单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 11461 - 11480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11461 | 2024-08-04 |
TGFβ-Responsive Stromal Activation Occurs Early in Serrated Colorectal Carcinogenesis
2024-Apr-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094626
PMID:38731846
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研究论文 | 该研究揭示了TGFβ激活的基质在锯齿状结直肠癌发生中的作用 | 文章提出了TGFβ依赖的基质激活在锯齿状肿瘤发生早期的关系 | 未提及具体的实验验证或临床相关性 | 阐明TGFβ激活的基质在锯齿状癌发生中的贡献 | 研究对象为39个结直肠癌样本和12个大规模转录组样本，分析其基质细胞的转录特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39个结直肠癌样本和2014个其他样本 |
| 11462 | 2024-08-05 |
Changes in seminal plasma microecological dynamics and the mechanistic impact of core metabolite hexadecanamide in asthenozoospermia patients
2024-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.166
PMID:38882497
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研究论文 | 本研究探讨了在精液微生态动态变化中核心代谢物十六烷酰胺对弱精子症患者的影响 | 揭示了精液中六种微生物属与核心代谢物十六烷酰胺之间的显著关联，及其提高精子活力的潜力 | 尚未清楚微生态与男性不育的直接关系 | 研究精液微生态动态与弱精子症之间的关系 | 弱精子症患者，分为正常、轻度、中度和重度四组 | 数字病理学 | 男性不育症 | 16S rDNA测序和多组学分析 | NA | 精液样本 | 四组弱精子症患者，具体样本量未提及 |
| 11463 | 2024-08-04 |
Preliminary Analysis of Aging-Related Genes in Intracerebral Hemorrhage by Integration of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Technology
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S457480
PMID:38883702
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研究论文 | 本研究旨在识别与脑内出血相关的潜在老龄化相关基因。 | 识别了24个特定于脑内出血的老龄化相关基因，提供了老龄化影响脑内出血机制的新见解。 | 样本量较小，分析结果可能限制于特定数据集。 | 探索老龄化在脑内出血发病机制中的作用。 | 四例脑内出血患者的周围血肿组织样本。 | 数字病理学 | 脑内出血 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名脑内出血患者的样本 |
| 11464 | 2024-08-05 |
Expression and clinical significance of interleukin-6 pathway in cholangiocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374967
PMID:38881895
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研究论文 | 本研究探讨了IL-6通路在胆管癌中的表达及其临床意义 | 本研究首次揭示了IL-6通路在胆管癌肿瘤微环境中的表达特征及其与预后的相关性 | 未发现基因表达与总体生存率及无病生存率直接相关，但关系的进一步机制尚需探讨 | 研究IL-6通路在胆管癌中的潜在预后价值 | 胆管癌组织微阵列中的IL-6及相关分子的表达 | 数字病理学 | 胆管癌 | 多重免疫荧光 | NA | 组织样本 | NA |
| 11465 | 2024-08-05 |
Identification of an 11-miRNA-regulated and surface-protein genes signature predicts the prognosis of lung adenocarcinoma based on multi-omics study
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CWMT4815
PMID:38883394
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研究论文 | 本研究开发了一种基于11个miRNA调控的表面蛋白基因的风险评分系统，以预测肺腺癌的预后 | 研究首次结合多组学分析，识别出与肺腺癌预后相关的特定miRNA及基因 | 研究结果可能受限于样本的选择和外部验证的准确性 | 改善肺腺癌患者的预后评估工具 | 聚焦于肺腺癌相关的miRNA和表面蛋白基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据进行验证 |
| 11466 | 2024-08-04 |
Comparative Analysis of Single-cell and Single-nucleus RNA-sequencing in a Rabbit Model of Retinal Detachment-related Proliferative Vitreoretinopathy
2023-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2023.100335
PMID:37496518
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研究论文 | 本研究比较了兔子模型中与视网膜脱离相关的增生性玻璃体视网膜病的单细胞和单核RNA测序 | 创新点在于结合使用单细胞RNA测序和单核RNA测序，以更准确地识别与增生性玻璃体视网膜病相关的转录网络 | 两种RNA测序技术的局限性均被强调，特别是在细胞类型捕获率方面 | 研究增生性玻璃体视网膜病的发病机制 | 使用兔子模型诱导的单侧增生性玻璃体视网膜病变 | 数字病理学 | 增生性玻璃体视网膜病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 兔子眼睛的增生性玻璃体视网膜病样本及对侧眼作为对照 |
| 11467 | 2024-08-04 |
Proteostasis governs differential temperature sensitivity across embryonic cell types
2023-11-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.10.013
PMID:37949057
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研究论文 | 本文研究了不同胚胎细胞类型对温度敏感性的差异 | 首次使用全动物单细胞RNA测序识别驱动表型变异的细胞类型和分子程序 | 目前未探讨其他环境压力对胚胎发育的影响 | 探究温度压力对胚胎细胞类型的影响及其敏感性的基础 | 研究斑马鱼胚胎在温度压力下的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 数百个斑马鱼胚胎 |
| 11468 | 2024-08-05 |
People critically ill with COVID-19 exhibit peripheral immune profiles predictive of mortality and reflective of SARS-CoV-2 lung viral burden
2021-12-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100476
PMID:34873589
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研究论文 | 本文研究了COVID-19重症患者的外周免疫状态与死亡率之间的关联 | 采用单细胞RNA测序对免疫状态进行高维剖析，揭示了与COVID-19死亡率相关的细胞分子特征 | 可能未能考虑所有潜在的免疫细胞状态和不同的临床变量 | 旨在阐明重症COVID-19患者的免疫细胞状态与死亡的关系 | 重症COVID-19患者的血液和呼吸样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 血液和呼吸样本 | 重症COVID-19患者的高维样本 |
| 11469 | 2024-08-05 |
A biomechanical switch regulates the transition towards homeostasis in oesophageal epithelium
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00679-w
PMID:33972733
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研究论文 | 这篇文章探讨了机械应力如何调节食管上皮向稳态过渡的机制 | 揭示了机械应力对KLF4细胞群体的影响，从而平衡细胞增殖并标志着稳态的过渡 | 目前尚未完全了解调控细胞决策的所有过程 | 研究食管上皮细胞在后出生阶段如何响应机械应力以达到稳态 | 小鼠食管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 11470 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of the immune microenvironment in pediatric acute leukemia
2024-Aug-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217018
PMID:38844062
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研究论文 | 该文章对儿童急性白血病的免疫微环境进行了单细胞转录组分析 | 揭示了不同T细胞亚群与急性髓性白血病（AML）进展和复发相关的特定功能表达程序，并识别了潜在的免疫治疗靶点 | 文章未提到样本的地理分布和数量限制 | 深入分析儿童白血病中的肿瘤微环境以改善免疫治疗的有效性 | 主要研究儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）和急性髓性白血病（AML）患者的骨髓来源T细胞 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 儿童B-ALL和AML患者的样本，具体数量未提及 |
| 11471 | 2024-08-04 |
Deconvoluting multi-person biological mixtures and accurate characterization and identification of separated contributors using non-targeted single-cell DNA sequencing
2024-Jul, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2024.103030
PMID:38513339
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研究论文 | 本文探讨了如何利用非靶向单细胞DNA测序解决多个人生物混合物的去卷积及个体特征鉴定问题 | 首次应用非靶向单细胞DNA测序(scDNA-seq)结合scATAC-seq技术，克服了RNA降解及测序限制，实现复杂血液混合物的去卷积和个体鉴定 | RNA易降解可能导致信息丢失，且基于RNA的测序限制了可用于基因混合物去卷积的单核苷酸多态性(SNP)数量 | 研究如何在法医学背景下实现多个人混合物的去卷积及个体识别 | 涉及多达五个个体的复杂血液混合物，及来源多样的个体特征 | 数字病理学 | NA | 非靶向单细胞DNA测序（scDNA-seq） | NA | 基因数据 | 涉及最多11个个体的高度复杂混合物和包含20个细胞的平衡及不平衡混合物 |
| 11472 | 2024-08-05 |
CellMarkerPipe: cell marker identification and evaluation pipeline in single cell transcriptomes
2024-06-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63492-z
PMID:38849445
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研究论文 | 提出了一种自动化细胞类型特异性标记基因识别和评估的平台CellMarkerPipe | 开发了一个统一的计算平台，能够自动识别和评估标记基因，提高效率 | 具体局限性未在摘要中体现 | 旨在简化单细胞转录组数据中细胞标记基因的识别和评估过程 | 涉及多种样本的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 多种样本 |
| 11473 | 2024-08-04 |
A single-cell and spatial RNA-seq database for Alzheimer's disease (ssREAD)
2024-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49133-z
PMID:38844475
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研究论文 | 本研究介绍了一个针对阿尔茨海默病的单细胞和空间RNA测序数据库(ssREAD) | 该数据库提供了更广泛的AD相关数据集，优化的分析流程和更高的可用性 | NA | 开发一个全面且用户友好的阿尔茨海默病单细胞和空间RNA-seq数据库 | 包含来自67个AD相关的scRNA-seq和snRNA-seq研究的1,053个样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, snRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 细胞数据, 数据集 | 1,053个样本，包括277个整合数据集，涉及7,332,202个细胞 |
| 11474 | 2024-08-04 |
Unravelling the metabolic landscape of cutaneous melanoma: Insights from single-cell sequencing analysis and machine learning for prognostic assessment of lactate metabolism
2024-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15119
PMID:38881438
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研究论文 | 本文全面探讨了乳酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的潜在预后作用 | 该研究利用单细胞测序和机器学习构建了乳酸代谢的预后模型，并验证了关键基因NDUFS7的生物学功能 | 样本量和 cohorts 的多样性可能限制了模型的普适性 | 旨在评估乳酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值 | 涉及的研究对象为皮肤黑色素瘤患者的肿瘤组织样本 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，机器学习 | NA | 转录组数据 | 多个 cohort，具体样本量未提及 |
| 11475 | 2024-08-05 |
TGF-β signalling limits effector function capacity of NK cell anti-tumour immunity in human bladder cancer
2024-Jun, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105176
PMID:38810560
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号如何限制NK细胞在膀胱癌中的抗肿瘤免疫功能 | 本研究揭示了TGF-β信号通路通过下调CD16抑制NK细胞介导的抗体依赖性细胞毒性（ADCC）机制 | 本研究的局限性在于仅使用了一种小鼠模型，可能无法全面反映人类膀胱癌中的所有免疫机制 | 研究TGF-β信号在膀胱癌中对NK细胞功能的影响 | 膀胱癌患者中的肿瘤浸润性NK细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和高维流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 11476 | 2024-08-05 |
Ketogenic diet modifies ribosomal protein dysregulation in KMT2D Kabuki syndrome
2024-Jun, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105156
PMID:38768529
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研究论文 | 本研究探讨了生酮饮食如何改变KMT2D卡布基综合症中的核糖体蛋白功能失调 | 本研究首次揭示了赖氨酸甲基转移酶缺陷与核糖体蛋白功能障碍之间的关联，并展示了生酮饮食对改善认知功能的潜在影响 | 样本量较小，仅涉及八名参与者，可能影响结果的普适性 | 研究生酮饮食对KMT2D卡布基综合症相关的分子机制和临床结果的影响 | 对4名卡布基综合症患者与4名对照组进行比较分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质数据 | 8名参与者（4名卡布基综合症患者和4名对照组） |
| 11477 | 2024-08-04 |
A Single-cell and Spatial RNA-seq Database for Alzheimer's Disease (ssREAD)
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.08.556944
PMID:37745592
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研究论文 | 本文介绍了针对阿尔茨海默病的单细胞与空间RNA测序数据库ssREAD | 创建了一个用户友好的数据库，整合了广泛的阿尔茨海默病相关数据集，并优化了分析流程 | NA | 建立一个全面的数据库以满足阿尔茨海默病相关数据管理和分析需求 | 阿尔茨海默病相关的单细胞RNA测序和空间转录组研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | 细胞数据集 | 1,053个样本（277个整合数据集），共计7,332,202个细胞和381个空间转录组数据集 |
| 11478 | 2024-08-04 |
Digital pathology and spatial omics in steatohepatitis: Clinical applications and discovery potentials
2024-Mar-22, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000866
PMID:38517078
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review | 本文回顾了数字病理学和空间组学在脂肪肝炎中的临床应用和发现潜力 | 文章创新点在于探讨了利用人工智能增强的数字病理学和空间组学方法，如何提高脂肪肝炎组织学解读的准确性 | 文章指出现有空间转录组学和蛋白组学技术的局限性，以及对这些工具和技术的知识空白 | 研究旨在探讨数字病理学与空间生物学的多模式整合对改善脂肪肝炎组织学解读的潜力 | 研究对象是肝病患者的组织样本，特别是与脂肪肝炎相关的组织切片 | 数字病理学 | 脂肪肝炎 | 数字病理学，空间转录组学，空间蛋白组学 | 人工智能算法，机器学习算法 | 图像，基因和蛋白表达数据 | NA |
| 11479 | 2024-08-05 |
cellMarkerPipe: Cell Marker Identification and Evaluation Pipeline in Single Cell Transcriptomes
2024-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3844718/v1
PMID:38313296
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研究论文 | 开发了一种名为cellMarkerPipe的计算平台，用于自动化识别和评估单细胞转录组中的细胞特征基因 | 提出了一种集成常用工具的统一计算平台，提升了细胞标记基因的识别和评估效率 | 在摘要中没有提到具体的局限性 | 优化单细胞转录组数据中细胞特征基因的识别和系统评估过程 | scRNA-seq数据中的细胞类型特异性标记基因 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 多样本的严格测试 |
| 11480 | 2024-08-04 |
Deciphering the Immune Microenvironment at the Forefront of Tumor Aggressiveness by Constructing a Regulatory Network with Single-Cell and Spatial Transcriptomic Data
2024-01-15, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15010100
PMID:38254989
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组数据解析肿瘤侵袭前沿的免疫微环境 | 开发了构建细胞间基因调控网络的软件管道，提高了细胞通信信号选择的可靠性 | 可能存在样本异质性对结果的影响 | 探索肿瘤微环境中恶性细胞的调控关系及其在疾病进展中的作用 | ER阳性乳腺癌患者的恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST） | NA | 基因表达数据 | ER阳性乳腺癌患者的多个样本 |