单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 11381 - 11400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11381 | 2024-08-05 |
Transcriptome-based measurement of CD8+ T cell age and its applications
2023-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.05.005
PMID:37248098
|
研究论文 | 本文讨论了基于转录组的CD8+ T细胞年龄测量及其应用 | 首次提出了机器学习辅助的转录组量化CD8 T细胞年龄的方法 | 本文未提及具体的样本大小和实验条件 | 提高对T细胞老化相关细胞变化的测量 | CD8+ T细胞的年龄和相关的基因表达变化 | 机器学习 | 老年疾病 | 转录组分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 11382 | 2024-08-05 |
Lineage-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Smooth Muscle Cell Modeling Predicts Integrin Alpha-V Antagonism Reduces Aortic Root Aneurysm Formation in Marfan Syndrome Mice
2023-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318448
PMID:37078287
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研究论文 | 本研究探讨了整合素αv在马凡综合症主动脉瘤形成中的作用，并验证了其拮抗剂GLPG0187的治疗效果 | 首次展示了从特定谱系衍生的诱导性多能干细胞光滑肌细胞对整合素αv的过表达及其在马凡综合症相关主动脉瘤中的作用机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床适用性尚需进一步验证 | 探讨整合素αv信号通路在马凡综合症主动脉瘤中的机制及其作为治疗策略的有效性 | 研究对象为诱导性多能干细胞生成的主动脉光滑肌细胞以及马凡综合症小鼠模型 | 数字病理学 | 马凡综合症 | 单细胞RNA测序 | Fbn1C1039G/+小鼠模型 | 细胞 | 涉及的样本包括小鼠模型和不同谱系的光滑肌细胞 |
| 11383 | 2024-08-05 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 本文探讨了人类胎盘T细胞的独特转录编程和克隆分布 | 使用单细胞RNA测序技术同时获得转录、有限蛋白和受体组合，揭示了胎盘T细胞的特殊转录组特征和克隆多样性减少 | 目前对母体与胎儿免疫共存的调控机制仍然认识不足 | 研究胎盘T细胞的转录组特征及其在母胎界面的作用 | 胎盘和匹配的母体外周人类T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 11384 | 2024-08-05 |
Dynamics of human hematopoietic stem and progenitor cell differentiation to the erythroid lineage
2023-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.05.001
PMID:37172755
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综述 | 该文章深入探讨了红血球生成过程中所有细胞类型的免疫表型特征 | 文章强调了红血球不同阶段的异质性，并描述了与经典红血球生成模型的偏差 | 尽管scRNA-seq提供了新见解，但流式细胞术仍然是验证新免疫表型的主要方法 | 研究红血球生成过程中细胞类型的免疫表型特征及其异质性 | 研究对象包括人类造血干细胞和其转化为红血球的各个阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 11385 | 2024-08-05 |
Unbiased Human Kidney Tissue Proteomics Identifies Matrix Metalloproteinase 7 as a Kidney Disease Biomarker
2023-07-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000141
PMID:37022120
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研究论文 | 该论文通过无偏的蛋白质组学分析确定基质金属蛋白酶7作为肾病生物标志物。 | 首次利用无偏的组织蛋白质组学信息发现MMP7与肾功能和纤维化的显著相关性，并识别MMP7作为未来肾功能下降的生物标志物。 | 研究主要集中于样本数量较小的个体，并可能受限于特定人群的临床信息。 | 研究人类糖尿病肾病（DKD）的无偏组织蛋白质组学，以确定潜在生物标志物。 | 23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | SomaScan平台与单细胞RNA测序 | NA | 组织样本与血液样本 | 共收集23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本，和11,030份血液样本 |
| 11386 | 2024-08-05 |
The Long Noncoding RNA Cardiac Mesoderm Enhancer-Associated Noncoding RNA (Carmn) Is a Critical Regulator of Gastrointestinal Smooth Muscle Contractile Function and Motility
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.229
PMID:37030336
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研究论文 | 本研究揭示了长非编码RNA Carmn在调节胃肠道平滑肌收缩功能和运动性方面的关键作用 | 这是首次研究长非编码RNA在调节内脏平滑肌表型中的重要性 | 仅在小鼠模型中进行研究，人体临床相关性尚需进一步验证 | 研究Carmn在维持胃肠道平滑肌收缩功能中的角色 | 以小鼠为模型，重点研究内脏平滑肌细胞的功能 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠及人类的胚胎、成年胃肠道组织样本 |
| 11387 | 2024-08-05 |
Detection of the effect of microvibrational stimulation on human discarded immature oocytes by single-cell transcriptome sequencing technology
2023-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02837-5
PMID:37273164
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研究论文 | 本研究探讨了对人类未成熟卵母细胞施加微振动机械刺激后转录组水平的变化。 | 该研究首次使用单细胞转录组测序技术揭示微振动刺激对卵母细胞基因表达的影响。 | 研究仅使用了有限数量的卵母细胞样本，且主要集中在特定的刺激频率上。 | 研究微振动机械刺激对人类卵母细胞转录组的影响。 | 被收集的为辅助生殖周期中未受精的废弃卵母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 12个（每组6个，分别为微振动组和静态培养组） |
| 11388 | 2024-08-05 |
Stress promotes the infiltration of peripheral immune cells to the brain
2023-07, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.05.003
PMID:37169132
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研究论文 | 本研究报道了应激后海马免疫微环境的变化，揭示了免疫细胞向海马的浸润与其适应或抗压能力之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示了应激后海马中免疫细胞浸润的调控机制 | 本研究可能未考虑其他潜在因素对免疫细胞浸润的影响 | 探讨应激对海马中免疫细胞分布和功能的影响 | 研究对象为经历学习无助实验的小鼠，关注其海马区域的免疫细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 生物数据 | 实验中使用了学习无助小鼠的多个样本 |
| 11389 | 2024-08-05 |
deMULTIplex2: robust sample demultiplexing for scRNA-seq
2023-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.536275
PMID:37090649
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研究论文 | 本文介绍了deMULTIplex2，这是一种针对scRNA-seq数据的强健样本去重技术 | deMULTIplex2引入了一种机制指导的分类算法，在各种具有挑战性的数据集上能够恢复更多的细胞 | 未提及特定的局限性 | 研究开发一种高效的样本去重算法以提高单细胞RNA测序的准确性 | 针对单细胞RNA测序的多重样本数据集 | 数字病理学 | NA | 随机化分位数残差 | 广义线性模型与期望最大化 | 数据集 | 使用了模拟和真实数据集进行基准分析 |
| 11390 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics unveils xylem cell development and evolution
2023-01-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02845-1
PMID:36624504
|
研究论文 | 该研究揭示了木质部细胞在不同植物物种中的发育谱系和进化关系 | 通过单细胞转录组学和激光捕获微切割技术，首次解析了多个木本被子植物的木质部细胞发育谱系 | 研究主要集中在有限数量的木本被子植物上，可能无法全面代表所有植物的木质部细胞发展 | 探索不同植物的木质部细胞类型的发育和进化过程 | 四种不同的木本被子植物的木质部细胞类型 | 数字植物学 | NA | 单细胞转录组分析，激光捕获微切割 | NA | 转录组数据 | 四种木本被子植物的多个样本 |
| 11391 | 2024-08-05 |
H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304798
PMID:38250071
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研究论文 | 本研究揭示了H2-O缺乏如何增强胸腺调节性T细胞的分化及CD4 T细胞的活性 | 首次提供了H2-O在胸腺调节性T细胞发育中的直接证据 | 缺乏对其他潜在机制的综合考虑 | 深入理解H2-O缺乏对自体免疫性疾病的影响 | 主要研究胸腺调节性T细胞及外周CD4 T细胞 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 11392 | 2024-08-05 |
A new gene set identifies senescent cells and predicts senescence-associated pathways across tissues
2022-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32552-1
PMID:35974106
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研究论文 | 本研究生成了一组基因集(SenMayo)，用于识别衰老细胞并预测组织中的衰老相关通路 | 该基因集能在不同组织和物种中高效识别衰老细胞，具有重要的临床应用潜力 | 尚未讨论SenMayo在其他组织类型的识别能力 | 研究衰老细胞的识别和衰老相关通路的预测 | 研究对象包括人类和小鼠的骨髓及骨组织的衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 来自两个老年人类队列的骨组织活检和小鼠的基因样本 |
| 11393 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病小鼠模型中，淀粉样斑块周围的转录变化 | 提供了一种前所未有的方法，通过空间转录组学分析解开阿尔茨海默病及其他脑部疾病致病标志物附近的失调细胞网络 | 该研究主要基于小鼠模型，临床应用可能受限 | 探讨阿尔茨海默病相关的分子变化和细胞相互作用 | 以阿尔茨海默病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学和原位测序 | NA | 组织样本 | 涉及小鼠和人类脑切片 |
| 11394 | 2024-08-05 |
Efficient Generation and Transcriptomic Profiling of Human iPSC-Derived Pulmonary Neuroendocrine Cells
2020-May-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101083
PMID:32380423
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研究论文 | 本研究展示了如何通过诱导性多能干细胞生成肺神经内分泌细胞，并进行了转录组特征分析 | 本研究首次利用诱导性多能干细胞生成并表征肺神经内分泌细胞，提供了全新的细胞模型 | 该研究未在临床样本中验证生成的细胞功能 | 研究肺神经内分泌细胞的发生和其在肺部疾病中的作用 | 诱导性多能干细胞衍生的肺神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | iPNECs | 转录组数据 | NA |
| 11395 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the correlation of aggrephagy signaling and multiple myeloma immune microenvironment composition
2024-Jul, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3712
PMID:38949072
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研究论文 | 本研究揭示了聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境成分之间的相关性 | 首次揭示了聚合自噬在多发性骨髓瘤中的作用以及其与免疫微环境和疾病预后的关系 | 尚未全面证明聚合自噬在多发性骨髓瘤中的所有作用 | 研究聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境的相关性及其对疾病预后的影响 | 包含来自七个多发性骨髓瘤骨髓样本和七个健康骨髓样本的12,187个单细胞的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12,187个单细胞样本 |
| 11396 | 2024-08-05 |
Activated Clec4nhi Neutrophils Aggravate Lung Injury in an Endothelial IGFBP7-Dependent Manner
2024-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0017OC
PMID:38574235
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞亚型在急性肺损伤中的作用，尤其是IGFBP7在调节炎症反应和屏障功能中的影响 | 揭示了IGFBP7在不同类型内皮细胞中的差异表达及其在急性肺损伤中引发的炎症和屏障功能障碍 | 具体亚型的内皮细胞在临床上的作用仍需进一步研究 | 研究IGFBP7在急性肺损伤中的角色及其潜在的治疗靶点 | 急性肺损伤模型中的内皮细胞和炎症细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 用脂多糖建立的急性肺损伤模型小鼠 |
| 11397 | 2024-08-05 |
Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9
2024-Jun-28, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003104
PMID:38945689
|
研究论文 | 本研究探讨迷走神经如何通过CXCL9调节急性慢性肝衰竭的进展。 | 本研究首次揭示了迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴在急性慢性肝衰竭发展中的作用。 | 本研究的局限性在于缺乏对人类样本的广泛验证。 | 研究迷走神经在急性慢性肝衰竭中的神经免疫交互作用。 | 急性慢性肝衰竭模型小鼠和人类患者。 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), CRISPR/Cas9技术 | NA | 蛋白质组学数据 | ACLF模型小鼠和患者样本 |
| 11398 | 2024-08-05 |
Cellular and transcriptional profiles of peripheral blood mononuclear cells pre-vaccination predict immune response to preventative MUC1 vaccine
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598031
PMID:38948837
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研究论文 | 这项研究探讨了预接种外周血单核细胞的细胞和转录组特征，以预测对MUC1疫苗的免疫反应 | 首次揭示了在恶性前期环境中，免疫系统可能已经受到抑制，并确定了预测免疫反应的潜在生物标志物 | 样本量较小，且仅在特定人群中进行研究，可能不具普遍适用性 | 研究MUC1肿瘤抗原疫苗的免疫反应预测因子 | 来自16名免疫反应者和16名非响应者的预接种外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 大肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞生物学数据 | 32个样本（16名免疫响应者和16名非响应者） |
| 11399 | 2024-08-05 |
Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor
2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2319623121
PMID:38889142
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研究论文 | 这篇文章探讨了低氧诱导因子2α(HIF-2α)在心脏移植过程中促进耐受性巨噬细胞发育的机制 | 文章首次揭示了HIF-2α作为耐受性单核细胞的关键转录因子，并与CSF1R的表达调控相联系 | 研究中使用的小鼠模型可能限制了结果在临床转化中的适用性 | 探讨介导移植耐受的不同因素 | 急性排斥或耐受性的心脏同种异体移植物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及急性拒绝或耐受心脏同种异体移植物的样本数量未指定 |
| 11400 | 2024-08-04 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
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研究论文 | 开发了一种基于纳米粒子的肌腱靶向药物传递系统以药理调节肌腱愈合 | 首次利用TRAP结合肽功能化的纳米粒子药物传递系统改善肌腱的药物靶向性 | 研究主要基于实验室数据，临床应用效果尚待进一步验证 | 提高肌腱愈合过程中的药物传递效率 | 急性肌腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米粒子药物传递系统 | NA | NA | NA |