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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11421 | 2024-08-04 |
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03040-1
PMID:38664501
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研究论文 | 这项研究揭示了GSK3β和UCHL3在卵巢癌中通过去 ubiquitination 维持 RIPK4 稳定性并增强肿瘤转移的重要作用 | 本研究首次揭示了GSK3β诱导的RIPK4磷酸化如何增强其与UCHL3的相互作用,从而提高RIPK4的去 ubiquitination 和稳定性 | 该研究主要集中于体外和体内模型,临床验证尚需进一步研究 | 研究 RIPK4 在卵巢癌发展中的作用及其调控机制 | 研究主要对象为卵巢癌组织及细胞,重点关注RIPK4、UCHL3和GSK3β的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
11422 | 2024-08-04 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了一个基于单细胞转录组学的计算管道PERCEPTION,用于预测患者对治疗的反应和抵抗 | 提出了一种新的精准肿瘤治疗计划工具,能够基于单细胞转录组数据预测患者的治疗反应 | 尚未提及任何特定的局限性 | 提升个体癌症患者最佳治疗方案的制定 | 肿瘤患者的单细胞转录组数据 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | 未提供 | 转录组数据 | 在多发性骨髓瘤和乳腺癌的两个临床试验中使用了患者源的初级细胞 |
11423 | 2024-08-04 |
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14822
PMID:38923860
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19对神经系统的损伤,并通过胶质瘤组织和胶质瘤类器官的分析提供了证据 | 首次揭示了胶质瘤组织对SARS-CoV-2的易感性以及其对COVID-19相关神经症状的代表性 | 缺乏对SARS-CoV-2入侵中枢神经系统精确机制的深入研究 | 研究COVID-19对神经系统的影响及其机制 | 胶质瘤患者的组织样本和胶质瘤类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、空间转录组分析 | NA | 组织样本、类器官 | 胶质瘤患者的组织样本及其类器官数据 |
11424 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
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研究论文 | 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 | 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用,可能未能全面反映整体免疫环境 | 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 | AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合 |
11425 | 2024-08-04 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
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研究论文 | 此研究对外髓性多发性骨髓瘤(EMM)肿瘤进行了全面的下一代测序分析 | 首次揭示EMM的肿瘤微环境,识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 | 样本规模相对较小,仅有14个样本 | 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 | 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS) | NA | 肿瘤样本 | 14个样本 |
11426 | 2024-08-05 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本研究探讨了渗透压胁迫对拟南芥根尖发育的影响,使用单细胞层面的转录调控网络分析 | 首次在单细胞层面重建了相应的转录调控网络,并捕捉到12,968个单细胞的基因和染色质可及性之间的联系 | 数据整合的准确性仍然是个挑战,尤其是在调查特定细胞类型的转录调控网络时 | 研究拟南芥在渗透压胁迫下的根尖发育机制 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个根尖细胞核 |
11427 | 2024-08-05 |
Recapitulation of Perturbed Striatal Gene Expression Dynamics of Donors' Brains With Ventral Forebrain Organoids Derived From the Same Individuals With Schizophrenia
2024-Jun-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220723
PMID:37915216
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研究论文 | 本研究通过从精神分裂症患者及神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官探索与精神分裂症相关的纹状体发育变化 | 提出了一种从精神分裂症患者的诱导多能干细胞生成腹侧前脑类器官的方法,并揭示了精神分裂症患者细胞在发育轨迹上的差异 | 研究样本量较小,仅限于四名精神分裂症患者和四名神经正常对照者 | 探索与精神分裂症相关的纹状体神经发育改变 | 来自精神分裂症患者和神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 诱导多能干细胞(IPS细胞)差异化 | 腹侧前脑类器官(VFO) | 单细胞RNA测序 | 四名精神分裂症患者及四名神经正常对照者 |
11428 | 2024-08-05 |
Amelioration of NAFLD by sleeve gastrectomy-triggered hepatocyte regeneration in mice - experimental research
2024-Jun-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001387
PMID:38573134
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研究论文 | 本研究探讨了袖状胃切除对小鼠非酒精性脂肪肝病的改善及其机制 | 首次揭示了袖状胃切除通过促进肝细胞再生来改善非酒精性脂肪肝病的机制 | 本研究主要基于小鼠模型,缺乏在人体中的验证 | 了解袖状胃切除改善代谢性疾病的潜在机制 | 采用饮食诱导的肥胖小鼠作为研究对象 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 实时定量逆转录PCR, Olink蛋白质组学 | NA | 图像, 生物样本 | 饮食诱导的肥胖小鼠 |
11429 | 2024-08-05 |
A risk score based on polyamine metabolism and chemotherapy-related genes predicts prognosis and immune cells infiltration of lung adenocarcinoma
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18387
PMID:38924680
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研究论文 | 本文探讨了铂类治疗和多胺代谢相关基因是否能够预测肺腺癌的预后 | 建立了基于铂类治疗和多胺代谢的关键基因的风险评分模型,提供了新颖的预后预测角度 | 行政性缺乏大规模临床试验验证该风险评分模型的准确性 | 研究铂类治疗和多胺代谢基因在LUAD预后预测中的作用 | 与铂类治疗和多胺代谢相关的基因及其对免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA |
11430 | 2024-08-07 |
Using single-cell transcriptomics to predict which tumors will respond to targeted therapy
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00757-6
PMID:38684925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11431 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Technology in Ruminant Livestock: Challenges and Opportunities
2024-May-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46060316
PMID:38920988
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评论 | 该文综述了单细胞测序技术在反刍动物中的应用及其面临的挑战和机遇 | 探讨了反刍动物中特有的单细胞组学技术,以及对细胞和分子机制深入理解的潜力 | 面临精准标注独特细胞群体和细胞在组织内空间分辨率等挑战 | 旨在提高对健康和高产反刍动物所需特征的理解 | 关注牛、羊和山羊的细胞多样性及免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 已经探讨的动物种类包括牛、羊和山羊 |
11432 | 2024-08-05 |
CASi: A framework for cross-timepoint analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-05-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58566-x
PMID:38724550
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研究论文 | 本研究开发了CASi,一个用于多时间点单细胞RNA测序数据分析的综合框架 | 提出了一个新的框架,专门用于分析多时间点的单细胞RNA测序数据,并提供多种分析功能 | 尚未在其他类型的单细胞数据集上进行广泛验证 | 旨在改善多时间点的单细胞RNA测序数据分析 | 关注单细胞层面基因表达差异研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 通过综合模拟研究与真实的多时间点单细胞数据集进行验证 |
11433 | 2024-08-04 |
Dual-Targeting Nanovesicles Carrying CSF1/CD47 Identified from Single-Cell Transcriptomics of Innate Immune Cells in Heart Transplant for Alleviating Acute Rejection
2024-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302443
PMID:37962054
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研究论文 | 本文研究了双靶向纳米囊泡CSF1/CD47在心脏移植中的作用,以缓解急性排斥反应 | 提出了一种新型的CSF1/CD47双靶向纳米囊泡,通过调节Ly6G Ly6C抑制性巨噬细胞来减轻免疫排斥 | 研究主要集中在小鼠模型上,临床应用可能需要更多验证 | 探讨固有免疫细胞在心脏移植急性排斥反应中的动态变化和调控机制 | 研究了Ly6G Ly6C炎性巨噬细胞及其与中性粒细胞的相互信号传导 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
11434 | 2024-08-04 |
Immunotherapy-resistant acute lymphoblastic leukemia cells exhibit reduced CD19 and CD22 expression and BTK pathway dependency
2024-Feb-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175199
PMID:38376944
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研究论文 | 本文探讨了对CD19免疫疗法产生耐药性的急性淋巴细胞白血病细胞的特征,发现其CD19和CD22的表达减少,并依赖于BTK通路 | 本研究首次揭示了CD19免疫耐药细胞中CD19和CD22表达的联合丧失以及对BTK通路的依赖性 | 研究主要基于体外模型,临床样本数量相对较少 | 探讨CD19免疫疗法耐药性机制及其对细胞信号通路的影响 | 急性淋巴细胞白血病细胞及其耐药性相关特征 | 数字病理 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-Seq), 大质量细胞术 | NA | 细胞 | 来自多名(儿科和年轻成人)复发B细胞急性淋巴细胞白血病患者的样本 |
11435 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of a new transgenic t(8;21) preleukemia mouse model reveals regulatory networks promoting leukemic transformation
2024-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02063-z
PMID:37838757
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研究论文 | 本研究描述了一种新的转基因鼠模型,揭示了促使白血病转化的调控网络 | 开发了一种新的AE9a基因敲入小鼠模型,适合研究前白血病阶段的改变 | 可能在临床上的适用性仍需进一步验证 | 研究t(8;21)的前白血病机理及其调控网络 | 使用AE9a小鼠模型分析前白血病细胞群体及其转化 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | 使用AE9a小鼠模型观察多个细胞群体 |
11436 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis of the canine duodenum in chronic inflammatory enteropathy and health
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397590
PMID:38933260
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析慢性炎性肠病犬的十二指肠细胞多样性 | 揭示了犬类十二指肠黏膜的细胞异质性和潜在的分子机制 | 该研究样本量较小,仅涉及7只狗 | 研究慢性炎性肠病中犬类十二指肠的细胞组成及其影响 | 健康犬和患有慢性炎性肠病的犬 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 7个样本(3只健康犬和4只慢性炎性肠病犬) |
11437 | 2024-08-04 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-Dec-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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research paper | 该研究探讨了肺间质中mTORC1的过度活跃如何导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 本研究提出了肺间质细胞与内皮细胞之间的配体-受体间相互作用,强调了在LAM及其他mTORC1驱动疾病中改变的间质细胞与内皮细胞轴的重要性 | 当前研究的限制是未能探讨TSC2突变对内皮细胞的直接影响 | 研究LAM细胞如何与内皮细胞相互作用,以引发血管重塑 | 使用含有Tsc2基因缺失的mTORC1功能获得小鼠模型来研究肺间质细胞与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠模型 | 基因组数据 | 涉及1年的Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠 |
11438 | 2024-08-05 |
High-resolution transcriptomics informs glial pathology in human temporal lobe epilepsy
2022-10-23, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-022-01453-1
PMID:36274170
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研究论文 | 本研究验证了一种从人类大脑皮层中同时分离神经元、星形胶质细胞和少突胶质前体细胞的方法,并研究了与颞叶癫痫相关的转录组特征 | 首次揭示了颞叶癫痫中特异性混合胶质亚群的存在,并表明其表达反应性星形胶质细胞和少突胶质细胞的特征 | 样本数量较小,可能影响结果的广泛适用性 | 研究癫痫中的神经元和胶质细胞之间的复杂相互作用及其转录组特征 | 从癫痫手术样本中分离的神经元和胶质细胞群体 | 数字病理学 | 癫痫 | RNA-seq,单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 包含四个额外的人类TLE样本和对照样本 |
11439 | 2024-08-05 |
Degradation-resistant implanted biomaterials establish an immunosuppressive microenvironment that induces T cell exhaustion by recruiting myeloid cells
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.10.007
PMID:38933993
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研究论文 | 研究表明,耐降解的钛基植入材料通过招募髓系细胞建立免疫抑制微环境,从而诱导T细胞耗竭 | 首次揭示了钛基植入物如何通过招募髓系细胞形成免疫抑制微环境 | 对植入物周围免疫环境的影响机制尚需进一步探索 | 探索植入生物材料对局部免疫环境的影响 | 耐降解的钛基植入材料及其对周围免疫环境的影响 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
11440 | 2024-08-05 |
Multi-tissue scRNA-seq reveals immune cell landscape of turbot (Scophthalmus maximus)
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.12.015
PMID:38933994
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研究论文 | 本文开发了一个鲽鱼的动态细菌感染模型,并创建了鱼类免疫细胞景观。 | 首次系统性解析了鲽鱼中的免疫细胞亚群及其在细菌感染中的双重功能 | 主要集中于鲽鱼,结果可能不适用于其他鱼类 | 阐明骨鱼类免疫细胞的细致分布和功能 | 鲽鱼(Scophthalmus maximus) | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 表达谱数据 | NA |