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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11361 | 2025-10-07 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-12, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
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研究论文 | 本研究探讨了TRIM分子在系统性红斑狼疮患者CD4+T细胞中的表达特征及其临床诊断价值 | 首次揭示TRIM表达与CD4+T细胞异常活化的关联,并证明其在SLE临床鉴别诊断中的潜力 | 样本来源包括人和小鼠,但具体样本数量未明确说明 | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞中的表达、功能和临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者、健康对照者和类风湿关节炎患者的PBMCs及小鼠外周血和脾脏CD4+T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | SLE患者、健康对照和RA患者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11362 | 2025-10-07 |
Graph contrastive learning of subcellular-resolution spatial transcriptomics improves cell type annotation and reveals critical molecular pathways
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf020
PMID:39883515
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研究论文 | 提出一种名为Focus的图对比学习方法,利用亚细胞分辨率空间转录组数据改进细胞类型注释 | 首次开发能够显式建模RNA亚细胞分布和社区的半监督图对比学习方法 | NA | 改进细胞类型注释并揭示关键分子通路 | 亚细胞分辨率空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组技术 | 图对比学习 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单分子分辨率空间转录组学 | MERFISH, CosMx SMI, Xenium | 亚细胞分辨率空间转录组平台 |
11363 | 2025-10-07 |
Beyond the Heartbeat: Single-Cell Omics Redefining Cardiovascular Research
2024-Nov, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-024-02117-3
PMID:39158785
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综述 | 探讨单细胞组学技术在人类心脏研究中的最新进展及其对心血管疾病研究的革命性影响 | 整合多种单细胞组学技术揭示心脏细胞多样性、调控网络和疾病机制,推动心脏再生和精准医疗发展 | NA | 探索单细胞组学技术在心血管研究中的应用与进展 | 人类心脏各区域组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 单细胞基因组学, 单细胞蛋白质组学, 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
11364 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells
2024-10, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904
PMID:39117004
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综述 | 本文通过单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞在正常和肿瘤状态下的更复杂分类 | 利用单细胞测序技术重新定义了胸腺上皮细胞的分类体系,揭示了从pre-AIRE状态到成熟medullary细胞再到post-AIRE细胞的分化轨迹 | NA | 探讨单细胞测序对胸腺上皮细胞分类的新见解 | 正常和肿瘤状态下的胸腺上皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11365 | 2025-10-07 |
Molecular Organization of Autonomic, Respiratory, and Spinally-Projecting Neurons in the Mouse Ventrolateral Medulla
2024-Jul-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2211-23.2024
PMID:38918066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠延髓腹外侧区细胞的全面分子图谱 | 首次通过靶向测序富集脊髓投射和肾上腺素能/去甲肾上腺素能神经元,识别出23种神经元亚型和5种星形胶质细胞亚型 | 研究仅针对小鼠模型,未在其它物种中验证 | 解析延髓腹外侧区的分子和细胞组织结构 | 小鼠延髓腹外侧区细胞,特别是脊髓投射神经元和单胺能神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 114,805个VLM细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11366 | 2025-10-07 |
Genetic control of the dynamic transcriptional response to immune stimuli and glucocorticoids at single-cell resolution
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276765.122
PMID:37442575
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索糖皮质激素对免疫刺激后外周血单个核细胞转录反应的遗传调控机制 | 开发了新的统计方法量化基因表达变异性和响应伪时间,首次在单细胞水平揭示糖皮质激素逆转免疫刺激效应的动态转录调控 | 研究样本仅来自非裔美国儿童,可能限制结果在其他人群的普适性 | 阐明糖皮质激素对免疫刺激转录反应的动态调控机制及遗传基础 | 96名非裔美国儿童的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 对角线线性判别分析 | 单细胞转录组数据 | 96名非裔美国儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11367 | 2025-10-07 |
Systematic Comparison of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Models Identifies a Conserved Highly Plastic Basal Cell State
2022-Oct-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1742
PMID:35952360
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研究论文 | 通过单细胞基因组学系统比较胰腺导管腺癌模型,发现了一个高度可塑性的保守基底细胞状态 | 首次系统比较不同生长条件下PDAC肿瘤细胞的异质性,发现原位移植能恢复肿瘤异质性并鉴定出具有上皮-间质基因共表达特征的高度可塑性基底细胞状态 | 研究主要基于模型系统,需要进一步验证在人类患者中的临床相关性 | 理解胰腺导管腺癌中细胞异质性和可塑性的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞 | 单细胞基因组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种体外和体内生长条件下的PDAC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11368 | 2025-10-07 |
RASGRF2 as a potential pathogenic gene mediating the progression of alcoholic hepatitis to alcohol-related cirrhosis and hepatocellular carcinoma
2025-Jan-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01853-4
PMID:39875737
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研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析发现RASGRF2是介导酒精性肝炎向酒精性肝硬化和肝细胞癌进展的关键致病基因 | 首次通过多数据库整合分析结合机器学习算法鉴定出RASGRF2作为AH向AC和HCC进展的核心共享基因,并利用单细胞和空间转录组数据进行了验证 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HepG2细胞系,缺乏更广泛的体内功能验证 | 探索酒精性肝炎向肝硬化和肝细胞癌进展的分子机制 | 酒精性肝炎、酒精性肝硬化、肝细胞癌患者组织样本及HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序、免疫浸润分析、免疫组化、细胞功能实验 | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多个转录组数据库的样本数据,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
11369 | 2025-10-07 |
Computational Identification of Migrating T cells in Spatial Transcriptomics Data
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619870
PMID:39484480
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研究论文 | 开发了一种利用空间转录组数据追踪T细胞迁移模式的计算方法ReMiTT | 首次提出基于空间转录组数据计算识别T细胞迁移轨迹的计算方法 | NA | 研究T细胞在肿瘤微环境中的迁移模式 | 肿瘤组织中的T细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | ReMiTT | 空间转录组数据 | 多个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11370 | 2025-10-07 |
The Role of Dectin-1-Akt-RNF146 Pathway in β-Glucan Induced Immune Trained State of Monocyte in Sepsis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482213
PMID:39881796
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研究论文 | 本研究探讨了Dectin-1-Akt-RNF146通路在β-葡聚糖诱导的单核细胞免疫训练状态中的作用及其在脓毒症中的机制 | 首次揭示RNF146通过dectin-1-Akt-mTOR通路调控单核细胞免疫训练状态,为逆转脓毒症免疫抑制提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明β-葡聚糖诱导的免疫训练在脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者外周血单核细胞、脓毒症小鼠模型、RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞系 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者PBMCs、小鼠模型和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
11371 | 2025-10-07 |
Therapeutic potential and mechanisms of umbilical cord mesenchymal stem cells differentiating into tendon cells and promotion of rotator cuff tendon-bone healing
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251315185
PMID:39882545
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研究论文 | 本研究探讨脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其促进肩袖肌腱-骨愈合的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序分析脐带间充质干细胞向肌腱细胞分化过程中的关键细胞亚群和信号通路,并揭示Hes1基因在促进分化和肩袖损伤修复中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 探索脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其在肩袖损伤修复中的应用价值 | 脐带间充质干细胞、肌腱细胞、肩袖损伤动物模型 | 干细胞研究 | 肩袖损伤 | 单细胞测序、基因过表达、细胞诱导分化 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11372 | 2025-10-07 |
Intratumoural CD8+ CXCR5+ follicular cytotoxic T cells have prognostic value and are associated with CD19+ CD38+ B cells and tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024-Dec-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03887-z
PMID:39739032
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中CD8+ CXCR5+滤泡细胞毒性T细胞的预后价值及其与B细胞和三级淋巴结构的关系 | 首次系统比较TFC细胞在MSI-high和MSS结直肠癌中的生物学功能差异,并建立了预后预测模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探索TFC细胞在结直肠癌中的特征及其在MSI-high和MSS亚型中的生物学功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织和外周血样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 共培养实验 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 临床队列和公共数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11373 | 2025-10-07 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNFα对小鼠软骨细胞转录组的差异影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示TNFα对骨骺软骨细胞不同亚群的差异调控作用 | 研究仅使用新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞,未验证其他年龄或物种 | 探究TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用机制 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11374 | 2025-10-07 |
Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response
2024-10, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12811
PMID:39048134
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术解析头颈癌肿瘤微环境特征与免疫治疗反应的关系 | 首次结合NanoString GeoMx空间转录组和Akoya Phenocycler-Fusion空间蛋白质组技术,在头颈癌中识别与免疫治疗反应相关的肿瘤和基质特征 | 样本量较小(仅12名患者),且为回顾性研究 | 识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物学特征 | 头颈癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理 | 头颈癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 12名患者的25个组织核心(包括4名无应答者8个核心,2名应答者5个核心,6名未治疗者12个核心) | NanoString, Akoya | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler, PhenoCycler-Fusion | NanoString GeoMx全转录组空间分析, Akoya PhenoCycler-Fusion空间蛋白质组分析 |
11375 | 2025-10-07 |
Computational estimation of clonal diversity in autoimmunity
2024-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12801
PMID:39010261
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序测量T细胞和B细胞受体多样性及其在自身免疫病研究中的应用 | 结合单细胞测序与多样性评估方法,推动自身免疫病机制发现和治疗创新 | NA | 探讨免疫受体多样性测量方法及其在自身免疫病研究中的意义 | T细胞受体和B细胞受体 | 生物信息学 | 自身免疫病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11376 | 2025-10-07 |
Discovery of a monoclonal, high-affinity CD8+ T-cell clone following natural hepatitis C virus infection
2024-08, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12791
PMID:38855806
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研究论文 | 在自然HCV感染后发现了一个具有高亲和力的单克隆CD8+ T细胞克隆 | 发现了在急性HCV感染后持续存在的单克隆CD8+ T细胞群体,其TCR-pMHC相互作用的解离时间异常长 | 研究样本量有限,仅从两名个体中分析HCV特异性T细胞群体 | 研究HCV感染后CD8+ T细胞的特异性免疫应答 | HCV感染个体的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞测序,HLA多聚体染色 | NA | 测序数据,流式细胞术数据 | 两名HCV感染个体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11377 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603155
PMID:39071344
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了早期妊娠胎盘绒毛板和基底板细胞滋养层细胞之间的差异及其与滋养层干细胞的比较 | 首次在单细胞水平系统比较了胎盘不同区域(绒毛板与基底板)细胞滋养层细胞的转录组差异,并明确了滋养层干细胞与特定滋养层亚群的相似性 | 样本量相对较小(6个正常胎盘和3个滋养层干细胞系),且仅关注了第一孕期的胎盘组织 | 探究早期人类胎盘细胞滋养层的转录组多样性,比较滋养层干细胞与不同细胞滋养层亚群的异同 | 人类早期妊娠胎盘组织(6-14周)和滋养层干细胞系 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个正常胎盘(4个早期6-8周,2个晚期12-14周)和3个滋养层干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11378 | 2025-10-07 |
Mapping the landscape of lineage-specific dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to genetics of complex disease
2023-Dec-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.24.23297476
PMID:37961453
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研究论文 | 开发单细胞转录组学框架量化基因表达动态遗传调控及其细胞类型特异性 | 建立细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型,实现单细胞分辨率下基因表达动态遗传调控的量化 | 研究聚焦中脑神经元,模型在其他细胞类型中的普适性需进一步验证 | 解析遗传变异如何通过影响基因表达参与人类生物学过程和复杂疾病 | 诱导多能干细胞分化的中脑神经元 | 单细胞转录组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 遗传模型 | 单细胞转录组数据 | 英国生物银行1500多种表型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11379 | 2025-10-07 |
Neoadjuvant chemotherapy plus nivolumab with or without ipilimumab in operable non-small cell lung cancer: the phase 2 platform NEOSTAR trial
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02189-0
PMID:36928818
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研究论文 | 评估纳武利尤单抗联合化疗与联合伊匹木单抗在可手术非小细胞肺癌新辅助治疗中的疗效和生物标志物 | 首次在NEOSTAR平台试验中比较纳武利尤单抗+化疗与联合伊匹木单抗三药方案的病理缓解率,并通过单细胞测序和多平台免疫分析探索生物标志物 | 样本量较小(每组22例患者),II期试验需要更大规模验证 | 评估新辅助免疫治疗联合化疗在可手术非小细胞肺癌中的疗效和安全性 | 可手术的非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序,多平台免疫分析,微生物组分析 | NA | 临床数据,基因组数据,微生物组数据 | 44例患者(每组22例) | NA | 单细胞RNA测序,免疫分析,微生物组测序 | NA | NA |
11380 | 2025-10-07 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
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研究论文 | 本研究开发了一种通过共刺激γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞的新方法,并验证其抗肿瘤活性 | 首次发现γδTCR和TLR7/8共刺激可增强Vδ2 T细胞抗肿瘤功能,并揭示其通过调节mTOR通路和APC功能的作用机制 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发更有效的γδ T细胞癌症免疫治疗方法 | Vδ2 T细胞、抗原呈递细胞、肿瘤细胞 | 免疫学、癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、反相蛋白阵列、体外共培养、动物模型 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 人PBMCs、人脾细胞、人源化NSG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |