单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11381 - 11400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11381 | 2025-10-07 |
The Role of Dectin-1-Akt-RNF146 Pathway in β-Glucan Induced Immune Trained State of Monocyte in Sepsis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482213
PMID:39881796
|
研究论文 | 本研究探讨了Dectin-1-Akt-RNF146通路在β-葡聚糖诱导的单核细胞免疫训练状态中的作用及其在脓毒症中的机制 | 首次揭示RNF146通过dectin-1-Akt-mTOR通路调控单核细胞免疫训练状态，为逆转脓毒症免疫抑制提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明β-葡聚糖诱导的免疫训练在脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者外周血单核细胞、脓毒症小鼠模型、RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞系 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者PBMCs、小鼠模型和细胞系（具体数量未明确说明） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11382 | 2025-10-07 |
Therapeutic potential and mechanisms of umbilical cord mesenchymal stem cells differentiating into tendon cells and promotion of rotator cuff tendon-bone healing
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251315185
PMID:39882545
|
研究论文 | 本研究探讨脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其促进肩袖肌腱-骨愈合的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序分析脐带间充质干细胞向肌腱细胞分化过程中的关键细胞亚群和信号通路，并揭示Hes1基因在促进分化和肩袖损伤修复中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 探索脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其在肩袖损伤修复中的应用价值 | 脐带间充质干细胞、肌腱细胞、肩袖损伤动物模型 | 干细胞研究 | 肩袖损伤 | 单细胞测序、基因过表达、细胞诱导分化 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11383 | 2025-10-07 |
Intratumoural CD8+ CXCR5+ follicular cytotoxic T cells have prognostic value and are associated with CD19+ CD38+ B cells and tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024-Dec-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03887-z
PMID:39739032
|
研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中CD8+ CXCR5+滤泡细胞毒性T细胞的预后价值及其与B细胞和三级淋巴结构的关系 | 首次系统比较TFC细胞在MSI-high和MSS结直肠癌中的生物学功能差异，并建立了预后预测模型 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 探索TFC细胞在结直肠癌中的特征及其在MSI-high和MSS亚型中的生物学功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织和外周血样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 共培养实验 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 临床队列和公共数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11384 | 2025-10-07 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNFα对小鼠软骨细胞转录组的差异影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示TNFα对骨骺软骨细胞不同亚群的差异调控作用 | 研究仅使用新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞，未验证其他年龄或物种 | 探究TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用机制 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11385 | 2025-10-07 |
Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response
2024-10, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12811
PMID:39048134
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术解析头颈癌肿瘤微环境特征与免疫治疗反应的关系 | 首次结合NanoString GeoMx空间转录组和Akoya Phenocycler-Fusion空间蛋白质组技术，在头颈癌中识别与免疫治疗反应相关的肿瘤和基质特征 | 样本量较小（仅12名患者），且为回顾性研究 | 识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物学特征 | 头颈癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理 | 头颈癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 12名患者的25个组织核心（包括4名无应答者8个核心，2名应答者5个核心，6名未治疗者12个核心） | NanoString, Akoya | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler, PhenoCycler-Fusion | NanoString GeoMx全转录组空间分析, Akoya PhenoCycler-Fusion空间蛋白质组分析 |
| 11386 | 2025-10-07 |
Computational estimation of clonal diversity in autoimmunity
2024-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12801
PMID:39010261
|
综述 | 本文综述了通过单细胞测序测量T细胞和B细胞受体多样性及其在自身免疫病研究中的应用 | 结合单细胞测序与多样性评估方法，推动自身免疫病机制发现和治疗创新 | NA | 探讨免疫受体多样性测量方法及其在自身免疫病研究中的意义 | T细胞受体和B细胞受体 | 生物信息学 | 自身免疫病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11387 | 2025-10-07 |
Discovery of a monoclonal, high-affinity CD8+ T-cell clone following natural hepatitis C virus infection
2024-08, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12791
PMID:38855806
|
研究论文 | 在自然HCV感染后发现了一个具有高亲和力的单克隆CD8+ T细胞克隆 | 发现了在急性HCV感染后持续存在的单克隆CD8+ T细胞群体，其TCR-pMHC相互作用的解离时间异常长 | 研究样本量有限，仅从两名个体中分析HCV特异性T细胞群体 | 研究HCV感染后CD8+ T细胞的特异性免疫应答 | HCV感染个体的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞测序，HLA多聚体染色 | NA | 测序数据，流式细胞术数据 | 两名HCV感染个体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11388 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603155
PMID:39071344
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了早期妊娠胎盘绒毛板和基底板细胞滋养层细胞之间的差异及其与滋养层干细胞的比较 | 首次在单细胞水平系统比较了胎盘不同区域（绒毛板与基底板）细胞滋养层细胞的转录组差异，并明确了滋养层干细胞与特定滋养层亚群的相似性 | 样本量相对较小（6个正常胎盘和3个滋养层干细胞系），且仅关注了第一孕期的胎盘组织 | 探究早期人类胎盘细胞滋养层的转录组多样性，比较滋养层干细胞与不同细胞滋养层亚群的异同 | 人类早期妊娠胎盘组织（6-14周）和滋养层干细胞系 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个正常胎盘（4个早期6-8周，2个晚期12-14周）和3个滋养层干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11389 | 2025-10-07 |
Mapping the landscape of lineage-specific dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to genetics of complex disease
2023-Dec-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.24.23297476
PMID:37961453
|
研究论文 | 开发单细胞转录组学框架量化基因表达动态遗传调控及其细胞类型特异性 | 建立细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型，实现单细胞分辨率下基因表达动态遗传调控的量化 | 研究聚焦中脑神经元，模型在其他细胞类型中的普适性需进一步验证 | 解析遗传变异如何通过影响基因表达参与人类生物学过程和复杂疾病 | 诱导多能干细胞分化的中脑神经元 | 单细胞转录组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 遗传模型 | 单细胞转录组数据 | 英国生物银行1500多种表型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11390 | 2025-10-07 |
Neoadjuvant chemotherapy plus nivolumab with or without ipilimumab in operable non-small cell lung cancer: the phase 2 platform NEOSTAR trial
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02189-0
PMID:36928818
|
研究论文 | 评估纳武利尤单抗联合化疗与联合伊匹木单抗在可手术非小细胞肺癌新辅助治疗中的疗效和生物标志物 | 首次在NEOSTAR平台试验中比较纳武利尤单抗+化疗与联合伊匹木单抗三药方案的病理缓解率，并通过单细胞测序和多平台免疫分析探索生物标志物 | 样本量较小（每组22例患者），II期试验需要更大规模验证 | 评估新辅助免疫治疗联合化疗在可手术非小细胞肺癌中的疗效和安全性 | 可手术的非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序，多平台免疫分析，微生物组分析 | NA | 临床数据，基因组数据，微生物组数据 | 44例患者（每组22例） | NA | 单细胞RNA测序，免疫分析，微生物组测序 | NA | NA |
| 11391 | 2025-10-07 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过共刺激γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞的新方法，并验证其抗肿瘤活性 | 首次发现γδTCR和TLR7/8共刺激可增强Vδ2 T细胞抗肿瘤功能，并揭示其通过调节mTOR通路和APC功能的作用机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发更有效的γδ T细胞癌症免疫治疗方法 | Vδ2 T细胞、抗原呈递细胞、肿瘤细胞 | 免疫学、癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、反相蛋白阵列、体外共培养、动物模型 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 人PBMCs、人脾细胞、人源化NSG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11392 | 2025-10-07 |
Airway stenosis: classification, pathogenesis, and clinical management
2025-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70076
PMID:39866837
|
综述 | 本文系统介绍气道狭窄的分类、发病机制及临床管理策略 | 基于单细胞RNA测序等新技术展望多机制交叉研究前景 | 未涉及具体临床实验数据验证 | 揭示气道狭窄发病机制并推动临床转化 | 气道狭窄疾病及其治疗方式 | 医学研究 | 气道狭窄 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 鸟枪法宏基因组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 11393 | 2025-10-07 |
A deep learning framework for in silico screening of anticancer drugs at the single-cell level
2025-Feb, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae451
PMID:39872221
|
研究论文 | 开发名为Shennong的深度学习框架，用于在单细胞水平上进行抗癌药物的计算机筛选 | 首次利用泛癌种和泛组织的单细胞转录组图谱构建深度学习框架，能够预测单个细胞对药物的反应并评估组织损伤效应 | 基于计算机模拟预测，需要实验验证 | 开发用于抗癌药物筛选的深度学习框架 | 恶性细胞、癌前细胞、癌症相关基质细胞和内皮细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 泛癌种和泛组织单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11394 | 2025-10-07 |
To describe the subsets of malignant epithelial cells in gastric cancer, their developmental trajectories and drug resistance characteristics
2025-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01715-5
PMID:39869282
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌细胞亚群，揭示其发育轨迹和耐药特性 | 首次在单细胞水平系统鉴定胃癌中5个恶性上皮细胞亚群，构建具有预测能力的预后风险评分模型 | 样本来源和数量有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 解析胃癌细胞异质性及其与治疗抵抗的关系 | 胃癌组织样本中的细胞 | 单细胞基因组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | 262,532个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 11395 | 2025-10-07 |
Fetal fibroblast heterogeneity defines dermal architecture during human embryonic skin development
2025-Jan-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.12.027
PMID:39880186
|
研究论文 | 本研究通过分析人类胚胎皮肤发育过程中的成纤维细胞异质性，揭示了8个不同的成纤维细胞群体及其时空分布特征 | 首次系统描绘了人类胚胎皮肤发育过程中成纤维细胞的异质性图谱，发现了发育阶段特异性的细胞群体动态变化和空间分布模式 | 研究样本仅涵盖8-16孕周的胚胎皮肤，缺乏更早期和更晚期的发育阶段数据 | 探究人类胚胎皮肤发育过程中成纤维细胞的异质性及其在皮肤结构形成中的作用 | 人类胚胎皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，单分子荧光原位杂交 | 聚类分析，基于分区的图抽象，伪时间分析 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 8和16孕周的人类胚胎皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11396 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals microenvironmental infiltration of myeloid cells and pancreatic prognostic markers in PDAC
2025-Jan-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01830-x
PMID:39847195
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示PDAC中髓系细胞的微环境浸润特征并建立胰腺癌预后预测模型 | 首次在单细胞水平系统解析PDAC髓系细胞异质性，发现TAM-spp1细胞与不良预后密切相关，并构建了8基因风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据，缺乏独立验证队列和实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中髓系细胞的异质性及其对预后的影响 | 胰腺导管腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集变异分析, CIBERSORT, LASSO回归, Cox回归分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自多个公共数据库的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11397 | 2025-10-07 |
Sleeve gastrectomy reveals the plasticity of the human gastric epithelium
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56135-y
PMID:39833151
|
研究论文 | 本研究通过组织学和单细胞RNA测序揭示了袖状胃切除术后人类胃上皮的可塑性变化 | 首次在分子和细胞水平展示袖状胃切除术后胃上皮重塑，发现壁细胞亚群和肠嗜铬样细胞的适应性变化 | 研究样本仅包括12名女性患者，样本量有限 | 探究袖状胃切除术后胃上皮的适应性变化机制 | 人类胃上皮组织 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 组织学, 单细胞RNA测序, 数学建模 | 非线性比例积分控制模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 12名女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11398 | 2025-10-07 |
A practical guide for choosing an optimal spatial transcriptomics technology from seven major commercially available options
2025-Jan-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11235-3
PMID:39833687
|
指南 | 本文分析和比较七种主要商业化空间转录组技术平台，为研究人员选择最适合其需求的平台提供实用指导 | 首次系统性地对七种主要商业化空间转录组平台进行全面比较分析 | 仅涵盖商业化平台，未包括实验性或早期开发阶段的技术 | 为研究人员提供选择合适空间转录组技术的实用指南 | 七种主要商业化空间转录组技术平台 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11399 | 2025-10-07 |
From Genes to Clinical Practice: Exploring the Genomic Underpinnings of Endometrial Cancer
2025-Jan-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17020320
PMID:39858102
|
综述 | 探讨子宫内膜癌的基因组基础及其向临床实践的转化 | 整合单细胞基因组学和空间转录组学等多组学技术，提供识别新型生物标志物和治疗靶点的整体视角 | 患者反应存在变异性、基因组数据整合到临床工作流程存在挑战以及伦理考量 | 探索子宫内膜癌的基因组基础并推动精准医疗发展 | 子宫内膜癌及其分子亚型 | 基因组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞基因组学, 空间转录组学, 多组学技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11400 | 2025-10-07 |
Primitive to visceral endoderm maturation is essential for mouse epiblast survival beyond implantation
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111671
PMID:39868030
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠胚胎植入后原始内胚层向脏壁内胚层成熟的分子机制及其对胚胎外胚层存活的重要性 | 首次在胚胎植入后关键时期（E5.0）通过单细胞RNA测序揭示BMP信号上调和Sox7表达短暂增加驱动原始内胚层向脏壁内胚层转化的动态信号活动 | 研究主要聚焦于Hnf1b基因缺陷模型，可能未涵盖其他潜在调控机制；样本时间点相对有限 | 探索小鼠胚胎植入后原始内胚层向脏壁内胚层成熟的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎（包括野生型和Hnf1b-/-突变体）在胚胎第5.0天的发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎第5.0天的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |