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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11441 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of peanut-responsive T cells in patients with peanut allergy reveals heterogeneous effector TH2 subsets
2018-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2017.11.060
PMID:29408715
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研究论文 | 该研究系统性地表征了花生特异性T细胞在花生过敏患者外周血中的表型。 | 首次发现花生过敏患者中存在多种效应性TH2亚群,并识别出与调节性T细胞相关的CD154表达变化。 | 研究主要集中在特定患者人群,结果可能不适用于其他类型的过敏或不同的种族人群。 | 全面表征花生特异性T细胞在花生过敏患者中的作用及其表型变化。 | 花生过敏患者及健康对照者的外周血样本中的花生反应性T细胞。 | 数字病理学 | 花生过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本细胞 | 包括花生过敏患者、健康对照者及高阈值个体的多个样本 |
11442 | 2024-08-04 |
Polypeptide N-Acetylgalactosaminyl transferase 14 is a novel mediator in pancreatic β-cell function and growth
2024-Sep-15, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2024.112269
PMID:38763428
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研究论文 | 研究表明GALNT14在胰腺β细胞中高度表达,并调节其功能和生长 | 发现GALNT14是调节β细胞生物学的新型调节因子,为β细胞O-糖基化与糖尿病发展的关系提供了新的视角 | 研究主要集中在小鼠模型,尚未在其他物种中验证 | 探讨GALNT14在胰腺β细胞功能和生长中的作用 | 主要研究GALNT14在小鼠胰腺β细胞中的表达和功能 | 数字病理学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞测序 | 三个啮齿动物2型糖尿病模型的初级岛屿 |
11443 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease
2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00395-9
PMID:38914538
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研究论文 | 本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模 | 提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法,并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系 | 模型的验证主要依赖于小鼠实验,可能不完全适用于人类 | 旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态 | 研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 常微分方程(ODE) | 细胞计数数据和基因表达数据 | 涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据 |
11444 | 2024-08-04 |
Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research
2024-Jun-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02040-9
PMID:38902727
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研究论文 | 本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用 | 本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化,提供了比传统转录组更多的信息 | 目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战 | 探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向 | 癌症相关的转录组数据及其空间表达 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
11445 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model
2024-Jun-13, Kidney research and clinical practice
IF:2.9Q1
DOI:10.23876/j.krcp.23.317
PMID:38934039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了人类白细胞抗原(HLA)敏化过程中Th17通路的角色。 | 首次揭示了Th17细胞及其细胞因子在HLA敏化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全转化到人类生理 | 探究在人类白细胞抗原敏化中涉及的特定通路 | 使用HLA.A2转基因小鼠开发的异体敏化小鼠模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分别从ALLO和SYN生成9190和8890个单细胞转录组 |
11446 | 2024-08-05 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的动脉粥样硬化逆转的影响 | 本研究首次揭示了IL-1β在饮食诱导动脉粥样硬化中的重要作用和机制 | 研究仅在阿泡蛋白E缺失小鼠模型中进行,可能影响结果的普适性 | 研究饮食改变对动脉粥样硬化病变性质和稳定性的影响 | 使用Apoe-/-小鼠模型来观察饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 心血管病学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫染色,高分辨率共聚焦显微镜分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠18只 |
11447 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals MYOF-Enriched Monocyte/Macrophage Subcluster as a Favorable Prognostic Factor in Sepsis
2024-05, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300673
