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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-04-23 |
cGAS inhibitor IMSB301 modifies interferon signalling in peripheral mononuclear cells of SAMHD1 genetic interferonopathy in vitro
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70090
PMID:42016148
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序评估了cGAS抑制剂IMSB301对SAMHD1基因突变患者外周血单个核细胞中干扰素信号通路的调节作用 | 首次在体外模型中验证了新型临床阶段cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病SAMHD1突变患者免疫细胞的特定干扰素信号通路抑制作用 | 研究仅基于单个患者样本,样本量有限,且为体外实验,未进行体内验证 | 评估cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病(Aicardi-Goutières综合征)患者免疫细胞干扰素信号通路的调节潜力 | SAMHD1双等位基因致病突变患者的PBMCs与年龄性别匹配的健康对照 | 单细胞组学 | 遗传性干扰素病(Aicardi-Goutières综合征) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SAMHD1突变患者和1例健康对照的PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1122 | 2026-04-23 |
Integration of single-cell and bulk transcriptomics reveals the association of manganese metabolism-related genes with prognosis and immune infiltration in lung adenocarcinoma
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70085
PMID:42016144
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了锰代谢相关基因与肺腺癌预后及免疫浸润的关联,并构建了一个基于9个基因的预后特征模型 | 首次整合单细胞RNA测序和TCGA数据系统研究锰代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值,并验证了JQ1与PTMA抑制的协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和治疗指导价值 | 探究锰代谢相关基因在肺腺癌预后评估和免疫治疗中的潜在价值 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | Cox回归模型,LASSO回归 | 转录组数据 | TCGA数据库中的肺腺癌样本及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1123 | 2026-04-23 |
Multi-Omics Analysis Reveals m7G Methylation-Related Genes May Be Involved in TGF-β Signaling-Mediated Anti-PD-L1 Response in Bladder Cancer
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S583577
PMID:42016541
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,揭示了m7G甲基化相关基因可能通过调控TGF-β信号通路参与膀胱癌抗PD-L1免疫治疗的耐药过程 | 首次整合bulk、单细胞和空间转录组数据,结合机器学习,系统研究了m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的作用,并鉴定出关键基因NUDT10 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内实验和更大规模的临床队列验证 | 探究m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的潜在作用机制 | 膀胱癌 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学分析(转录组学、甲基化分析)、机器学习、siRNA转染、qRT-PCR、Western blot、免疫组化、CCK-8、伤口愈合实验 | 机器学习模型 | 转录组数据(bulk、单细胞、空间)、甲基化数据 | 来自多个公共数据库(TCGA、GEO、IMvigor210)的膀胱癌队列数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1124 | 2026-04-23 |
Long-Read Sequencing Reveals RNA Splicing Complexity in Human Diseases
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0052
PMID:42017050
|
综述 | 本文综述了长读长RNA测序技术在揭示人类疾病中RNA剪接复杂性方面的应用与优势 | 强调了长读长RNA测序在无需转录本组装的情况下,精确解析外显子-内含子结构、可变剪接模式及非经典RNA加工事件的能力,并探讨了其与单细胞和空间转录组学的整合趋势 | 作为一篇综述文章,未涉及具体实验数据或样本量的局限性分析 | 概述长读长RNA测序的工作原理、技术创新及其在疾病研究中的应用,以推动疾病诊断和精准医学 | 人类疾病相关的转录组,特别是RNA剪接复杂性 | 自然语言处理 | NA | 长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 长读长RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1125 | 2026-04-23 |
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000967
PMID:41563281
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术方法,揭示了细胞外基质刚度在急性肾损伤修复中的关键作用,并识别出Mfap2作为通过非经典Hippo通路调控酮体生成的重要修复介质 | 首次系统描绘了AKI肾脏基质支架的蛋白质组图谱,发现成纤维细胞/周细胞来源的Mfap2通过LATS1介导的非经典Hippo通路调控代谢重编程,提出了Mfap2-Esr2-Hmgcs2轴作为潜在药物靶点 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中验证;机制研究集中在特定信号通路,可能存在其他未被发现的调控网络 | 阐明细胞外基质如何通过机械代谢信号通路调控急性肾损伤修复过程 | 急性肾损伤动物模型、肾脏细胞外基质、成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 数据非依赖性采集蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程学 | NA | 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1126 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 | 首次在斑马鱼视网膜再生中系统解析了Müller胶质细胞的两种静止亚型及其向激活状态或杆状前体细胞的转化,并鉴定了小胶质细胞的三种亚型及其动态变化,同时揭示了炎症通过Jak1-Stat3信号通路调控胶质细胞重编程的机制 | 研究主要基于斑马鱼模型,结果向哺乳动物视网膜再生的直接转化仍需进一步验证 | 探究炎症在视网膜再生过程中如何调控Müller胶质细胞重编程 | 斑马鱼视网膜中的免疫细胞(特别是小胶质细胞)和Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜损伤与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及未损伤和损伤后的斑马鱼视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1127 | 2026-04-23 |
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063
PMID:39101644
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞在动态发育过程中的不同演化路径和功能差异 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统解析了脊髓损伤后小胶质细胞与巨噬细胞的差异化演化轨迹,并识别了巨噬细胞中与促炎效应(整合素β2)和神经保护效应(制瘤素M通路)相关的关键分子机制 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类临床样本中得到验证;空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析细胞间相互作用的微观空间结构 | 阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞与巨噬细胞的动态变化及其在炎症反应中的不同作用 | 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1128 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a peripheral monocyte subpopulation and its interaction with atrial macrophages via the CCL3-CCR1 axis during atrial remodeling
2025-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3023-9
PMID:40833709
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1129 | 2026-04-23 |
Role of long-chain acyl-CoA synthetases in MASH-driven hepatocellular carcinoma and ferroptosis
2025-Nov-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00096.2025
PMID:40875358
|
研究论文 | 本研究通过整合多种组学技术,揭示了长链酰基辅酶A合成酶(ACSLs)在MASH驱动的肝细胞癌(MASH-HCC)脂质代谢重编程和铁死亡敏感性中的关键作用 | 首次在MASH-HCC中系统描绘了脂质代谢全景图,并在单细胞水平上揭示了ACSL4在肿瘤组织和免疫微环境中的特异性表达模式及其与铁死亡敏感性的关联 | 研究主要基于观察性数据,ACSLs在MASH-HCC中的具体功能机制和作为治疗靶点的潜力仍需进一步实验验证 | 探究MASH-HCC中脂质代谢重编程的特征及其与铁死亡敏感性的关系,以寻找新的治疗靶点 | 人类MASH-HCC组织样本、人类HCC细胞系、饮食诱导的小鼠MASH-HCC模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 人类MASH和MASH-HCC肝脏样本(具体数量未明确说明),人类HCC细胞系,小鼠MASH-HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1130 | 2026-04-23 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISEE的新算法,用于建模单细胞数据集中的扰动响应,并应用于斑马鱼胚胎中ERK信号通路的研究 | 开发了DAISEE算法,能更有效地在复杂实验设计中分离单细胞扰动响应与混杂变异,并揭示了过激活信号通路在发育胚胎中诱导新基因表达状态的能力 | NA | 研究发育信号通路扰动对单细胞转录状态的影响 | 斑马鱼胚胎中的细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解框架 | 单细胞转录组数据 | 5小时龄斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1131 | 2026-04-23 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除疼痛感知外的调控功能,并利用化学遗传学方法验证了TrkA抑制对肉瘤生长和转移的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,且干预策略的长期效果和临床转化需进一步评估 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 | 小鼠骨肉瘤模型和人类骨肉瘤骨样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多模态多组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1132 | 2026-04-23 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
|
研究论文 | 本研究揭示了急性髓系白血病(AML)微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能,导致免疫抑制和感染易感性增加 | 首次在非照射的宿主中使用中性粒细胞报告小鼠模型,结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选,系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路重塑中性粒细胞的表观遗传和功能 | 研究主要基于小鼠模型,虽然患者样本验证了类似生物学现象,但人类AML的异质性可能带来更复杂的调控机制 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响及其分子机制 | AML暴露的中性粒细胞(来自小鼠模型和AML患者) | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学、染色质重塑分析、基序发现、体外细胞因子筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据 | 临床前AML小鼠模型及AML患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1133 | 2026-04-23 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-Oct, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70057
PMID:40631762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除技术,揭示了Yap和Taz转录因子在嗅鞘细胞和施万细胞发育中的不同作用,并发现这些变化不影响GnRH-1神经元的迁移 | 首次在单细胞水平上比较了嗅鞘细胞和施万细胞的基因表达差异,并明确了Hippo通路在嗅鞘细胞发育中的关键作用,同时发现尽管神经嵴衍生物发生显著变化,但GnRH-1神经元迁移不受影响 | 研究仅基于小鼠胚胎模型,未在成年动物或人类样本中验证,且未深入探讨Yap/Taz缺失导致嗅觉上皮发育改变的分子机制 | 探究Yap和Taz转录因子在嗅鞘细胞和施万细胞发育中的作用,以及它们对GnRH-1神经元迁移的影响 | 小鼠胚胎的鼻组织,包括嗅鞘细胞、施万细胞、黑色素细胞、嗅觉感觉神经元和GnRH-1神经元 | 单细胞组学 | 神经系统发育障碍 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | Sox10-Cre转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 未明确指定样本数量,但基于小鼠胚胎鼻组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1134 | 2026-04-23 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 | 首次在收集淋巴管中表征了TRPV4的表达,并发现其通过表达TRPV4的髓系细胞与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间的相互作用介导收缩失调 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本仅限于乳腺癌相关淋巴水肿患者,机制细节如其他血管舒张前列腺素的作用需进一步验证 | 探究TRPV4通道在淋巴系统疾病中的表达和功能作用 | 小鼠收集淋巴管及周围组织,以及乳腺癌相关淋巴水肿患者的活检样本 | 单细胞转录组学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,细胞内钙活性测量 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,功能实验数据 | 小鼠收集淋巴管样本及患者活检样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1135 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
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研究论文 | 本研究系统性地评估了整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)数据以改善批量RNA测序(bulk RNA-seq)反卷积性能的策略 | 首次系统性地比较了多种整合scRNA-seq和snRNA-seq数据的方法,并提出了针对不同场景的明确指导原则,包括基因过滤和条件变分自编码器(scVI)的应用 | 研究仅在四种组织类型中进行了验证,对于更广泛或更特殊的组织类型,方法的普适性有待进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性,特别是在缺乏完整scRNA-seq参考数据的情况下 | 批量RNA测序数据的细胞类型组成反卷积 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单核RNA测序(snRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 条件变分自编码器(scVI),非条件变分自编码器,主成分分析 | RNA测序数据 | 四种不同的组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1136 | 2026-04-23 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞的功能及其通过非经典Wnt信号调控增殖状态的动态过程 | 首次在Lgr5表达干细胞出现之前鉴定出Bmi1细胞作为功能性干细胞,并发现其通过非经典Wnt信号调控增殖状态向慢周期状态的转变 | 研究主要基于小鼠模型,人类肠道发育中的类似机制仍需验证 | 探究肠道上皮发育过程中干细胞亚群的动态调控机制 | 小鼠肠道发育早期的Bmi1表达干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1137 | 2026-04-23 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4和FABP5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,系统阐明了内皮细胞FABP4/5在肺动脉高压发病中的关键角色,特别是其通过调控糖酵解和动脉编程促进血管重塑的机制 | 研究主要基于动物模型和有限的患者样本,需要更大规模的人群研究验证;机制研究尚未完全揭示FABP4/5下游的具体信号通路 | 探究内皮细胞FABP4和FABP5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺组织、患者血浆样本、Egln1Tie2Cre基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 血浆蛋白质组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 包括特发性肺动脉高压患者样本、肺动脉高压大鼠模型、Egln1Tie2Cre小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1138 | 2026-04-23 |
A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660779
PMID:40666883
|
研究论文 | 本研究构建了一个绝经前女性的单细胞图谱(PreMeno Atlas),用于卵巢生物学研究和药物靶点发现 | 首次创建了专注于绝经前女性的多组织单细胞图谱,并系统比较了卵巢细胞类型的转录组特征,识别了潜在的卵巢特异性药物靶点 | 样本来源和数量可能有限,未涵盖所有绝经前年龄段或病理状态 | 构建绝经前女性单细胞图谱以促进卵巢生物学理解和药物靶点发现 | 绝经前女性的卵巢及其他13种组织 | 单细胞组学 | 生育管理 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 511,365个细胞,来自14种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1139 | 2026-04-23 |
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849
PMID:40233746
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研究论文 | 本文介绍了首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱RIRA,通过对比转录组谱与免疫谱系,揭示了无监督聚类在解释免疫细胞表型和功能时的局限性 | 首次构建猕猴免疫单细胞多组织图谱,并利用表面蛋白和标记基因作为基准,系统评估转录组谱与免疫谱系的对齐情况,识别了具有高判别价值的基因程序 | 无监督聚类在T细胞和NK细胞等功能性亚群中可能导致系统性混合,因为这些亚群缺乏明确的标记基因且共享强烈的表达程序(如细胞毒性) | 提高通过单细胞RNA测序数据解释免疫细胞表型和功能的准确性 | 猕猴的免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1140 | 2026-04-23 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2025-May-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027884
PMID:40014797
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研究论文 | 本研究揭示了成人肺中存在功能性造血祖细胞,这些细胞具有增殖和移植潜力,并可能支持人类造血功能 | 首次在成人肺中鉴定出功能性造血祖细胞,其频率与骨髓相似,并具有独特的基因特征和空间定位 | 研究主要基于小鼠移植实验和基因表达分析,人类体内功能验证有限 | 探索成人肺中造血祖细胞的存在、功能和潜在作用 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间定位数据 | 人类肺组织样本和血液样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |