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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11341 | 2025-10-07 |
Ionizing radiation-induced disruption of Rela-Bclaf1-spliceosome regulatory axis in primary spermatocytes causing spermatogenesis dysfunction
2025-Jan-31, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02067-5
PMID:39891142
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研究论文 | 本研究揭示了电离辐射通过破坏Rela-Bclaf1-剪接体调控轴导致初级精母细胞功能障碍的机制 | 首次发现IR通过抑制NF-κB/Rela和Bclaf1活性破坏剪接体通路,并证实NF-κB激动剂可通过上调Bclaf1修复剪接异常 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究电离辐射导致精子发生障碍的分子机制及潜在治疗策略 | Balb/c小鼠睾丸组织及精子发生过程 | 生殖生物学 | 男性不育症 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blotting, RT-qPCR | NA | 基因表达数据,组织学图像 | 小鼠睾丸模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11342 | 2025-10-07 |
Myeloid cell-derived apCAFs promote HNSCC progression by regulating proportion of CD4+ and CD8+ T cells
2025-Jan-31, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03290-1
PMID:39891284
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研究论文 | 本研究揭示了头颈鳞状细胞癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞来源于髓系细胞并通过调节CD4+/CD8+T细胞比例促进肿瘤进展的机制 | 首次发现HNSCC中apCAFs来源于髓系细胞,阐明MIF通过激活JAK/STAT3通路驱动这一转分化过程,并证实apCAFs通过调节CD4+/CD8+T细胞比例促进肿瘤进展 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的来源、机制和功能 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的抗原呈递癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 细胞轨迹分析, Cellchat分析, 谱系追踪实验, TCGA数据库分析, 体内实验 | NA | 单细胞转录组数据, 临床数据库数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11343 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis of clock circadian regulator with prognostic and immune microenvironment in thyroid cancer
2025-Jan-31, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102299
PMID:39892222
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序分析时钟昼夜节律调节因子在甲状腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序系统分析CLOCK在甲状腺癌中的预后价值和免疫微环境调控机制 | NA | 探索CLOCK在甲状腺癌进展和免疫微环境中的作用及潜在机制 | 甲状腺癌组织和正常组织样本 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,LASSO回归,Kaplan-Meier生存分析,KEGG/GO分析,GSEA分析,PPI网络,体内外实验验证 | LASSO回归模型,预后模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
11344 | 2025-10-07 |
Dissecting macrophage heterogeneity and kaempferol in lung adenocarcinoma: a single-cell transcriptomic approach and network pharmacology
2025-Jan-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01832-9
PMID:39884998
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和网络药理学方法,探索肺腺癌中巨噬细胞异质性及黄芪活性成分槲皮素、异鼠李素和山奈酚的免疫调节作用 | 首次结合单细胞RNA测序与网络药理学系统分析肺腺癌肿瘤相关巨噬细胞异质性,并发现山奈酚可抑制M2型巨噬细胞极化 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;机制研究仍需深入 | 解析肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞异质性及中药成分的免疫调节作用 | 肺腺癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、黄芪活性成分 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 伪时间轨迹分析, 免疫荧光染色, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11345 | 2025-10-07 |
Single cell RNA sequencing improves the next generation of approaches to AML treatment: challenges and perspectives
2025-Jan-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01085-w
PMID:39885388
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病治疗中的改进作用、面临的挑战及未来展望 | 系统阐述scRNA-seq在AML分类、风险分层、治疗靶点识别及白血病干细胞鉴定中的创新应用 | 面临高维数据分析、技术噪音、批次效应和小生物模式识别等挑战 | 提升急性髓系白血病的治疗策略和疗效 | 急性髓系白血病患者及白血病干细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 人工智能模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11346 | 2025-10-07 |
Epithelial cell diversity and immune remodeling in bladder cancer progression: insights from single-cell transcriptomics
2025-Jan-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06138-6
PMID:39885578
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示膀胱癌进展过程中上皮细胞多样性和免疫重塑的动态变化 | 首次在单细胞水平系统描绘膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润进展过程中肿瘤微环境的动态变化,发现糖酵解增强、T细胞耗竭和免疫细胞重塑等关键机制 | 样本量相对有限(11个样本),需要更大队列验证发现 | 探究膀胱癌进展过程中肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境的重塑机制 | 膀胱癌患者组织样本(包括NMIBC、MIBC和癌旁正常组织) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 11个膀胱癌样本(4个NMIBC、4个MIBC、3个癌旁正常组织) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11347 | 2025-10-07 |
Sp3 ameliorated experimental autoimmune encephalomyelitis by triggering Socs3 in Th17 cells
2025-Jan-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.051
PMID:39884649
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研究论文 | 本研究揭示了Sp3通过触发Th17细胞中的Socs3改善实验性自身免疫性脑脊髓炎的分子机制 | 首次发现miR-223/Sp3/Socs3/TGF-β信号通路在Th17细胞分化中的调控作用,并揭示了Socs3通过反馈回路调节Sp3表达的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步在人类临床样本中验证 | 探索Sp3对Th17细胞介导的实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型、Th17细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | scRNA-seq, 流式细胞术, ELISA, PCR, 免疫印迹, 免疫荧光, 报告基因技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | Sp3+/+CD4Cre小鼠和Sp3+/-敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11348 | 2025-10-07 |
Inhibition of Retinal Neovascularization by BEZ235: Targeting the Akt/4EBP1/Cyclin D1 Pathway in Endothelial Cells
2025-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.1.66
PMID:39888634
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研究论文 | 本研究探讨BEZ235通过抑制Akt/4EBP1/Cyclin D1通路在视网膜新生血管形成中的治疗作用 | 首次揭示BEZ235通过抑制PI3K/Akt/mTOR通路下调cyclin D1表达,从而抑制内皮细胞周期进程和视网膜新生血管形成 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 研究BEZ235对视网膜新生血管形成的抑制作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、人脐静脉内皮细胞、人视网膜微血管内皮细胞 | 生物医学 | 视网膜新生血管疾病 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光染色、H&E染色、视网膜电图 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、组织形态数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、两种内皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11349 | 2025-10-07 |
Long non-coding RNA H19X as a regulator of mononuclear cell adhesion to the endothelium in systemic sclerosis
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae034
PMID:38305495
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研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA H19X在系统性硬化症血管病变中作为内皮细胞活化调节因子的功能 | 首次揭示H19X通过调控内皮细胞粘附分子表达参与系统性硬化症血管病变的机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 阐明H19X lncRNA在内皮细胞活化过程中的功能作用 | 系统性硬化症患者皮肤活检组织、人真皮微血管内皮细胞、外周血单核细胞 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 荧光染色, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11350 | 2025-10-07 |
Benchmarking bulk and single-cell variant-calling approaches on Chromium scRNA-seq and scATAC-seq libraries
2024-Sep-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277066.122
PMID:39147582
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研究论文 | 评估在10x Genomics单细胞RNA测序和ATAC测序文库上应用不同变异检测方法的性能 | 首次系统比较批量变异检测和单细胞水平变异检测在Chromium平台单细胞测序数据上的表现 | 研究主要针对10x Genomics平台,结果可能不适用于其他单细胞测序技术 | 评估不同变异检测方法在单细胞测序数据中的准确性和可行性 | 单细胞RNA测序和ATAC测序文库 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 全基因组测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序文库 |
11351 | 2025-10-07 |
Developmental regulation of dermal adipose tissue by BCL11b
2024-Sep-19, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351907.124
PMID:39266447
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了BCL11b通过调节Wnt信号微环境调控真皮白色脂肪组织发育的机制 | 首次发现BCL11b在胚胎发育过程中通过调控Wnt信号通路影响真皮脂肪组织的形成 | 研究主要基于小鼠模型,人类代谢疾病的相关性需要进一步验证 | 探究真皮脂肪组织的胚胎发育起源及其调控机制 | 小鼠胚胎发育过程中的脂肪组织 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11352 | 2025-10-07 |
Prostacyclin Mitigates Renal Fibrosis by Activating Fibroblast Prostaglandin I 2 Receptor
2024-02-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000286
PMID:38062563
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研究论文 | 本研究探讨了前列环素通过激活成纤维细胞前列腺素I2受体减轻肾纤维化的作用机制 | 首次揭示了PGI2/PTGIR信号通路在肾纤维化中的保护作用,并证明靶向该通路可成为慢性肾脏病的潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 研究前列环素在肾纤维化和慢性肾脏病进展中的作用机制 | PTGIS和PTGIR基因缺陷小鼠、PGI2类似物、选择性PTGIR激动剂、慢性肾脏病患者的单细胞RNA测序数据 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | 基因缺陷小鼠模型和人类慢性肾脏病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11353 | 2025-10-07 |
Zika virus co-opts microRNA networks to persist in placental niches detected by spatial transcriptomics
2024-02, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2023.08.012
PMID:37598997
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了寨卡病毒通过劫持胎盘microRNA网络在胎盘微环境中持续存在的机制 | 首次发现寨卡病毒通过破坏胎盘microRNA调控网络实现持续感染,并利用空间转录组学技术识别了病毒特异性胎盘生态位 | 样本量相对较小(人类胎盘n=5,小鼠胎盘n=14),且动物模型与人类生理存在差异 | 探究寨卡病毒在胎盘中持续存在而不引起明显组织损伤的机制 | 人类原代滋养层细胞、人类胎盘盘标本、无菌小鼠模型 | 空间转录组学 | 寨卡病毒感染 | 空间转录组学, Argonaute HITS-CLIP, 批量RNA测序, 流式细胞术 | 动物模型 | 空间转录组数据, RNA测序数据 | 5个人类胎盘供体, 3名寨卡病毒阳性受试者, 2名未感染对照, 20只孕鼠产生187个胎儿标本, 14个小鼠胎盘 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术获得9743个空间转录组 |
11354 | 2025-10-07 |
Computational cell-cell interaction technologies drive mechanistic and biomarker discovery in the tumor microenvironment
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103048
PMID:38142648
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究肿瘤微环境中细胞间相互作用的最新进展 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术阐明肿瘤微环境动态,推动关键细胞间相互作用和药物靶点生物标志物的发现 | NA | 促进肿瘤微环境中细胞间相互作用机制研究和生物标志物发现 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用网络 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11355 | 2025-10-07 |
Strategies for dissecting the complexity of neurodevelopmental disorders
2024-02, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.009
PMID:37949722
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综述 | 本文综述了利用模型生物、诱导多能干细胞、单细胞测序技术和大规模平行报告分析等策略解析神经发育障碍复杂性的方法 | 重点介绍了基于单细胞CRISPR筛选技术,能够以高效率、准确性和高通量方式研究细胞转录组 | NA | 解析神经发育障碍的复杂性并探索疾病因果关系和潜在机制 | 神经发育障碍 | 生物医学研究 | 神经发育障碍 | 高通量测序, 单细胞测序, CRISPR筛选, 大规模平行报告分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11356 | 2025-10-07 |
Astrocyte ensheathment of calyx-forming axons of the auditory brainstem precedes accelerated expression of myelin genes and myelination by oligodendrocytes
2024-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25552
PMID:37916792
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研究论文 | 本研究揭示了听觉脑干中星形胶质细胞在少突胶质细胞髓鞘形成前包裹轴突的新机制 | 首次证明小鼠MNTB中星形胶质细胞在少突胶质细胞包裹和髓鞘压实前广泛包裹生长的CH终末轴突 | 研究局限于小鼠早期 postnatal 发育阶段,需要进一步验证在其他物种或发育阶段的普适性 | 探究听觉脑干早期发育阶段神经元与胶质细胞相互作用的分子机制和时序特征 | 小鼠 medial nucleus of the trapezoid body (MNTB) 组织 | 神经科学 | NA | 微阵列基因表达分析, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 电子显微镜3D成像 | NA | 基因表达数据, 电子显微镜图像 | postnatal day P0-P14 发育时间序列的小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
11357 | 2025-10-07 |
Multi-omic analysis of human kidney tissue identified medulla-specific gene expression patterns
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.10.024
PMID:37995909
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研究论文 | 通过多组学分析揭示成人肾脏髓质特异性基因表达模式 | 首次系统描述成人肾脏髓质的基线基因表达和表观基因组特征,并整合染色质可及性、构象与空间转录组数据 | 样本量较小(仅5例男性患者),仅使用肿瘤旁正常组织 | 解析肾脏髓质发育和功能的分子机制 | 成人肾脏皮质和髓质组织 | 基因组学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 5例男性患者的肾切除标本 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组 | NA | NA |
11358 | 2025-10-07 |
Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis
2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320030
PMID:38152886
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研究论文 | 通过整合多个单细胞转录组数据集,定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化 | 开发了基于报告基因表达的细胞类型分类算法,首次系统验证了平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的罕见性 | 受限于现有研究数据的实验条件,转分化现象的检测可能存在灵敏度限制 | 解决血管疾病单细胞RNA测序研究中存在的争议性发现,深入理解驻留血管细胞在解剖和疾病中的作用 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | 细胞分类算法 | 单细胞转录组数据 | 多个已发表数据集的整合分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11359 | 2025-10-07 |
Single-cell resolution of human airway epithelial cells exposed to bronchiolitis obliterans-associated chemicals
2024-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00304.2023
PMID:38084407
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析暴露于闭塞性细支气管炎相关化学物质的人气道上皮细胞的转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示不同BO相关化学物质暴露引起的气道上皮细胞表型变化和功能通路差异 | 研究仅限于体外细胞模型,未涉及动物模型或临床样本验证 | 阐明闭塞性细支气管炎相关化学物质暴露诱导疾病发生的分子机制 | 原代人气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 75,663个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11360 | 2025-10-07 |
Distribution of P2Y and P2X purinergic receptor expression within the intestine
2024-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00108.2023
PMID:37987757
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肠道上皮细胞中P2Y和P2X嘌呤能受体的分布模式 | 首次系统性地描述了胃肠道上皮细胞中嘌呤能受体的表达谱,并发现人肠道类器官是研究肠道嘌呤能信号传导的优选模型 | 研究主要基于mRNA表达水平,蛋白质表达和功能验证需要进一步研究 | 探究嘌呤能受体在肠道上皮细胞中的表达分布和功能 | 人类小肠和大肠组织、人肠道类器官、T84、Caco2和HT29肠道上皮细胞系 | 单细胞生物学 | 肠道炎性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肠道组织单细胞测序数据、三种肠道上皮细胞系和人肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |