单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 11401 - 11420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11401 | 2024-08-04 |
Prognostic and therapeutic insights into colorectal carcinoma through immunogenic cell death gene profiling
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17629
PMID:38938617
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研究论文 | 本研究探讨了免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用，并开发了新型的量化系统来预测患者的预后与免疫治疗效果 | 开发了一种新颖的免疫原性细胞死亡量化系统，并在肿瘤免疫微环境中构建了ICD评分 | 本研究侧重于结直肠癌的特定类型，可能无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用与预测患者治疗结果的潜力 | 研究对象为被诊断为结肠腺癌/直肠腺癌的1,184名患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 主成分分析 (PCA) | 基因组数据 | 1,184名结肠腺癌/直肠腺癌患者 |
| 11402 | 2024-08-04 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Uncover and Elucidate GP73-Mediated Pro-Angiogenic Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0387
PMID:38939041
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研究论文 | 本研究展示了GP73介导的促血管生成调控网络在肝细胞癌中的作用 | 揭示了GP73与血管内皮细胞的细胞通信及其在肝细胞癌血管发育中的作用 | 研究可能未能涵盖所有肝细胞癌类型及其复杂性 | 探讨GP73在肝细胞癌中促血管生成的机制及其临床相关性 | 肝细胞癌患者的细胞及其在血管生成中的关键角色 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 细胞、血清 | 肝细胞癌患者的样本未具体说明 |
| 11403 | 2024-08-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies an aneuploidy-based gene signature to predict sensitivity of lung adenocarcinoma to traditional chemotherapy drugs and patients' prognosis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17545
PMID:38938612
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研究论文 | 该文章研究了一个基于基因签名的模型，以预测肺腺癌对传统化疗药物的敏感性和患者的预后 | 开发了一个五基因异倍体相关风险评分（ARS）模型，发现高表达的CKS1B促进肺腺癌细胞系的增殖、迁移和侵袭性表型 | 目前对异倍体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗能力的研究仍然有限 | 研究异倍体相关基因在肺腺癌中的潜在作用，以改善诊断和治疗方法 | 以肺腺癌（LUAD）细胞系为研究对象，筛选与异倍体相关的基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归与Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用公共数据库的肿瘤数据以及细胞实验验证 |
| 11404 | 2024-08-05 |
Identification of CD133+ intercellsomes in intercellular communication to offset intracellular signal deficit
2023-10-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86824
PMID:37846866
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研究论文 | 本文报道了CD133在细胞间通信中的作用，以补偿细胞内信号不足 | 提出了名为'intercellsome'的细胞间结构，并发现其与CD133表达相关 | 尚未探讨CD133 intercellsomes在其他组织或不同生理环境下的行为 | 研究CD133在细胞间通信和应对细胞内信号不足中的作用 | 主要研究CD133阳性肝细胞及其在肝再生中的表现 | 数字病理 | 肿瘤相关疾病 | 单细胞RNA测序，超分辨率显微镜，电子显微镜 | NA | mRNA | 多个动物物种中的癌细胞类型和肝脏、肠脏的原器官 |
| 11405 | 2024-08-05 |
Signature morphoelectric properties of diverse GABAergic interneurons in the human neocortex
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf6484
PMID:37824669
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研究论文 | 本研究分析了人类新皮层中多样的GABA能中间神经元的特征和形态电性质 | 采用快速GABA能神经元病毒遗传标记和Patch-seq技术，可靠地对人类皮层GABA能神经元亚类进行目标分析 | 研究主要集中在活体切片，可能无法完全代表神经元在体内的真实状态 | 探究人类大脑GABA能神经元的转录组多样性及其形态特征 | 人类新皮层的GABA能神经元亚类及其个别转录组类型 | 数字病理学 | NA | Patch-seq | NA | 转录组数据 | 人脑切片的多个样本 |
| 11406 | 2024-08-05 |
Key Genetic Determinants Driving Esophageal Squamous Cell Carcinoma Initiation and Immune Evasion
2023-09, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.030
PMID:37257519
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研究论文 | 本研究揭示了TP53、CDKN2A和NOTCH1的缺失如何诱导食道肿瘤和免疫逃逸，促进食道鳞状细胞癌的发生 | 建立了32种基因工程食道类器官，并识别出驱动食道鳞状细胞癌启动的关键基因决定因素 | 本研究的局限性在于只涉及小鼠模型，是否适用于人类尚需进一步验证 | 探索食道鳞状细胞癌的启动机制和免疫逃逸的遗传决定因素 | 使用CRISPR/Cas9基因敲除技术靶向9个基因进行的食道类器官研究 | 数字病理学 | 食道癌 | CRISPR/Cas9 | 小鼠食道类器官 | 单细胞RNA测序 | 32个基因工程食道类器官 |
| 11407 | 2024-08-04 |
Smooth muscle α-actin missense variant promotes atherosclerosis through modulation of intracellular cholesterol in smooth muscle cells
2023-08-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehad373
PMID:37377039
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研究论文 | 该研究探讨了平滑肌α-肌动蛋白突变如何通过调节平滑肌细胞内胆固醇促进动脉粥样硬化 | 建立了一种新的机制，表明平滑肌特异性收缩蛋白中的致病性突变与动脉粥样硬化的易感性有关 | 研究未考虑其他可能影响动脉粥样硬化的环境因素 | 研究平滑肌α-肌动蛋白变异如何导致动脉粥样硬化 | 使用携带ACTA2变异的小鼠模型和体外提取的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基因组学，单细胞转录组分析 | NA | 生物样本 | Apoe-/-小鼠及其携带和不携带变异的平滑肌细胞 |
| 11408 | 2024-08-04 |
Integrated multi-omics analyses reveal homology-directed repair pathway as a unique dependency in near-haploid leukemia
2023-06-08, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-023-00863-1
PMID:37286545
|
研究论文 | 本文揭示了近单倍体白血病依赖同源重组修复通路的独特性 | 首次系统性地揭示了近单倍体白血病中RAD51B作为关键基因的重要性 | 研究主要集中在细胞周期特定的基因表达，而对其他潜在机制的探讨有限 | 揭示近单倍体急性淋巴细胞白血病的独特生理特征及潜在易感性 | 近单倍体急性淋巴细胞白血病细胞及相关基因 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量近单倍体急性淋巴细胞白血病患者样本 |
| 11409 | 2024-08-05 |
Upregulation of acid ceramidase contributes to tumor progression in tuberous sclerosis complex
2023-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166850
PMID:36927688
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研究论文 | 本研究探讨了酸性神经酰胺酶在结节性硬化症中对肿瘤进展的贡献 | 研究首次揭示了TSC2缺失细胞中ASAH1上调与肿瘤形成相关的机制 | 仅在小鼠模型中进行实验，未在人类样本中验证结果 | 探讨ASAH1在结节性硬化症（TSC）和淋巴管平滑肌肉瘤（LAM）中的作用 | 研究对象为结节性硬化症相关突变细胞及其小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 结节性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TSC2缺失的小鼠模型和人类细胞样本 |
| 11410 | 2024-08-05 |
Hermansky-Pudlak syndrome type 1 causes impaired anti-microbial immunity and inflammation due to dysregulated immunometabolism
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00572-1
PMID:36302964
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研究论文 | 本研究探讨了Hermansky-Pudlak综合症1型中免疫代谢失调对抗微生物免疫和炎症的影响 | 揭示了HPS1缺乏如何通过Rab32介导的mTOR信号通路改变代谢程序，并影响抗微生物反应 | 该研究的细胞机制和临床显著性仍需进一步验证 | 理解Hermansky-Pudlak综合症1型中炎症的细胞基础 | 研究HPS-1患者的外周血细胞和血清 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 大规模细胞测定、蛋白组学和转录组学分析 | NA | 血液样本、组织样本 | HPS-1患者的外周血细胞和血清样本 |
| 11411 | 2024-08-05 |
STRT-seq-2i: dual-index 5' single cell and nucleus RNA-seq on an addressable microwell array
2017-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-16546-4
PMID:29180631
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRT-seq-2i的新型单细胞RNA测序技术 | STRT-seq-2i结合了可寻址的9600微孔阵列和高通量成像，具有竞争性成本的独特优势 | 该研究未提及对老龄化人脑样本的具体应用效果 | 研究旨在提高对单细胞RNA测序技术的高通量应用能力 | 研究对象包括新鲜的小鼠皮质细胞和冷冻的死后人类皮质核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞 RNA 数据 | 使用了新鲜小鼠皮质细胞和冷冻人类皮质核的样本 |
| 11412 | 2024-08-05 |
VISTA deficiency exerts anti-tumor effects in breast cancer through regulating macrophage polarization
2024-Jul-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112365
PMID:38820964
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research paper | 本研究首次揭示了VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞的影响 | 揭示了VISTA通过STAT通路调节巨噬细胞极化，进而影响肿瘤生长 | 未涉及VISTA在其他类型肿瘤中的作用 | 探讨VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响 | 乳腺癌中的巨噬细胞 | NA | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | NA | 体内实验中使用了VISTA缺失小鼠 |
| 11413 | 2024-08-05 |
Immune Response following FLASH and Conventional Radiation in Diffuse Midline Glioma
2024-Jul-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.01.219
PMID:38364947
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研究论文 | 本研究探讨了FLASH和常规放疗对弥漫性中线胶质瘤免疫微环境的影响 | 首次以单细胞分辨率描绘了CONV和FLASH对DMG免疫的变化 | 研究尚未探讨不同细胞类型和剂量率对免疫反应的更广泛影响 | 研究FLASH与常规放疗对弥漫性中线胶质瘤免疫微环境的影响 | 使用正交同种小鼠模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和流式细胞术 | NA | 免疫细胞数据 | NA |
| 11414 | 2024-08-04 |
Wnt Signaling Inhibition Prevents Postnatal Inflammation and Disease Progression in Mouse Congenital Myxomatous Valve Disease
2024-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320388
PMID:38660802
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研究论文 | 本研究探讨了Wnt信号通路抑制对小鼠先天性黏液性瓣膜疾病的后续炎症和疾病进展的影响 | 首次揭示了Wnt信号在MVD早期启动中的作用，并提出了Wnt信号作为早期治疗的潜在靶标 | 在MVD开始后2个月施用Wnt抑制剂未能阻止疾病进展，说明治疗时机的限制 | 研究Wnt信号在小鼠先天性黏液性瓣膜疾病中的作用及其治疗潜力 | Fbn1C1039G/+基因变异的小鼠模型 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠基因变异模型 |
| 11415 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the differentiation of bone marrow haematopoietic cells in patients with paroxysmal nocturnal haemoglobinuria
2024-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1671
PMID:38924689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11416 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
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研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少，仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本（四个琼脂样透明带患者和四个健康供体） |
| 11417 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11418 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系，并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析（GSEA），单细胞转录组分析，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 使用了多种数据集，包括TCGA、GTEx和CGGA |
| 11419 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 |
| 11420 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 |