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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11421 | 2025-10-07 |
Gene regulatory patterning codes in early cell fate specification of the C. elegans embryo
2024-Jan-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87099
PMID:38284404
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了秀丽隐杆线虫胚胎早期细胞命运特化过程中的基因调控模式 | 首次系统分析了早期至晚期原肠胚形成阶段(28-102细胞期)的转录组,识别了119种胚胎细胞状态,发现了基于亚细胞谱系的模块化基因表达程序 | 研究聚焦于特定发育阶段(1-102细胞期),可能未完全覆盖更晚期的发育事件 | 探索缺乏合胞体物种中细胞命运特化的基因调控机制 | 秀丽隐杆线虫胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1-102细胞阶段的胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11422 | 2025-10-07 |
Biomarker discovery in acetaminophen hepatotoxicity: leveraging single-cell transcriptomics and mechanistic insight
2024 Jan-Jun, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2306219
PMID:38217408
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综述 | 本文探讨了对乙酰氨基酚肝毒性中生物标志物的发现,重点关注单细胞转录组学方法和机制研究 | 整合小鼠模型机制研究与人类对乙酰氨基酚过量病理生理学,利用单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术发现新型生物标志物 | 所有已发现的生物标志物仍需进一步验证,需要更大规模的队列研究来确认其临床实用性 | 识别对乙酰氨基酚诱导急性肝衰竭的预后生物标志物,以确定需要肝移植的患者 | 对乙酰氨基酚肝毒性机制、生物标志物发现 | 数字病理学 | 肝毒性、急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学方法 | NA | 转录组数据、分子表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
11423 | 2025-10-07 |
PPARγ agonist treatment reduces fibroadipose tissue in secondary lymphedema by exhausting fibroadipogenic PDGFRα+ mesenchymal cells
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165324
PMID:38131378
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研究论文 | 本研究探讨PPARγ激动剂罗格列酮通过消耗PDGFRα+间充质细胞减少继发性淋巴水肿中纤维脂肪组织沉积的机制 | 首次发现促脂肪生成药物罗格列酮能同时减少淋巴水肿中的纤维化和脂肪组织沉积,揭示了PDGFRα+细胞在病理过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限,临床转化需要进一步研究 | 探究PPARγ激动剂治疗继发性淋巴水肿的机制和效果 | 继发性淋巴水肿小鼠模型和人类组织样本 | 病理生理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织图像 | 小鼠模型和人类组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11424 | 2025-10-07 |
Functional Pdgfra fibroblast heterogeneity in normal and fibrotic mouse lung
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164380
PMID:37824216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了正常和纤维化小鼠肺中Pdgfra+成纤维细胞的功能异质性 | 首次在单细胞水平上描述了肺损伤后Pdgfra+脂成纤维细胞的转录组变化,并发现其获得促纤维化特性同时保留脂源性身份 | 研究仅限于小鼠模型,且观察时间点为损伤后14天,未涵盖纤维化全过程 | 探究肺损伤对Pdgfra+脂成纤维细胞功能的影响及其在肺纤维化中的作用机制 | 小鼠肺组织中的Pdgfra+成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,PdgfraGFP谱系追踪,3D类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常和博来霉素损伤后14天的小鼠肺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11425 | 2025-10-07 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells direct atherosclerotic plaque composition complexity in a Klf4-dependent manner
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174639
PMID:37991018
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研究论文 | 本研究探讨平滑肌来源的外膜祖细胞通过Klf4依赖性方式调控动脉粥样硬化斑块组成复杂性 | 首次揭示AdvSca1-SM祖细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用机制及Klf4基因对其分化和斑块组成的调控功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明平滑肌来源外膜祖细胞在动脉粥样硬化中的功能及其分子调控机制 | 血管平滑肌来源的外膜祖细胞(AdvSca1-SM)及其在动脉粥样硬化斑块中的分化命运 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学分析, 细胞谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 组织学图像 | 野生型和Klf4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11426 | 2025-10-07 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
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研究论文 | 通过单细胞基因组学揭示幼年皮肌炎中协调的免疫失调机制 | 首次通过单细胞转录组学结合表面蛋白表达分析,发现B细胞区室向幼稚状态偏移是JDM的标志特征,并揭示I型干扰素反应与蛋白质加工失调和细胞死亡程序调控的协调网络 | 研究样本量有限,仅分析了血液样本,未涉及组织特异性免疫反应 | 解析幼年皮肌炎的免疫失调机制 | 幼年皮肌炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞转录组学,表面蛋白表达分析,免疫表型分析,网络分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白表达数据 | 不同疾病活动期的JDM患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11427 | 2025-10-07 |
Virus-specific TRM cells of both donor and recipient origin reside in human kidney transplants
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172681
PMID:37751288
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研究论文 | 本研究表征了人类肾移植组织中组织驻留淋巴细胞的特征及其在抗病毒免疫中的潜在作用 | 首次发现肾移植中存在供体和受体来源的病毒特异性组织驻留记忆T细胞,并证明它们具有相似的转录组特征和共享的TCR克隆型 | 研究样本为肾移植切除组织,可能无法完全代表正常功能移植中的免疫状态 | 表征肾移植中组织驻留淋巴细胞的特征并研究其在抗病毒免疫中的作用 | 人类肾移植切除组织中的组织驻留淋巴细胞 | 免疫学 | 肾脏移植 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 病毒dextramer染色 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞术数据 | 肾移植切除组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | NA |
11428 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics analysis of proliferative diabetic retinopathy fibrovascular membranes reveals AEBP1 as fibrogenesis modulator
2023-11-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172062
PMID:37917183
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析糖尿病视网膜病变纤维血管膜,揭示AEBP1在纤维生成中的调控作用 | 首次在增生性糖尿病视网膜病变纤维血管膜中通过单细胞RNA测序鉴定AEBP1作为周细胞-肌成纤维细胞转化的关键调控因子 | 样本来源仅限于手术切除的纤维血管膜,未涉及更广泛的疾病阶段验证 | 探索糖尿病视网膜病变纤维血管膜的细胞分子特征,寻找新的治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者的视网膜前纤维血管膜 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 手术切除的纤维血管膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11429 | 2025-10-07 |
CAR T-cell detection scoping review: an essential biomarker in critical need of standardization
2023-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006596
PMID:37217245
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综述 | 本文通过范围综述评估CAR-T细胞检测方法的异质性,强调建立标准化报告体系的必要性 | 首次系统评估FDA批准CAR-T细胞临床试验中检测方法的异质性和数据报告不一致性问题 | 仅纳入美国临床试验数据,可能无法代表全球实践;主要关注已发表文献而非原始数据 | 评估CAR-T细胞扩增和持久性检测方法的标准化程度和数据报告质量 | 21项美国CAR-T细胞临床试验的60篇相关文献 | 细胞治疗 | 肿瘤免疫治疗 | 流式细胞术,定量PCR,微滴数字PCR,NanoString,单细胞RNA测序 | NA | 临床检测数据,文献报告数据 | 21项临床试验的60篇文献分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11430 | 2025-10-07 |
A scoping review on the significance of programmed death-ligand 1-inhibiting microRNAs in non-small cell lung treatment: A single-cell RNA sequencing-based study
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1027758
PMID:36388933
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序系统综述了PD-L1抑制性microRNAs在非小细胞肺癌治疗中的意义 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估PD-L1抑制性miRNAs在NSCLC中的作用机制 | 仍需进一步研究将这一方法转化为临床应用 | 系统回顾PD-L1抑制性miRNAs在NSCLC抑制中的意义及其作用机制 | 非小细胞肺癌和PD-L1抑制性microRNAs | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 肿瘤bulk RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
11431 | 2025-10-07 |
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112213
PMID:34560556
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综述 | 本文探讨了PD-L1抑制性microRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及单细胞测序指导的生物相容性递送策略 | 首次系统综述了多种PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的作用,并提出了单细胞测序指导的生物相容性递送新策略 | 仅纳入了2021年3月17日前的文献,未进行定量meta分析 | 评估PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及递送策略 | 结直肠癌细胞及PD-L1抑制性microRNAs | 生物医学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,文献系统检索 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11432 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous tumor and immune cell populations in early-stage lung adenocarcinomas harboring EGFR mutations
2021-01, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-020-01528-0
PMID:33144684
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早期EGFR突变肺腺癌中肿瘤和免疫细胞群体的异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘早期EGFR突变肺腺癌的肿瘤微环境异质性,发现ELF3基因在肿瘤进展中的关键作用 | 样本量相对较小(7个肿瘤样本),仅针对早期EGFR突变肺腺癌 | 解析EGFR突变肺腺癌的肿瘤微环境异质性 | 早期肺腺癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 125,674个细胞(来自7个I/II期肺腺癌样本和5个癌旁组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11433 | 2025-10-07 |
MAIT Cell-Mediated Immune Mechanisms of Dialysis-Induced Peritoneal Fibrosis and Therapeutic Targeting
2025-Jan-28, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000627
PMID:39874111
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研究论文 | 本研究揭示了黏膜相关恒定T细胞在腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的关键作用机制 | 首次发现MAIT细胞通过MR1受体与间皮细胞相互作用激活mTORC1信号通路促进腹膜纤维化 | 研究样本量有限,主要基于长期腹膜透析患者和动物模型 | 探索腹膜透析诱导腹膜纤维化的免疫机制并寻找治疗靶点 | 长期腹膜透析患者和Mr1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 长期腹膜透析患者和Mr1敲除小鼠 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
11434 | 2025-10-07 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
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研究论文 | 本研究探讨NRF2-KEAP1抑制剂DDO1002在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次揭示DDO1002通过激活NRF2-ARE通路改善衰老造血干细胞功能并缓解辐射诱导的造血损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需验证 | 探究DDO1002对造血干细胞衰老和辐射损伤的保护作用 | 造血干细胞(HSCs),特别是衰老小鼠的造血干细胞 | 干细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞测序,竞争性移植实验 | NA | 基因表达数据,细胞功能数据 | 衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11435 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合从胚胎期到老年期的单细胞RNA测序数据,系统描绘卵巢基质细胞的发育轨迹和细胞间通讯网络,并鉴定出CD24阳性间充质祖细胞作为基质细胞起源 | 研究主要基于小鼠模型,人类卵巢中的情况可能需要进一步验证 | 探索卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从胚胎11.5天到12月龄小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11436 | 2025-10-07 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了GPR35在MASLD中调控肝脏分区特异性脂质代谢的机制 | 首次结合空间转录组学、空间代谢组学和脂质代谢组学,在肝脏分区水平上系统解析GPR35调控MASLD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明GPR35在代谢功能障碍相关脂肪肝病中调控肝脏分区特异性基因表达和代谢物分布的机制 | 小鼠肝脏组织,重点关注GPR35缺陷模型在MASLD进展中的变化 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学,空间代谢组学,脂质代谢组学 | NA | 空间基因表达数据,空间代谢物分布数据 | GPR35缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
11437 | 2025-10-07 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
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研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组和染色质可及性分析揭示卵巢体细胞的进化特征 | 首次在人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子五个物种中整合分析单细胞转录组和染色质可及性数据,揭示卵巢细胞进化规律 | 研究仅针对成年卵巢,未涵盖发育过程;物种数量有限 | 探究不同物种间卵巢体细胞分子机制的保守性与差异性 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢体细胞 | 单细胞多组学 | 卵巢生理与疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 五个物种的卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
11438 | 2025-10-07 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
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研究论文 | 通过比较分析人类iPSC-NK细胞分化与NK细胞发育的转录景观,识别诱导分化过程中的关键缺失因子 | 首次对胎儿肝脏NK细胞和iPSC-NK细胞进行关键分化阶段的比较性单细胞转录组分析,并创建具有NK细胞和巨噬细胞双重特征的STAT5A-iPSC新细胞系 | 未明确说明样本数量和实验重复次数,STAT5A-iPSC新细胞系的功能验证需要进一步临床前研究 | 解析iPSC-NK细胞分化机制以改进治疗性iNK细胞的生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11439 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
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综述 | 总结单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新进展,及其在肿瘤研究中的整合应用 | 整合单细胞转录组和表观遗传测序数据的生物信息学策略,深化对肿瘤发生发展的理解 | 未提及具体实验样本量和数据验证结果 | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用与整合策略 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
11440 | 2025-10-07 |
Generation of renal tubular organoids from adult SOX9+ kidney progenitor cells
2023-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad047
PMID:39872058
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研究论文 | 本研究从成年SOX9+肾脏祖细胞成功生成了肾小管类器官 | 首次证明成年SOX9+肾脏祖细胞具有自主形成肾脏类器官的能力 | 无法分化为肾小球细胞 | 研究SOX9+肾脏祖细胞的分化潜能和类器官形成能力 | 小鼠和人类的SOX9+肾脏祖细胞 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |