单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 11381 - 11400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11381 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551692
PMID:37577553
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研究论文 | 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 | 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 | 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 | 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 11382 | 2024-08-05 |
Tumor gene signatures that correlate with release of extracellular vesicles shape the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2023-07-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad019
PMID:36752300
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研究论文 | 这项研究评估了与肿瘤释放的细胞外小泡相关的基因特征对抗肿瘤免疫反应的临床相关性和影响 | 研究揭示了肿瘤基因特征与细胞外小泡产生之间的关系，及其如何影响免疫细胞浸润和抗肿瘤免疫 | 样本来源限制于单一的癌症基因组图谱和几个小型数据集，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨头颈鳞状细胞癌中基因特征与细胞外小泡释放的相关性及其对免疫反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的基因表达和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 522名患者（癌症基因组图谱），250名患者（GSE65858数据集），18名患者（单细胞RNA测序数据集） |
| 11383 | 2024-08-04 |
Polymorphic KIR3DL3 expression modulates tissue-resident and innate-like T cells
2023-06-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade5343
PMID:37390222
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研究论文 | 本研究探讨了多态性KIR3DL3的表达对组织驻留和类固有T细胞的调节作用 | 首次揭示了KIR3DL3在γδ和CD8 T细胞中的高表达及其抑制T细胞受体刺激的功能 | 未能检测到KIR3DL3多态性对配体结合的影响 | 研究KIR3DL3的表达特征及其生物学功能 | 主要对象是KIR3DL3表达的γδ和CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 高分辨率流式细胞术和单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 涉及少量的KIR3DL3表达细胞 |
| 11384 | 2024-08-05 |
Basement membrane proteins in extracellular matrix characterize NF1 neurofibroma development and response to MEK inhibitor
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168227
PMID:37140985
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研究论文 | 本研究系统调查了在神经纤维瘤发展过程中的细胞外基质(ECM)的富集情况 | 发现基底膜(BM)蛋白是上调的ECM成分，而非主要胶原亚型，并且确定了TGF-β1信号在ECM动态中的作用 | 关于神经纤维瘤发展和治疗反应过程中ECM沉积机制的了解仍然有限 | 研究NF1神经纤维瘤中ECM的变化及其对MEK抑制剂治疗的反应 | 以神经纤维瘤的发育和MEK抑制剂的响应为研究对象 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 11385 | 2024-08-05 |
Regionally distinct progenitor cells in the lower airway give rise to neuroendocrine and multiciliated cells in the developing human lung
2023-06-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210113120
PMID:37279279
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研究论文 | 本文描述了在发育中的人类肺部下气道中富集的一种细胞 | 通过单细胞条形码谱系追踪方法，揭示了该细胞与基底细胞的不同分化潜能 | 研究未明确指出具体的局限性 | 研究下气道中细胞的分化潜力及其在上皮多样性中的作用 | 发育中的人类肺部下气道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 11386 | 2024-08-05 |
Improving head and neck cancer therapies by immunomodulation of the tumour microenvironment
2023-03, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00531-9
PMID:36456755
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研究论文 | 本文探讨了通过免疫调节肿瘤微环境改善头颈部癌症治疗的策略 | 文章创新性在于全面分析了头颈部鳞状细胞癌的肿瘤微环境，包括免疫与非免疫细胞的相互作用 | 研究中可能存在样本选择的影响，以及对于小规模的不同TME特征的个体化分析不足 | 研究目的是提高头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤特异性T细胞反应 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其TME | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，高维流式细胞术，空间多光谱成像 | NA | 数据集 | 利用了癌症基因组图谱等丰富的数据资源进行分析 |
| 11387 | 2024-08-05 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.24.529987
PMID:36909553
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研究论文 | 本研究开发了一个新的模型CTMM，以检测和量化个体间的细胞类型特异性变异 | 创新点在于提出了CTMM模型，可以在单细胞RNA测序数据中识别个体之间的细胞类型特异性变异 | 样本规模较小可能会对结果的普适性产生影响 | 研究的目的是提高统计能力，以识别细胞类型特异性的生物学特征 | 研究对象为人类诱导多能干细胞中的转录组变异 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | CTMM | 转录组数据 | NA |
| 11388 | 2024-08-05 |
Tissue-resident C1q + macrophages exert anti-aging potential through the Sirt1 pathway
2024-Jul, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01883-8
PMID:38724770
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研究论文 | 研究表明C1q+巨噬细胞通过Sirt1通路发挥抗衰老潜力 | 首次识别C1q+巨噬细胞在衰老过程中慢性炎症中的相关性 | 目前对老化组织中常驻免疫细胞的Sirt通路角色尚不明确 | 探讨Sirt1通路在老化组织常驻免疫细胞中的作用 | 老龄小鼠模型中的常驻免疫细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 年轻和老龄小鼠的单细胞数据 |
| 11389 | 2024-08-05 |
Ash1 l loss-of-function results in structural birth defects and altered cortical development
2024-Jun-30, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae218
PMID:38943682
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研究论文 | 本研究探讨了ASH1L功能丧失对小鼠生存和颅面骨骼发育的影响 | 首次明确ASH1L在脑部发育中的作用，并探讨了其在自闭症等神经发育障碍中的潜在机制 | 本研究主要在小鼠模型中进行，结果能否完全转化到人类尚需进一步验证 | 研究ASH1L在小鼠脑部发育及颅面结构形成中的作用 | ASH1L缺失的小鼠模型 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 克隆小鼠模型 | 基因表达数据、形态数据 | 生存跟踪77个胚胎，出生后41个小鼠 |
| 11390 | 2024-08-05 |
Macrophages as determinants and regulators of systemic sclerosis-related interstitial lung disease
2024-Jun-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05403-4
PMID:38937794
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在系统性硬化症相关间质性肺病中的影响和调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序区分系统性硬化症相关间质性肺病与特发性肺纤维化，并提出了潜在的预防和治疗方向 | 研究限于使用NCBI Gene Expression Omnibus数据库，可能存在样本偏差 | 阐明系统性硬化症相关间质性肺病与特发性肺纤维化的病理机制差异 | 通过单细胞分析研究健康对照组、特发性肺纤维化及系统性硬化症相关间质性肺病的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用来自GSE159354和GSE212109的样本进行分析 |
| 11391 | 2024-08-05 |
The Alk receptor tyrosine kinase regulates Sparkly, a novel activity regulating neuropeptide precursor in the Drosophila central nervous system
2024-Jun-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88985
PMID:38904987
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研究论文 | 本文描述了Alk受体酪氨酸激酶在果蝇中枢神经系统中调控一种新的神经肽前体的作用 | 揭示了Alk信号通路在神经内分泌基因表达转录调控中的新功能，以及新发现的神经肽前体作为Alk信号的转录靶标 | 对Alk信号通路的具体分子机制理解仍然较为有限 | 探讨Alk受体酪氨酸激酶在果蝇中枢神经系统中的功能及其调控机制 | 研究对象为果蝇幼虫的中枢神经系统和相关的基因表达 | 神经生物学 | NA | Targeted DamID (TaDa) 转录剖析 | NA | scRNA-seq数据和转录组数据 | 果蝇幼虫的中枢神经系统组织 |
| 11392 | 2024-08-05 |
Branching topology of the human embryo transcriptome revealed by Entropy Sort Feature Weighting
2024-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202832
PMID:38691188
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研究论文 | 本文展示了一种新的用于单细胞转录组学分析的特征选择数学框架Entropic Sorting。 | 创新点在于提出了连续熵排序特征加权（cESFW），并展示其在细胞状态特异基因区分上的优越性。 | 未提及具体的局限性 | 研究的目的是开发一种新的特征选择方法，以更好地分析人胚胎发育中的单细胞转录组数据。 | 研究对象为六个合并的人类早期胚胎发育的单细胞转录组数据集。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 六个单细胞转录组数据集 |
| 11393 | 2024-08-04 |
Cell-type specific defects in PTEN-mutant cortical organoids converge on abnormal circuit activity
2023-09-05, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad107
PMID:37384417
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研究论文 | 这篇文章探讨了PTEN基因杂合突变对不同细胞类型在人脑发育中的影响。 | 本研究通过不同供体的人类皮质类器官揭示了PTEN杂合突变对细胞类型特异性发育事件的影响。 | 研究的样本量和供体背景的多样性可能限制了结论的普适性。 | 探讨PTEN基因的杂合突变如何影响人类大脑发育中的不同细胞类型。 | 使用不同供体的人类皮质类器官作为研究对象。 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，空间转录组学 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 不同供体的人类皮质类器官 |
| 11394 | 2024-08-05 |
Cellular reprogramming with ATOH1, GFI1, and POU4F3 implicate epigenetic changes and cell-cell signaling as obstacles to hair cell regeneration in mature mammals
2022-11-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79712
PMID:36445327
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研究论文 | 该研究探讨了使用ATOH1、GFI1和POU4F3进行耳蜗再编程，以克服在成熟哺乳动物中毛细胞再生的障碍 | 揭示了老年动物毛细胞再编程的表观遗传障碍和细胞间信号传导的影响 | 只在特定的转录因子组合下进行了研究，未充分评估其他可能的因素 | 研究耳蜗中毛细胞特异性转录因子对听力恢复的影响 | 使用Cre诱导小鼠模型来比较不同转录因子的毛细胞再编程效果 | 数字病理学 | 听力损失 | scRNA-seq和ATAC-seq | NA | 细胞 | 新生小鼠与1周龄小鼠的比较 |
| 11395 | 2024-08-05 |
Anti-diabetic drug canagliflozin hinders skeletal muscle regeneration in mice
2022-Oct, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-022-00878-7
PMID:35217814
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研究论文 | 这篇文章探讨了抗糖尿病药物canagliflozin对小鼠骨骼肌再生的影响 | 首次揭示了canagliflozin在骨骼肌再生中的负面作用以及LARS2在肌肉干细胞中的关键角色 | 主要研究了小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 研究canagliflozin对小鼠缺血性下肢肌肉再生的影响 | 小鼠和C2C12肌母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 肌肉组织和细胞数据 | 小鼠模型和细胞实验的具体样本量未提及 |
| 11396 | 2024-08-05 |
Spatial profiling of chromatin accessibility in mouse and human tissues
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05094-1
PMID:35978191
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研究论文 | 本文描述了一种通过空间-ATAC-seq方法对组织切片进行空间分辨的染色质可及性分析 | 创新之处在于结合了原位Tn5转座化学和微流体确定性条形码，能够在细胞水平和基因组规模上捕捉组织的空间表观遗传信息 | NA | 研究目的在于改善对细胞身份、状态及命运决策的理解，尤其是与表观遗传基础相关的部分 | 研究对象包括小鼠和人类的脑组织以及扁桃体组织 | 空间生物学 | NA | 下一代测序 | NA | 组织切片 | 使用了小鼠胚胎和扁桃体组织样本 |
| 11397 | 2024-08-05 |
A broken network of susceptibility genes in the monocytes of Crohn's disease patients
2024-Sep, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302394
PMID:38925865
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研究论文 | 本研究探讨了Crohn病患者和健康对照组中232个易感基因的表达网络 | 研究提供了单细胞水平上单核细胞易感基因网络状态的新见解，强调了基因网络的破裂与Crohn病的发病机制之间的关系 | 缺乏对其他免疫细胞类型易感基因表达的综合分析 | 明确Crohn病患者单核细胞中易感基因的表达网络及其在病理中的作用 | Crohn病患者及健康对照组的单核细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 生物信息学分析和单细胞转录组数据集 | NA | 基因表达数据 | 包含了多个克罗恩病患者和健康对照的单细胞转录组数据 |
| 11398 | 2024-08-05 |
Global dynamics and cytokinin participation of salt gland development trajectory in recretohalophyte Limonium bicolor
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae199
PMID:38588029
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研究论文 | 本文研究了盐腺的发展轨迹及其相关的分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了海熏衣草盐腺的演变及细胞命运的决定机制 | 研究仅基于盐腺发育的特定阶段，可能无法全面反映整个发育过程 | 揭示盐腺的发育轨迹以及细胞命运决定的分子机制 | 研究对象为海熏衣草（Limonium bicolor）中的盐腺及其相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11399 | 2024-08-05 |
Breast cancer patient-derived organoids for the investigation of patient-specific tumour evolution
2024-Jun-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03375-5
PMID:38926706
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研究论文 | 开发了一种可靠的来自乳腺癌患者的类器官模型，以调查肿瘤演变 | 首次利用患者来源的类器官模型研究新辅助化疗和手术前后的肿瘤演变 | 研究基于单一病例，需要更多样本验证普遍性 | 研究患者特异性的肿瘤演变过程 | 69岁乳腺癌女性患者的组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、药物筛选 | 类器官 | 组织培养 | 2个类器官样本（则为治疗前后的组织） |
| 11400 | 2024-08-04 |
MOI is a comprehensive database collecting processed multi-omics data associated with viral infection
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65629-6
PMID:38926513
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研究论文 | 本研究开发了一个名为'MOI'的综合数据库，聚合与病毒感染相关的处理过的多组学数据 | MOI数据库填补了缺乏集中存储病毒宿主反应数据的空白，并为病毒宿主相互作用的深入研究提供了宝贵资源 | 本文未提及数据库的持续更新和数据验证过程的具体细节 | 研究病毒宿主相互作用的分子机制，以推动对病毒致病机制的理解及治疗干预的发展 | 涉及3200多个病毒感染样本，包括人类和小鼠感染 | 数字病理学 | NA | RNA测序, ChIP测序, ATAC-seq | NA | 多组学数据 | 3200多个病毒感染样本 |