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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11461 | 2025-10-07 |
Visium spatial transcriptomics and proteomics identifies novel hepatic cell populations and transcriptomic signatures of alcohol-associated hepatitis
2025-Jan, Alcohol, clinical & experimental research
DOI:10.1111/acer.15494
PMID:39592394
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术识别酒精相关性肝炎中的新型肝细胞群体及其分子特征 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学技术系统揭示AH中细胞群体的空间分布特征和分子改变,发现PCNA+肝细胞的胆管细胞样特征及疾病相关肝细胞标志物 | 样本量较小(仅2例AH患者和2例对照),需要更大规模研究验证发现 | 识别酒精相关性肝炎中的肝细胞群体及其转录组和蛋白质组改变 | 人类酒精相关性肝炎患者和正常对照的肝组织 | 空间转录组学 | 酒精相关性肝炎 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 4例(2例AH患者,2例非ALD对照) | 10x Genomics | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组和蛋白质组分析平台,使用福尔马林固定石蜡包埋肝组织 |
11462 | 2025-10-07 |
Analysis of the effect of ALA-PDT on macrophages in footpad model of mice infected with Fonsecaea monophora based on single-cell sequencing
2025, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2024-1132
PMID:39822988
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序技术分析ALA-PDT治疗对单色芬氏菌感染小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响 | 首次结合单细胞测序技术与小鼠足垫感染模型,系统研究ALA-PDT对真菌感染中巨噬细胞免疫调控机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证;样本量有限 | 探究ALA-PDT治疗对着色芽生菌病免疫反应的影响机制 | 单色芬氏菌感染的小鼠足垫模型中的巨噬细胞 | 单细胞测序 | 真菌感染性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠足垫感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11463 | 2025-10-07 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
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研究论文 | 通过构建人鼠嵌合脑模型研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用机制 | 开发了同时移植人类诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞的新型共移植模型,首次在体内观察到人类小胶质细胞修剪人类神经元突触并吞噬神经元的现象 | 使用小鼠作为宿主环境可能无法完全模拟人类大脑的复杂微环境 | 研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在神经系统疾病中的作用 | 人鼠嵌合脑模型中的人类神经细胞(神经元、小胶质细胞、大胶质细胞) | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建技术,细胞间通讯分析 | 人鼠嵌合脑模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11464 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
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研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化,且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA |
11465 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征,发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限,主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11466 | 2025-10-07 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
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综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用,重点关注可变剪接机制及其在血液系统疾病中的意义 | 整合了最新单细胞测序技术与造血研究,系统阐述剪接因子突变在血液恶性肿瘤中的作用机制 | 作为综述文章,未提供原始实验数据和新发现 | 探讨可变剪接在造血过程和血液疾病中的作用机制 | 造血干细胞、祖细胞、成熟血细胞及其转录组 | 自然语言处理 | 血液系统疾病 | 多色流式细胞分选、bulk测序、单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11467 | 2025-10-07 |
Low-intensity focused ultrasound stimulation promotes stroke recovery via astrocytic HMGB1 and CAMK2N1 in mice
2024-Nov-05, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2023-002614
PMID:38191183
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研究论文 | 本研究探讨低强度聚焦超声刺激通过星形胶质细胞中的HMGB1和CAMK2N1促进小鼠脑卒中恢复的机制 | 首次揭示LIFUS通过调控星形胶质细胞特定亚群中HMGB1上调和CAMK2N1下调来促进血管生成和突触形成 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及性别差异分析 | 探究低强度聚焦超声在缺血性脑卒中中的神经修复机制 | 成年雄性小鼠的缺血性脑卒中模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | iTRAQ蛋白质组学分析,scRNA-seq,激光散斑成像,电肌电图,纤维光度记录,荧光原位杂交,Western blot | NA | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据,影像数据,电生理数据 | 成年雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
11468 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice
2024-Oct, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006
PMID:39153545
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人巨细胞病毒感染人源化小鼠后外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次在人源化小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术研究HCMV感染后的免疫细胞反应 | 研究基于人源化小鼠模型,与真实人体感染环境存在差异 | 揭示HCMV感染过程中病毒与宿主的相互作用机制 | 人源化小鼠模型中的外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞测序分析 | 人巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11469 | 2025-10-07 |
G-protein signaling of oxytocin receptor as a potential target for cabazitaxel-resistant prostate cancer
2024-Jan, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae002
PMID:38250514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞,发现催产素受体信号通路可作为治疗靶点 | 首次在卡巴他赛耐药前列腺癌中发现催产素受体信号通路上调,并验证氯哌斯汀通过抑制该通路具有抗肿瘤活性 | 样本量有限,需要更大规模的临床研究验证 | 探索卡巴他赛耐药前列腺癌的耐药机制并寻找治疗靶点 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞和肿瘤组织 | 单细胞测序 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间基因表达分析, 质谱磷酸化蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11470 | 2025-10-07 |
Altered Sox9 and FGF signaling gene expression in Aga2 OI mice negatively affects linear growth
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171984
PMID:37796615
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Aga2 OI小鼠生长板组织,揭示I型胶原突变对软骨生长板的影响机制 | 首次在OI小鼠模型中通过单细胞RNA测序发现生长板软骨细胞中Sox9和FGF信号通路表达异常 | 研究仅限于Aga2+/-小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究成骨不全症对线性生长的负面影响机制 | Aga2+/-小鼠的胫骨和股骨生长板组织 | 单细胞转录组学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Aga2+/-小鼠生长板组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11471 | 2025-10-07 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现胰腺导管腺癌中的浆细胞能够分泌针对自身抗原的抗体 | 首次系统性地鉴定了胰腺癌中浆细胞产生的自身抗体所针对的三种特异性自身抗原(F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1) | 样本量较小(仅7例PDAC样本),且抗体反应性的功能意义尚未完全阐明 | 探索胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原特征 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和血浆样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白测序,重组抗体技术 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据,免疫组织化学数据 | 7例原发PDAC样本,41个重组抗体代表235个浆细胞和12个B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11472 | 2025-10-07 |
Islet-autoreactive CD4+ T cells are linked with response to alefacept in type 1 diabetes
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167881
PMID:37751304
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研究论文 | 本研究通过分析胰岛自身反应性CD4+ T细胞特征,探索其对阿法赛特治疗1型糖尿病疗效的预测价值 | 首次发现具有特定转录特征(簇3)的记忆表型IAR CD4+ T细胞基线频率与阿法赛特治疗反应呈负相关 | 样本量有限,需在更大队列中验证生物标志物的预测效能 | 寻找能预测1型糖尿病治疗反应的生物标志物 | 新发1型糖尿病患者的胰岛抗原反应性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | T1DAL临床试验参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11473 | 2025-10-07 |
Mutant RB1 enhances therapeutic efficacy of PARPis in lung adenocarcinoma by triggering the cGAS/STING pathway
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165268
PMID:37937640
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研究论文 | 本研究探讨RB1基因突变如何通过激活cGAS/STING通路增强PARP抑制剂在肺腺癌中的疗效 | 首次揭示RB1突变通过诱导基因组不稳定性和激活cGAS/STING通路增强PARP抑制剂敏感性的机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索PARP抑制剂在肺腺癌中的疗效机制及RB1突变的调控作用 | 肺腺癌细胞系、RB1基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 生物信息学筛选、单细胞RNA测序、异种移植实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个肺腺癌细胞系和RB1-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11474 | 2025-10-07 |
Characterization of Canine Peyer's Patches by Multidimensional Analysis: Insights from Immunofluorescence, Flow Cytometry, and Single-Cell RNA Sequencing
2023-11-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2300091
PMID:38015460
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研究论文 | 通过多维分析技术表征犬类派尔集合淋巴结的细胞组成和免疫功能 | 首次开发并验证了特异性靶向犬类M细胞的抗体,为研究抗原转运机制提供了新工具 | 研究仅关注稳态条件下的犬类派尔集合淋巴结,未涉及疾病或疫苗接种后的动态变化 | 深入理解犬类肠道相关淋巴组织的结构和功能,以改进口服疫苗策略 | 犬类派尔集合淋巴结的免疫细胞和组织结构 | 免疫学 | NA | 免疫荧光,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 图像,细胞计数数据,基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11475 | 2025-10-07 |
IL-21-producing effector Tfh cells promote B cell alloimmunity in lymph nodes and kidney allografts
2023-10-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169793
PMID:37870962
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研究论文 | 本研究揭示了产生IL-21的效应Tfh细胞在肾移植排斥中通过调控B细胞克隆动态发挥关键作用 | 首次发现并表征了产生IL-21的效应Tfh细胞亚群在肾移植排斥中的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证 | 阐明Tfh细胞在肾移植排斥中的具体亚群、起源和功能机制 | 效应Tfh细胞、B细胞、肾移植模型 | 免疫学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序, 单B细胞培养系统 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11476 | 2025-10-07 |
Itaconate-producing neutrophils regulate local and systemic inflammation following trauma
2023-10-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169208
PMID:37707952
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研究论文 | 本研究揭示了创伤后产生衣康酸的中性粒细胞在调节局部和全身炎症中的关键作用 | 首次发现高度成熟的中性粒细胞亚型(而非巨噬细胞)是创伤后衣康酸的主要生产者,并揭示了这些细胞通过骨髓循环调节全身炎症的新机制 | 研究主要关注肌腱损伤模型,在其他类型创伤中的普适性需要进一步验证 | 探究创伤后免疫反应的代谢调控机制及其对修复结局的影响 | 肌腱损伤模型中的免疫细胞,特别是中性粒细胞亚型 | 免疫代谢 | 创伤修复 | 代谢组学,单细胞RNA测序,分子验证 | NA | 代谢组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,代谢组学 | NA | NA |
11477 | 2025-10-07 |
scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis
2023-05-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216149
PMID:36990268
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和成像质谱流式分析揭示了iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的抗肿瘤免疫作用 | 首次在模拟临床条件的胰腺癌肝转移模型中系统阐明iNKT细胞激活通过增强NK/T细胞免疫和减少肿瘤相关巨噬细胞发挥抗肿瘤作用 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的免疫调节作用 | 胰腺癌肝转移小鼠模型中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 成像质谱流式, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 超过30,000个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 成像质谱流式 | NA | NA |
11478 | 2025-10-07 |
Quantitative single-cell transcriptome-based ranking of engineered AAVs in human retinal explants
2022-Jun-09, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2022.04.014
PMID:35615708
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术评估18种AAV血清型在人类视网膜外植体中的感染效率和趋向性 | 首次在人类视网膜外植体中使用单细胞分辨率定量评估工程化AAV载体的感染性能 | 视网膜外植体中光感受器细胞基因表达发生改变,可能影响结果准确性 | 评估工程化AAV载体在人类视网膜组织中的基因递送效率 | 18种野生型和工程化AAV衣壳 | 单细胞测序 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | scAAVengr流程 | 单细胞转录组数据 | 人类视网膜外植体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11479 | 2025-10-07 |
Dysfunction of Endothelial Cell-Mediated Intercellular Communication and Metabolic Pathways in Age-Related Macular Degeneration
2025-Feb, Current eye research
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/02713683.2024.2407361
PMID:39329213
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据,分析年龄相关性黄斑变性中内皮细胞介导的细胞间通讯和代谢通路异常 | 首次在单细胞水平系统揭示AMD中内皮细胞介导的细胞通讯障碍和代谢通路异常,发现黄斑区与周边区的差异信号传导 | 未发现疾病特异性细胞类型或细胞比例差异,研究主要基于转录组数据 | 探索年龄相关性黄斑变性的分子机制和潜在治疗靶点 | 视网膜和视网膜色素上皮/脉络膜组织中的细胞 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | CellChat细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 整合六个项目的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11480 | 2025-10-07 |
CCN5 suppresses injury-induced vascular restenosis by inhibiting smooth muscle cell proliferation and facilitating endothelial repair via thymosin β4 and Cd9 pathway
2025-Jan-28, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae911
PMID:39873228
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研究论文 | 本研究揭示了CCN5通过抑制血管平滑肌细胞增殖和促进内皮细胞修复的双重保护作用机制,并开发了CCN5重组蛋白涂层支架用于预防支架内再狭窄 | 首次发现CCN5通过胸腺素β4和Cd9通路发挥双重保护作用,并开发了CCN5重组蛋白涂层支架作为新型治疗策略 | 研究主要基于动物模型,尚未进行大规模临床试验验证 | 探究CCN5在支架内再狭窄中的保护作用机制 | 猪冠状动脉、小鼠股动脉、内皮细胞、血管平滑肌细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 支架植入猪冠状动脉、损伤诱导小鼠股动脉、ISR患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |