单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11401 - 11420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11401 | 2025-10-07 |
Tumour heterogeneity and personalized treatment screening based on single-cell transcriptomics
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.12.020
PMID:39877290
|
研究论文 | 基于单细胞转录组数据构建肿瘤细胞异质性图谱并探索个性化治疗策略 | 整合五种癌症的单细胞转录组数据，识别肿瘤细胞亚群特异性生物标志物和潜在治疗药物，并将不同癌症的肿瘤细胞亚群按治疗策略分为三大类 | 仅分析了五种常见癌症类型，样本量有限，需要进一步实验验证 | 研究肿瘤异质性并开发个性化治疗筛选方法 | 肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌和肝癌患者 | 数字病理学 | 肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌、肝癌 | 单细胞转录组测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 五个单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11402 | 2025-10-07 |
Transcriptional Profiling of Testis Development in Pre-Sexually-Mature Hezuo Pig
2024-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47010010
PMID:39852125
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析合作猪青春期前睾丸发育的转录组特征 | 首次在合作猪中应用单细胞RNA测序技术解析睾丸细胞异质性，揭示了Leydig细胞和肌样细胞共同祖细胞来源 | 仅分析了一个月龄的青春期前样本，缺乏发育时间序列数据 | 探究合作猪睾丸发育过程中不同细胞类型的转录变化 | 合作猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,276个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 11403 | 2025-10-07 |
SSL5-AnxA5 Fusion Protein Constructed Based on Human Atherosclerotic Plaque scRNA-Seq Data Preventing the Binding of Apoptotic Endothelial Cells, Platelets, and Inflammatory Cells
2024-Dec-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010008
PMID:39857592
|
研究论文 | 基于人动脉粥样硬化斑块单细胞测序数据构建SSL5-AnxA5融合蛋白，用于阻止凋亡内皮细胞、血小板和炎症细胞的结合 | 首次基于人动脉粥样硬化斑块单细胞测序数据构建双功能融合蛋白SSL5-AnxA5，能够同时靶向PSGL1和凋亡细胞 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内验证 | 开发预防斑块破裂后动脉阻塞的新型治疗蛋白 | 人动脉粥样硬化斑块、凋亡内皮细胞、血小板、炎症细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, PCR, Western blot, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 从GEO数据库获取的SAP和ACS患者斑块单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11404 | 2025-10-07 |
Disruption of immune responses by type 1 diabetes exacerbates SARS-CoV-2 mediated lung injury
2024-Dec-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00250.2024
PMID:39320093
|
研究论文 | 本研究探讨1型糖尿病如何通过破坏免疫反应加剧SARS-CoV-2感染引起的肺损伤 | 开发了用于高度固定组织流式细胞分析的新技术，并首次在糖尿病模型中揭示炎症性巨噬细胞特征与COVID-19严重程度的关联 | 研究使用小鼠模型，结果可能不能完全适用于人类；组织分析受生物安全限制 | 评估1型糖尿病对COVID-19肺炎严重程度的影响机制 | 野生型小鼠感染小鼠适应型SARS-CoV-2的糖尿病模型 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 转录组分析，流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 糖尿病和正常血糖小鼠对照研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11405 | 2025-10-07 |
A prenatal skin atlas reveals immune regulation of human skin morphogenesis
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08002-x
PMID:39415002
|
研究论文 | 本研究构建了人类产前皮肤的多组学参考图谱，揭示了免疫细胞在皮肤形态发生中的关键调控作用 | 首次系统揭示了先天免疫细胞通过与非免疫细胞相互作用调控皮肤形态发生、毛囊形成和无瘢痕伤口愈合的新功能 | 皮肤类器官模型缺乏免疫细胞且内皮细胞异质性和数量显著减少 | 探究先天免疫细胞在人类皮肤形态发生中的功能 | 人类产前皮肤(7-17孕周)、皮肤类器官模型、人胚胎干细胞和诱导多能干细胞 | 空间转录组学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | 皮肤类器官模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 7-17孕周人类产前皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 11406 | 2025-10-07 |
Construction and Validation of a Novel T/NK-Cell Prognostic Signature for Pancreatic Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Nov, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2024.2424328
PMID:39523741
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序构建并验证了胰腺癌的新型T/NK细胞预后标志物 | 首次利用配对的原发性和转移性胰腺癌组织单细胞RNA测序数据，鉴定出T/NK细胞亚群在转移过程中的关键作用，并构建了6基因预后模型 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模的研究验证模型的普适性 | 开发胰腺癌预后预测模型并探索转移机制 | 胰腺癌患者的原发性和转移性肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 3例胰腺癌患者的配对原发和转移肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11407 | 2025-10-07 |
Scoping Review: Methods and Applications of Spatial Transcriptomics in Tumor Research
2024-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16173100
PMID:39272958
|
综述 | 本文通过范围综述方法总结了空间转录组学在肿瘤研究中的方法学进展和应用现状 | 系统分析了截至2023年底的41篇文献和公共数据库，明确了空间转录组学在肿瘤研究中的主流平台、数据分析方法和应用趋势 | 近半数研究缺乏完整的数据处理流程描述，影响了研究的可重复性 | 评估空间转录组学在肿瘤研究中的方法学挑战和实际应用价值 | 41篇已发表文献和公共数据资源库 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学，单细胞测序，免疫组织化学 | SCTransform | 基因表达数据，空间位置信息 | 41篇文献分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |
| 11408 | 2025-10-07 |
Delving deeper into the mechanisms fundamental to HIV-associated immunopathology using single-cell sequencing techniques: A scoping review of current literature
2024-Aug-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35856
PMID:39224354
|
综述 | 通过系统回顾14项HIV相关单细胞RNA测序研究，深入探讨HIV感染免疫病理机制 | 首次系统整合单细胞RNA测序技术在HIV免疫病理机制研究中的应用现状 | 仅纳入14项研究，样本量有限，且为范围综述而非系统性荟萃分析 | 阐明HIV相关免疫病理机制并探索疾病进展和治疗的潜在生物标志物 | HIV感染者的免疫细胞（CD4 T细胞、CD8 T细胞、B细胞、NK细胞、髓样树突状细胞） | 单细胞组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14项已发表研究 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11409 | 2025-10-07 |
Molecular dynamics of chemotactic signalling orchestrates dental pulp stem cell fibrosis during aging
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1530644
PMID:39866843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了衰老过程中牙髓纤维化的分子机制，发现RARRES2/CCRL2/CMKLR1信号轴在调控巨噬细胞活化与牙髓纤维化中的关键作用 | 首次发现Ccrl2巨噬细胞在衰老早期易感性，并阐明RARRES2/CCRL2/CMKLR1信号轴通过调控免疫微环境驱动牙髓纤维化的新机制 | 研究主要聚焦于分子机制层面，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究衰老过程中牙髓纤维化的分子机制 | 牙髓干细胞、巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 牙髓疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 自有数据集和公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11410 | 2025-10-07 |
Genetic variation in patent foramen ovale: a case-control genome-wide association study
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1523304
PMID:39872005
|
研究论文 | 通过全基因组关联研究识别与卵圆孔未闭相关的遗传变异 | 首次在中国人群中开展卵圆孔未闭的全基因组关联研究，结合单细胞测序分析揭示相关基因在心脏发育中的表达模式 | 样本量相对有限，仅在中国人群中进行研究 | 识别与卵圆孔未闭相关的常见遗传变异 | 3,227名中国参与者（发现队列517例病例和517例对照，验证队列111例病例和152例对照） | 基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组测序, Sanger测序, 单细胞测序, 表达数量性状位点分析 | 伪时间轨迹建模 | 基因组数据, 单细胞表达数据 | 发现队列1,034人，验证队列263人 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11411 | 2025-10-07 |
Integration of histone modification-based risk signature with drug sensitivity analysis reveals novel therapeutic strategies for lower-grade glioma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1523779
PMID:39872055
|
研究论文 | 本研究开发了基于组蛋白修饰的风险特征模型，并分析其与药物敏感性的关系，为低级别胶质瘤提供个性化治疗策略 | 首次构建基于组蛋白修饰的风险特征模型，整合单细胞RNA测序和多组学数据分析，揭示风险分层与药物敏感性的关联 | 样本量相对有限，单细胞RNA测序仅使用4个样本，需要更多独立队列验证 | 开发低级别胶质瘤预后预测模型并指导个性化治疗 | 低级别胶质瘤患者 | 生物信息学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 多组学整合分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 临床数据, 药物敏感性数据 | TCGA-LGG数据集513例, CGGA数据集1018例(693+325), 单细胞测序4例 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11412 | 2025-10-07 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to explore prognostic value and immune landscapes of methionine metabolism-related signature in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1521269
PMID:39877420
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，探索了乳腺癌中甲硫氨酸代谢相关特征的预后价值和免疫景观 | 首次构建基于甲硫氨酸代谢相关基因的乳腺癌预后特征，并发现关键基因APOC1在调控巨噬细胞极化中的新功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索甲硫氨酸代谢在乳腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者和乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, Cox回归, 体外实验 | 预后风险评分模型 | 转录组数据 | 基于TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11413 | 2025-10-07 |
Revisiting the female germline cell development
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1525729
PMID:39877734
|
综述 | 回顾雌性生殖细胞发育过程及其调控机制的最新研究进展 | 整合单细胞转录组/空间转录组学等先进技术揭示雌性生殖细胞发育的关键调控网络 | NA | 探索雌性生殖细胞发育的关键调控机制 | 开花植物的雌性生殖细胞系 | 植物发育生物学 | NA | 全标本单分子荧光原位杂交,激光辅助显微切割,染色质免疫沉淀测序,CRISPR基因编辑,单细胞转录组分析,空间转录组学 | NA | 转录组数据,表观遗传数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 11414 | 2025-10-07 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
|
研究论文 | 开发了基于单细胞转录组学的精准医学计算流程PERCEPTION，用于预测患者对治疗的反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量和单细胞表达谱构建治疗反应模型，在多个临床队列中优于现有预测方法 | NA | 开发精准医学工具以优化癌症患者的个性化治疗方案 | 癌症患者肿瘤单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤,乳腺癌,肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算预测模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11415 | 2025-10-07 |
Accurately deciphering spatial domains for spatially resolved transcriptomics with stCluster
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae329
PMID:38975895
|
研究论文 | 提出一种名为stCluster的新方法，通过整合图对比学习和多任务学习来改进空间转录组数据的表示学习，从而提高空间域识别准确性 | 首次将图对比学习与多任务学习相结合用于空间转录组数据分析，能够识别空间一致性模式并捕获基因表达与空间组织间的复杂关系 | 论文未明确说明方法的具体局限性 | 改进空间转录组数据中的空间域识别准确性 | 空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图对比学习, 多任务学习 | 空间基因表达数据 | 多个数据集和平台，涵盖组织、器官和胚胎水平 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11416 | 2025-10-07 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals the alterations in epithelial cells during nodular formation in benign prostatic hyperplasia
2024-04-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05212-9
PMID:38654277
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了良性前列腺增生结节形成过程中上皮细胞的改变 | 首次发现BE5基底上皮细胞亚群在结节形成中的关键作用，并阐明其通过缺氧诱导的上皮-间质转化信号通路驱动BPH进展的机制 | 技术限制阻碍了对BPH患者的体内深入研究 | 探究良性前列腺增生结节形成的具体机制 | 良性前列腺增生患者的组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,免疫组织化学染色 | RCTD(稳健细胞类型分解) | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,组织图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11417 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics dissects the transcriptome alterations of hematopoietic stem cells in myelodysplastic neoplasms
2024-04-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05165-z
PMID:38632656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析骨髓增生异常肿瘤中造血干细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示MDS患者造血干细胞沿伪时间轴的转录组变化轨迹，并鉴定出PLCB1在白血病转化中的关键作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；体外实验结果需进一步体内验证 | 探索骨髓增生异常肿瘤中造血干细胞分化轨迹和白血病转化机制 | 骨髓增生异常肿瘤患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增生异常肿瘤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | MDS患者造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11418 | 2025-10-07 |
A Systematic Overview of Single-Cell Transcriptomics Databases, their Use cases, and Limitations
2024-Apr-15, ArXiv
PMID:38699169
|
综述 | 系统评述单细胞转录组数据库的分类、应用场景与局限性 | 首次系统性地对大规模单细胞RNA测序数据库进行分类梳理，并提出通过用户友好型平台弥合计算科学与实验科学间的鸿沟 | 未涉及具体实验验证，主要聚焦数据库的宏观分析 | 评估单细胞转录组数据库的现状与发展方向 | 在线单细胞RNA测序数据库与存储库 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11419 | 2025-10-07 |
The integration of single-cell and bulk RNA-seq atlas reveals ERS-mediated acinar cell damage in acute pancreatitis
2024-04-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05156-0
PMID:38605381
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq图谱揭示内质网应激介导的腺泡细胞损伤在急性胰腺炎中的作用机制 | 首次在单细胞水平描绘急性胰腺炎中腺泡细胞的转录组图谱，发现内质网应激和ERAD通路的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明急性胰腺炎的发病机制，特别是腺泡细胞的分子变化 | 急性胰腺炎小鼠的胰腺组织、急性胰腺炎患者的外周血样本 | 单细胞转录组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因集富集分析, 伪时间分析, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据 | 多个单细胞测序数据集和bulk RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11420 | 2025-10-07 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析实验性中风后急性和亚急性期大脑与血液细胞的动态变化 | 首次系统揭示缺血性中风后不同时间点大脑和血液免疫细胞的转录组动态，预测巨噬细胞原位转分化和中性粒细胞的持续新招募过程 | 研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明缺血性中风后大脑和血液免疫细胞的动态变化和多样性 | 实验性中风小鼠模型中的大脑和血液细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年雌雄小鼠的中风模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |