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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11321 - 11340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11321 | 2025-10-07 |
Spatial integration of multi-omics single-cell data with SIMO
2025-Feb-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56523-4
PMID:39893194
|
研究论文 | 开发了一种名为SIMO的计算方法，用于通过概率对齐实现多组学数据集的空间整合 | 不仅整合空间转录组学与单细胞RNA-seq，还能整合染色质可及性和DNA甲基化等多种单细胞模态数据，这是之前未在空间尺度上共同分析过的 | NA | 解决空间和单细胞组学测序中的技术限制，在空间尺度上捕获和描述多模态信息 | 多组学单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，染色质可及性分析，DNA甲基化分析 | 概率对齐模型 | 多组学单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 11322 | 2025-10-07 |
Oocyte transcriptomes and follicular fluid proteomics of ovine atretic follicles reveal the underlying mechanisms of oocyte degeneration
2025-Feb-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11291-9
PMID:39893388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析揭示了绵羊闭锁卵泡中卵母细胞退化的分子机制 | 首次系统揭示了卵母细胞铁死亡在卵泡闭锁中的作用机制，并鉴定了与卵泡闭锁相关的关键生物标志物 | 研究仅针对绵羊模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究卵泡闭锁过程中卵母细胞退化的分子机制 | 绵羊闭锁卵泡中的卵母细胞和卵泡液 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,串联质谱标签蛋白质组学 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据 | 不同发育阶段的卵泡样本 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 11323 | 2025-10-07 |
MetaQ: fast, scalable and accurate metacell inference via single-cell quantization
2025-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56424-6
PMID:39885131
|
研究论文 | 提出MetaQ算法，通过单细胞量化实现快速、可扩展且准确的元细胞推断 | 将元细胞概念化为生物学相似细胞的集体祖先，通过离散码本量化细胞，将计算复杂度从指数级降低到线性级 | NA | 克服大规模单细胞测序数据分析的计算障碍 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 量化算法 | 单细胞测序数据 | 数百万细胞规模的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11324 | 2025-10-07 |
Role of hepatocyte RIPK1 in maintaining liver homeostasis during metabolic challenges
2025-Jan-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96798
PMID:39886919
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞中RIPK1在代谢挑战期间维持肝脏稳态的关键作用 | 首次发现肝细胞特异性RIPK1缺失会增强短期禁食诱导的肝损伤和炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 探究RIPK1在代谢应激下维持肝脏稳态的分子机制 | 肝细胞特异性RIPK1缺陷小鼠（雄性和雌性） | 分子生物学 | 肝病 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 肝细胞特异性RIPK1缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11325 | 2025-10-07 |
Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease
2025-Jan-31, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04700-3
PMID:39890696
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法探索帕金森病的新型药物靶点 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法结合，系统分析细胞毒性CD4+T细胞在帕金森病中的作用并鉴定新的药物靶点 | 研究结果需要进一步的功能验证和临床试验确认 | 探索帕金森病的致病机制和潜在药物靶点 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 伪时间序列分析, 细胞间通讯分析, 代谢通路分析, GO和KEGG富集分析 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位分析 | 单细胞RNA测序数据, 全基因组关联研究数据, 批量转录组测序数据 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 11326 | 2025-10-07 |
Assessment of XCI skewing and demonstration of XCI escape region based on single-cell RNA sequencing: comparison between female Grave's disease and control
2025-Jan-31, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-025-00533-z
PMID:39891056
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序评估X染色体失活偏斜并鉴定XCI逃逸区域，比较女性Graves病与对照组的差异 | 首次在单细胞水平比较自身免疫性疾病（Graves病）与正常女性的X染色体失活偏斜模式和逃逸基因 | 样本量较小（仅1例患者和1例对照），需要更大规模研究验证 | 探究X染色体失活偏斜和逃逸在自身免疫性疾病性别差异中的作用机制 | 女性Graves病患者和正常女性对照 | 单细胞基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2例（1例Graves病患者，1例正常对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11327 | 2025-10-07 |
Flexible analysis of spatial transcriptomics data (FAST): a deconvolution approach
2025-Jan-31, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06054-y
PMID:39891065
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研究论文 | 提出了一种基于正则化非负矩阵分解的空间转录组学去卷积方法FAST | 开发了无需参考数据的灵活去卷积方法，能够整合基因表达数据、空间信息和组织学信息 | NA | 开发高分辨率空间转录组学数据的去卷积分析方法 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 正则化非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据、空间数据、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11328 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis reveals that neutrophil extracellular traps related gene TIMP1 promotes CRC progression and influences ferroptosis
2025-Jan-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03643-y
PMID:39891145
|
研究论文 | 通过多组学分析发现中性粒细胞胞外诱捕网相关基因TIMP1促进结直肠癌进展并影响铁死亡 | 首次将中性粒细胞胞外诱捕网相关基因TIMP1与结直肠癌进展及铁死亡联系起来，并通过机器学习筛选出关键基因 | 未明确说明样本量大小，研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证 | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌中的新标志物以辅助治疗 | 结直肠癌细胞和中性粒细胞胞外诱捕网相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA转录组测序，单细胞转录组分析，机器学习，Western blot，Transwell，细胞划痕实验，细胞克隆形成实验 | 机器学习模型 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11329 | 2025-10-07 |
Exploratory analysis of a Novel RACK1 mutation and its potential role in epileptic seizures via Microglia activation
2025-Jan-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03350-5
PMID:39891152
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序和全外显子测序技术，发现RACK1基因新突变RACK1-p.L206P通过激活小胶质细胞影响神经元兴奋性，导致癫痫发作 | 首次发现RACK1-p.L206P突变通过增强小胶质细胞功能影响神经元兴奋性和突触功能，揭示了癫痫发病的新分子机制 | NA | 探索RACK1基因突变在癫痫发病机制中的作用 | 人类小胶质细胞、小鼠模型、海马神经元 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq)、全外显子测序(WES)、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因测序数据、电生理数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 11330 | 2025-10-07 |
Ionizing radiation-induced disruption of Rela-Bclaf1-spliceosome regulatory axis in primary spermatocytes causing spermatogenesis dysfunction
2025-Jan-31, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02067-5
PMID:39891142
|
研究论文 | 本研究揭示了电离辐射通过破坏Rela-Bclaf1-剪接体调控轴导致初级精母细胞功能障碍的机制 | 首次发现IR通过抑制NF-κB/Rela和Bclaf1活性破坏剪接体通路，并证实NF-κB激动剂可通过上调Bclaf1修复剪接异常 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究电离辐射导致精子发生障碍的分子机制及潜在治疗策略 | Balb/c小鼠睾丸组织及精子发生过程 | 生殖生物学 | 男性不育症 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blotting, RT-qPCR | NA | 基因表达数据，组织学图像 | 小鼠睾丸模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11331 | 2025-10-07 |
Myeloid cell-derived apCAFs promote HNSCC progression by regulating proportion of CD4+ and CD8+ T cells
2025-Jan-31, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03290-1
PMID:39891284
|
研究论文 | 本研究揭示了头颈鳞状细胞癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞来源于髓系细胞并通过调节CD4+/CD8+T细胞比例促进肿瘤进展的机制 | 首次发现HNSCC中apCAFs来源于髓系细胞，阐明MIF通过激活JAK/STAT3通路驱动这一转分化过程，并证实apCAFs通过调节CD4+/CD8+T细胞比例促进肿瘤进展 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的来源、机制和功能 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的抗原呈递癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 细胞轨迹分析, Cellchat分析, 谱系追踪实验, TCGA数据库分析, 体内实验 | NA | 单细胞转录组数据, 临床数据库数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11332 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis of clock circadian regulator with prognostic and immune microenvironment in thyroid cancer
2025-Jan-31, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102299
PMID:39892222
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序分析时钟昼夜节律调节因子在甲状腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序系统分析CLOCK在甲状腺癌中的预后价值和免疫微环境调控机制 | NA | 探索CLOCK在甲状腺癌进展和免疫微环境中的作用及潜在机制 | 甲状腺癌组织和正常组织样本 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,LASSO回归,Kaplan-Meier生存分析,KEGG/GO分析,GSEA分析,PPI网络,体内外实验验证 | LASSO回归模型,预后模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11333 | 2025-10-07 |
Dissecting macrophage heterogeneity and kaempferol in lung adenocarcinoma: a single-cell transcriptomic approach and network pharmacology
2025-Jan-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01832-9
PMID:39884998
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和网络药理学方法，探索肺腺癌中巨噬细胞异质性及黄芪活性成分槲皮素、异鼠李素和山奈酚的免疫调节作用 | 首次结合单细胞RNA测序与网络药理学系统分析肺腺癌肿瘤相关巨噬细胞异质性，并发现山奈酚可抑制M2型巨噬细胞极化 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究仍需深入 | 解析肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞异质性及中药成分的免疫调节作用 | 肺腺癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、黄芪活性成分 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 伪时间轨迹分析, 免疫荧光染色, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11334 | 2025-10-07 |
Single cell RNA sequencing improves the next generation of approaches to AML treatment: challenges and perspectives
2025-Jan-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01085-w
PMID:39885388
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病治疗中的改进作用、面临的挑战及未来展望 | 系统阐述scRNA-seq在AML分类、风险分层、治疗靶点识别及白血病干细胞鉴定中的创新应用 | 面临高维数据分析、技术噪音、批次效应和小生物模式识别等挑战 | 提升急性髓系白血病的治疗策略和疗效 | 急性髓系白血病患者及白血病干细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 人工智能模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11335 | 2025-10-07 |
Epithelial cell diversity and immune remodeling in bladder cancer progression: insights from single-cell transcriptomics
2025-Jan-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06138-6
PMID:39885578
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示膀胱癌进展过程中上皮细胞多样性和免疫重塑的动态变化 | 首次在单细胞水平系统描绘膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润进展过程中肿瘤微环境的动态变化，发现糖酵解增强、T细胞耗竭和免疫细胞重塑等关键机制 | 样本量相对有限（11个样本），需要更大队列验证发现 | 探究膀胱癌进展过程中肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境的重塑机制 | 膀胱癌患者组织样本（包括NMIBC、MIBC和癌旁正常组织） | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 11个膀胱癌样本（4个NMIBC、4个MIBC、3个癌旁正常组织） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11336 | 2025-10-07 |
Sp3 ameliorated experimental autoimmune encephalomyelitis by triggering Socs3 in Th17 cells
2025-Jan-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.051
PMID:39884649
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研究论文 | 本研究揭示了Sp3通过触发Th17细胞中的Socs3改善实验性自身免疫性脑脊髓炎的分子机制 | 首次发现miR-223/Sp3/Socs3/TGF-β信号通路在Th17细胞分化中的调控作用，并揭示了Socs3通过反馈回路调节Sp3表达的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步在人类临床样本中验证 | 探索Sp3对Th17细胞介导的实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型、Th17细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | scRNA-seq, 流式细胞术, ELISA, PCR, 免疫印迹, 免疫荧光, 报告基因技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | Sp3+/+CD4Cre小鼠和Sp3+/-敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11337 | 2025-10-07 |
Inhibition of Retinal Neovascularization by BEZ235: Targeting the Akt/4EBP1/Cyclin D1 Pathway in Endothelial Cells
2025-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.1.66
PMID:39888634
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研究论文 | 本研究探讨BEZ235通过抑制Akt/4EBP1/Cyclin D1通路在视网膜新生血管形成中的治疗作用 | 首次揭示BEZ235通过抑制PI3K/Akt/mTOR通路下调cyclin D1表达，从而抑制内皮细胞周期进程和视网膜新生血管形成 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未进行临床试验验证 | 研究BEZ235对视网膜新生血管形成的抑制作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、人脐静脉内皮细胞、人视网膜微血管内皮细胞 | 生物医学 | 视网膜新生血管疾病 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光染色、H&E染色、视网膜电图 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、组织形态数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、两种内皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11338 | 2025-10-07 |
Long non-coding RNA H19X as a regulator of mononuclear cell adhesion to the endothelium in systemic sclerosis
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae034
PMID:38305495
|
研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA H19X在系统性硬化症血管病变中作为内皮细胞活化调节因子的功能 | 首次揭示H19X通过调控内皮细胞粘附分子表达参与系统性硬化症血管病变的机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 阐明H19X lncRNA在内皮细胞活化过程中的功能作用 | 系统性硬化症患者皮肤活检组织、人真皮微血管内皮细胞、外周血单核细胞 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 荧光染色, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11339 | 2025-10-07 |
Benchmarking bulk and single-cell variant-calling approaches on Chromium scRNA-seq and scATAC-seq libraries
2024-Sep-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277066.122
PMID:39147582
|
研究论文 | 评估在10x Genomics单细胞RNA测序和ATAC测序文库上应用不同变异检测方法的性能 | 首次系统比较批量变异检测和单细胞水平变异检测在Chromium平台单细胞测序数据上的表现 | 研究主要针对10x Genomics平台，结果可能不适用于其他单细胞测序技术 | 评估不同变异检测方法在单细胞测序数据中的准确性和可行性 | 单细胞RNA测序和ATAC测序文库 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 全基因组测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序文库 |
| 11340 | 2025-10-07 |
Developmental regulation of dermal adipose tissue by BCL11b
2024-Sep-19, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351907.124
PMID:39266447
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了BCL11b通过调节Wnt信号微环境调控真皮白色脂肪组织发育的机制 | 首次发现BCL11b在胚胎发育过程中通过调控Wnt信号通路影响真皮脂肪组织的形成 | 研究主要基于小鼠模型，人类代谢疾病的相关性需要进一步验证 | 探究真皮脂肪组织的胚胎发育起源及其调控机制 | 小鼠胚胎发育过程中的脂肪组织 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |