单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 11381 - 11400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11381 | 2024-08-05 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49756-2
PMID:38942804
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研究论文 | 本研究探讨了地塞米松在重症COVID-19患者中对肺部和全身免疫细胞的影响 | 揭示了地塞米松在不同细胞区室中的特异性作用及其潜在机制 | 未提及特定的限制条件NA | 研究地塞米松在重症COVID-19患者中的免疫学效应及机制 | 重症COVID-19患者的下呼吸道和血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | 无 | 血液样本和下呼吸道样本 | NA |
| 11382 | 2024-08-05 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2024-Jun-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202502
PMID:38912572
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研究论文 | 该研究定义了胚胎eCNm的分子亚域并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元中的保守作用 | 首次使用scRNA-seq和空间表达分析定义了胚胎eCNm的分子亚域，并描述了它们的发育过程 | 未涉及其他小脑核团的发育机制和影响 | 研究胚胎小脑兴奋性神经元的分子多样性及其生存机制 | 胚胎小脑中间核的兴奋性神经元及其分子亚域 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 11383 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing of Mutant Whole Mouse Embryos: From the Epiblast to the End of Gastrulation
2024-Jun-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66866
PMID:38949298
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研究论文 | 本文介绍了一种针对小鼠胎儿突变体的单细胞RNA测序管道，涵盖了从外胚层到胃肠发育结束的过程 | 提出了一种新方法，以克服对突变体胚胎进行单细胞分析的技术限制 | 此研究依然受到胚胎基因分型及其数量限制的影响 | 研究突变如何影响胃肠发展的细胞景观 | 小鼠胚胎突变体，特别是在胃肠形成期间的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 涉及多个人工妊娠的突变体小鼠胚胎 |
| 11384 | 2024-08-05 |
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology
2024-06-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01350-3
PMID:38862979
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评论 | 这篇文章讨论了机器学习整合方法在计算免疫学中的应用。 | 文章强调了现代机器学习技术在整合多种‘组学’数据方面的创新能力，尤其是在单细胞和空间分析中的应用。 | 文章提到了一些整体方法的挑战，但具体的限制未详细说明 | 探讨机器学习整合技术如何推动免疫学研究的发展。 | 聚焦于免疫学领域内多层次数据集的整合分析。 | 计算免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 多组学数据 | NA |
| 11385 | 2024-08-05 |
Mitochondrial Oxidative Stress Regulates FOXP3+ T-Cell Activity and CD4-Mediated Inflammation in Older Adults with Frailty
2024-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116235
PMID:38892421
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研究论文 | 本研究阐明了衰弱老年人CD4/Treg轴的复杂免疫动力学 | 首次揭示了衰弱老年人Treg细胞亚群及其转录组特征与CD4 T细胞反应失调之间的关系 | 当前研究主要比较年轻和老年人群，未充分考虑健康老年人与经历病理衰老者之间的差异 | 研究衰弱老年人中CD4/Treg轴的免疫调节机制 | 衰弱老年人及其与同龄健康老年人的比较 | 数字病理学 | 衰弱 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用公开的外周血单核细胞数据进行分析 |
| 11386 | 2024-08-05 |
Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer
2024-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16129
PMID:38494600
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研究论文 | 本研究探讨了BET家族蛋白BRD3在结直肠癌中的肿瘤抑制作用 | 首次展示了BRD3通过诱导p21表达抑制细胞周期并抑制肿瘤生长的作用 | 未讨论BRD3以外的其他BET家族成员在结直肠癌中的作用 | 研究BRD3在结直肠癌（CRC）中的功能角色 | 结直肠癌细胞及临床样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 11387 | 2024-08-05 |
Mutant U2AF1-Induced Mis-Splicing of mRNA Translation Genes Confers Resistance to Chemotherapy in Acute Myeloid Leukemia
2024-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2543
PMID:38417135
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研究论文 | 该文章探讨了U2AF1突变导致的mRNA翻译基因误剪接与急性髓性白血病化疗耐药之间的关系 | 本研究首次揭示了U2AF1突变如何通过影响mRNA剪接和翻译过程来促成急性髓性白血病的化疗耐药 | 本研究为回顾性分析，可能存在数据整合和样本选择偏差的局限性 | 探讨急性髓性白血病患者对诱导化疗的耐药机制 | 超过1500例急性髓性白血病患者的多组学数据 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 超过1500例急性髓性白血病患者 |
| 11388 | 2024-08-05 |
Striking the Balance with a PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody
2024-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0566
PMID:38745496
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研究论文 | 本文介绍了一种新型PD-L1×4-1BB双特异性抗体ATG-101用于癌症免疫疗法 | ATG-101在降低4-1BB亲和力的同时，具有高亲和力的PD-L1，从而减轻肝毒性 | 尽管ATG-101具有良好的抗肿瘤活性，但其长期安全性和效力仍需进一步验证 | 研究ATG-101的潜力，以改善癌症免疫治疗中的肝毒性问题 | 研究对象为肿瘤微环境中的T细胞和免疫细胞群体 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 在非人灵长类动物中进行了ATG-101治疗，且未给出样本具体数量 |
| 11389 | 2024-08-05 |
ATG-101 Is a Tetravalent PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody That Stimulates Antitumor Immunity through PD-L1 Blockade and PD-L1-Directed 4-1BB Activation
2024-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2701
PMID:38501978
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研究论文 | ATG-101是一种四价PD-L1×4-1BB双特异性抗体，通过PD-L1阻断和PD-L1导向的4-1BB激活刺激抗肿瘤免疫 | 本研究工程化了ATG-101，发现其能够同时与PD-L1和4-1BB结合，并能有效激活T细胞，显示出在ICIs抗性肿瘤中的潜在抗肿瘤活性 | 虽然ATG-101表现出良好的耐受性，但在临床试验中仍需进一步评估其长期安全性和有效性 | 本研究旨在开发一种新的抗肿瘤免疫疗法，以克服现有免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究对象为ATG-101抗体及其对4-1BB+ T细胞和肿瘤微环境的影响 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 多个体内肿瘤模型 |
| 11390 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591777
PMID:38746120
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研究论文 | 本研究设计了一种强大的单细胞分析流程，以研究小鼠胚胎在内胚层形成过程中的基因表达动态 | 提出了一种方法以克服在单细胞分析突变小鼠胚胎中的技术限制 | 突变胚胎的单细胞分析仍然稀少，且通常仅限于FACS分选的群体 | 探索突变如何影响胚胎在胃肠发育阶段的细胞景观 | 突变的小鼠胚胎，从E6.5到E8的发育阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 11391 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal distinct immune-infiltrating phenotypes and macrophage-tumor interaction axes among different lineages of pituitary neuroendocrine tumors
2024-04-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01325-4
PMID:38658971
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研究论文 | 本研究揭示了不同垂体神经内分泌肿瘤的免疫细胞浸润表型及巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用轴。 | 首次系统分析并分类了PitNET中的肿瘤免疫微环境亚型及其与肿瘤细胞的独特相互作用。 | 该研究未涉及PitNET以外的其他肿瘤类型，可能限制了结论的广泛适用性。 | 探讨不同类型PitNET中肿瘤及免疫细胞的多样性及其影响。 | 23例PitNET样本以及与之相关的细胞类型和免疫细胞。 | 数字病理学 | 垂体癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），大量RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学，量热免疫荧光（QIF） | NA | RNA数据 | 23个PitNET样本和365个大量RNA测序样本 |
| 11392 | 2024-08-04 |
NR2E3 loss disrupts photoreceptor cell maturation and fate in human organoid models of retinal development
2024-Apr-23, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173892
PMID:38652563
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研究论文 | 本文研究了NR2E3缺失对人类视网膜发育中的感光细胞成熟和命运的影响 | 提出了人类感光细胞发育的详细谱系，并定义了杆状视网膜特异性转录因子的作用 | 缺乏与小鼠模型的比较数据 | 研究NR2E3在光感受器细胞发育中的具体角色 | 使用携带视网膜疾病变异的类器官和同源及无关对照进行研究 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了数个视网膜类器官样本 |
| 11393 | 2024-08-04 |
Single cell lineage tracing reveals clonal dynamics of anti-EGFR therapy resistance in triple negative breast cancer
2024-04-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01327-2
PMID:38605363
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研究论文 | 该研究揭示了三阴性乳腺癌中抗EGFR治疗抵抗的克隆动力学 | 首次使用单细胞转录组学和细胞条形码技术重构EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞的亚克隆动态 | 研究中未提及样本的多样性及其对结果的影响 | 探究EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞对阿法替尼治疗的反应差异及其机制 | EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组学，细胞条形码 | 深度学习 | 基因表达数据 | 应用于阿法替尼治疗响应的少量细胞样本 |
| 11394 | 2024-08-05 |
Imbalance of programmed cell death patterns mediated by dendritic cell subsets in systemic lupus erythematosus and lupus nephritis
2024-Mar-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮(SLE)和狼疮性肾炎(LN)中免疫细胞死亡模式的异常。 | 研究首次揭示了CLEC9A+cDC1在SLE和LN中细胞死亡模式失衡中的作用。 | 该研究的样本大小及其代表性可能限制其结果的普适性。 | 研究SLE和LN中免疫细胞死亡模式与疾病的关联。 | 研究对象为系统性红斑狼疮患者及狼疮性肾炎患者的免疫细胞。 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 大规模RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涵盖了SLE和LN患者的外周血单核细胞及肾脏组织样本 |
| 11395 | 2024-08-04 |
Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts
2023-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.05.531162
PMID:36945572
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研究论文 | 本研究系统表征了胶质母细胞瘤在患者肿瘤和患者衍生的肿瘤异种移植中的肿瘤微环境 | 本研究揭示了教育后的小胶质细胞在不同胶质母细胞瘤环境和肿瘤腔室中转变为多样的表型状态，并显示其在支持胶质母细胞瘤生长和治疗反应中的关键作用 | 关于胶质母细胞瘤生态系统及其在临床前模型中的再现性尚不充分，导致结果不准确和临床试验失败 | 深入理解胶质母细胞瘤驱动的肿瘤微环境及其在临床前模型中的再现 | 以胶质母细胞瘤（GBM）患者的肿瘤和患者衍生的肿瘤异种移植为研究对象 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多色流式细胞术、免疫组化及功能研究 | NA | 细胞 | 不同肿瘤表型的胶质母细胞瘤PDOXs与胶质瘤小鼠GL261同源模型和患者肿瘤进行比较 |
| 11396 | 2024-08-05 |
Personalized tumor combination therapy optimization using the single-cell transcriptome
2023-12-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01256-6
PMID:38041202
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研究论文 | 该文章提出了一种利用单细胞转录组优化个性化肿瘤联合治疗的方法 | 介绍了一种名为comboSC的计算原型，能够基于单细胞转录组评估个别患者的免疫微环境并优化联合治疗 | 该研究的具体临床应用和实验验证尚需进一步探索 | 推动个性化癌症治疗的方法和工具的发展 | 119个来自15种癌症类型的肿瘤样本的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 119个肿瘤样本 |
| 11397 | 2024-08-05 |
Complementary and countervailing actions of Jak2 and Ikk2 in hematopoiesis in mice
2023-12, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.08.005
PMID:37611729
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研究论文 | 本研究探讨了Jak2和Ikk2在小鼠造血中的互补和相对作用 | 提出了Jak2和Ikk2在促进造血干细胞自我更新与髓系分化之间的相互作用机制 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探讨NFκB通路的高活性如何与Jak2 V617F突变相互作用影响造血过程 | 使用含有Jak2 V617F突变和Ikk2-CA的小鼠模型进行实验 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 包含多个小鼠模型，具体样本大小未明确提及 |
| 11398 | 2024-08-04 |
Loss of p53-DREAM-mediated repression of cell cycle genes as a driver of lymph node metastasis in head and neck cancer
2023-11-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01236-w
PMID:37978395
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研究论文 | 本研究探索了p53-DREAM介导的细胞周期基因抑制的丧失如何驱动头颈癌的淋巴结转移 | 本文揭示了淋巴结转移相关基因与癌细胞的上皮去分化及细胞周期调节之间的新的联系 | 未具体讨论治疗选项或干预措施的有效性 | 识别驱动头颈癌转移及进展的分子通路 | 2074个头颈癌组织活检样本及其基因表达数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2074个头颈癌活检样本 |
| 11399 | 2024-08-04 |
An ANXA11 P93S variant dysregulates TDP-43 and causes corticobasal syndrome
2023-Oct-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3462973/v1
PMID:37886540
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研究论文 | 本研究识别了ANXA11中的一个新型变异P93S，其导致TDP-43的异常调控，并与皮质基底综合征相关。 | 首次将ANXA11 P93S变异与皮质基底综合征联系起来，拓展了ANXA11突变所致临床综合征的范围。 | 关于ANXA11 P93S变异对神经元功能的影响尚未全面理解，且样本规模可能有限。 | 探讨ANXA11突变在皮质基底综合征中的致病作用及其相关生物学机制。 | 针对携带ANXA11 P93S突变的个体进行的表型分析和细胞功能研究。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 多组学评估 | iPSC衍生神经元 | 单细胞测序和蛋白组学分析 | 涉及对应突变的个体样本及其iPSC衍生的神经元和小胶质细胞 |
| 11400 | 2024-08-05 |
Fundamental and practical approaches for single-cell ATAC-seq analysis
2022-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-022-00082-5
PMID:36313930
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综述 | 本文提供了关于单细胞ATAC-seq数据处理的实用指南，从质量评估到下游分析。 | 本文探讨了单细胞ATAC-seq在表观基因组分析中的应用及其对非编码变异功能的研究。 | 由于scATAC-seq数据的稀疏和噪声性质，处理数据需要不同的方法论和经验。 | 本研究旨在提供单细胞ATAC-seq数据处理的实用方法，以便于各种应用的研究。 | 研究对象包括单细胞水平测量的开放染色质区域及其在表观遗传调控中的作用。 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq | NA | 基因组数据 | NA |