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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11421 | 2024-08-05 |
The role of immune cells in different stages of atherosclerosis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.94570
PMID:38774746
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综述 | 本文探讨了免疫细胞在动脉粥样硬化不同阶段的作用 | 强调了免疫细胞亚型的多样性及其在动脉粥样硬化进展中的适应性 | 未详细探讨临床应用的具体策略 | 理解免疫细胞及其亚型如何影响动脉粥样硬化的发展 | 关注动脉粥样硬化病变内的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 高维质谱和单细胞RNA测序 | NA | 细胞、组织样本 | 利用动脉粥样硬化病变中的白血球样本 |
11422 | 2024-08-04 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.16.571680
PMID:38187648
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研究论文 | 本研究探讨了母体饮食诱导肥胖对胎儿大脑小胶质细胞和霍夫鲍尔细胞的转录组影响 | 首次证明霍夫鲍尔细胞可以作为胎儿大脑小胶质细胞发育的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型,尚需在其他动物模型或人类中验证 | 识别反映胎儿大脑小胶质细胞程序的非侵入性生物标志物以支持干预 | 小鼠模型中的胎儿大脑小胶质细胞和胎盘霍夫鲍尔细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验,样本数量未详细说明 |
11423 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals the impact of genetic alterations on the differentiation of inflammation-induced colon tumors
2023-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569463
PMID:38077052
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研究论文 | 这篇文章揭示了遗传改变对炎症诱导的结肠肿瘤分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序分析了不同遗传突变在结肠肿瘤细胞分化中的作用 | 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类结肠癌的形成机制 | 探索炎症诱导的结肠肿瘤中遗传突变与细胞分化之间的关系 | 使用小鼠模型研究具有不同遗传突变的结肠肿瘤 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同突变类型的结肠肿瘤样本 |
11424 | 2024-08-05 |
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102133
PMID:38000512
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综述 | 该综述讨论了成人神经发生的主要发现,强调了在理解脑部可塑性和相关疾病机制方面的重要发现和争议 | 文章总结了过去四十年关于成人神经发生的研究进展和方法论改进,揭示了其在学习、记忆和情绪中的作用 | 尚未确认成人和老年人类海马体内的强神经发生,且需要更多大规模研究来验证其存在及在不同神经疾病中的作用 | 旨在深入了解成人神经发生及其在认知功能和神经疾病中的角色 | 成人及老年人类的海马神经发生 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | 大规模研究的海马组织样本 |
11425 | 2024-08-05 |
Genomic and transcriptomic advances in amyotrophic lateral sclerosis
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102126
PMID:37972860
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研究论文 | 本文综述了基因组学、表观基因组学、转录组学和微RNA在肌萎缩侧索硬化症(ALS)研究中的应用 | 提出了微RNA作为潜在生物标志物和分子干预的有前景工具 | 至今尚缺乏有效的ALS治疗方法 | 深入探讨ALS的发展和维持的分子机制 | 与ALS发病机制相关的主要基因及其表观修饰 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 高通量测序技术 | 体外及体内模型 | 基因组数据,转录组数据 | NA |
11426 | 2024-08-05 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 该文章讨论了一种基于纳米颗粒的药物递送系统,旨在靶向促进腱的愈合 | 创新地利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒,实现了对腱的靶向药物递送 | 目前仅在小鼠模型中测试,临床应用的可行性尚未确定 | 研究旨在提高腱愈合过程中的药物递送效率 | 研究对象为腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米颗粒药物递送系统 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 |
11427 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551692
PMID:37577553
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研究论文 | 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 | 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 | 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 | 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
11428 | 2024-08-05 |
Tumor gene signatures that correlate with release of extracellular vesicles shape the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2023-07-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad019
PMID:36752300
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研究论文 | 这项研究评估了与肿瘤释放的细胞外小泡相关的基因特征对抗肿瘤免疫反应的临床相关性和影响 | 研究揭示了肿瘤基因特征与细胞外小泡产生之间的关系,及其如何影响免疫细胞浸润和抗肿瘤免疫 | 样本来源限制于单一的癌症基因组图谱和几个小型数据集,可能影响结果的广泛适用性 | 探讨头颈鳞状细胞癌中基因特征与细胞外小泡释放的相关性及其对免疫反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的基因表达和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 522名患者(癌症基因组图谱),250名患者(GSE65858数据集),18名患者(单细胞RNA测序数据集) |
11429 | 2024-08-04 |
Polymorphic KIR3DL3 expression modulates tissue-resident and innate-like T cells
2023-06-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade5343
PMID:37390222
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研究论文 | 本研究探讨了多态性KIR3DL3的表达对组织驻留和类固有T细胞的调节作用 | 首次揭示了KIR3DL3在γδ和CD8 T细胞中的高表达及其抑制T细胞受体刺激的功能 | 未能检测到KIR3DL3多态性对配体结合的影响 | 研究KIR3DL3的表达特征及其生物学功能 | 主要对象是KIR3DL3表达的γδ和CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 高分辨率流式细胞术和单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 涉及少量的KIR3DL3表达细胞 |
11430 | 2024-08-05 |
Basement membrane proteins in extracellular matrix characterize NF1 neurofibroma development and response to MEK inhibitor
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168227
PMID:37140985
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研究论文 | 本研究系统调查了在神经纤维瘤发展过程中的细胞外基质(ECM)的富集情况 | 发现基底膜(BM)蛋白是上调的ECM成分,而非主要胶原亚型,并且确定了TGF-β1信号在ECM动态中的作用 | 关于神经纤维瘤发展和治疗反应过程中ECM沉积机制的了解仍然有限 | 研究NF1神经纤维瘤中ECM的变化及其对MEK抑制剂治疗的反应 | 以神经纤维瘤的发育和MEK抑制剂的响应为研究对象 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
11431 | 2024-08-05 |
Regionally distinct progenitor cells in the lower airway give rise to neuroendocrine and multiciliated cells in the developing human lung
2023-06-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210113120
PMID:37279279
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研究论文 | 本文描述了在发育中的人类肺部下气道中富集的一种细胞 | 通过单细胞条形码谱系追踪方法,揭示了该细胞与基底细胞的不同分化潜能 | 研究未明确指出具体的局限性 | 研究下气道中细胞的分化潜力及其在上皮多样性中的作用 | 发育中的人类肺部下气道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和显微镜 | NA | 细胞 | NA |
11432 | 2024-08-05 |
Improving head and neck cancer therapies by immunomodulation of the tumour microenvironment
2023-03, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00531-9
PMID:36456755
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研究论文 | 本文探讨了通过免疫调节肿瘤微环境改善头颈部癌症治疗的策略 | 文章创新性在于全面分析了头颈部鳞状细胞癌的肿瘤微环境,包括免疫与非免疫细胞的相互作用 | 研究中可能存在样本选择的影响,以及对于小规模的不同TME特征的个体化分析不足 | 研究目的是提高头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤特异性T细胞反应 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其TME | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序,高维流式细胞术,空间多光谱成像 | NA | 数据集 | 利用了癌症基因组图谱等丰富的数据资源进行分析 |
11433 | 2024-08-05 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.24.529987
PMID:36909553
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研究论文 | 本研究开发了一个新的模型CTMM,以检测和量化个体间的细胞类型特异性变异 | 创新点在于提出了CTMM模型,可以在单细胞RNA测序数据中识别个体之间的细胞类型特异性变异 | 样本规模较小可能会对结果的普适性产生影响 | 研究的目的是提高统计能力,以识别细胞类型特异性的生物学特征 | 研究对象为人类诱导多能干细胞中的转录组变异 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | CTMM | 转录组数据 | NA |
11434 | 2024-08-05 |
Tissue-resident C1q + macrophages exert anti-aging potential through the Sirt1 pathway
2024-Jul, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01883-8
PMID:38724770
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研究论文 | 研究表明C1q+巨噬细胞通过Sirt1通路发挥抗衰老潜力 | 首次识别C1q+巨噬细胞在衰老过程中慢性炎症中的相关性 | 目前对老化组织中常驻免疫细胞的Sirt通路角色尚不明确 | 探讨Sirt1通路在老化组织常驻免疫细胞中的作用 | 老龄小鼠模型中的常驻免疫细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 年轻和老龄小鼠的单细胞数据 |
11435 | 2024-08-05 |
Ash1 l loss-of-function results in structural birth defects and altered cortical development
2024-Jun-30, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae218
PMID:38943682
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研究论文 | 本研究探讨了ASH1L功能丧失对小鼠生存和颅面骨骼发育的影响 | 首次明确ASH1L在脑部发育中的作用,并探讨了其在自闭症等神经发育障碍中的潜在机制 | 本研究主要在小鼠模型中进行,结果能否完全转化到人类尚需进一步验证 | 研究ASH1L在小鼠脑部发育及颅面结构形成中的作用 | ASH1L缺失的小鼠模型 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 克隆小鼠模型 | 基因表达数据、形态数据 | 生存跟踪77个胚胎,出生后41个小鼠 |
11436 | 2024-08-05 |
Macrophages as determinants and regulators of systemic sclerosis-related interstitial lung disease
2024-Jun-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05403-4
PMID:38937794
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在系统性硬化症相关间质性肺病中的影响和调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序区分系统性硬化症相关间质性肺病与特发性肺纤维化,并提出了潜在的预防和治疗方向 | 研究限于使用NCBI Gene Expression Omnibus数据库,可能存在样本偏差 | 阐明系统性硬化症相关间质性肺病与特发性肺纤维化的病理机制差异 | 通过单细胞分析研究健康对照组、特发性肺纤维化及系统性硬化症相关间质性肺病的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用来自GSE159354和GSE212109的样本进行分析 |
11437 | 2024-08-05 |
The Alk receptor tyrosine kinase regulates Sparkly, a novel activity regulating neuropeptide precursor in the Drosophila central nervous system
2024-Jun-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88985
PMID:38904987
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研究论文 | 本文描述了Alk受体酪氨酸激酶在果蝇中枢神经系统中调控一种新的神经肽前体的作用 | 揭示了Alk信号通路在神经内分泌基因表达转录调控中的新功能,以及新发现的神经肽前体作为Alk信号的转录靶标 | 对Alk信号通路的具体分子机制理解仍然较为有限 | 探讨Alk受体酪氨酸激酶在果蝇中枢神经系统中的功能及其调控机制 | 研究对象为果蝇幼虫的中枢神经系统和相关的基因表达 | 神经生物学 | NA | Targeted DamID (TaDa) 转录剖析 | NA | scRNA-seq数据和转录组数据 | 果蝇幼虫的中枢神经系统组织 |
11438 | 2024-08-05 |
Branching topology of the human embryo transcriptome revealed by Entropy Sort Feature Weighting
2024-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202832
PMID:38691188
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研究论文 | 本文展示了一种新的用于单细胞转录组学分析的特征选择数学框架Entropic Sorting。 | 创新点在于提出了连续熵排序特征加权(cESFW),并展示其在细胞状态特异基因区分上的优越性。 | 未提及具体的局限性 | 研究的目的是开发一种新的特征选择方法,以更好地分析人胚胎发育中的单细胞转录组数据。 | 研究对象为六个合并的人类早期胚胎发育的单细胞转录组数据集。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 六个单细胞转录组数据集 |
11439 | 2024-08-04 |
Cell-type specific defects in PTEN-mutant cortical organoids converge on abnormal circuit activity
2023-09-05, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad107
PMID:37384417
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研究论文 | 这篇文章探讨了PTEN基因杂合突变对不同细胞类型在人脑发育中的影响。 | 本研究通过不同供体的人类皮质类器官揭示了PTEN杂合突变对细胞类型特异性发育事件的影响。 | 研究的样本量和供体背景的多样性可能限制了结论的普适性。 | 探讨PTEN基因的杂合突变如何影响人类大脑发育中的不同细胞类型。 | 使用不同供体的人类皮质类器官作为研究对象。 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,空间转录组学 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | 不同供体的人类皮质类器官 |
11440 | 2024-08-05 |
Cellular reprogramming with ATOH1, GFI1, and POU4F3 implicate epigenetic changes and cell-cell signaling as obstacles to hair cell regeneration in mature mammals
2022-11-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79712
PMID:36445327
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研究论文 | 该研究探讨了使用ATOH1、GFI1和POU4F3进行耳蜗再编程,以克服在成熟哺乳动物中毛细胞再生的障碍 | 揭示了老年动物毛细胞再编程的表观遗传障碍和细胞间信号传导的影响 | 只在特定的转录因子组合下进行了研究,未充分评估其他可能的因素 | 研究耳蜗中毛细胞特异性转录因子对听力恢复的影响 | 使用Cre诱导小鼠模型来比较不同转录因子的毛细胞再编程效果 | 数字病理学 | 听力损失 | scRNA-seq和ATAC-seq | NA | 细胞 | 新生小鼠与1周龄小鼠的比较 |