PMID:38456367
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了脓毒症中MYOF富集的单核细胞/巨噬细胞亚簇作为有利预后因素 | 该研究首次展示了MYOF基因在脓毒症中的重要性,并揭示了其与生存结果的相关性 | 该研究的限制未被明确提及 | 探讨脓毒症中免疫细胞景观及其与预后的关系 | 单细胞RNA测序得到的脓毒症患者免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究中未明确样本数量 |
11448 | 2024-08-05 |
Satellite Cell-Derived Exosomes: A Novel Approach to Alleviate Skeletal Muscle Atrophy and Fibrosis
2024-04, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300558
PMID:38329214
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研究论文 | 这项研究探讨了来自骨骼肌卫星细胞的外泌体在缓解骨骼肌萎缩和纤维化中的作用 | 引入了骨骼肌卫星细胞产生的外泌体作为治疗骨骼肌萎缩和纤维化的新方法 | 缺乏长期疗效的研究数据和在不同动物模型上的验证 | 研究骨骼肌卫星细胞外泌体在治疗骨骼肌萎缩和纤维化中的潜在应用 | Sprague Dawley (SD) 大鼠的去神经骨骼肌 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了去神经的Sprague Dawley (SD) 大鼠 |
11449 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Ameliorative Effect of Oridonin on Septic Liver Injury
2024-03, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300542
PMID:38408269
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研究论文 | 该文章主要研究了Oridonin对脓毒症肝损伤的改善作用及其机制 | 通过单细胞转录组学揭示Oridonin在脓毒症模型中的保护机制 | 实验主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类 | 探索Oridonin对脓毒症引起的生理变化的保护作用 | 脓毒症诱导的小鼠肝脏模型 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 63,486个细胞 |
11450 | 2024-08-04 |
Identification of Surface Markers and Functional Characterization of Myeloid Derived Suppressor Cell-Like Adherent Cells
2024-03, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300159
PMID:37986133
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研究论文 | 本研究识别了髓源抑制细胞样附着细胞的基因特征及功能 | 本研究首次识别了特定的MLAC表面标记,为进一步研究这种细胞类型提供了重要工具 | 缺乏对MLAC特异性标记的了解在进一步特性化该细胞类型时造成限制 | 研究髓源抑制细胞样附着细胞在肿瘤微环境中的角色以及其特征 | 髓源抑制细胞样附着细胞的基因签名和功能特性 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公共单细胞RNA-seq数据分析特定细胞群体 |
11451 | 2024-08-04 |
Insight into Tetrabromobisphenol A-Associated Liver Transcriptional Landscape via Single Cell RNA Sequencing
2024-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300477
PMID:37867281
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术描述了四溴双酚A引起的小鼠肝脏转录组特征 | 揭示了四溴双酚A(TBBPA)对肝细胞和内皮细胞的功能障碍及其对免疫细胞招募的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行,需在其他模型和人类样本中验证 | 探讨环境毒素四溴双酚A引发的肝脏损伤机制 | 小鼠肝脏中的主要细胞类型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
11452 | 2024-08-05 |
Identification and Validation of Glomeruli Cellular Senescence-Related Genes in Diabetic Nephropathy by Multiomics
2024-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300453
PMID:37957539
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研究论文 | 本研究旨在识别和验证与糖尿病肾病相关的肾小球细胞衰老相关基因 | 研究首次揭示FOS和ZFP36可能在糖尿病肾病中发挥抗衰老作用 | 研究中只是验证了部分核心基因的表达,仍需更大规模的验证 | 提供新的线索以基于抗衰老策略治疗糖尿病肾病 | 研究对象包括糖尿病肾小球和对照肾小球样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 微阵列分析, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 41个糖尿病肾小球和20个对照肾小球样本 |
11453 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of B cells and tertiary lymphoid structures in muscle-invasive bladder cancer
2024-01-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04860-1
PMID:38216927
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研究论文 | 该研究揭示了肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中B细胞和三级淋巴结构的异质性 | 本研究提供了关于MIBC中B细胞亚型的异质性及TLSs在MIBC结果中的重要作用的新见解 | 本研究的局限性在于样本大小较小,仅涉及12名膀胱癌患者 | 探索肌肉侵袭性膀胱癌中肿瘤浸润B细胞和三级淋巴结构的功能和机制 | 该研究的对象为12名膀胱癌患者的B细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名膀胱癌患者的11612个B细胞和55392个T细胞 |
11454 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals aberrantly activated inter-tumor cell signaling pathways in the development of clear cell renal cell carcinoma
2024-01-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04818-9
PMID:38191424
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研究论文 | 本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌发展过程中异常激活的肿瘤细胞间信号传导通路 | 首次揭示了透明细胞肾细胞癌中异常激活的细胞间信号通路及其特定的癌干细胞亚群体的作用 | 只分析了少量病例,且未深入探讨信号通路的具体机制 | 研究透明细胞肾细胞癌发展相关的细胞间信号传导 | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | NA | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 |
11455 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneous features of myeloid-derived suppressor cells in newborns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1367230
PMID:38919617
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿骨髓源抑制细胞的异质性特征和成熟轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序明确了新生儿多形核骨髓源抑制细胞的分化阶段 | 尚未深入探讨新生儿MDSCs在免疫系统中的具体功能和机制 | 探讨新生儿骨髓源抑制细胞的组成及功能异质性 | 新生儿外周血中的多形核骨髓源抑制细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 新生儿的外周血样本 |
11456 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Transcriptome of the Human Endometrium Reveals Epithelial Characterizations Associated with Recurrent Implantation Failure
2024-01, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300110
PMID:37690851
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示了与反复植入失败(RIF)相关的子宫内膜上皮特征 | 首次表明RIF患者子宫内膜腺体中MAP2K6 EPCAM上皮细胞替代腺上皮细胞,并表明RIF患者衍生的腺体类器官对性激素反应减弱 | 研究样本量较小,仅包括3名RIF患者,可能影响结果的普适性 | 探讨反复植入失败患者中子宫内膜的细胞和分子机制 | 研究对象为3名反复植入失败患者的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 3名反复植入失败患者,分析25,315个单个细胞 |
11457 | 2024-08-05 |
T cell-related ubiquitination genes as prognostic indicators in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424752
PMID:38919610
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T细胞相关泛素化基因的HCC预后风险评分 | 提出了一种新的预后和免疫治疗效果预测指标,基于T细胞相关泛素化基因 | 未提及具体的限制 | 为肝细胞癌患者设计新的预后评估工具 | 肝细胞癌患者的T细胞相关泛素化基因 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 风险评分模型 | RNA数据 | 3050个T细胞标记基因,结合TCGA的临床数据 |
11458 | 2024-08-05 |
Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305874
PMID:38917129
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研究论文 | 该文章展示了一种基于效应大小的替代方法,用于多物种单细胞RNA测序的差异分析 | 提出了一种基于效应大小的分析管道,适用于小样本和多物种数据的融合 | 涉及的样本小,且可能存在批次效应导致的偏差 | 旨在展示效应大小配置文件作为单细胞转录组分析的有效替代 | 探讨来自于人类和牛的外周血单核细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 其他 | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个物种的小样本数据,包括人类和牛的外周血单核细胞 |
11459 | 2024-08-04 |
Construction and Validation of a Prognostic Model Based on Novel Senescence-Related Genes in Non-Small Cell Lung Cancer Patients with Drug Sensitivity and Tumor Microenvironment
2023-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300190
PMID:37518773
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研究论文 | 本文开发了一种基于新颖衰老相关基因的预后模型,以评估非小细胞肺癌患者的药物敏感性和肿瘤微环境 | 提出了一种新的预后系统,基于12个衰老基因的表达,评估肺腺癌患者的生存风险 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据,可能会受到数据集的限制 | 研究衰老相关基因在非小细胞肺癌中对预后的影响 | 非小细胞肺癌(LUAD)患者以及相关细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | LASSO Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和GEO数据集的样本,具体数量未在摘要中说明 |
11460 | 2024-08-04 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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评论 | 本文总结了空间单细胞技术在探索胃肠组织转录组方面的最新进展 | 提出了利用空间转录组技术提供基因表达的基因组范围全景,以揭示胃肠组织的分子组成 | 未在摘要中明确指出具体的局限性 | 推广对胃肠生理的理解 | 胃肠道组织及其单细胞层次的功能和表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |