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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11521 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome revealed the metabolic heterogeneity in human glioma
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41241
PMID:39844970
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研究论文 | 本研究通过整合分析批量、单细胞和空间转录组数据,揭示了人类胶质瘤的代谢异质性并建立了基于四种关键代谢途径的预后分型系统 | 首次基于四种关键代谢途径(谷氨酰胺分解、糖酵解、磷酸戊糖途径和脂肪酸氧化)构建胶质瘤代谢分型系统,并结合单细胞和空间转录组分析揭示代谢异质性与肿瘤微环境的关联 | 研究基于转录组数据,未直接验证代谢功能;样本量相对有限;需要进一步实验验证CX3CL1/CX3CR1信号轴的功能 | 开发基于代谢途径的胶质瘤分类系统,揭示代谢异质性及其临床意义 | 人类胶质瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 批量转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组 | ConsensusClusterPlus,CellChat,stLearn | 转录组数据,单细胞数据,空间数据 | 多个胶质瘤数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组,批量RNA-seq | NA | NA |
11522 | 2025-10-07 |
Clinical and immunological outcomes after randomized trial of baked milk oral immunotherapy for milk allergy
2025-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184301
PMID:39782691
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研究论文 | 本研究评估烘焙牛奶口服免疫疗法对牛奶过敏儿童的安全性和有效性 | 首次通过随机试验证明烘焙牛奶口服免疫疗法可在减少不良反应的同时诱导脱敏,并识别了成功的免疫学相关标志物 | 样本量相对较小,仅包含30名参与者 | 确定烘焙牛奶口服免疫疗法是否能减少不良反应同时诱导脱敏,并识别成功的免疫学相关因素 | 3-18岁牛奶过敏儿童 | 临床免疫学 | 食物过敏 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 预测模型 | 临床数据,免疫学数据 | 30名牛奶过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11523 | 2025-10-07 |
Altered Atlas of Exercise-Responsive MicroRNAs Revealing miR-29a-3p Attacks Armored and Cold Tumors and Boosts Anti-B7-H3 Therapy
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0590
PMID:39845707
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研究论文 | 本研究揭示了miR-29a-3p作为运动响应性miRNA通过抑制B7-H3表达攻击装甲型和冷肿瘤并增强抗B7-H3治疗的机制 | 首次发现miR-29a-3p是关键的运动响应性miRNA,能同时靶向巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞下调B7-H3表达,并开发了具有良好生物相容性的lipo@miR-29a-3p纳米递送系统 | 研究主要基于公共数据库和动物模型,尚未进行大规模临床试验验证 | 探索运动响应性miRNA在肿瘤抑制中的作用机制及其治疗潜力 | 乳腺癌及多种泛癌类型,包括巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术,体外实验,体内模型 | 动物模型 | 基因表达数据,预后数据,单细胞测序数据 | 多个独立公共队列和内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11524 | 2025-10-07 |
NBAtlas: A harmonized single-cell transcriptomic reference atlas of human neuroblastoma tumors
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114804
PMID:39368085
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研究论文 | 本研究整合了七个单细胞或单核转录组数据集,构建了一个包含362,991个细胞的人类神经母细胞瘤协调参考图谱 | 创建了首个涵盖61名患者的大规模神经母细胞瘤单细胞转录组协调参考图谱,揭示了肿瘤区室转录组特征与临床结局的关联 | 整合的研究数据量仍有限,可能无法完全代表神经母细胞瘤的全部异质性 | 构建人类神经母细胞瘤的单细胞转录组参考图谱并解析其肿瘤异质性 | 神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61名患者的362,991个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
11525 | 2025-10-07 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
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研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过抑制PD-1+Nrp1lo Treg细胞调控IL6中性粒细胞募集,从而控制炎症驱动性结直肠肿瘤发生 | 首次发现PD-L1通过调控PD-1+Nrp1lo Treg细胞亚群和IL6中性粒细胞来抑制结直肠肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究PD-L1在结直肠癌中调控T细胞功能的具体机制 | 小鼠结直肠肿瘤模型中的T细胞亚群和中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11526 | 2025-10-07 |
Persistent bone marrow hemozoin accumulation confers a survival advantage against bacterial infection via cell-intrinsic Myd88 signaling
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114850
PMID:39392758
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研究论文 | 本研究揭示了疟疾中血晶素在骨髓持续沉积通过细胞内在Myd88信号通路增强先天免疫记忆的机制 | 首次发现血晶素通过细胞内在Myd88依赖途径诱导骨髓生成偏向,并证实其能增强单核细胞杀菌能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究血晶素沉积对造血和免疫反应的调控机制 | 骨髓造血祖细胞和单核细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合体, 骨内注射 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11527 | 2024-10-12 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2024-Oct-11, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae374
PMID:39392468
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11528 | 2025-10-07 |
Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.016
PMID:39317200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示Notch-RBPJ信号通路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中调控单核细胞向巨噬细胞转化的关键作用 | 首次揭示Notch-RBPJ信号通路在MASH中控制单核细胞-巨噬细胞转化的时空动态机制,发现Rbpj缺陷通过上调CD36表达促进保护性Ly6C单核细胞的脂质摄取 | 巨噬细胞分化和功能的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎中巨噬细胞分化和功能的调控机制 | 肝脏巨噬细胞群体(包括驻留库普弗细胞和单核来源巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序,命运图谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11529 | 2025-10-07 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对胰岛素衍生表位的反应动态和致病性 | 发现InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向独特的Th1效应表型且具有致病性,而其他胰岛素表位特异性T细胞主要呈现调节表型 | 研究仅限于NOD小鼠模型,未在人类患者中验证 | 探究自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对不同胰岛素衍生表位的反应特性和致病机制 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序, 四聚体分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从胰腺中分选的CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11530 | 2025-10-07 |
Cryo-PRO facilitates whole blood cryopreservation for single-cell RNA sequencing of immune cells from clinical samples
2024-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.18.24313760
PMID:39371152
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研究论文 | 开发了一种名为Cryo-PRO的全血冷冻保存方法,用于临床样本免疫细胞的单细胞RNA测序 | 首次提出直接从冷冻保存的全血中分离PBMC的方法,将现场处理时间从2小时以上缩短至15分钟以内 | 仅在23名脓毒症患者中进行了验证,样本量相对较小 | 开发更便捷的临床样本处理方法以促进单细胞RNA测序在多中心研究中的应用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞(PBMC) | 单细胞测序 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 23名脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11531 | 2025-10-07 |
Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606465
PMID:39149311
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研究论文 | 开发了一种无需成像的空间转录组学方法,通过分子扩散模式和计算重建获得空间基因组学数据 | 利用分子扩散模式计算重建空间数据,无需依赖成像或直接配准设备 | NA | 开发可扩展的无成像空间基因组学技术 | 组织中的细胞及其分子程序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,分子扩散分析,计算重建 | UMAP算法 | 空间转录组数据,分子相互作用矩阵 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seq, Slide-tags | 二维条形码阵列 |
11532 | 2025-10-07 |
LMNA-Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-Derived iPSC Differentiation Support Cell Type and Lineage-Specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-09-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171479
PMID:39273049
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC通过单细胞转录组学分析LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 首次在患者来源的iPSC分化过程中通过单细胞RNA测序揭示LMNA单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞基因表达和发育的细胞类型特异性调控紊乱 | 方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 研究LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 来自携带LMNA c.357-2A>G剪接位点突变家族的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),涵盖7个时间点,共110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11533 | 2025-10-07 |
Keratin 8/18a.1 Expression Influences Embryonic Neural Crest Cell Dynamics and Contributes to Postnatal Corneal Regeneration in Zebrafish
2024-09-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171473
PMID:39273043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现角蛋白中间丝基因K8和K18a.1在斑马鱼眼部发育和角膜再生中的重要作用 | 首次揭示K8和K18a.1在斑马鱼神经嵴细胞迁移和角膜再生中的功能,并发现K18a.1受视黄酸调控 | 使用吗啉代寡核苷酸进行基因敲降可能存在脱靶效应,研究主要聚焦于斑马鱼模型 | 探究神经嵴细胞在眼部发育和角膜再生中的分子机制 | 斑马鱼胚胎神经嵴细胞和成年斑马鱼角膜组织 | 发育生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光显微镜, 吗啉代寡核苷酸敲降 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11534 | 2025-10-07 |
circRNAs as Epigenetic Regulators of Integrity in Blood-Brain Barrier Architecture: Mechanisms and Therapeutic Strategies in Multiple Sclerosis
2024-08-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13161316
PMID:39195206
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综述 | 本文综述了环状RNA通过调节血脑屏障完整性在多发性硬化症中的作用机制及治疗策略 | 首次系统阐述circRNAs通过表观遗传调控血脑屏障完整性的机制,为多发性硬化症治疗提供新靶点 | 目前仍处于机制探索阶段,缺乏临床验证数据 | 探讨circRNAs在维持血脑屏障完整性中的作用及其在多发性硬化症治疗中的应用潜力 | 血脑屏障内皮细胞、紧密连接和粘附连接蛋白、环状RNA | 神经科学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11535 | 2025-10-07 |
Regulatory B Cells Expressing Granzyme B from Tolerant Renal Transplant Patients: Highly Differentiated B Cells with a Unique Pathway with a Specific Regulatory Profile and Strong Interactions with Immune System Cells
2024-07-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13151287
PMID:39120317
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肾移植耐受患者中表达颗粒酶B的调节性B细胞特征 | 首次发现肾移植耐受患者中GZMB B细胞是高度分化的B细胞,具有独特的发育轨迹和特异性转录组特征 | 样本量较小(每组3例患者),需要更大规模研究验证 | 确定表达颗粒酶B的调节性B细胞在肾移植耐受患者外周血中是否富集 | 肾移植患者的外周血单个核细胞和体外诱导的GZMB B细胞 | 单细胞组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | 伪时序轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 9例肾移植患者(3例稳定功能,3例药物耐受,3例抗体介导排斥) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11536 | 2025-10-07 |
Transition of signal requirement in hematopoietic stem cell development from hemogenic endothelial cells
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404193121
PMID:39042698
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞从生血内皮细胞发育过程中信号需求的变化 | 首次阐明了干细胞因子和血小板生成素在不同发育阶段对造血干细胞诱导的关键作用,并建立了无血清无饲养层的培养系统 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索造血干细胞从生血内皮细胞发育过程中的信号需求机制 | 小鼠胚胎期的生血内皮细胞、前造血干细胞-I和前造血干细胞-II | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E10.5至E11.5小鼠胚胎的背主动脉及周围组织、胎肝 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11537 | 2025-10-07 |
Markers of Dermal Fibroblast Subpopulations for Viable Cell Isolation via Cell Sorting: A Comprehensive Review
2024-07-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13141206
PMID:39056788
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综述 | 本文全面综述了用于细胞分选的真皮成纤维细胞亚群表面标志物 | 系统分析了3000多篇研究文献,首次全面鉴定和比较了不同成纤维细胞亚群的表面标志物特征 | 基于文献综述,缺乏原始实验验证 | 鉴定适用于细胞分选和功能研究的成纤维细胞表面标志物 | 人体真皮成纤维细胞及其亚群 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 文献数据 | 3000多篇研究文章 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11538 | 2025-10-07 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49565-7
PMID:38898078
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制模式的建立机制及其与基因组不稳定性的关联 | 首次证明晚期复制区域在受精后第一个细胞周期就与B区室和核纤层共同建立,且这种模式先于胚胎基因组激活 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎,在人类胚胎中的直接证据有限 | 探索哺乳动物发育过程中DNA复制程序的建立时机和机制 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 牛和小鼠早期胚胎单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11539 | 2025-10-07 |
LMNA -Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-derived iPSC Differentiation Support Cell type and Lineage-specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.12.598335
PMID:38915555
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC进行单细胞转录组测序,探索LMNA相关扩张型心肌病在心肌细胞和心外膜来源细胞中的基因表达和发育失调机制 | 首次在LMNA单倍体不足背景下,通过单细胞转录组测序分析iPSC分化过程中多种细胞类型的基因表达失调,揭示了细胞类型和谱系特异性的发育异常 | 研究方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 探索LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 携带LMNA剪接位点突变的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),包含110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11540 | 2025-10-07 |
Hyperoxia impairs induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells and drives an atherosclerosis-like transcriptional phenotype
2024, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2024.100193
PMID:38770110
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研究论文 | 本研究探讨高氧条件对诱导多能干细胞来源内皮细胞功能的影响及其与动脉粥样硬化表型的关联 | 首次发现高氧培养的晚期iPSC-ECs会发展为内皮-间质转化表型,且其转录表型与动脉粥样硬化内皮细胞存在重叠 | 生理氧条件虽能改善线粒体功能,但单独使用不足以保持血管生成能力 | 研究不同氧浓度条件下iPSC-ECs的功能特性和分子表型变化 | 诱导多能干细胞来源的内皮细胞 | 干细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |