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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11341 | 2025-10-07 |
cfDiffusion: diffusion-based efficient generation of high quality scRNA-seq data with classifier-free guidance
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf071
PMID:39987461
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研究论文 | 提出基于扩散模型的高质量单细胞RNA测序数据生成方法cfDiffusion | 结合无分类器引导和高级特征缓存机制,显著降低训练成本并提高多属性单细胞数据生成效率 | 推理时间仍长于scDiffusion方法 | 解决单细胞RNA测序数据模拟中的质量和效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11342 | 2025-10-07 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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研究论文 | 通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集,构建肠道神经元的元图谱并建立神经元亚型的转录组学共识定义 | 首次系统整合多个独立scRNA-seq数据集,构建肠道神经元的元图谱,实现跨年龄段的共识分类 | 数据集间细胞分离和文库构建方法存在差异,未来需将转录组谱与历史分类系统关联 | 识别新的细胞类型、共享标记基因、数据集差异,并建立肠道神经元亚型的转录组学共识定义 | 小鼠肠道神经系统神经元 | 单细胞转录组学 | 胃肠动力障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序 | 数据整合分析 | 单细胞转录组数据 | 多个独立数据集整合 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11343 | 2025-10-07 |
Characterization of an orthotopic mouse transplant model reveals early changes in the tumor microenvironment of lung cancer
2024-Nov, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:39044458
|
研究论文 | 本研究通过建立原位移植小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了肺癌早期肿瘤微环境的细胞和分子变化 | 首次在携带Kras G12C突变的Lewis肺癌原位移植模型中,通过检测突变Kras转录本识别肿瘤细胞,并系统揭示了早期肿瘤微环境中成纤维细胞、髓系细胞和T/NK细胞的表型变化 | 研究基于小鼠移植模型,可能无法完全模拟人类肺癌的自然发生过程 | 探究肺癌早期阶段的细胞和分子动态变化 | Lewis肺癌细胞系(LLC)和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11344 | 2025-10-07 |
MCAM is a prognostic biomarker in patients with liver cirrhosis and HCC
2024-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000532
PMID:39992088
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研究论文 | 本研究评估了可溶性黑色素瘤细胞粘附分子(sMCAM)作为肝硬化和肝细胞癌患者预后血液生物标志物的潜力 | 首次发现sMCAM在肝纤维化和HCC患者血液中水平升高,并证明其作为预后生物标志物的价值 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 评估sMCAM作为肝硬化和HCC患者预后血液生物标志物的临床应用价值 | 健康对照者、慢性肝病患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 组织图像, 血液样本 | 健康对照8例, 慢性肝病66例, 肝硬化236例, 肝细胞癌72例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11345 | 2025-10-07 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts determine the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008721
PMID:39067872
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 首次系统鉴定POSTN+ CAF亚群在肝癌免疫治疗中的屏障作用,并阐明其通过IL-6/STAT3信号通路招募SPP1+巨噬细胞形成免疫抑制微空间的机制 | 研究基于六个数据集的220个样本,样本来源和数量可能存在局限性 | 探究肝细胞癌免疫治疗抵抗机制,特别关注癌症相关成纤维细胞亚群的作用 | 肝细胞癌患者肿瘤微环境中的细胞组成和相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 220个样本来自六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11346 | 2025-10-07 |
The rise of single-cell transcriptomics in yeast
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3934
PMID:38403881
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综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在酵母研究中的应用现状与发展前景 | 系统总结了酵母单细胞RNA测序技术面临的独特技术挑战及解决方案 | NA | 探讨单细胞转录组技术在酵母研究中的技术发展和应用潜力 | 酵母单细胞转录组学研究 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11347 | 2025-10-07 |
Dynamic Changes in the Gene Expression Patterns and Lipid Profiles in the Developing and Maturing Meibomian Glands
2022-Jul-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23147884
PMID:35887230
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠睑板腺发育和成熟过程中的脂质组和转录组变化,揭示了睑脂生物合成的分子机制 | 首次系统研究睑板腺从新生到成年阶段的动态基因表达模式和脂质谱变化,并采用单细胞RNA测序技术识别了不同细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型,人类睑板腺可能存在差异 | 阐明睑板腺发育成熟过程中睑脂生物合成的分子机制 | 小鼠睑板腺组织 | 单细胞生物学 | 眼表疾病 | 单细胞RNA测序,脂质组学分析,转录组分析 | NA | 基因表达数据,脂质谱数据 | 新生至成年多个发育阶段的小鼠睑板腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11348 | 2025-10-07 |
High antigen-presenting CAF levels correlate with reduced glycosaminoglycan biosynthesis-heparan sulfate/heparin metabolism in immune cells and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma: Insights from bulk and single-cell transcriptome profiling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140418
PMID:39889995
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现食管鳞状细胞癌中抗原呈递CAF亚群通过调控糖胺聚糖生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素代谢途径影响免疫细胞功能并导致不良预后 | 首次在食管鳞癌中鉴定出抗原呈递CAF亚群,并揭示其通过调控糖胺聚糖代谢通路重塑肿瘤代谢微环境的新机制 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证代谢通路的具体功能机制 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞癌肿瘤微环境代谢重编程中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11349 | 2025-10-07 |
Unveiling FKBP7 as an early endoplasmic reticulum sentinel in pancreatic stellate cell activation, collagen remodeling and tumor progression
2025-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217538
PMID:39924075
|
研究论文 | 本研究揭示了FKBP7作为胰腺星状细胞早期内质网标志物在细胞活化、胶原重塑和肿瘤进展中的作用机制 | 首次发现FKBP7作为胰腺星状细胞早期活化标志物,早于αSMA表达,并通过与BiP相互作用调控特定胶原亚型分泌 | 研究主要基于体外实验和动物模型,在人体内的具体作用机制仍需进一步验证 | 探究内质网驻留蛋白FKBP7在胰腺导管腺癌基质活化中的作用机制 | 胰腺星状细胞、癌症相关成纤维细胞、胰腺导管腺癌患者组织 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、功能分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 胰腺导管腺癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11350 | 2025-10-07 |
The development and potent antitumor efficacy of CD44/CD133 dual-targeting IL7Rα-armored CAR-T cells against glioblastoma
2025-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217541
PMID:39952598
|
研究论文 | 本研究开发了靶向CD44和CD133的双特异性IL7Rα装甲CAR-T细胞,用于治疗胶质母细胞瘤 | 首创串联靶向CD44和CD133的双特异性CAR结构,并在CD28共刺激受体和CD3ζ信号链之间插入截短型IL-7受体α胞内结构域(Δ7R) | 临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 开发针对胶质母细胞瘤的新型免疫治疗方法 | 胶质瘤干细胞、胶质母细胞瘤患者样本、颅内异种移植模型、患者来源异种移植模型、胶质母细胞瘤类器官 | 免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | CAR-T细胞疗法 | 测序数据、细胞表型数据 | 胶质母细胞瘤患者样本、患者来源模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11351 | 2025-10-07 |
Resolving the bone - optimizing decalcification in spatial transcriptomics and molecular pathology
2025-Mar, Journal of histotechnology
IF:0.6Q4
DOI:10.1080/01478885.2024.2446038
PMID:39723974
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综述与观点文章 | 探讨骨组织脱钙方法在空间转录组学和分子病理学中的优化策略 | 系统分析传统与现代脱钙方法,为骨组织分子完整性保护提供技术改进建议 | NA | 优化骨组织脱钙流程以提升空间转录组学和分子病理学分析质量 | 骨组织和钙化组织 | 空间转录组学 | NA | 脱钙处理,PCR,测序,免疫组织化学,杂交 | NA | 分子病理数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11352 | 2025-10-07 |
GAMG alleviates liver fibrosis through inducing ferroptosis in inflammatory macrophages via the IRF1/SLC7A11 signaling pathway
2025-Mar, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103509
PMID:39904190
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研究论文 | 本研究探讨了GAMG通过IRF1/SLC7A11信号通路诱导炎症巨噬细胞铁死亡从而缓解肝纤维化的机制 | 首次发现GAMG通过激活IRF1/SLC7A11轴诱导炎症巨噬细胞铁死亡的新机制 | NA | 探究GAMG对肝纤维化的治疗作用及分子机制 | 肝纤维化小鼠模型和炎症巨噬细胞 | 生物医学研究 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 质谱代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 肝纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11353 | 2025-10-07 |
Inhibition of glutathione peroxidase 4 suppresses gastric cancer peritoneal metastasis via regulation of RCC2 homeostasis
2025-Mar, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103519
PMID:39908861
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研究论文 | 本研究揭示GPx4通过调控RCC2稳定性促进胃癌腹膜转移的分子机制 | 首次阐明GPx4通过ROS-aurora A通路调控RCC2泛素化降解的分子机制 | 未明确GPx4抑制剂在临床治疗中的具体应用价值 | 探索GPx4在胃癌转移中的作用机制并寻找治疗靶点 | 胃癌细胞及临床样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 回顾性临床样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11354 | 2025-10-07 |
Human placental extract improves liver cirrhosis in mice with regulation of macrophages and senescent cells
2025-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.01.017
PMID:39991509
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研究论文 | 本研究探讨人胎盘提取物通过调节巨噬细胞和衰老细胞改善小鼠肝硬化的作用机制 | 首次发现人胎盘提取物可通过促进巨噬细胞向抗炎M2表型极化并减少衰老细胞数量来改善肝硬化 | 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(每组n=8),需要进一步临床验证 | 开发肝硬化的新型治疗方法,替代肝移植 | 四氯化碳诱导的肝硬化小鼠模型 | 空间转录组学 | 肝硬化 | 实时PCR, 免疫染色, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 每组8只小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11355 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of peripheral blood mononuclear cells in patients with Graves' disease
2025-Feb-25, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf038
PMID:39996309
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了格雷夫斯病患者外周血单个核细胞的单细胞景观 | 首次在格雷夫斯病患者中应用单细胞RNA测序技术全面分析外周血单个核细胞的异质性和功能变化 | 样本量相对较小(8名患者和12名健康对照),需要更大规模研究验证 | 阐明格雷夫斯病中免疫异常的具体机制 | 格雷夫斯病患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 格雷夫斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22680个外周血单个核细胞,来自8名GD患者和12名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11356 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing to identify a distinct tumor stem cells and construct a novel prognostic signature for evaluating prognosis and immunotherapy in LUAD
2025-Feb-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06243-6
PMID:39987127
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别肺腺癌中的肿瘤干细胞特征并构建预后标志物模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序识别肺腺癌肿瘤干细胞特征,构建了包含49个基因的预后标志物模型,并发现TAF10作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明,模型验证需要进一步前瞻性研究 | 开发肺腺癌预后评估和免疫治疗效果预测的肿瘤干细胞标志物模型 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qRT-PCR,Western blot,免疫组化 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11357 | 2025-10-07 |
NK cell immunopotentiators-loaded nanoliposomes enhance ADCC effect for targeted therapy against HER2-positive breast cancer
2025-Feb-22, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-02023-9
PMID:39987140
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研究论文 | 本研究开发了负载NK细胞免疫增强剂的HER2靶向纳米脂质体,用于增强曲妥珠单抗在HER2阳性乳腺癌治疗中的ADCC效应 | 首次将TKD和IP-10p两种免疫调节肽封装于HER2靶向pH敏感纳米脂质体中,通过增强NK细胞浸润和活性来克服曲妥珠单抗耐药性 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发新型纳米递送系统以增强曲妥珠单抗在HER2阳性乳腺癌中的治疗效果 | HER2阳性乳腺癌患者肿瘤组织及相应的疾病模型 | 肿瘤免疫治疗 | 乳腺癌 | 单细胞测序、生物信息学分析、纳米脂质体技术 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11358 | 2025-10-07 |
Interferon-gamma receptor signaling regulates innate immunity during Staphylococcus aureus craniotomy infection
2025-Feb-22, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03376-9
PMID:39987156
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研究论文 | 本研究探讨了干扰素-γ受体信号在金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中对先天免疫的调控作用 | 首次揭示了IFN-γ通过增强巨噬细胞和小胶质细胞的抗菌活性在颅骨切开术感染中的关键保护作用,并发现Th1/Th17比例失衡导致免疫功能失调 | 在粒细胞或巨噬细胞/小胶质细胞条件性敲除IFN-γR1小鼠中未观察到表型,提示存在冗余机制 | 研究IFN-γ信号在颅骨切开术生物膜感染免疫应答中的调控机制 | 金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染小鼠模型 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序,条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型和Ifngr1缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11359 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2025-Feb-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57157-2
PMID:39987196
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研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法,用于改进scRNA-seq数据分析 | 通过去除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的未解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集(肾脏图谱、PBMC数据集、大鼠肝脏图谱、健康人类肝脏图谱) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11360 | 2025-10-07 |
Human nasal turbinate stem cells with specific gene signatures (HAS2, CXCL1, KRTAP1-5, GSTT2B, and C4B) attenuate rheumatoid arthritis
2025-Feb-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90707-8
PMID:39987230
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研究论文 | 本研究探讨人鼻甲来源干细胞对类风湿性关节炎的治疗效果及其相关基因特征 | 首次发现具有特定基因特征(HAS2、CXCL1、KRTAP1-5、GSTT2B和C4B)的人鼻甲干细胞对类风湿性关节炎具有治疗潜力 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;样本量有限(20例健康对照) | 研究人鼻甲干细胞对类风湿性关节炎的治疗效果及机制 | 人鼻甲来源干细胞、胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 干细胞治疗 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、RT-qPCR、流式细胞术、TRAP染色 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 20名健康对照的鼻甲干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |