单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 11481 - 11500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11481 | 2024-08-04 |
The Fibroblast Landscape in Stomach Carcinogenesis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.001
PMID:38342299
|
评论 | 本文总结和讨论了近年来关于人类胃中成纤维细胞组分从正常到化生、异型增生和癌症的研究。 | 本文创新点在于强调了成纤维细胞群体在胃癌发生过程中的异质性和可塑性，尤其是在化生和异型增生中的变化。 | 本文为综述，可能未包含某些最新的研究进展。 | 研究胃癌发生过程中成纤维细胞的组分和特征。 | 研究对象为人类胃中不同阶段（正常、化生、异型增生和癌症）的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11482 | 2024-08-04 |
Multi-omic profiling of breast tumor microenvironment uncovers a role of mitochondrial calcium gatekeepers
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95979
PMID:38911376
|
研究论文 | 本研究旨在阐明线粒体钙摄取1/2（MiCU1/2）在乳腺癌中的作用 | 采用针对整个肿瘤组织、单细胞和空间转录组分析的新型网络应用，发掘MiCU1/2与肿瘤免疫微环境之间的关联 | NA | 探讨MiCU1/2作为乳腺癌的独立诊断生物标志物及其预后预测的潜力 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 涉及乳腺癌患者的肿瘤样本 |
| 11483 | 2024-08-05 |
Mussel inspired 3D elastomer enabled rapid calvarial bone regeneration through recruiting more osteoprogenitors from the dura mater
2024, Regenerative biomaterials
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/rb/rbae059
PMID:38911700
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研究论文 | 该研究开发了一种3D弹性体，促进了颅骨缺损的再生。 | 首次揭示了硬脑膜细胞与巨噬细胞之间的相互作用对颅骨全层修复的关键作用。 | 研究中未提及样本数量和临床试验情况，可能影响结果的广泛适用性。 | 探索新材料在颅骨再生中的应用及其机制。 | 主要研究硬脑膜细胞和巨噬细胞在颅骨愈合中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D弹性体 | 生物材料实验数据 | 8mm颅骨缺损模型 |
| 11484 | 2024-08-05 |
A review on gene regulatory network reconstruction algorithms based on single cell RNA sequencing
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01473-8
PMID:38032470
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综述 | 本文综述了15种基于单细胞RNA测序的基因调控网络重建工具及其优缺点 | 强调了单细胞RNA测序技术的进步如何促进了基因调控网络的重建 | 未能提供对所有GRN重建工具的深入验证 | 介绍不同的基因调控网络重建工具及其在单细胞RNA测序中的应用 | 15种基因调控网络重建工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11485 | 2024-08-05 |
Demultiplexing of single-cell RNA-sequencing data using interindividual variation in gene expression
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae085
PMID:38911824
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研究论文 | 本文描述了一种新颖的计算方法表达意识解混（EAD），用于利用个体间基因表达的差异性进行单细胞RNA测序的数据解混。 | 提出了表达意识解混（EAD），该方法无额外实验步骤地利用个体间差异的共表达模式进行解混。 | 在文章中没有提到具体的局限性。 | 研究如何利用个体间基因表达变异提高单细胞RNA测序的解混精度。 | 研究对象包括六只同种系近交小鼠的样本及来自脓毒症和健康个体的样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 样本数据 | 使用了30个来自脓毒症和健康个体的样本 |
| 11486 | 2024-08-05 |
Development and validation of matrix metalloproteinase for predicting prognosis and tumour microenvironment immune profiles in uterine corpus endometrial carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.91277
PMID:38911387
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研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶（MMP）在预测子宫体癌患者预后和肿瘤微环境免疫特征中的应用 | 文章创新性在于构建了MMP评分系统，能够有效预测子宫内膜癌患者的预后与肿瘤微环境的免疫细胞浸润 | 尽管低MMP评分组患者预后较差，但对免疫治疗的反应更好，这一结论需要更深入的临床验证 | 研究的目的是评估MMP表达模式对子宫内膜癌预后的影响 | 研究对象为子宫内膜癌患者及其MMP相关的表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 子宫癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA） | 基因表达数据 | NA |
| 11487 | 2024-08-05 |
Identification Of Endothelial Cell Immune-related Gene Signature for Lung Adenocarcinoma by Integrated Analysis of Single-cell and Bulk RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94501
PMID:38911372
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研究论文 | 本研究旨在探讨内皮细胞免疫相关基因在肺腺癌（LUAD）中的预后价值，并提供进一步见解 | 通过整合单细胞和大规模RNA测序数据，构建了新的预后模型和预后标志，发展了针对LUAD患者的个性化治疗方向 | 研究的模型和标志还需要在更广泛的人群中进一步验证 | 研究内皮细胞免疫相关基因在肺腺癌中的作用及其预后价值 | 肺腺癌患者及其相关的内皮细胞免疫相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和大规模RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 分析了来自GEO数据库的单细胞RNA测序样本和来自TCGA的批量RNA测序数据 |
| 11488 | 2024-08-05 |
Ligament injury in adult zebrafish triggers ECM remodeling and cell dedifferentiation for scar-free regeneration
2023-Sep-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00329-9
PMID:37726321
|
研究论文 | 这项研究揭示了成年斑马鱼韧带在损伤后的无疤痕再生能力 | 建立了一个新的成年无疤痕韧带再生模型，强调了免疫和间充质细胞相互作用在细胞外基质重塑中的作用 | 尚未明确不同免疫细胞在再生过程中的具体功能 | 研究成年斑马鱼韧带受伤后的再生机制 | 成年斑马鱼的韧带组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | 斑马鱼数目未具体提及 |
| 11489 | 2024-08-04 |
Identification of ulcerative colitis-specific immune cell signatures from public single-cell RNA-seq data
2023-07, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01390-w
PMID:37133723
|
研究论文 | 本研究利用公共单细胞RNA-seq数据研究溃疡性结肠炎的组织微环境 | 研究揭示了溃疡性结肠炎特异性的免疫细胞标志，并探讨了不同免疫细胞间的相互作用 | 未提及所有数据集的细胞类型注释，可能影响细胞群体的选择 | 研究溃疡性结肠炎的组织微环境及其免疫细胞机制 | 溃疡性结肠炎患者的免疫细胞亚群 | 数字病理 | 肠道炎症 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本量未具体说明 |
| 11490 | 2024-08-05 |
Peripheral Ischemia Imprints Epigenetic Changes in Hematopoietic Stem Cells to Propagate Inflammation and Atherosclerosis
2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318956
PMID:36891902
|
研究论文 | 本研究探讨了外周缺血对造血干细胞的表观遗传变化及其在炎症和动脉粥样硬化中的作用 | 揭示了外周缺血后HSPC的迁移和增殖增加，并确认了IL-3Rb和IL-1R1在炎症和动脉粥样硬化加剧中的关键作用 | 未详细阐明外周动脉疾病患者炎症加剧的具体机制 | 研究外周缺血如何影响造血干细胞及其在慢性炎症和动脉粥样硬化中的潜在作用 | 使用外周动脉疾病患者的外周血和不同饮食条件下的啮齿类动物 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | RNA测序，流式细胞术 | Apoe-/-小鼠，C57BL/6J小鼠 | 血液样本，骨髓样本 | 外周动脉疾病患者的样本和数个小鼠模型 |
| 11491 | 2024-08-04 |
Investigating the Role of Ferroptosis-Related Genes in Ovarian Aging and the Potential for Nutritional Intervention
2023-05-25, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu15112461
PMID:37299424
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡相关基因对卵巢衰老的影响及营养干预的潜力 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序研究铁死亡与卵巢衰老的关系 | 缺乏广泛的样本数据支持和长期效果评估 | 探讨铁死亡相关基因在卵巢衰老中的作用及营养补充的效果 | 75名卵巢衰老不足患者 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 75名患者 |
| 11492 | 2024-08-05 |
Reconstructing codependent cellular cross-talk in lung adenocarcinoma using REMI
2022-Mar-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi4757
PMID:35302849
|
研究论文 | 本研究提出REMI，一个图形算法，通过考虑配体-受体依赖性来重建肺腺癌中的细胞交互作用 | 提出了一种新型算法REMI，能够处理高维小样本数据集并考虑配体-受体交互之间的依赖性 | 当前方法依赖于小样本数据，可能在推广性和准确性上存在限制 | 研究细胞交互作用在肺腺癌中的重建，以识别与临床相关的交互 | 关注人类肺腺癌（LUAD）的配体-受体交互作用及其在肿瘤-基质-免疫亚群中的前景特征 | 计算机视觉 | 肺癌 | RNA测序 | 图算法 | 转录组数据 | 使用了来自流式分选的RNA测序数据集和单细胞转录组数据 |
| 11493 | 2024-08-05 |
Sensory Neuron Diversity in the Inner Ear Is Shaped by Activity
2018-08-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.07.007
PMID:30078709
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研究论文 | 这篇文章探讨了内耳感觉神经元的多样性及其被活动影响的机制 | 通过单细胞RNA测序，提出了一种小鼠I型螺旋神经节神经元的分子分类，并揭示了其在听觉处理中意想不到的活跃角色 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于其他物种 | 研究I型螺旋神经节神经元的特征与多样性的起源 | 小鼠的类型I螺旋神经节神经元 | 数字病理学 | 先天性耳聋 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子数据 | 小鼠模型的多种类型I螺旋神经节神经元 |
| 11494 | 2024-08-05 |
A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes
2018-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0393-7
PMID:30069044
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研究论文 | 本文研究了小鼠气管上皮的细胞组成和层次结构，识别了稀有的Foxi1肺离子细胞等细胞类型 | 提出了'脉冲-seq'技术，结合单细胞RNA测序和谱系追踪，揭示了气道细胞的新陈代谢模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全代表人类气道病理 | 探讨哮喘和囊性纤维化中气道上皮的细胞组成及其在疾病中的作用 | 对小鼠气管上皮细胞进行单细胞RNA测序和谱系追踪 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | NA |
| 11495 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of early progenitor cells that build coronary arteries
2018-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0288-7
PMID:29973725
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和小鼠遗传学展示了发育心脏中的静脉细胞如何经过早期细胞命运转换，形成构建冠状动脉的前动脉细胞群。 | 揭示了静脉细胞如何在发育过程中转变为前动脉细胞，并阐明了COUP-TF2对这一过程的抑制作用 | 未提及特定的限制性因素 | 研究冠状动脉的发育机制与静脉细胞的转变 | 静脉细胞和前动脉细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | NA |
| 11496 | 2024-08-05 |
High-Throughput Screening Enhances Kidney Organoid Differentiation from Human Pluripotent Stem Cells and Enables Automated Multidimensional Phenotyping
2018-Jun-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.04.022
PMID:29779890
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研究论文 | 本文提出了一种全自动化的高通量筛选平台，用于增强人类肾脏类器官的分化和表型分析 | 开发了一个完全自动化且兼容高通量筛选的系统，能够在21天内实现从培养到分析的全流程自动化 | 未提及任何特定的限制 | 研究人类肾脏类器官的分化和多维表型筛选 | 人类诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾囊性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 11497 | 2024-08-05 |
Melatonin improves mouse oocyte quality from 2-ethylhexyl diphenyl phosphate-induced toxicity by enhancing mitochondrial function
2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116559
PMID:38865937
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研究论文 | 本研究探讨了2-乙基己基二苯酸酯对小鼠卵母细胞质量的影响，并评估了褪黑激素的保护作用 | 揭示了2-乙基己基二苯磷酸酯在小鼠卵母细胞上的毒性机制，并显示褪黑激素能够部分恢复卵母细胞的成熟能力 | 该研究主要针对小鼠卵母细胞，可能无法直接推广到其他物种或临床应用 | 研究2-乙基己基二苯磷酸酯对小鼠卵母细胞的影响及其潜在修复机制 | 小鼠卵母细胞及其在体外培养中的成熟情况 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 11498 | 2024-08-04 |
Targeting ESE3/EHF With Nifurtimox Inhibits CXCR2+ Neutrophil Infiltration and Overcomes Pancreatic Cancer Resistance to Chemotherapy and Immunotherapy
2024-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.02.046
PMID:38492894
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研究论文 | 本研究探讨了EHF在胰腺癌化疗和免疫治疗中的作用，以及Nifurtimox的治疗潜力 | 提出了EHF在CXCR2+中性粒细胞招募中的重要作用，及其对化疗和免疫治疗敏感性的影响 | 未提及具体的临床试验结果或长期效果评估 | 识别新的靶点和化合物以克服胰腺癌的治疗抵抗 | 采用小鼠模型及基因组和单细胞分析研究CXCR2+中性粒细胞招募 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因组单核苷酸多态性测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | KPC小鼠、Ehf敲除小鼠及人源化小鼠 | 基因组数据、细胞分型数据 | 多种小鼠模型，具体样本数量未披露 |
| 11499 | 2024-08-04 |
Radiofrequency radiation reshapes tumor immune microenvironment into antitumor phenotype in pulmonary metastatic melanoma by inducing active transformation of tumor-infiltrating CD8+ T and NK cells
2024-Jul, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01260-5
PMID:38538718
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研究论文 | 这篇文章研究了射频辐射如何重塑肺部转移性黑色素瘤的肿瘤免疫微环境 | 该研究首次表明非侵入性射频辐射通过活化肿瘤浸润CD8+ T细胞和NK细胞，诱导抗肿瘤表型的重塑 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨非侵入性射频辐射对肿瘤进展和肿瘤免疫微环境表型的影响 | 建立了肺部转移性黑色素瘤的小鼠模型，以研究肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部转移性黑色素瘤 | RNA-seq | NA | RNA数据 | B16F10细胞注射的小鼠模型 |
| 11500 | 2024-08-05 |
Microcirculatory disturbance in acute liver injury is triggered by IFNγ-CD40 axis
2024-Jun-21, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-024-00387-w
PMID:38907339
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研究论文 | 文章分析了急性肝损伤中IFNγ-CD40轴引发的微循环障碍的分子机制 | 首次揭示了IFNγ-CD40轴在急性肝损伤微循环障碍中的关键作用 | 研究仅限于单中心的回顾性分析，结果可能有限于特定人群和模型 | 探讨急性肝损伤的发病机制及其与微循环障碍的关系 | 急性肝损伤患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | Con A诱导的小鼠模型 | 血液样本、肝脏组织 | 120名急性肝损伤患者 |