单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 11521 - 11540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11521 | 2024-08-05 |
Comparison of genetic and epigenetic profiles of periodontitis according to the presence of type 2 diabetes
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.620
PMID:38903536
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研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病与牙周炎之间的遗传和表观遗传特征的比较 | 使用多组学方法揭示了与Fc-伽马受体介导的吞噬作用通路相关的特定遗传和表观遗传变化 | 暂无具体的限制说明 | 深入理解2型糖尿病与牙周炎之间的相互关系 | 2型糖尿病患者的牙周组织样本与健康参与者进行比较 | 数字病理学 | 牙周炎, 2型糖尿病 | 全基因组测序, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 甲基化数据, RNA测序数据 | 涉及牙周炎患者（含糖尿病与不含糖尿病）及健康参与者的样本 |
| 11522 | 2024-08-04 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 该论文研究了肠道病毒基因型网络的结构和动态 | 使用单细胞测序方法揭示了病毒种群结构的复杂性，并将宿主细胞转录表型与病毒基因型结构联系起来 | NA | 理解病毒种群如何适应选择环境的变化 | 肠道病毒的基因型及其与宿主细胞转录组的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | mRNA | 来自数百个感染细胞的病毒单倍型 |
| 11523 | 2024-08-04 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
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研究论文 | 该文章探讨了跨种杂交引发的学习能力扩展，特别是关于鸟类的歌唱学习 | 研究揭示了杂交鸟类在学习能力上超越亲本的机制，特别是在神经元转录特征方面的独特性 | 缺乏对环境因素及其影响的具体研究 | 探索物种特定的歌唱学习的神经遗传机制 | F杂交鸟类的学习能力及其神经元特征 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | F杂交鸟类的多个个体 |
| 11524 | 2024-08-04 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-Jun-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
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research paper | 本研究提出了一种新的深度学习方法SPACE，用于通过细胞相互作用意识的细胞嵌入分析单细胞分辨率的空间转录组数据 | SPACE能够识别具有特殊空间分布模式和不同邻近相互作用细胞类型的空间信息细胞亚型，并自动发现具有明显边界的细胞社区 | NA | 揭示个体细胞如何发挥组织特异性功能的空间组织原则 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 11525 | 2024-08-05 |
Knockdown of ATRX enhances radiosensitivity in glioblastoma
2024-Jun-19, Chinese neurosurgical journal
DOI:10.1186/s41016-024-00371-6
PMID:38898533
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研究论文 | 本研究探讨了ATRX在胶质母细胞瘤中的放射敏感性作用 | 揭示了ATRX突变对胶质母细胞瘤患者生存期的影响，并提出ATRX作为克服放射抗性的新靶点 | 未提供具体的临床试验数据支持 | 研究ATRX在胶质母细胞瘤放射抗性中的作用 | 胶质母细胞瘤患者的ATRX突变率及其表达 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从癌症基因组图谱中获取的胶质瘤患者数据 |
| 11526 | 2024-08-04 |
Traumatic brain injury promotes neurogenesis at the cost of astrogliogenesis in the adult hippocampus of male mice
2024-Jun-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49299-6
PMID:38890340
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研究论文 | 创伤性脑损伤(TBI)导致小鼠成年海马中的神经发生增加，同时减少星形胶质细胞生成 | 本研究揭示了创伤性脑损伤如何改变神经干细胞的命运，促进神经发生而代价于星形胶质细胞生成 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，未考虑性别对结果的影响 | 探讨创伤性脑损伤对成年小鼠海马神经干细胞及其衍生细胞线的影响 | 成年雄性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 受控皮层撞击模型 | 细胞、基因表达数据 | NA |
| 11527 | 2024-08-05 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-Jun-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
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研究论文 | 本研究探讨了趋化因子chemerin在中性粒细胞逆向迁移中的作用机制 | 首次揭示了chemerin通过与C-C动机趋化因子受体样2的相互作用，吸引中性粒细胞离开炎症部位的机制 | 该研究主要集中在急性肺损伤模型，尚未在其他疾病模型中验证 | 旨在探索中性粒细胞逆向迁移的机制 | 主要研究在急性肺损伤模型中逆向迁移的中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 血液样本 | 急性肺损伤模型中的白细胞 |
| 11528 | 2024-08-05 |
Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63542-6
PMID:38890395
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研究论文 | 本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征 | 采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成 | 样本稀缺性可能影响研究结果的全面性 | 探讨人类窦房结的细胞组成和功能 | 主要聚焦于人类窦房结的细胞群体 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | RNA-seq | 深度学习解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考 |
| 11529 | 2024-08-05 |
Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64567-7
PMID:38890346
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研究论文 | 本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应 | 首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征 | 研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证 | 旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果 | 研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，差异表达基因分析 | Cox回归分析，LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明 |
| 11530 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis
2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02613-2
PMID:38890734
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研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制 | 发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制 | 研究未提及样本数量和临床有效性验证 | 探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制 | 分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 分析了32724个细胞 |
| 11531 | 2024-08-04 |
Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations
2024-06-07, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02746-6
PMID:38847845
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研究论文 | 本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。 | 识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。 | 缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。 | 旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。 | 研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 包括多个次级群体（SGS I-VIII）的样本 |
| 11532 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18373
PMID:38894657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用 | 首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型 | 研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性 | 揭示胃癌快速进展的分子生物学机制 | 对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 27名胃癌患者的38个样本 |
| 11533 | 2024-08-05 |
Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction
2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374
PMID:38752343
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研究论文 | 本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。 | 通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。 | 该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。 | 研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。 | 38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞 |
| 11534 | 2024-08-05 |
Human-like adrenal features in Chinese tree shrews revealed by multi-omics analysis of adrenal cell populations and steroid synthesis
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了中国树鼩的肾上腺细胞群和类固醇合成中的人类样特征 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组分析系统性映射了中国树鼩肾上腺细胞类型和类固醇代谢通路 | 研究主要集中在树鼩的肾上腺细胞类型及其与人类的比较，其他模型的比较可能有限 | 研究树鼩中肾上腺类固醇合成的细胞类型及其功能 | 中国树鼩的肾上腺细胞群和类固醇合成机制 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合症，原发性醛固酮增多症，高血压 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析，质谱，免疫组化 | NA | RNA序列，代谢数据 | 多种细胞类型的样本，包括树鼩，人类，猕猴和小鼠的比较 |
| 11535 | 2024-08-05 |
Applications of single-cell RNA sequencing in spermatogenesis and molecular evolution
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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评论 | 本文综述了单细胞RNA测序在精子发生和分子演化中的应用 | 该文章创新性地探索了单细胞转录组测序技术在揭示精子发生细胞异质性及其分子演化过程中的作用 | 文章主要为综述，缺乏实验数据支持 | 阐明单细胞RNA测序在哺乳动物精子发生中的调控机制 | 精子发生细胞及其生态位细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11536 | 2024-08-05 |
Meiotic transcriptional reprogramming mediated by cell-cell communications in humans and mice revealed by scATAC-seq and scRNA-seq
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过scATAC-seq和scRNA-seq揭示了人类和小鼠中的减数分裂转录重编程受到细胞间通讯的介导 | 首次展示了精原细胞在减数分裂早期阶段重编程的转录变化以及Sertoli细胞与生殖细胞之间信号的角色 | 对减数分裂调控机制的深入了解仍然有限，需要更多研究来确认发现 | 研究减数分裂过程中转录重编程的机制及其与生殖细胞功能的关系 | 人类和小鼠的精巢组织中的减数分裂细胞 | 数字病理学 | 无阻塞性无精症 | scATAC-seq和scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 人类和小鼠的精巢组织样本 |
| 11537 | 2024-08-04 |
Clinically relevant molecular hallmarks of PFA ependymomas display intratumoral heterogeneity and correlate with tumor morphology
2024-01-24, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02682-x
PMID:38265527
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研究论文 | 本文探讨了后颅窝A型（PF-EPN-A）ependymoma的分子特征及其肿瘤内部异质性与肿瘤形态之间的关联。 | 研究揭示了PF-EPN-A肿瘤内部的异质性以及其与肿瘤形态的临床相关性，尤其在细胞密度及其不同区域的DNA甲基化差异方面。 | 研究主要集中在113个样本，可能无法全面代表所有PF-EPN-A病例的分子特征。 | 识别PFA ependymomas中形态不同区域的分子差异及其临床意义。 | 分析113个PF-EPN-A样本以及40个相关复发样本。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数分析和原位荧光杂交（FISH） | NA | 组织样本 | 113个PF-EPN-A样本，包括40个复发样本 |
| 11538 | 2024-08-05 |
Novel lissencephaly-associated NDEL1 variant reveals distinct roles of NDE1 and NDEL1 in nucleokinesis and human cortical malformations
2024-01-09, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02665-y
PMID:38194050
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研究论文 | 该研究识别了第一个与大脑皮层发育不良相关的NDEL1变异，并阐明了NDE1和NDEL1在细胞核运动和人类皮层畸形中的不同作用 | 首次识别了与大脑皮层回归症相关的NDEL1变异，揭示了NDE1和NDEL1在细胞核运动中的独特角色 | 未涉及NDEL1变异在其他类型发育不良中的潜在作用 | 研究NDE1和NDEL1在神经细胞迁移和皮层畸形发病机制中的作用 | 两个携带相同de novo体细胞马赛克NDEL1变异的患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | NA | 两个患者 |
| 11539 | 2024-08-04 |
A pan-cancer single-cell transcriptional analysis of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372432
PMID:38903527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析肿瘤微环境中的抗原呈递癌相关成纤维细胞（apCAFs） | 首次深入解析了apCAFs在不同实体肿瘤类型中的作用及其与抗肿瘤效应的关系 | 研究主要依赖公共数据库的数据，可能存在数据的偏倚或不完整 | 探讨apCAFs在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 不同类型实体肿瘤中的抗原呈递癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9种不同类型的实体肿瘤数据集 |
| 11540 | 2024-08-04 |
Investigating cellular similarities and differences between upper tract urothelial carcinoma and bladder urothelial carcinoma using single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1298087
PMID:38903524
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了上尿路尿路上皮癌（UTUC）和膀胱尿路上皮癌（BLCA）之间的细胞相似性和差异 | 发现了UTUC和BLCA在细胞身份、免疫微环境和MARCKS表达模式方面的明显差异 | 样本量较小，仅分析了三例UTUC病例和四个正常输尿管组织 | 探讨UTUC的分子过程，识别UTUC与BLCA之间的生物学差异 | 上尿路尿路上皮癌和膀胱尿路上皮癌的细胞及其微环境 | 数字病理学 | 尿路癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 三例UTUC病例和四个正常输尿管组织 |