讨肾脏中细胞类型如何影响血压的基因调控 | 主要研究肌成纤维细胞和内皮细胞在血压调节中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据和单细胞转录组数据 | 1028980名欧洲血统成年人和14个成熟人类肾脏的单细胞数据 |
| 11551 | 2024-08-05 |
Overexpressed KCNK1 regulates potassium channels affecting molecular mechanisms and biological pathways in bladder cancer
2024-Apr-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01844-1
PMID:38689322
|
研究论文 | 本研究旨在探讨KCNK1在膀胱癌中的表达、分子机制及其生物功能 | 首次揭示KCNK1在膀胱癌中的过表达及其在三维空间中的复杂转录调控网络 | 未在不同种族或其他类型癌症中验证KCNK1的角色 | 研究KCNK1在膀胱癌中的作用及其潜在分子机制 | 膀胱癌患者的KCNK1表达及其与临床特征的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、ATAC-seq、ChIA-PET | NA | mRNA、蛋白质、免疫组化数据 | 外部样本1486，内部样本245 |
| 11552 | 2024-08-04 |
Impaired innate and adaptive immune responses to BNT162b2 SARS-CoV-2 vaccination in systemic lupus erythematosus
2024-Mar-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176556
PMID:38456511
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研究论文 | 本研究分析了系统性红斑狼疮患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫反应 | 本研究揭示了系统性红斑狼疮患者在接种BNT162b2疫苗后存在明显的免疫反应缺陷 | 研究仅限于19名系统性红斑狼疮患者，样本量较小 | 了解系统性红斑狼疮患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫反应 | 19名系统性红斑狼疮患者和56名健康对照志愿者 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 19名系统性红斑狼疮患者，56名健康对照 |
| 11553 | 2024-08-05 |
A conserved transcriptional program for MAIT cells across mammalian evolution
2024-Feb-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231487
PMID:38117256
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研究论文 | 本文研究了MAIT细胞在跨越110百万年进化的六个物种中的转录组特征 | 揭示了不同物种中MAIT细胞成熟的保守转录事件，以及其在不同物种中的共享转录程序 | 主要集中在六个特定物种，可能无法全面代表所有哺乳动物的MAIT细胞功能 | 探索MAIT细胞在哺乳动物进化中的功能和转录程序 | 涉及六种跨越110百万年进化的物种中的MAIT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 六种物种的MAIT细胞样本 |
| 11554 | 2024-08-05 |
Dynamic immune status analysis of peripheral blood mononuclear cells in patients with Klebsiella pneumoniae bloodstream infection sepsis using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380211
PMID:38898888
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了克雷伯氏肺炎菌血流感染引起的脓毒症患者外周血单核细胞的动态免疫状态 | 首次研究了在克雷伯氏肺炎菌血流感染急性阶段和恢复阶段外周血单核细胞的免疫状态变化 | 样本量仅为13个，可能影响结果的广泛适用性 | 揭示克雷伯氏肺炎菌血流感染引起的脓毒症患者外周血单核细胞的免疫功能机制 | 包括3名健康对照和10名因克雷伯氏肺炎菌血流感染而入院的患者 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 13个样本（3名健康对照，7名急性阶段患者，3名恢复阶段患者） |
| 11555 | 2024-08-04 |
Identification of Niche-Specific Gene Signatures between Malignant Tumor Microenvironments by Integrating Single Cell and Spatial Transcriptomics Data
2023-10-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14112033
PMID:38002976
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研究论文 | 该文章提出了一种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法，以识别恶性肿瘤微环境中的特定基因特征 | 通过整合scRNA-seq和空间转录组数据，识别特定于细胞生态位的基因特征，展示了这一整合方法的潜力 | 未提及具体的局限性 | 旨在综合评估组织样本中的基因活性并识别细胞生态位特异性基因特征 | 研究对象包括五种癌症类型的配对或匹配的scRNA-seq和Visium平台数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、胃肠道间质肿瘤、肝细胞癌、子宫内膜癌、卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及五种癌症类型的配对或匹配样本数据 |
| 11556 | 2024-08-04 |
Targeting intratumor heterogeneity suppresses colorectal cancer chemoresistance and metastasis
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256416
PMID:37338390
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研究论文 | 本文研究了肠道肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌化疗抗性和转移的影响 | 创新点在于揭示了结直肠癌干细胞样细胞的不对称分裂在早期肿瘤异质性建立中的关键作用 | 本研究仅集中于结直肠癌，可能无法广泛适用于其他类型癌症 | 研究肠内肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌治疗的影响 | 研究对象为结直肠癌干细胞样细胞及其衍生的细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 七个细胞亚型的异种移植模型 |
| 11557 | 2024-08-04 |
Quantification of spatial pharmacogene expression heterogeneity in breast tumors
2023-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1686
PMID:35906899
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研究论文 | 本研究分析了乳腺肿瘤中286个药物基因的空间表达异质性。 | 该研究利用新开发的Visium空间转录组平台，首次定量分析了乳腺肿瘤中药物基因的空间异质性。 | 本研究主要关注了六个乳腺癌样本，样本量相对较小，可能影响结果的普适性。 | 研究肿瘤组织中药物基因的空间表达异质性及其对癌症治疗的影响。 | 六个乳腺癌组织样本中的286个药物基因。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 六个乳腺癌组织样本 |
| 11558 | 2024-08-05 |
A transcriptomics-guided drug target discovery strategy identifies receptor ligands for lung regeneration
2022-03-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj9949
PMID:35319981
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研究论文 | 本研究提出了一种转录组指导的药物靶标发现策略，识别了用于肺部再生的受体配体 | 开发了一种新方法来识别针对慢性阻塞性肺病(COPD)的再生药物靶标，强调了EP和IP前列腺素受体配体的疗效 | 研究可能未充分考虑其他可能影响慢性病修复机制的因素 | 探索治疗慢性疾病中的组织修复缺陷的新药物靶点 | 烟草相关的慢性阻塞性肺病患者及其小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 结合慢性阻塞性肺病的临床样本和吸烟小鼠模型 |
| 11559 | 2024-08-05 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
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研究论文 | 本研究揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型的不同免疫特性 | 首次明确了FIRS I型和II型的免疫机制差异，揭示了它们在免疫反应中的不同角色 | 由于FIRS的低发病率和产后诊断困难，分子机制仍未完全理解 | 探讨胎儿炎症反应综合征(I型和II型)的免疫机制 | 来自早产儿的脐血样本，诊断为FIRS I型或II型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 人类脐血样本来自早产儿 |
| 11560 | 2024-08-05 |
The CDK9 inhibitor enitociclib overcomes resistance to BTK inhibition and CAR-T therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jun-18, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00589-7
PMID:38886769
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研究论文 | 该文章探讨了CDK9抑制剂enitociclib对抗MCL中的BTK抑制和CAR-T疗法的耐药性 | 研究表明CDK9是双重耐药样本中上调基因的关键成分，提出针对CDK9的治疗可能有效对抗耐药性 | 尚未提及临床试验的数据和对其他类型淋巴瘤的适用性 | 研究新疗法以克服对BTK抑制和CAR-T治疗的耐药性 | 主要研究了mantle cell lymphoma (MCL) 的耐药性以及enitociclib的疗效 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 涉及MCL和弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系 |