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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11261 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a novel signature based on macrophage marker genes for predicting prognosis and drug response in kidney renal clear cell carcinoma by integrated analysis of single cell and bulk RNA sequencing
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205671
PMID:38517387
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研究论文 | 本研究首次基于巨噬细胞标记基因开发并验证了一个预测肾透明细胞癌患者整体生存率的模型 | 通过分析单细胞和整体RNA测序数据,识别并验证了244个巨噬细胞标记基因并建立了五基因预后签名 | 本文未提供巨噬细胞标记基因的临床相关性的详细信息 | 旨在探索巨噬细胞标记基因在肾透明细胞癌中的预后和药物反应预测能力 | 主要针对肾透明细胞癌(KIRC)患者进行研究 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因组数据 | NA |
11262 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of disulfidptosis and a prognostic signature in BLCA
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205686
PMID:38507521
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研究论文 | 本文研究了与膀胱癌(BLCA)相关的二巯基凋亡特征及其预后标志。 | 本文首次构建了与二巯基凋亡相关的风险评分标志,并验证其在膀胱癌预后中的有效性。 | 本文限于具体的样本类型和数量,可能影响结果的普遍性。 | 探究二巯基凋亡在膀胱癌中的生物机制及其预后意义。 | 研究对象为膀胱癌患者中的二巯基凋亡相关基因及其表达模式。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和常规RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究中分析了膀胱癌组织及相邻正常组织样本中的十个核心二巯基凋亡相关基因 |
11263 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-seq identifies a FOS/JUN-related monocyte signature associated with clinical response of heart failure patients with mesenchymal stem cell therapy
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205670
PMID:38517374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别与心力衰竭患者干细胞治疗临床反应相关的FOS/JUN相关单核细胞特征。 | 首次发现与MSC治疗反应相关的CD14单核细胞亚群,并构建了基于单核细胞的预测模型。 | 样本量较小,仅涉及4名心力衰竭患者,可能影响研究结果的广泛适用性。 | 研究MSC治疗对心力衰竭患者的影响及相关生物标志物。 | 4名心力衰竭患者在MSC治疗前后的单核细胞样本。 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 生物样本数据 | 4名心力衰竭患者 |
11264 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell sequencing, spatial transcriptome sequencing and bulk RNA sequencing highlights the molecular characteristics of parthanatos in gastric cancer
2024-03-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205658
PMID:38499384
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研究论文 | 本研究首次揭示了胃癌中parthanatos的单细胞和空间转录组学的分子特征 | 提出新的基于parthanatos信号的模型,用于区分个体异质性和预测胃癌患者的临床结果 | 研究中可能存在的特定肿瘤微环境复杂性和样本数量的限制未被详细讨论 | 探讨parthanatos在胃癌中的分子特征及其在临床结果中的应用 | 胃癌患者的肿瘤细胞及其微环境中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、空间转录组测序和大宗RNA测序 | NA | 组学数据 | NA |
11265 | 2024-08-04 |
Comprehensive assessment of regulatory T-cells-related scoring system for predicting the prognosis, immune microenvironment and therapeutic response in hepatocellular carcinoma
2024-03-08, Aging
DOI:10.18632/aging.205649
PMID:38461439
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研究论文 | 本文探讨了一种新的Tregs相关评分系统来预测肝细胞癌的肿瘤免疫微环境、临床结果和个体化治疗 | 构建了一种新的Tregs相关生物标志物,具有良好的预后预测效能和稳定性 | 可能在样本选择和数据一致性上存在局限性,未来需要更多的研究来验证 | 研究肝细胞癌的预后和免疫微环境 | 肝细胞癌患者的Tregs及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox回归和LASSO回归 | 基因组数据 | 三组独立队列的数据 |
11266 | 2024-08-05 |
Investigating the mechanisms of drug resistance and prognosis in ovarian cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2024-03-08, Aging
DOI:10.18632/aging.205628
PMID:38461424
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研究论文 | 本文研究了卵巢癌中药物耐受性及预后的机制 | 揭示了不同表皮细胞亚群与卵巢癌预后的相关基因,特别是EPCs耐药性与氧化磷酸化通路之间的强关联 | 本文未详细探讨其他影响卵巢癌预后的因素 | 研究卵巢癌中药物耐受性与预后的机制 | 核心肿瘤细胞及其不同表皮细胞亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | NA | NA |
11267 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA combined with bulk RNA analysis to explore oxidative stress and energy metabolism factors and found a new prostate cancer oncogene MXRA8
2024-03-04, Aging
DOI:10.18632/aging.205599
PMID:38441550
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研究论文 | 本文探讨了氧化应激和能量代谢因素,并发现了一种新的前列腺癌致癌基因MXRA8 | 本研究首次整合单细胞RNA测序和总体RNA测序数据,识别了前列腺癌的分子亚型,并构建了风险评分模型 | 研究可能受到样本数量和异质性的限制,影响结果的普适性 | 旨在通过分析氧化应激和能量代谢相关基因,提升前列腺癌的预后评估和个性化治疗 | 前列腺癌患者及其组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序和总体RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA |
11268 | 2024-08-05 |
Unlocking the potential of senescence-related gene signature as a diagnostic and prognostic biomarker in sepsis: insights from meta-analyses, single-cell RNA sequencing, and in vitro experiments
2024-02-26, Aging
DOI:10.18632/aging.205574
PMID:38412321
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研究论文 | 该研究开发了一个与衰老相关的基因特征,以作为脓毒症的诊断和预后生物标志物 | 研究揭示了衰老相关基因在脓毒症中的诊断和预后价值,并提供了新的生物标志物候选 | 研究中样本来自单一基因表达数据库,可能影响结果的普适性 | 探讨衰老相关基因特征作为脓毒症的生物标志物的潜力 | 研究对象包括脓毒症样本和健康对照样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 42个对照样本和760个脓毒症样本 |
11269 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA-seq reveals transcriptomic modulation of Alzheimer's disease by activated protein C
2024-02-21, Aging
DOI:10.18632/aging.205624
PMID:38385967
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研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了激活蛋白C对阿尔茨海默病的转录组调节 | 研究发现激活蛋白C能够通过下调炎症过程和恢复神经系统功能来改善阿尔茨海默病模型的小鼠的认知功能 | 未提及研究的局限性 | 探讨激活蛋白C在阿尔茨海默病进展中的潜在影响 | 使用5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型与野生型小鼠进行比较研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用5xFAD小鼠和野生型小鼠进行比较 |
11270 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies senescence-associated secretory phenotype (SASP) features of testicular aging in human
2024-02-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205538
PMID:38349859
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类睾丸老化的细胞衰老相关分泌表型特征 | 首次使用单细胞RNA测序分析睾丸老化的细胞间通讯网络,并识别了衰老睾丸中主要表达于莱迪格细胞的SASP相关基因 | 尚无法提前预测睾丸老化的发生 | 探讨睾丸老化的分子机制及其细胞衰老相关分泌表型特征 | 主要研究对象为不同年龄组的人类睾丸样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的数据,涉及年轻组与老年组的样本 |
11271 | 2024-08-04 |
Machine learning constructs a T cell-related signature for predicting prognosis and drug sensitivity in ovarian cancer
2024-02-09, Aging
DOI:10.18632/aging.205536
PMID:38345575
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研究论文 | 本文构建了一个T细胞相关的预后标志以预测卵巢癌的预后和药物敏感性 | 使用10种不同的机器学习算法构建了TRS预测卵巢癌患者的临床结果和免疫治疗反应 | 本文的限制未详细说明 | 研究卵巢癌中T细胞相关标志物与预后及药物敏感性之间的关系 | 卵巢癌患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 多个数据集,包括TCGA和其他GSE数据集 |
11272 | 2024-08-05 |
Anoikis-related gene signature is associated with immune infiltration and predicts the prognosis of non-small cell lung cancer
2024-02-07, Aging
DOI:10.18632/aging.205522
PMID:38329444
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研究论文 | 本文探讨了与anoikis相关的基因签名与非小细胞肺癌的免疫浸润相关,并预测其预后 | 提出了一个基于与anoikis相关的基因的预后模型,并分析了其与免疫特征的相关性 | 未详细讨论其他可能影响免疫浸润的因素 | 探讨anoikis在非小细胞肺癌患者中的预后价值和治疗指导 | 研究对象为非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了来自RNA测序的数据集,样本量未具体说明 |
11273 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data revealed disulfidptosis genes-based molecular subtypes and a prognostic signature in lung adenocarcinoma
2024-02-05, Aging
DOI:10.18632/aging.205509
PMID:38319721
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研究论文 | 本文进行了一项单细胞和bulk RNA测序数据的综合分析,揭示了基于二硫化物凋亡基因的分子亚型和预后特征 | 本文首次提出并验证了基于二硫化物凋亡基因的预后风险模型DRG评分,推动了肺腺癌的免疫治疗和化疗研究 | 研究中可能存在样本量限制和数据来源的偏倚 | 探索二硫化物凋亡基因在肺腺癌中的作用及其预后价值 | 本研究主要针对肺腺癌患者样本,通过单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归和LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA样本和GSE131907数据集中的单细胞样本 |
11274 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of LAG3 immune signature and identification of a LAG3-related genes prognostic signature in kidney renal clear cell carcinoma
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205476
PMID:38277212
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研究论文 | 本研究分析了LAG3在肾透明细胞癌中的免疫特征及其预后相关基因标志。 | 揭示了LAG3在KIRC中的表达模式及其与预后和免疫相关组分的关系 | 未提及其他相关替代疗法的比较分析 | 探讨LAG3在肾透明细胞癌(KIRC)中的功能及其作为预后生物标志的潜力 | 主要研究KIRC患者的LAG3表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序及单细胞测序 | NA | RNA-seq | 利用TCGA_KIRC数据集,样本量未具体说明 |
11275 | 2024-08-05 |
FABP6 serves as a new therapeutic target in esophageal tumor
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205448
PMID:38277205
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研究论文 | 本研究探讨FABP6在食道肿瘤中的作用,作为新的治疗靶点 | 揭示FABP6在食道肿瘤中的高表达及其潜在的代谢和肿瘤生长相关性 | 未详细探讨FABP6作为治疗靶点的具体机制和临床应用 | 改善食道癌患者的生存率,寻找新的诊断和治疗靶点 | 食道肿瘤微环境中细胞组成及其异质性 | 数字病理学 | 食道癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 使用了初级食道肿瘤的多个细胞群 |
11276 | 2024-08-05 |
Identification of molecular characteristics of FUT8 and alteration of core fucosylation in kidney renal clear cell cancer
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205482
PMID:38277230
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研究论文 | 本文研究了KIRC中FUT8的分子特征和核心富糖基化的变化 | 首次识别出KIRC中的两种与核心富糖基化相关的亚型,并探讨了其预后差异 | 研究中没有提及样本量和潜在的临床应用 | 探讨核心富糖基化在肾透明细胞癌中的作用及FUT8的分子特征 | 集中于肾透明细胞癌(KIRC)及其核心富糖基化相关基因 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
11277 | 2024-08-04 |
The integration of multi-omics analysis and machine learning for the identification of prognostic assessment and immunotherapy efficacy through aging-associated genes in lung cancer
2024-01-22, Aging
DOI:10.18632/aging.205464
PMID:38261733
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研究论文 | 本研究整合了多组学分析和机器学习,评估与衰老相关基因在肺癌中的预后评估和免疫疗法有效性 | 首次结合多组学分析和机器学习来构建预后模型,特别关注与衰老相关的基因 | 尚未明确关键分子在肺癌发病和进展中的确切作用 | 评估肺癌患者的预后和免疫疗法有效性 | 涉及与免疫相关的关键基因及其在肺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, WGCNA, Lasso-Cox方法, ssGSEA | NA | 基因数据 | NA |
11278 | 2024-08-05 |
Malignant cell receptor-ligand subtypes guide the prediction of prognosis and personalized immunotherapy of liver cancer
2024-01-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205453
PMID:38244584
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA分析识别肝癌患者的恶性细胞受体-配体亚型 | 通过恶性细胞受体-配体基因识别亚群,提供个性化免疫治疗的新见解 | 未详细说明样本来源和具体的临床应用数据 | 识别基于恶性细胞受体-配体基因的肝癌亚群以发展个性化免疫治疗 | 肝癌患者的恶性细胞及其相关的受体-配体基因 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 16个基因表达水平 |
11279 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the substantia nigra reveals microglial activation in a model of MPTP
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1390310
PMID:38952478
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研究论文 | 这项工作揭示了MPTP小鼠黑质中小胶质细胞的功能变化、信号通路和关键基因 | 首次在MPTP模型中详细分析了小胶质细胞的激活状态及其功能变化 | 研究可能仅限于特定的细胞类型和小鼠模型,结果可能无法完全外推至其他类型的帕金森病 | 探索MPTP对帕金森病相关细胞和基因的影响 | 使用单细胞RNA测序分析MPTP小鼠的黑质 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MPTP小鼠的单细胞样本 |
11280 | 2024-08-04 |
Combined analysis of single-cell sequencing and bulk transcriptome sequencing reveals new mechanisms for non-healing diabetic foot ulcers
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306248
PMID:38950058
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序和大规模转录组测序,揭示了非愈合糖尿病足溃疡的新的机制 | 揭示了愈合与非愈合糖尿病足溃疡之间的细胞组成和基因表达的差异,特别是不同成纤维细胞亚群的独特生物学功能 | 研究依赖于已有的公共转录组测序数据,可能存在数据的局限性和偏倚 | 深入了解非愈合糖尿病足溃疡与愈合糖尿病足溃疡之间的生物学差异 | 研究对象为非愈合和愈合的糖尿病足溃疡患者的细胞成分与基因表达 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |