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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11461 | 2025-10-07 |
Elucidating cardiomyocyte heterogeneity and maturation dynamics through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111596
PMID:39811652
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学揭示心肌细胞的异质性和成熟动态 | 识别了过渡性心肌细胞亚群,揭示了连续而非离散的成熟轨迹,并阐明了心肌细胞发育的空间组织 | 仅使用新生小鼠心脏细胞,未涉及其他发育阶段或物种 | 解析心肌细胞异质性及其在心脏发育中的动态变化 | 新生小鼠心脏中的心肌细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 新生小鼠心脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
11462 | 2024-11-30 |
Dissecting the effect of genetic variants on atherosclerosis: integrating bulk and single-cell transcriptomics
2025-Jan-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae489
PMID:39607792
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11463 | 2025-10-07 |
Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis
2025-Jan-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123315
PMID:39675550
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研究论文 | 本研究通过平滑肌细胞特异性CD47基因敲除揭示了TSP1-CD47信号通路在调控血管平滑肌细胞表型和动脉粥样硬化发展中的关键作用 | 首次发现CD47在动脉粥样硬化动脉中表型调制的平滑肌细胞内表达上调,且平滑肌细胞特异性CD47缺失能抑制动脉粥样硬化 | 未观察到体重增加、肝脏和脂肪组织质量、血浆总胆固醇及空腹血糖的显著差异 | 探究平滑肌细胞CD47在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、小鼠模型、人类动脉粥样硬化血管组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、基因敲除、体外细胞实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织切片图像、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11464 | 2025-10-07 |
Elucidating stearoyl metabolism and NCOA4-mediated ferroptosis in gastric cancer liver metastasis through multi-omics single-cell integrative mendelian analysis: advancing personalized immunotherapy strategies
2025-Jan-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01769-z
PMID:39812999
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研究论文 | 通过多组学单细胞整合孟德尔分析阐明硬脂酰代谢和NCOA4介导的铁死亡在胃癌肝转移中的作用 | 首次整合孟德尔随机化、批量转录组分析和单细胞多组学技术揭示硬脂酰代谢通过铁死亡途径促进胃癌肝转移的机制 | NA | 探究硬脂酰代谢在胃癌肝转移肿瘤微环境异质性中的作用机制 | 胃癌肝转移患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 批量转录组分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
11465 | 2025-10-07 |
BMP6, a potential biomarker of inflammatory fibrosis and promising protective factor for dilated cardiomyopathy
2025-Jan-15, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01062-9
PMID:39825396
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现BMP6是扩张型心肌病的潜在生物标志物和抗纤维化保护因子 | 首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析相结合的方法,鉴定出BMP6在DCM中的特异性表达及其保护作用机制 | NA | 鉴定扩张型心肌病心力衰竭的潜在特异性标志物和干预靶点 | 扩张型心肌病患者心脏组织、动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 孟德尔随机化分析, 动物模型构建, BMP6敲低 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11466 | 2025-10-07 |
A comprehensive analysis to reveal the underlying molecular mechanisms of natural killer cell in thyroid carcinoma based on single-cell RNA sequencing data
2025-Jan-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01779-x
PMID:39808350
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据揭示自然杀伤细胞在甲状腺癌中的分子机制 | 首次整合limma、WGCNA和singleR分析方法系统鉴定甲状腺癌中NK细胞相关枢纽基因,并构建mRNA-miRNA-lncRNA调控网络 | 仅从公共数据库获取数据,缺乏实验验证;KEGG富集分析仅获得两条信号通路 | 探索甲状腺癌中自然杀伤细胞的分子机制以改善疾病管理和治疗 | 甲状腺癌组织和癌旁组织中的自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | limma, WGCNA, singleR, Pearson相关分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11467 | 2025-10-07 |
Predictive value of dendritic cell-related genes for prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025-Jan-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03642-z
PMID:39810206
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研究论文 | 本研究通过筛选树突状细胞相关基因构建预后特征模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 创新性地建立了基于深度学习的预测模型DCRGS,结合单细胞RNA测序和机器学习算法筛选树突状细胞相关基因 | NA | 开发预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, 机器学习算法 | Coxboost, 随机生存森林, 深度学习 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11468 | 2025-10-07 |
Differential impact of TIM-3 ligands on NK cell function
2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010618
PMID:39773563
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研究论文 | 本研究探讨了四种TIM-3配体对头颈鳞状细胞癌患者自然杀伤细胞功能的差异性影响 | 首次系统比较四种TIM-3配体对NK细胞功能的差异性调控,并确定半乳糖凝集素-9是最具免疫抑制作用的配体 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本来源局限于头颈鳞状细胞癌患者 | 评估TIM-3+ NK细胞在头颈鳞癌中的功能特性,确定不同TIM-3配体的免疫调节作用 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和血液样本中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外杀伤实验,细胞增殖检测,细胞因子分析,数字空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11469 | 2025-10-07 |
Chemotherapy-induced cellular senescence promotes stemness of aggressive B-cell non-Hodgkin's lymphoma via CCR7/ARHGAP18/IKBα signaling activation
2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009356
PMID:39773566
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研究论文 | 本研究揭示了化疗诱导的细胞衰老通过CCR7/ARHGAP18/IKBα信号通路促进侵袭性B细胞非霍奇金淋巴瘤干性特征的机制 | 首次发现化疗诱导衰老的B-NHL细胞中CCR7高表达记忆B细胞群体,并阐明CCR7/ARHGAP18/IKBα信号轴在促进淋巴瘤干性中的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步的体内实验验证;样本量有限 | 探究化疗诱导的细胞衰老如何促进B细胞非霍奇金淋巴瘤的干性特征和化疗耐药 | 侵袭性B细胞非霍奇金淋巴瘤细胞系(Raji和SU-DHL-2)及患者样本 | 癌症生物学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,流式细胞术,免疫荧光,western blot,免疫共沉淀,细胞增殖检测,衰老相关β-半乳糖苷酶染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据,细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11470 | 2025-10-07 |
Disruption of tumor-intrinsic PGAM5 increases anti-PD-1 efficacy through the CCL2 signaling pathway
2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009993
PMID:39773565
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研究论文 | 本研究探讨肿瘤内在PGAM5通过调控线粒体动态影响肿瘤微环境中免疫细胞浸润及免疫治疗疗效的机制 | 首次揭示PGAM5通过调控线粒体分裂-融合平衡影响mtDNA应激和CCL2信号通路,进而调节肿瘤相关巨噬细胞极化和抗PD-1疗效的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 探索肿瘤内在PGAM5作为肝细胞癌免疫治疗增敏靶点的潜力 | 肝细胞癌患者样本、小鼠肝癌模型、肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、蛋白质组学、免疫荧光、染色质免疫沉淀、ELISA、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 两个独立队列的肿瘤组织芯片、TCGA-LIHC和GEO数据库、皮下和原位小鼠肝癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11471 | 2025-10-07 |
Targeting the NLRP3 inflammasome abrogates cardiotoxicity of immune checkpoint blockers
2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010127
PMID:39773567
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研究论文 | 本研究通过抑制NLRP3炎症小体活性,成功减轻了免疫检查点抑制剂引发的心脏毒性并同时增强抗肿瘤免疫 | 首次证明NLRP3抑制剂MCC950能够同时解决免疫检查点抑制剂的心脏毒性和抗肿瘤效果之间的矛盾 | 研究仅在黑色素瘤小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 寻找有效减轻心脏毒性同时保留或增强免疫检查点抑制剂抗肿瘤免疫的方法 | 黑色素瘤荷瘤C57BL/6J雌性小鼠 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 逆转录定量PCR, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 图像数据, 细胞表型数据 | 黑色素瘤荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
11472 | 2025-10-07 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.02.530774
PMID:39803528
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研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合方法,从基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的生物物理模型相结合,通过可解释的稀疏线性回归模型将离子通道基因表达与生物物理模型参数直接关联 | 模型与数据之间存在不匹配的挑战,且方法依赖于多模式Patch-seq数据的质量和可用性 | 建立基因表达与皮层神经元类型生理特性之间的联系 | 多种皮层细胞类型 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学, Patch-seq, 模拟推理 | Hodgkin-Huxley模型, 稀疏线性回归模型 | 多模式电生理和基因表达数据 | 多种皮层细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11473 | 2025-10-07 |
Neuropilin-1 is a novel host factor modulating the entry of hepatitis B virus
2025-Jan, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.06.032
PMID:38960374
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现神经纤毛蛋白-1(NRP1)是调控乙型肝炎病毒进入肝细胞的新型宿主因子 | 首次发现NRP1通过与HBV大表面蛋白preS1结构域和NTCP受体形成复合物来调控HBV进入过程 | NA | 探究除NTCP外其他调控HBV感染的宿主因子 | 儿童乙肝肝活检样本、原代人肝细胞、HepG2-NTCP细胞、人肝嵌合小鼠 | NA | 乙型肝炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 儿童乙肝患者肝活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11474 | 2025-10-07 |
Combination of spatial transcriptomics analysis and retrospective study reveals liver infection of SARS-COV-2 is associated with clinical outcomes of COVID-19
2025-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105517
PMID:39709771
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析和回顾性研究揭示了SARS-CoV-2肝脏感染与COVID-19临床结局的关联 | 首次结合空间转录组学技术和临床回顾性研究证实SARS-CoV-2可直接感染肝脏细胞,并发现血清白蛋白浓度变化与死亡风险相关 | 样本量有限(仅6例患者肝组织),回顾性研究设计存在固有偏倚 | 探究SARS-CoV-2肝脏感染的机制及其对COVID-19临床结局的影响 | COVID-19患者肝组织、住院患者临床数据、叙利亚仓鼠模型 | 空间转录组学 | COVID-19 | 免疫组织化学染色,空间转录组测序,TCR CDR3序列分析,回顾性研究 | NA | 组织切片图像,基因表达数据,临床检验数据 | 6例患者肝组织样本,650例住院患者临床数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium CytAssist Spatial Gene Assay |
11475 | 2025-10-07 |
Visium spatial transcriptomics and proteomics identifies novel hepatic cell populations and transcriptomic signatures of alcohol-associated hepatitis
2025-Jan, Alcohol, clinical & experimental research
DOI:10.1111/acer.15494
PMID:39592394
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术识别酒精相关性肝炎中的新型肝细胞群体及其分子特征 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学技术系统揭示AH中细胞群体的空间分布特征和分子改变,发现PCNA+肝细胞的胆管细胞样特征及疾病相关肝细胞标志物 | 样本量较小(仅2例AH患者和2例对照),需要更大规模研究验证发现 | 识别酒精相关性肝炎中的肝细胞群体及其转录组和蛋白质组改变 | 人类酒精相关性肝炎患者和正常对照的肝组织 | 空间转录组学 | 酒精相关性肝炎 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 4例(2例AH患者,2例非ALD对照) | 10x Genomics | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组和蛋白质组分析平台,使用福尔马林固定石蜡包埋肝组织 |
11476 | 2025-10-07 |
Analysis of the effect of ALA-PDT on macrophages in footpad model of mice infected with Fonsecaea monophora based on single-cell sequencing
2025, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2024-1132
PMID:39822988
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序技术分析ALA-PDT治疗对单色芬氏菌感染小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响 | 首次结合单细胞测序技术与小鼠足垫感染模型,系统研究ALA-PDT对真菌感染中巨噬细胞免疫调控机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证;样本量有限 | 探究ALA-PDT治疗对着色芽生菌病免疫反应的影响机制 | 单色芬氏菌感染的小鼠足垫模型中的巨噬细胞 | 单细胞测序 | 真菌感染性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠足垫感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11477 | 2025-10-07 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
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研究论文 | 通过构建人鼠嵌合脑模型研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用机制 | 开发了同时移植人类诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞的新型共移植模型,首次在体内观察到人类小胶质细胞修剪人类神经元突触并吞噬神经元的现象 | 使用小鼠作为宿主环境可能无法完全模拟人类大脑的复杂微环境 | 研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在神经系统疾病中的作用 | 人鼠嵌合脑模型中的人类神经细胞(神经元、小胶质细胞、大胶质细胞) | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建技术,细胞间通讯分析 | 人鼠嵌合脑模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11478 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
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研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化,且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA |
11479 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征,发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限,主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11480 | 2025-10-07 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
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综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用,重点关注可变剪接机制及其在血液系统疾病中的意义 | 整合了最新单细胞测序技术与造血研究,系统阐述剪接因子突变在血液恶性肿瘤中的作用机制 | 作为综述文章,未提供原始实验数据和新发现 | 探讨可变剪接在造血过程和血液疾病中的作用机制 | 造血干细胞、祖细胞、成熟血细胞及其转录组 | 自然语言处理 | 血液系统疾病 | 多色流式细胞分选、bulk测序、单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |