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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11501 - 11520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11501 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Applied in Plants
2024-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181561
PMID:39329745
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物研究中的应用现状、挑战与未来方向 | 首次系统梳理了scRNA-seq技术在植物科学中的研究进展，并提供了五个有助于识别不同细胞类型标记基因的数据库 | 主要关注模式植物、作物和木材植物，可能未完全覆盖所有植物物种 | 探索scRNA-seq技术在植物研究中的应用潜力 | 植物组织，特别是模式植物、作物和木材 | 植物科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11502 | 2025-10-07 |
Deep Immunoprofiling of Large-Scale Tuberculosis Dataset at Single Cell Resolution Reveals a CD81bright γδ T Cell Population Associated with Latency
2024-09-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181529
PMID:39329713
|
研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序分析揭示了与结核潜伏感染相关的CD81高表达γδ T细胞亚群 | 首次在大规模结核病数据集中通过单细胞分辨率免疫分析发现CD81bright γδ T细胞亚群与潜伏感染相关 | 研究主要关注外周血γδ T细胞，未深入探讨其他免疫细胞类型或组织特异性反应 | 探索γδ T细胞不同亚群在结核病保护性免疫或疾病进展中的作用 | 结核病患者外周血γδ T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 流式细胞数据 | 大规模结核病数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11503 | 2025-10-07 |
Characterizing the Tumor Microenvironment and Its Prognostic Impact in Breast Cancer
2024-09-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181518
PMID:39329702
|
研究论文 | 通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，系统表征乳腺癌肿瘤微环境的免疫景观和细胞间通讯 | 识别了三种不同的免疫浸润患者亚型，发现中等免疫浸润患者预后最佳，并揭示了SPP1和EGF信号通路在低免疫浸润组中的特异性激活 | NA | 研究乳腺癌肿瘤微环境的免疫特征及其预后价值 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11504 | 2025-10-07 |
SPANN: annotating single-cell resolution spatial transcriptome data with scRNA-seq data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad533
PMID:38279647
|
研究论文 | 提出一种名为SPANN的注释方法，用于将单细胞RNA测序数据的细胞类型标签转移到空间转录组数据并发现新型细胞 | SPANN能够自动检测未见细胞类型的新型细胞，同时在已知细胞类型上保持高注释准确性，并通过寻找空间转录组样本与RNA数据原型之间的映射实现细胞类型级别的对齐 | NA | 开发空间转录组数据的注释工具，解决现有方法在细胞类型映射和新细胞检测方面的不足 | 单细胞分辨率空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11505 | 2025-10-07 |
Aberrant c-AMP signalling in richter syndrome revealed by single-cell transcriptome and 3D chromatin analysis
2025-Jan-23, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00723-5
PMID:39849544
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和3D染色质分析揭示Richter综合征中异常的cAMP信号通路 | 首次整合单细胞RNA测序和Hi-C技术分析Richter综合征，揭示染色质重构和cAMP信号异常在疾病转化中的关键作用 | 仅基于单个患者的配对样本进行分析，样本量有限 | 阐明Richter综合征的发病机制 | DLBCL-RS患者的配对样本（CLL和DLBCL细胞） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, Hi-C测序, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据, 3D染色质构象数据 | 超过10,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量染色体构象捕获 | NA | NA |
| 11506 | 2025-10-07 |
Invasive growth of brain metastases is linked to CHI3L1 release from pSTAT3-positive astrocytes
2024-06-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae013
PMID:38271182
|
研究论文 | 本研究揭示了pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过释放CHI3L1促进脑转移瘤侵袭性生长的机制 | 首次发现pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过分泌CHI3L1驱动脑转移瘤的侵袭性生长，并证实STAT3和CHI3L1可作为治疗靶点 | NA | 探究脑转移瘤侵袭模式与pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞的关系及其作为STAT3抑制预测生物标志物的潜力 | 人类脑转移瘤样本、患者来源异种移植模型、小鼠模型、脑切片-肿瘤共培养体系 | 肿瘤学 | 脑转移瘤 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、脑切片-肿瘤共培养实验 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11507 | 2025-10-07 |
Epigenomics-guided precision oncology: Chromatin variants in prostate tumor evolution
2025-Jan-23, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35327
PMID:39853587
|
综述 | 探讨表观基因组异质性在前列腺癌中的作用，重点关注染色质变异如何促进肿瘤进化和治疗抵抗 | 提出染色质变异作为表观基因组异质性的基本单位，强调其在细胞可塑性和治疗抵抗中的关键作用 | NA | 支持精准肿瘤学新时代，利用表观基因组学见解改善前列腺癌患者预后 | 前列腺癌 | 表观基因组学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、液体活检表观基因组分析 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11508 | 2025-10-07 |
The role of MRO as an M2 macrophage-associated gene in non-small cell lung cancer: insights into immune infiltration, prognostic significance, and therapeutic implications
2025-Jan-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01817-8
PMID:39838218
|
研究论文 | 本研究探讨M2巨噬细胞相关基因MRO在非小细胞肺癌中的免疫浸润、预后意义和治疗潜力 | 首次系统揭示MRO基因作为M2巨噬细胞标志物在非小细胞肺癌中的预后价值和免疫治疗预测意义 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证MRO的具体功能机制 | 探索MRO基因在非小细胞肺癌免疫微环境中的作用和临床意义 | 非小细胞肺癌患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, ESTIMATE算法, TIDE分析, Submap分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的非小细胞肺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11509 | 2025-10-07 |
Characterizing the diabetes-induced pathological changes of the mouse lung by single-cell RNA sequencing
2025-Jan-18, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123408
PMID:39832739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术表征糖尿病对小鼠肺部造成的病理变化 | 首次在晚期糖尿病小鼠肺中发现免疫细胞显著增加且主要为未成熟PMN-MDSCs，并揭示了肺泡细胞在糖尿病早期呈现间质表型及免疫功能下降的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病对肺部病理变化的影响机制 | 糖尿病小鼠模型肺组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11510 | 2025-10-07 |
Novel Integration of Spatial and Single-Cell Omics Data Sets Enables Deeper Insights into IPF Pathogenesis
2025-Jan-13, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13010003
PMID:39846634
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据，识别特发性肺纤维化中与疾病相关的细胞类型和潜在治疗靶点 | 创新性地整合空间多组学与单细胞RNA测序数据，并验证了空间蛋白质组学与单细胞RNA测序整合方法的有效性 | NA | 深入理解特发性肺纤维化发病机制，识别与组织病理区域相关的细胞类型 | 人类特发性肺纤维化肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割质谱, 空间蛋白质组学 | Query方法, Overlap方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 11511 | 2025-10-07 |
Galaxy as a gateway to bioinformatics: Multi-Interface Galaxy Hands-on Training Suite (MIGHTS) for scRNA-seq
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae107
PMID:39775842
|
研究论文 | 开发了一个多界面Galaxy实践培训套件(MIGHTS)，用于单细胞RNA测序分析 | 提供并行分析方法，支持图形界面和代码两种操作方式，促进不同编程水平科学家的同步培训 | NA | 解决生物信息学学习曲线陡峭的问题，为生物学家和临床医生提供单细胞分析培训工具 | 生物学家、临床医生和初学生物信息学的研究人员 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Galaxy平台 | Galaxy Training Network，支持Python-based (Scanpy)和R-based (Seurat & Monocle)分析 |
| 11512 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
|
研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集，探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点，提出间充质表型不仅是结构支持特征，更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析，缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11513 | 2025-10-07 |
TRIM44, a Novel Prognostic Marker, Supports the Survival of Proteasome-Resistant Multiple Myeloma Cells
2024-08-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171431
PMID:39273003
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM44在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗抵抗机制 | 首次系统阐明TRIM44通过连接泛素-蛋白酶体系统和自噬途径，支持蛋白酶体抑制剂耐药性骨髓瘤细胞生存的新机制 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要进一步的前瞻性研究验证TRIM44的临床价值 | 探讨TRIM44在多发性骨髓瘤预后和治疗抵抗中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 858例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11514 | 2025-10-07 |
3D-Bioprinted Co-Cultures of Glioblastoma Multiforme and Mesenchymal Stromal Cells Indicate a Role for Perivascular Niche Cells in Shaping Glioma Chemokine Microenvironment
2024-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171404
PMID:39272976
|
研究论文 | 本研究利用3D生物打印技术构建胶质母细胞瘤与间充质基质细胞共培养模型，探索血管周围微环境细胞在塑造胶质瘤趋化因子微环境中的作用 | 首次结合公共测序数据分析和3D生物打印技术，揭示血管周围微环境细胞对胶质母细胞瘤趋化因子谱多样性的关键调控作用 | 研究仅使用两种胶质母细胞瘤细胞系，未涵盖GBM的完整异质性；体外模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究胶质母细胞瘤微环境中不同细胞类型对趋化因子分泌的贡献 | 胶质母细胞瘤细胞系(U-251和DK-MG)和间充质基质细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 3D生物打印，单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 3D共培养模型 | RNA测序数据，分泌组数据 | 两种胶质母细胞瘤细胞系和间充质基质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11515 | 2025-10-07 |
Genome Restructuring around Innate Immune Genes in Monocytes in Alcohol-associated Hepatitis
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.07.607014
PMID:39211112
|
研究论文 | 本研究通过Hi-C技术分析酒精相关性肝炎患者单核细胞的基因组三维结构变化 | 首次在酒精相关性肝炎患者单核细胞中发现基因组三维结构的显著改变，特别是在天然免疫基因簇区域 | 样本量较小（仅4例患者和4例对照），需要更大规模研究验证 | 探究酒精相关性肝炎中单核细胞基因组三维结构变化及其对炎症基因表达的调控 | 酒精相关性肝炎患者和健康对照者的单核细胞 | 基因组学 | 酒精相关性肝炎 | Hi-C, scRNA-seq | NA | 基因组三维构象数据, 单细胞转录组数据 | 4例AH患者和4例健康对照 | NA | 高通量染色质构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11516 | 2025-10-07 |
Negative binomial mixture model for identification of noise in antibody-antigen specificity predictions from single-cell data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae170
PMID:39659592
|
研究论文 | 提出一种使用负二项混合模型对LIBRA-seq单细胞数据进行去噪的方法 | 首次将负二项混合模型应用于LIBRA-seq数据的噪声识别，通过聚类抗原计数为信号和噪声组分 | 方法在不同样本间存在数据规模和噪声结构的变异 | 提高单细胞B细胞受体测序数据中抗体-抗原特异性预测的准确性 | LIBRA-seq单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞B细胞受体测序，LIBRA-seq | 负二项混合模型 | 单细胞测序数据 | 9名供者代表的独立LIBRA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | LIBRA-seq（通过测序连接B细胞受体与抗原特异性） |
| 11517 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates cellular plasticity in esophageal small cell carcinoma following chemotherapy treatment
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1477705
PMID:39850495
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析食管小细胞癌患者化疗前后的细胞可塑性变化 | 首次在单细胞水平揭示食管小细胞癌化疗后的细胞可塑性动态变化及肿瘤微环境组成改变 | 仅基于单个患者的样本分析，样本量有限 | 探究食管小细胞癌化疗后细胞可塑性的分子机制 | 食管小细胞癌患者化疗前后的肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 食管小细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者化疗前后配对的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11518 | 2025-10-07 |
Correlation between circulating innate lymphoid cell precursors and thymic function
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103732
PMID:35118353
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胸腺在先天淋巴细胞池稳态维持中的作用 | 首次发现循环中存在表达细胞内CD3但不表达表面CD3的ILC前体细胞，并证明其分化能力受组织环境和年龄影响 | 未明确胸腺来源ILC前体在整体ILC池中的具体贡献比例 | 探究胸腺对周围组织先天淋巴细胞池稳态的维持作用 | 先天淋巴细胞前体、胸腺功能、不同组织环境 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和无胸腺裸鼠血液及组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11519 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and cytokine signatures in acute myeloid leukemia: A novel prognostic model
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102194
PMID:39689517
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病的细胞异质性，并基于细胞因子相关基因构建预后风险评分模型 | 首次基于7个关键细胞因子相关基因(CCL23, IL2RA, IL3RA, IL6R, INHBA, TNFSF15, TNFSF18)构建AML预后风险模型，揭示了风险组间免疫细胞浸润和细胞因子信号传导的显著差异 | 使用公开数据集，缺乏前瞻性临床验证 | 开发急性髓系白血病的精准预后评估工具 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据 | 多个独立AML患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11520 | 2025-10-07 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
|
研究论文 | 提出基于Kolmogorov-Arnold网络的KanCell深度学习模型，通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据来增强细胞异质性分析 | 利用KAN网络有效捕捉非线性关系并优化计算效率，在多种评估指标上优于现有方法 | NA | 开发整合单细胞和空间转录组数据的计算模型以解析细胞异质性 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、背外侧前额叶皮层和小鼠胚胎大脑 | 计算生物学 | 多种癌症（黑色素瘤、乳腺癌） | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | KAN（Kolmogorov-Arnold网络） | 基因表达数据 | 模拟和真实数据集（来自STARmap、Slide-seq、Visium和Spatial Transcriptomics平台） | 10x Genomics, 其他（STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics） | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Visium, 其他（STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics） | 10x Visium空间转录组平台及其他空间转录组技术 |