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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11541 | 2025-10-07 |
SGSM2 in Uveal Melanoma: Implications for Survival, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity
2024, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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研究论文 | 本研究探讨SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与预后、免疫浸润和药物敏感性的关系 | 首次系统研究SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达模式及其临床意义,揭示了其与免疫浸润和药物敏感性的新关联 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验,需要更多临床样本验证 | 阐明SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的作用机制及其临床价值 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系和TCGA数据库中的患者数据 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | qRT-PCR, 生物信息学分析, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据库中的葡萄膜黑色素瘤患者样本和细胞系 | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
11542 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptomics and bulk transcriptomics to explore prognostic and immunotherapeutic characteristics of nucleotide metabolism in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1466249
PMID:39845190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和批量转录组数据,探索核苷酸代谢在肺腺癌中的预后和免疫治疗特征 | 首次构建基于核苷酸代谢相关基因的预后风险评分模型,并发现其能准确预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索核苷酸代谢在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用机制 | 肺腺癌患者和肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序,批量转录组测序,体外细胞实验 | Lasso + Stepcox机器学习组合模型 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
11543 | 2025-10-07 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2023-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.25.573304
PMID:38234839
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式化特征及其与染色体脆弱性的关联 | 首次发现哺乳动物胚胎在受精后第一个细胞周期就建立了早期和晚期复制区域,并证明这种模式导致核纤层相关区域易于发生染色体断裂 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎,在人类胚胎中的验证仍需进一步研究 | 探索哺乳动物发育过程中DNA复制程序的建立机制及其生物学意义 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 牛和小鼠早期胚胎单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11544 | 2025-10-07 |
Mural cell-derived chemokines provide a protective niche to safeguard vascular macrophages and limit chronic inflammation
2023-10-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.08.002
PMID:37652021
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研究论文 | 本研究揭示了血管壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF为巨噬细胞提供保护性微环境,维持其稳态功能并限制慢性炎症 | 首次发现血管壁细胞通过分泌特定趋化因子构建巨噬细胞保护性微环境,这一机制在动脉粥样硬化中具有关键保护作用 | 研究主要聚焦于动脉粥样硬化模型,在其他慢性炎症疾病中的普适性需要进一步验证 | 探究维持血管巨噬细胞稳态的分子机制及其在慢性炎症疾病中的作用 | 血管巨噬细胞、血管壁细胞(周细胞和平滑肌细胞) | 细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 活体成像、单细胞转录组测序、共培养实验、基因敲除 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11545 | 2025-10-07 |
Endothelial CCRL2 induced by disturbed flow promotes atherosclerosis via chemerin-dependent β2 integrin activation in monocytes
2023-08-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad085
PMID:37279540
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研究论文 | 本研究揭示了血流扰动诱导的内皮细胞CCRL2通过chemerin依赖性β2整合素激活促进动脉粥样硬化的新机制 | 发现CCRL2-chemerin-β2整合素轴这一新型动脉粥样硬化形成通路,chemerin具有蛋白二硫键异构酶样活性 | 主要基于小鼠模型研究,临床样本数量有限 | 探究CCRL2及其配体chemerin在动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-小鼠、内皮细胞、单核细胞、动脉粥样硬化患者 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、Di-E-GSSG测定、邻近连接测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、临床血清数据 | ApoE-/-小鼠模型、急性动脉粥样硬化血栓性卒中患者与健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11546 | 2024-08-07 |
RNA visualization and single-cell transcriptomics: methods and applications
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2286761
PMID:38047544
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11547 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA sequencing investigation of female-male differences under PAD conditions
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1251141
PMID:37745110
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究了在周围动脉疾病条件下内皮细胞性别差异对促动脉粥样硬化通路的影响 | 首次结合血流紊乱和基质硬度两种机械环境因素,系统研究性别差异对PAD中内皮细胞表型的影响 | 当前PAD模型缺乏对血流和硬度参数的全面考虑,且研究尚未完全阐明d-flow和硬度共同作用对内皮细胞表型的影响机制 | 探索性别对暴露于血流紊乱和僵硬环境的内皮细胞促动脉粥样硬化通路的影响 | 内皮细胞(ECs)和鼠颈动脉 | 单细胞组学 | 周围动脉疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11548 | 2025-10-07 |
Differential responses to immune checkpoint inhibitor dictated by pre-existing differential immune profiles in squamous cell carcinomas caused by same initial oncogenic drivers
2022-Apr-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02337-x
PMID:35366939
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研究论文 | 本研究通过建立两种具有相同致癌驱动但免疫特征不同的鳞状细胞癌模型,揭示了肿瘤内在差异导致免疫检查点抑制剂反应差异的机制 | 首次利用具有相同TP53缺失和PIK3CA超活化但免疫特征不同的鳞癌模型,揭示肿瘤内在差异决定ICI反应差异的机制 | 研究基于小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证 | 阐明头颈鳞状细胞癌对免疫检查点抑制剂产生不同反应的机制 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型(KPPA肿瘤系TAb2和TCh3) | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 两种肿瘤细胞系(TAb2和TCh3) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11549 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the carotid artery and femoral artery of rats exposed to hindlimb unloading
2025-Jan-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05572-x
PMID:39833543
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了后肢卸载大鼠颈动脉和股动脉的细胞图谱,揭示了模拟微重力条件下血管重塑的细胞分子机制 | 首次构建后肢卸载大鼠传导动脉的单细胞图谱,系统揭示了血管细胞异质性、细胞间通讯和转录因子网络在血管重塑中的作用 | 研究仅基于大鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证;样本量相对有限 | 探究模拟微重力条件下大鼠动脉血管重塑的细胞分子机制 | 后肢卸载处理3个月的大鼠颈动脉和股动脉组织 | 单细胞组学 | 血管功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析,细胞通讯分析,转录因子网络分析 | 单细胞转录组数据 | 后肢卸载大鼠的颈动脉和股动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11550 | 2025-10-07 |
Inhibition of programmed cell death by melanoma cell subpopulations reveals mechanisms of melanoma metastasis and potential therapeutic targets
2025-Jan-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01789-9
PMID:39832036
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示黑色素瘤细胞亚群抑制程序性细胞死亡的机制及其在转移中的作用 | 首次通过单细胞测序技术识别出C0 SOD3+黑色素瘤核心亚群,并发现其与氧化途径和转移过程的密切关联 | 研究主要基于单细胞测序数据分析,部分机制需要进一步实验验证 | 探究黑色素瘤转移机制并识别潜在治疗靶点 | 黑色素瘤肿瘤组织中的细胞亚群 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11551 | 2025-10-07 |
Polycystin-1 regulates tendon-derived mesenchymal stem cells fate and matrix organization in heterotopic ossification
2025-Jan-20, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00392-y
PMID:39833160
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研究论文 | 本研究揭示机械敏感蛋白Polycystin-1通过调控肌腱来源间充质干细胞的命运和细胞外基质组织影响异位骨化进程 | 首次发现CTSK谱系肌腱来源间充质干细胞是异位骨化的主要细胞来源,并阐明PC1-TAX信号轴在机械信号传导中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床适用性需进一步验证 | 探究机械应力影响异位骨化的细胞机制和分子通路 | CTSK谱系肌腱来源间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 谱系追踪小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11552 | 2025-10-07 |
Revolutionizing ESCC prognosis: the efficiency of tumor-infiltrating immune cells (TIIC) signature score
2025-Jan-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01709-3
PMID:39833504
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研究论文 | 本研究开发了基于肿瘤浸润免疫细胞特征评分的食管鳞癌预后模型 | 首次开发了肿瘤浸润免疫细胞特征评分,为ESCC预后和免疫治疗提供了新策略 | NA | 评估肿瘤浸润免疫细胞特征评分在食管鳞癌预后中的效能 | 食管鳞癌患者样本 | 机器学习 | 食管鳞癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | 二十种机器学习算法 | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | 来自GEO和TCGA数据库的ESCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11553 | 2025-10-07 |
Benchmarking cell type annotation methods for 10x Xenium spatial transcriptomics data
2025-Jan-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06044-0
PMID:39833693
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研究论文 | 本研究对10x Xenium空间转录组数据的细胞类型注释方法进行了基准测试 | 首次系统评估基于参考的细胞类型注释工具在成像空间转录组数据上的性能表现 | 仅评估了五种基于参考的注释工具,且仅使用人类乳腺癌Xenium数据进行验证 | 评估和比较不同细胞类型注释方法在10x Xenium空间转录组数据上的性能 | 人类乳腺癌组织的10x Xenium空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | SingleR, Azimuth, RCTD, scPred, scmapCell | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 成像空间转录组平台 |
11554 | 2025-10-07 |
Desmoglein-2 was a novel cancer-associated fibroblasts-related biomarker for oral squamous cell carcinoma
2025-Jan-20, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-05284-5
PMID:39833796
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出口腔鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞相关生物标志物DSG2 | 首次发现DSG2作为口腔鳞状细胞癌中CAFs相关的新型预后生物标志物 | CAFs在OSCC中的具体作用机制仍不完全清楚 | 探索口腔鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞相关生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌样本 | 单细胞测序分析 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, western blot, 生物信息学分析 | Cox回归分析, ROC分析, Pearson相关分析 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11555 | 2025-10-07 |
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Jan-20, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.025
PMID:39842636
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研究论文 | 通过空间转录组学和多色免疫组化技术研究胎盘分子和细胞形态,揭示生殖免疫新机制 | 首次发现胚胎滋养细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白,揭示胎儿通过细胞和体液免疫主动维持母胎免疫平衡的新机制 | 样本类型包括正常妊娠和异位妊娠,但具体样本数量未明确说明 | 研究胎盘在早期和晚期的细胞分子特征及母胎免疫调节机制 | 人类正常妊娠、异位妊娠胎盘组织及动物模型 | 空间生物学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学, 多重免疫组织化学, 免疫组化-荧光原位杂交双标记 | NA | 空间转录组数据, 组织图像, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 免疫组织化学, 荧光原位杂交 | NA | NA |
11556 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and multi-omics analyses reveal ferroptosis-associated gene expression and immune microenvironment heterogeneity in gastric cancer
2025-Jan-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01798-8
PMID:39831925
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研究论文 | 通过整合单细胞和多组学分析揭示胃癌中铁死亡相关基因表达和免疫微环境异质性 | 首次在胃癌中系统整合单细胞RNA测序与多组学数据研究铁死亡相关基因表达谱和免疫微环境异质性 | 未明确说明样本数量和具体实验验证细节 | 探究胃癌中铁死亡相关基因表达特征及其与免疫微环境的关系 | 胃癌组织和微环境中的细胞群体 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, ssGSEA分析, GO/KEGG富集分析 | 机器学习预测模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
11557 | 2025-10-07 |
Acquisition of discrete immune suppressive barriers contributes to the initiation and progression of preinvasive to invasive human lung cancer
2025-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.31.630523
PMID:39803458
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研究论文 | 通过单细胞技术构建肺腺癌从癌前到浸润阶段的高分辨率免疫图谱,揭示免疫抑制屏障的形成机制 | 首次构建个体肺部分实性结节中非实性(癌前)和实性(浸润)区域的高分辨率单细胞图谱,发现4-1BB+ Treg新亚群及其IL2-STAT5抑制通路 | 研究样本量有限,主要聚焦肺腺癌的特定发展阶段 | 揭示肺腺癌从癌前病变向浸润性癌发展的早期决定因素 | 人类肺部分实性结节组织的微解剖样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 多重成像质谱流式, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间成像数据, 转录组数据 | 个体肺部分实性结节的微解剖样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重成像 | NA | NA |
11558 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of the intrahepatic ecosystem in alcohol-related liver disease
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70198
PMID:39834100
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了酒精相关肝病肝内生态系统的细胞景观,发现具有干细胞特性和恶性转化潜能的ALBKRT7上皮细胞群 | 首次在人类ALD肝脏中发现同时表达肝细胞和胆管标记的ALBKRT7上皮细胞群,并证明其通过Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤生长 | NA | 阐明酒精相关肝病的分子机制和恶性转化过程 | 酒精相关肝病患者和健康供体的肝脏组织 | 单细胞生物学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11559 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of Programmed Cell Death-Related Genes in Diagnosis and Synovitis During Osteoarthritis Development: Based on Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S491203
PMID:39839184
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,系统分析了程序性细胞死亡相关基因在骨关节炎滑膜炎中的作用 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术,系统研究PCD相关基因在OA滑膜炎中的表达模式及其与免疫微环境的相互作用 | 研究样本来源于公共数据库,需要进一步实验验证 | 探讨程序性细胞死亡相关基因在骨关节炎诊断和滑膜炎发展中的作用 | 骨关节炎患者的滑膜组织样本 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA测序, qRT-PCR, 机器学习算法, 单细胞RNA测序 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的OA滑膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
11560 | 2025-10-07 |
Analysis and Validation of Autophagy-Related Gene Biomarkers and Immune Cell Infiltration Characteristic in Bronchopulmonary Dysplasia by Integrating Bioinformatics and Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S495132
PMID:39839185
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研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法,分析与验证支气管肺发育不良中自噬相关基因生物标志物及免疫细胞浸润特征 | 首次对BPD中自噬相关基因和免疫浸润进行生物信息学分析,并采用三种机器学习算法识别枢纽基因 | 研究基于单一数据集GSE8586,样本来源有限 | 筛选和验证支气管肺发育不良的特征基因 | 支气管肺发育不良患者基因表达数据和高压氧大鼠模型 | 生物信息学 | 支气管肺发育不良 | 基因表达分析,单细胞测序,免疫组织化学 | Lasso,MCC,Degree,MCODE | 基因表达数据 | GSE8586数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |