单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 11361 - 11380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11361 | 2024-08-05 |
Transcriptional programs mediating neuronal toxicity and altered glial-neuronal signaling in a Drosophila knock-in tauopathy model
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.02.578624
PMID:38352559
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas基因编辑技术构建了前额叶痴呆的果蝇模型，并探讨了神经元功能障碍和死亡的分子机制 | 该研究使用自有基因编辑方法忠实地重现了人类疾病的遗传背景与表型特征 | 该研究使用的模型可能无法完全代表人类疾病的所有复杂性 | 研究前额叶痴呆中tau蛋白突变导致的神经元毒性及胶质细胞-神经元信号改变的分子机制 | 进行单细胞RNA测序分析的果蝇，具体包括tau P251L突变体和对照果蝇 | 数字病理 | 前额叶痴呆 | CRISPR-Cas基因编辑 | 突变体模型 | 单细胞RNA测序数据 | 约130,000个细胞 |
| 11362 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomic analysis to unveil heterogeneity in high-grade serous ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420847
PMID:38975339
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示高等级浆液性卵巢癌的异质性 | 该研究首次揭示了HGSOC的特定细胞特征与不良结果的相关性，并提出了代谢通路的治疗靶点 | 本研究主要集中在HGSOC的特定特征上，可能限制了其他类型卵巢癌的适用性 | 研究HGSOC的复杂机制并识别其异质性 | HGSOC的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括转移样本在内的多种HGSOC样本 |
| 11363 | 2024-08-05 |
An age-and sex-matched postoperative therapy should be required in thyroid papillary carcinoma
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1339191
PMID:38974575
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）的淋巴结转移风险因素并提出了差异化治疗方案。 | 首次指出性别和年龄对PTC术后治疗的影响，并建议在治疗中考虑这些因素。 | 未能明确TSH对PTC行为的影响，且部分临床数据可能存在偏差。 | 研究PTC术后淋巴结转移的风险因素，并开发针对PTC的差异化治疗。 | 分析2073例PTC患者的临床信息及基因表达数据。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、基因表达数据 | 2073例 |
| 11364 | 2024-08-05 |
A comprehensive exploration of the heterogeneity of immune cells in Han and Zang systemic lupus erythematosus patients via single-cell RNA sequencing
2024-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110770
PMID:38128704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索汉族和藏族系统性红斑狼疮患者免疫细胞的异质性 | 首次揭示汉族和藏族SLE患者免疫细胞的异质性 | 可能样本量有限，未包括其他民族的比较 | 揭示SLE患者免疫细胞的异质性 | 汉族和藏族的系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 11365 | 2024-08-05 |
De novo identification of expressed cancer somatic mutations from single-cell RNA sequencing data
2023-12-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01269-1
PMID:38111063
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研究论文 | 提出了一种计算框架RESA用于从单细胞RNA测序数据中识别表达的肿瘤体细胞突变 | RESA提供了一种新的方法来进行表达的肿瘤体细胞突变分析，并在现有方法中表现优异 | 没有提及具体的局限性 | 旨在提高从单细胞RNA测序数据中识别表达肿瘤突变的准确性 | 针对黑色素瘤药物耐药性数据集分析肿瘤内突变异质性 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 19个数据集 |
| 11366 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in pulmonary post-acute sequelae of SARS-CoV-2
2023-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.31.551349
PMID:37577518
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研究论文 | 本文揭示了SARS-CoV-2后肺病症状患者中骨髓来源细胞的特征。 | 通过单细胞RNA测序，首次详细描绘了与COVID-19后急性并发症相关的免疫细胞特征和代谢变化。 | 样本大小和控制组的选择可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究COVID-19后急性并发症患者中免疫反应的特点。 | 与SARS-CoV-2病毒感染后的慢性肺部症状相关的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了34,139个外周血单核细胞样本 |
| 11367 | 2024-08-05 |
Cross-species scRNA-seq reveals the cellular landscape of retina and early alterations in type 2 diabetes mice
2023-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110644
PMID:37279838
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研究论文 | 本研究揭示了2型糖尿病小鼠视网膜的细胞景观和早期病理变化 | 首次通过跨物种的单细胞RNA测序详细描述了视网膜细胞图谱，并发现了新的视网膜双极细胞亚型 | 该研究仅基于小鼠和人类的数据，未涵盖其他物种的视网膜变化 | 探索2型糖尿病对视网膜的早期影响 | 人类和小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 276,402个细胞 |
| 11368 | 2024-08-05 |
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000098
PMID:36787763
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研究论文 | 本研究探讨了激活Angiopoietin-Tie2信号通路如何通过调节内皮特异性途径来保护肾脏免受缺血损伤。 | 引入了Hepta-ANG1作为一种新的治疗生物药物，并提供了Tie2激活保护肾脏的分子机制依据。 | 本研究的局限性未在摘要中提到 | 研究缺血再灌注急性肾损伤（IR-AKI）中Tie2信号的激活及其保护作用。 | 使用VE-PTP小鼠和C57BL/6J小鼠进行实验，研究其在肾脏缺血再灌注损伤中的作用。 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织活检, RNA测序 | 使用VE-PTP野生型和敲除小鼠及C57BL/6J小鼠的样本 |
| 11369 | 2024-08-04 |
Accurate integration of multiple heterogeneous single-cell RNA-seq data sets by learning contrastive biological variation
2023-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277522.122
PMID:37308294
|
研究论文 | 本文介绍了一个新的单细胞RNA测序数据集整合方法 scInt | scInt通过构建精确、稳健的细胞间相似性并学习统一的对比生物变异，从多个数据集中进行有效整合，超越了现有的十种 cutting-edge 方法 | 针对复杂实验设计的整合效果仍需进一步验证 | 实现多种异质单细胞RNA测序数据集的有效整合 | 不同生物条件下的单细胞异质样本及其功能性亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 涉及多种生物条件的多个模拟和真实数据集 |
| 11370 | 2024-08-05 |
Understanding the cellular interactome of non-alcoholic fatty liver disease
2022-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2022.100524
PMID:35845296
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综述 | 本文主要描述了非酒精性脂肪肝疾病的细胞相互作用网络。 | 介绍了快速发展的技术如何改变我们对NAFLD/NASH中细胞相互作用网络的理解，并利用这些信息开发新疗法。 | 未提及具体的实验数据和结果，只是综述现有的研究和技术。 | 探讨非酒精性脂肪肝疾病中的细胞相互作用及其对病理的影响。 | 主要关注非酒精性脂肪肝疾病（NAFLD）及其相关病理。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝疾病 | 单细胞基因组学、空间转录组学、单细胞配体-受体分析 | NA | NA | NA |
| 11371 | 2024-08-05 |
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101459
PMID:33789950
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研究论文 | 本研究表明猕猴是人类侧支肾发生的有效模型。 | 首次确认猕猴作为真实侧支肾发生的模型，促进了对人类晚期妊娠肾发生的分子研究。 | 该研究未能详细探讨不同妊娠阶段的细胞变化。 | 研究大三分支肾发生的分子机制。 | 129-131天妊娠期的猕猴胎儿肾脏。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 4个猕猴胎儿肾脏样本 |
| 11372 | 2024-08-05 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
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研究论文 | 本文描述了一种患者的罕见自炎症综合症及其与JAK1激酶突变的关联 | 提出了突变'转录型'的概念，展示了S703I突变的独特功能 | 研究主要基于单个病例，缺乏更大样本的验证 | 探索JAK1在自炎症疾病中的转录和生化功能 | 一名因JAK1突变出现多脏器免疫失调的患者 | 数字病理学 | 自炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 1名患者 |
| 11373 | 2024-08-05 |
cellHarmony: cell-level matching and holistic comparison of single-cell transcriptomes
2019-12-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz789
PMID:31529053
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研究论文 | 本文介绍了cellHarmony，一个用于单细胞转录组分析和比较的新工具 | cellHarmony采用社区聚类和对齐策略有效匹配单细胞转录组，能够揭示细胞特异的基因表达差异 | NA | 研究目的在于定义疾病相关细胞群体内外的变化，理解人类疾病的分子发病机制 | 研究对象为正常和疾病状态下的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 潜在涉及数十个细胞群体 |
| 11374 | 2024-08-05 |
The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke
2024-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01169-x
PMID:37378751
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研究论文 | 本研究探讨了急性缺血性中风中周细胞的转录组特征 | 首次揭示了缺血性中风后周细胞特有的转录变化和潜在的治疗靶点 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全代表人类缺血性中风的复杂性 | 改善缺血性中风的治疗效果，寻找新的治疗靶点 | 急性缺血性中风中的周细胞 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 通过中动脉闭塞模型获得的样本在1小时、12小时和24小时后进行分析 |
| 11375 | 2024-08-05 |
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2024-Jul-09, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2024_554
PMID:38976205
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研究论文 | 本研究提出了一种新方法，通过人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的皮层类器官和小胶质细胞生成神经免疫组合体 | 创新点在于将小胶质细胞整合到皮层类器官模型中，以反映神经免疫交互作用 | 研究中没有提及样本的广泛性或不同类型的小胶质细胞对结果的影响 | 研究旨在开发一种能够更好地模拟神经发育和神经疾病中神经细胞与免疫细胞相互作用的体外模型 | 研究对象为人诱导多能干细胞衍生的皮层类器官和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 11376 | 2024-08-04 |
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-Jul-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
PMID:38655770
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研究论文 | 本研究首次揭示了循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化和在生理过程中的作用 | 首次对循环髓系细胞的研究价值进行了系统分析，并确定了其特定类型的亚群 | 本研究的具体样本大小和实验条件未详细说明 | 研究循环髓系细胞在生理和病理过程中的起源和功能 | 循环髓系细胞，特别是亚群a的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |
| 11377 | 2024-08-04 |
Establishment of an ovarian cancer exhausted CD8+T cells-related genes model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jul-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01948-8
PMID:38970067
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研究论文 | 建立了一种与卵巢癌耗竭CD8+T细胞相关的基因模型 | 首次识别了与耗竭的CD8+T细胞相关的基因，并提出了其在卵巢癌中的预后意义 | 模型的临床适用性需要在更多样本上进行进一步验证 | 识别与卵巢癌中耗竭CD8+T细胞相关的基因及其预后意义 | 卵巢癌患者的肿瘤样本及相关基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的大样本 |
| 11378 | 2024-08-05 |
Deciphering lineage specification during early embryogenesis in mouse gastruloids using multilayered proteomics
2024-Jul-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.017
PMID:38754429
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研究论文 | 本研究利用多层质谱技术研究了小鼠胃胚体早期发育中的蛋白质表达动态 | 首次使用多层质谱技术对小鼠胃胚体发育中的蛋白质进行全面分析，发现了各个胚层特有的时间性表达模式 | 缺乏对早期哺乳动物胚胎发育的蛋白质组学研究，现有研究较为稀缺 | 探讨小鼠胃胚体发育过程中胚层特异性蛋白质的表达和功能 | 小鼠胃胚体和发育过程中相关的蛋白质 | 数字病理学 | NA | 质谱 | NA | 蛋白质组数据 | 研究涉及的小鼠胃胚体样本数量NA |
| 11379 | 2024-08-07 |
Author Correction: The shaky foundations of simulating single-cell RNA sequencing data
2024-Jul-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03329-0
PMID:38970115
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11380 | 2024-08-05 |
Harnessing Single-Cell Technologies in the Search for New Therapies for Diamond-Blackfan Anemia Syndrome
2024-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104235
PMID:38740323
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综述 | 本文讨论了单细胞技术在钻石-黑凡贫血综合症(DBA)新疗法研究中的应用。 | 该文章创新性地探索了单细胞研究对理解DBA病理机制及新疗法开发的启示。 | 本文主要为综述，具体的实验数据和结果较为有限。 | 研究DBA的病理机制及其新疗法的潜在开发。 | 钻石-黑凡贫血综合症及其相关的单细胞技术研究。 | 数字病理学 | 其他血液疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 克隆细胞培养测定 | NA | NA | NA |