单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 11401 - 11420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11401 | 2024-08-05 |
Activated Clec4nhi Neutrophils Aggravate Lung Injury in an Endothelial IGFBP7-Dependent Manner
2024-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0017OC
PMID:38574235
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞亚型在急性肺损伤中的作用，尤其是IGFBP7在调节炎症反应和屏障功能中的影响 | 揭示了IGFBP7在不同类型内皮细胞中的差异表达及其在急性肺损伤中引发的炎症和屏障功能障碍 | 具体亚型的内皮细胞在临床上的作用仍需进一步研究 | 研究IGFBP7在急性肺损伤中的角色及其潜在的治疗靶点 | 急性肺损伤模型中的内皮细胞和炎症细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 用脂多糖建立的急性肺损伤模型小鼠 |
| 11402 | 2024-08-05 |
Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9
2024-Jun-28, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003104
PMID:38945689
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研究论文 | 本研究探讨迷走神经如何通过CXCL9调节急性慢性肝衰竭的进展。 | 本研究首次揭示了迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴在急性慢性肝衰竭发展中的作用。 | 本研究的局限性在于缺乏对人类样本的广泛验证。 | 研究迷走神经在急性慢性肝衰竭中的神经免疫交互作用。 | 急性慢性肝衰竭模型小鼠和人类患者。 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), CRISPR/Cas9技术 | NA | 蛋白质组学数据 | ACLF模型小鼠和患者样本 |
| 11403 | 2024-08-05 |
Cellular and transcriptional profiles of peripheral blood mononuclear cells pre-vaccination predict immune response to preventative MUC1 vaccine
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598031
PMID:38948837
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研究论文 | 这项研究探讨了预接种外周血单核细胞的细胞和转录组特征，以预测对MUC1疫苗的免疫反应 | 首次揭示了在恶性前期环境中，免疫系统可能已经受到抑制，并确定了预测免疫反应的潜在生物标志物 | 样本量较小，且仅在特定人群中进行研究，可能不具普遍适用性 | 研究MUC1肿瘤抗原疫苗的免疫反应预测因子 | 来自16名免疫反应者和16名非响应者的预接种外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 大肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞生物学数据 | 32个样本（16名免疫响应者和16名非响应者） |
| 11404 | 2024-08-05 |
Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor
2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2319623121
PMID:38889142
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研究论文 | 这篇文章探讨了低氧诱导因子2α(HIF-2α)在心脏移植过程中促进耐受性巨噬细胞发育的机制 | 文章首次揭示了HIF-2α作为耐受性单核细胞的关键转录因子，并与CSF1R的表达调控相联系 | 研究中使用的小鼠模型可能限制了结果在临床转化中的适用性 | 探讨介导移植耐受的不同因素 | 急性排斥或耐受性的心脏同种异体移植物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及急性拒绝或耐受心脏同种异体移植物的样本数量未指定 |
| 11405 | 2024-08-04 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
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研究论文 | 开发了一种基于纳米粒子的肌腱靶向药物传递系统以药理调节肌腱愈合 | 首次利用TRAP结合肽功能化的纳米粒子药物传递系统改善肌腱的药物靶向性 | 研究主要基于实验室数据，临床应用效果尚待进一步验证 | 提高肌腱愈合过程中的药物传递效率 | 急性肌腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米粒子药物传递系统 | NA | NA | NA |
| 11406 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Jun-20, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.06.008
PMID:38908487
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研究论文 | 本研究构建了小鼠胰腺导管树的单细胞图谱，识别了具有潜在胰腺再生和外分泌病理学影响的新细胞群体 | 首次识别出15种新型胰腺导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 尚未在体内进一步验证这些新细胞群体的特定功能 | 旨在全面表征小鼠胰腺导管的单细胞异质性及其在再生和病理中的作用 | 研究对象包括小鼠胰腺的导管细胞和胰腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 包括健康胰腺、慢性胰腺炎和肿瘤样本的多个细胞群体 |
| 11407 | 2024-08-05 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49242-9
PMID:38898015
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研究论文 | 本研究开发了一种新模型CTMM，用于检测和量化单细胞RNA测序中的细胞类型特异性个体间变异 | 提出了一种新的细胞类型特异性线性混合模型CTMM，用于深入理解细胞类型特异性的生物学 | 样本量有限可能影响细胞类型特异性个体间变异的检测精度 | 阐明细胞类型特异性生物学，并识别与复杂性状相关的基因和细胞类型 | 人诱导多能干细胞中细胞分化为内胚层时的转录组变异 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞类型特异性线性混合模型 (CTMM) | 转录组数据 | 使用人诱导多能干细胞的有限样本进行研究 |
| 11408 | 2024-08-05 |
Patho-transcriptomic analysis of invasive mucinous adenocarcinoma of the lung (IMA): comparison with lung adenocarcinoma with signet ring cell features (SRCC)
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598839
PMID:38948839
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研究论文 | 该论文分析了侵袭性粘液腺癌（IMA）与具有印戒细胞特征的肺腺癌（SRCC）之间的病理转录组学比较。 | 通过Visium空间转录组学方法揭示了IMA和SRCC中存在的六种不同细胞簇，并识别了各自特征性基因的表达差异。 | 缺乏有效治疗IMA的措施，且在无法进行手术切除的情况下，研究重点可能受限于分子机制的完整性。 | 研究侵袭性粘液腺癌的分子机制及其与印戒细胞特征肺腺癌的差异。 | 侵袭性粘液腺癌（IMA）和具有印戒细胞特征的肺腺癌（SRCC）。 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了两种腺癌类型的不同细胞群体，具体样本数量未提供 |
| 11409 | 2024-08-05 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育程序的转录和表观遗传图谱 | 揭示了与年龄相关的不同基因调控程序的发生学，并识别出一个随年龄发散的基因模块 | 研究中可能未涵盖所有影响T细胞发育的因素 | 探讨年龄如何影响T细胞的发展 | 新生小鼠和成年小鼠的T细胞发育程序 | 数字病理学 | NA | CRISPR和单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传数据 | 新生小鼠和成年小鼠的多样本 |
| 11410 | 2024-08-05 |
Tissue fibroblasts are versatile immune regulators: An evaluation of their impact on the aging process
2024-06, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102296
PMID:38588867
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research paper | 本文章探讨了成纤维细胞作为免疫调节剂在老化过程中的作用 | 揭示了成纤维细胞在组织免疫和炎症中的多种功能及其在老化过程中的重要性 | 未明确提及具体的实验数据和样本量 | 探究成纤维细胞与免疫细胞在衰老过程中的相互作用 | 老化组织中分离的成纤维细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 基因表达数据 | 来自老化组织的成纤维细胞 |
| 11411 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling Reveals the Impact of Genetic Alterations on the Differentiation of Inflammation-Induced Murine Colon Tumors
2024-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16112040
PMID:38893159
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研究论文 | 该研究揭示了基因突变如何影响炎症诱导的鼠类结肠肿瘤细胞分化 | 本研究首次明确了在炎症诱导的结肠肿瘤中，BLM和MSH2KO突变对肿瘤细胞分化的不同影响 | 研究主要基于鼠类模型，可能无法完全代表人类结肠癌的复杂性 | 探讨基因突变对炎症诱导的结肠肿瘤细胞分化的影响 | 以炎症诱导的鼠类结肠肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种突变的鼠类肿瘤样本 |
| 11412 | 2024-08-04 |
Critical view on oligo(dT)-based RNA-seq: bias arising, modeling, and mitigating
2024-03-06, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad190
PMID:37857456
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研究论文 | 本文探讨了基于oligo(dT)的RNA测序中存在的偏差及其缓解方法。 | 本研究识别了两个新的未被考虑的偏差，并发展出一种普适的缓解方法以减少这些偏差的影响。 | 研究可能未涵盖所有类型的RNA测序偏差，且其通用性需进一步验证。 | 研究的目的是理解和解决基于oligo(dT)的RNA测序数据中的偏差。 | 研究主要集中在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集及其分析上。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 11413 | 2024-08-05 |
ACC1-mediated fatty acid biosynthesis intrinsically controls thymic iNKT cell development
2024-Feb-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad049
PMID:38041796
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研究论文 | 本研究发现ACC1在胸腺iNKT细胞发育中起关键作用 | 首次揭示了ACC1通过控制细胞生存来调控胸腺iNKT细胞发育的新功能 | 在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探讨代谢通路在iNKT细胞发育中的作用 | 小鼠模型中缺乏T细胞特异性ACC1的情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型（数量未具体说明） |
| 11414 | 2024-08-04 |
Characterizing hub biomarkers for post-transplant renal fibrosis and unveiling their immunological functions through RNA sequencing and advanced machine learning techniques
2024-02-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04971-9
PMID:38378674
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研究论文 | 本文探讨了肾移植后肾纤维化的中心生物标志物及其免疫功能 | 识别了与肾纤维化相关的四个核心基因及其潜在的有效小分子，提出了新的研究思路 | 缺乏临床数据验证所识别生物标志物的实用性 | 研究肾移植后肾纤维化的生物标志物及其机制 | 聚焦于肾纤维化患者的基因组数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞测序、加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | NA | 转录组数据 | 从NCBI基因表达综合体 (GEO) 获取的多名患者的数据和小鼠模型 |
| 11415 | 2024-08-04 |
Senescent fibroblast facilitates re-epithelization and collagen deposition in radiation-induced skin injury through IL-33-mediated macrophage polarization
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04972-8
PMID:38369466
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研究论文 | 这篇文章探讨了衰老成纤维细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用 | 本研究揭示了p16表达的衰老成纤维细胞通过分泌IL-33促进辐射诱导的皮肤愈合的机制 | 本研究的限制在于未完全阐明所有潜在的细胞机制和其他因素 | 研究衰老细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用及其机制 | 辐射诱导的皮肤损伤中的衰老成纤维细胞及其对愈合过程的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | 单细胞数据, 组学数据 | NA |
| 11416 | 2024-08-05 |
Diffuse large B-cell lymphoma: the significance of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes exhaustion mediated by TIM3/Galectin-9 pathway
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05002-3
PMID:38369502
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研究论文 | 本研究探讨了TIM3/Galectin-9通路在弥漫大B细胞淋巴瘤中对CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫的意义 | 首次揭示了TIM3/Galectin-9通路在CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫及免疫逃逸中的关键作用 | 对TIM3介导的CD8+TILs疲惫机制的理解仍然较为有限 | 明确TIM3介导的CD8+TILs疲惫的潜在通路及其在弥漫大B细胞淋巴瘤中的重要性 | 研究对象为弥漫大B细胞淋巴瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | RNA，免疫组化 | NA |
| 11417 | 2024-08-05 |
Potential crosstalk between SPP1 + TAMs and CD8 + exhausted T cells promotes an immunosuppressive environment in gastric metastatic cancer
2024-02-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04688-1
PMID:38365757
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研究论文 | 本文研究了SPP1+ TAM与CD8+衰竭T细胞在胃癌转移中的相互作用及其免疫抑制环境的影响 | 首次揭示了SPP1+ TAMs与CD8+衰竭T细胞之间的相互作用及其在胃癌转移中的免疫抑制作用 | 研究主要依赖于动物模型，可能存在物种间差异 | 探讨SPP1+ TAM在胃癌转移中的作用 | SPP1+ TAM和CD8+衰竭T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析和动物模型 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11418 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals immunosuppressive landscape in overweight and obese colorectal cancer
2024-02-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04921-5
PMID:38311726
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研究论文 | 本研究探讨了超重和肥胖结直肠癌（CRC）的免疫抑制环境和代谢特征 | 首次在单细胞层面揭示了超重和肥胖CRC的免疫抑制微环境和特定代谢重编程 | 样本量相对较小，仅包括15名超重/肥胖及15名正常体重CRC患者 | 深入理解超重和肥胖CRC的肿瘤特征以推动更有效的治疗方案 | 超重/肥胖及正常体重的结直肠癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 192,785个细胞，来自30名CRC患者的样本 |
| 11419 | 2024-08-05 |
A fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02139-9
PMID:38191932
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞组学数据分析的非线性降维算法SnapATAC2 | 该算法在提高单细胞组学数据异质性捕捉精度的同时，确保了运行时和内存使用的高效性 | 传统降维技术在计算效率和生物多样性描述上仍面临挑战 | 研究单细胞组学数据的降维与细胞异质性分析 | 多种单细胞组学数据集，包括单细胞RNA测序等 | 数字病理 | NA | 单细胞组学技术 | 非线性降维算法 | 组学数据 | 多个单细胞组学数据集 |
| 11420 | 2024-08-05 |
Prognostic and predictive value of super-enhancer-derived signatures for survival and lung metastasis in osteosarcoma
2024-01-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04902-8
PMID:38254188
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研究论文 | 本研究探讨了超增强子衍生签名在骨肉瘤生存和肺转移中的预后和预测价值 | 该研究开发了基于超增强子的预后签名，显著提高了骨肉瘤患者的预后准确性 | 本研究仅基于回顾性分析，缺乏前瞻性验证 | 提高骨肉瘤患者的预后评估准确性 | 研究对象为212名接受标准治疗的骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 212名骨肉瘤患者的样本 |