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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11261 | 2025-10-07 |
Preoperative electroacupuncture versus sham electroacupuncture for the treatment of postoperative ileus after laparoscopic surgery for colorectal cancer in China: a study protocol for a multicentre, randomised, sham-controlled trial
2024-07-05, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2023-083460
PMID:38969370
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研究论文 | 评估术前电针与假电针对结直肠癌腹腔镜手术后肠梗阻恢复效果的多中心随机对照试验 | 首次采用多中心随机假对照试验设计评估术前电针对POI的预防作用,并结合单细胞RNA测序进行机制研究 | 样本量相对较小(80例),仅在中国进行,结果可能受文化背景和医疗实践差异影响 | 评估术前电针对结直肠癌腹腔镜手术后肠梗阻的预防和恢复效果 | 接受结直肠癌腹腔镜手术的患者 | 临床医学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 随机对照试验 | 临床数据,生物样本 | 80例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11262 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics: background, technologies, applications, and challenges
2024-Apr-30, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09553-y
PMID:38689046
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综述 | 本文综述单细胞转录组学技术的发展背景、技术平台、应用场景及当前面临的挑战 | 系统整合单细胞转录组学最新技术进展,涵盖空间转录组学和多组学技术的衔接点 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 总结单细胞转录组学技术发展现状与未来方向 | 单细胞测序技术及其生物信息学方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
11263 | 2025-10-07 |
Maternal factor Trim75 contributes to zygotic genome activation program in mouse early embryos
2024-Apr-20, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09349-0
PMID:38643284
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据发现母源因子Trim75在小鼠早期胚胎合子基因组激活中的潜在作用 | 首次通过RNA速率分析识别Trim75作为次要ZGA的潜在驱动因子,并揭示其可能通过招募EP300和建立H3K27ac修饰促进胚胎发育 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据,需要进一步实验验证 | 探索母源因子在哺乳动物合子基因组激活中的作用机制 | 小鼠早期胚胎和胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA速率分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11264 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals the transcriptional alterations in the submandibular glands of aged mice
2024-03, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2023.12.002
PMID:38142941
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析老年小鼠颌下腺的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示老年小鼠颌下腺不同细胞类型的基因表达变化,特别是细胞衰老标志物和MHC I类分子的表达变化 | 研究仅针对小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明 | 阐明衰老相关唾液腺变化的分子机制 | 成年和老年小鼠的颌下腺组织 | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年和老年小鼠颌下腺(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11265 | 2025-10-07 |
COL6A3 enhances the osteogenic differentiation potential of BMSCs by promoting mitophagy in the osteoporotic microenvironment
2024-Jan-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-08918-z
PMID:38270688
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研究论文 | 本研究探讨COL6A3基因通过促进线粒体自噬增强骨髓间充质干细胞在骨质疏松微环境中的成骨分化能力 | 首次发现COL6A3基因可通过促进线粒体自噬改善骨质疏松微环境中BMSCs的成骨分化能力 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索COL6A3基因在骨质疏松微环境中对BMSCs成骨分化的调控机制 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 细胞生物学 | 骨质疏松症 | 慢病毒转染, Western blot, 免疫荧光, TUNEL检测, JC-1染色 | NA | 蛋白质表达数据, 细胞成像数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11266 | 2025-10-07 |
Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2023-02-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过靶向Epsins蛋白调控成纤维细胞生长因子信号通路,抑制内皮-间质转化过程从而治疗动脉粥样硬化 | 首次揭示Epsins通过调控FGFR1内化和降解促进TGF-β信号通路的新机制,并开发了靶向治疗肽 | 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验验证 | 探究Epsins在动脉粥样硬化中促进内皮-间质转化的分子机制并评估治疗策略 | Apoe-/-基因敲除小鼠和谱系示踪/PCSK9突变病毒诱导的动脉粥样硬化小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,分子、细胞和生化分析,谱系示踪技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11267 | 2025-10-07 |
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
PMID:36239989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间建立免疫抑制空间网络的机制 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞在肝转移微环境中形成互补的配体-受体对,并通过空间邻近建立免疫抑制网络 | 研究主要针对微卫星稳定型结直肠癌肝转移,样本来源和数量可能有限 | 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞变化特征 | 结直肠癌肝转移组织、正常肝组织和外周血单核细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重空间成像, 细胞反卷积 | NA | 基因表达数据, 空间成像数据 | 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及其配对组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11268 | 2025-02-05 |
Hepatic HSD17B6 is dispensable for diet-induced fatty liver disease in mice
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101924
PMID:39896111
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研究论文 | 本研究探讨了HSD17B6在饮食诱导的脂肪肝疾病中的作用 | 首次揭示了HSD17B6在肝脏中的表达与脂肪肝疾病的相关性,并发现其肝脏特异性缺失不影响脂肪肝疾病的发展 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究HSD17B6在饮食诱导的脂肪肝疾病中的作用 | 小鼠模型 | 代谢疾病研究 | 脂肪肝疾病 | 单细胞RNA测序, AAV8介导的基因编辑 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
11269 | 2025-02-05 |
Single-cell RNA sequencing provides new insights into the interaction between astrocytes and neurons after spinal cord injury in mice
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101917
PMID:39896108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了小鼠脊髓损伤后不同阶段及正常组织中星形胶质细胞和神经元亚型的动态变化及其功能,揭示了特定星形胶质细胞亚型在脊髓损伤过程中可能向神经元转化的机制 | 发现了一种特定亚型的星形胶质细胞,其具有独特的基因表达特征,并在脊髓损伤过程中可能转化为神经元,同时揭示了糖酵解途径在这一细胞转化过程中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨脊髓损伤后星形胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在疾病进展中的机制 | 小鼠脊髓损伤模型中的星形胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 小鼠脊髓损伤模型及正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
11270 | 2025-02-05 |
Single-cell transcriptome atlas of male mouse pituitary across postnatal life highlighting its stem cell landscape
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111708
PMID:39898054
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研究论文 | 本文构建了雄性小鼠内分泌垂体的单细胞转录组图谱,涵盖了健康与损伤状态下的重要出生后年龄段,重点研究了垂体干细胞及其复杂身份和微环境 | 通过单细胞转录组技术揭示了垂体干细胞的标记物和调控因子,并利用垂体干细胞类器官功能验证了转录组发现,特别是KLF5、AP-1复合物和EGF通路在垂体干细胞调控中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,尽管部分发现可转化至人类,但仍需进一步验证 | 揭示垂体干细胞的生物学特性及其在衰老过程中的变化 | 雄性小鼠的垂体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖健康与损伤状态下的雄性小鼠垂体样本 | NA | NA | NA | NA |
11271 | 2025-02-05 |
Molecular characterization of ovarian mesonephric-like adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing and mitochondrial metabolism
2025-Feb, Gynecologic oncology reports
IF:1.2Q3
DOI:10.1016/j.gore.2024.101670
PMID:39895896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对卵巢中肾样腺癌(MLA)进行了分子特征分析,并与高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)进行了比较 | 首次使用单细胞RNA测序技术对卵巢MLA进行分子特征分析,揭示了其与HGSOC的差异,并提出了针对MAP激酶和PI3K/AKT/mTOR通路的联合治疗策略 | 需要在更大规模的队列中进行验证以支持临床应用 | 揭示卵巢MLA的分子特征及其与HGSOC的差异,探索潜在的治疗靶点 | 卵巢中肾样腺癌(MLA)和高级别浆液性卵巢癌(HGSOC) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 一个卵巢MLA样本和HGSOC的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
11272 | 2025-02-05 |
Bioinformatics combining machine learning and single-cell sequencing analysis to identify common mechanisms and biomarkers of rheumatoid arthritis and ischemic heart failure
2025-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41641
PMID:39897930
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研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序分析,旨在识别类风湿性关节炎(RA)和缺血性心力衰竭(IHF)的共同机制和生物标志物 | 通过整合多个RA和IHF数据集的RNA测序数据,识别出177个共同差异表达基因,并通过PPI网络分析和机器学习确定了五个枢纽基因,揭示了炎症免疫反应在RA患者IHF进展中的关键作用 | 研究依赖于现有数据集,可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别RA和IHF的共同机制和生物标志物,为早期诊断、个性化治疗和预防策略提供方向 | 类风湿性关节炎(RA)和缺血性心力衰竭(IHF)患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎, 缺血性心力衰竭 | RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习 | RNA测序数据 | 五个RA和IHF数据集 | NA | NA | NA | NA |
11273 | 2025-02-05 |
Multi-omics analysis of core E3 ubiquitin ligase identifies prognostic biomarkers associated with immune infiltration and drug sensitivity in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104837
PMID:39895786
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研究论文 | 本文通过多组学分析核心E3泛素连接酶,识别了与肺腺癌免疫浸润和药物敏感性相关的预后生物标志物 | 首次系统研究了E3泛素连接酶在肺腺癌中的表达、预后、免疫浸润、药物敏感性及潜在分子机制,并发现其与不良预后和特定免疫细胞浸润相关 | 研究主要基于数据库分析和计算机模拟,缺乏实验验证 | 研究E3泛素连接酶在肺腺癌中的调控作用及其作为预后和药物敏感性标志物的潜力 | 肺腺癌(LUAD)患者及肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学分析、免疫荧光分析、免疫组化、单细胞分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
11274 | 2025-02-05 |
Integrating of Radiomics and Single-cell Transcriptomics Uncovers the Crucial Role of γδ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105586
PMID:39895781
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研究论文 | 本研究通过整合放射组学和单细胞转录组学,揭示了γδ T细胞在肺腺癌中的关键作用 | 首次结合多组学数据研究γδ T细胞在肺腺癌中的功能,并建立了基于放射组学的预测模型 | γδ T细胞在肿瘤中的双重作用及其对肺腺癌的影响仍存在争议 | 探讨γδ T细胞在肺腺癌中的功能及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 放射组学、单细胞转录组学 | 预测模型 | CT图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
11275 | 2025-02-05 |
Integration of Single-Cell and Bulk Transcriptomes to Identify a Poor Prognostic Tumor Subgroup to Predict the Prognosis of Patients with Early-stage Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105926
PMID:39895784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了早期肺腺癌的不良预后肿瘤亚群,并构建了预后模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征,并开发了一个基于KRT8和PERP的新型预后模型 | 研究主要依赖于已发表的文献和数据库中的细胞标记物,可能限制了新细胞类型的发现 | 研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征并开发预后模型 | 早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR),蛋白质印迹(western blot) | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
11276 | 2025-02-05 |
Integrated Multi-omics Data Analysis and In Vitro Validation Reveal the Crucial Role of Glycogen Metabolism in Gastric Cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104424
PMID:39895799
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研究论文 | 本研究旨在探讨胃癌中的糖原代谢,并开发基于糖原的风险评分模型以预测胃癌预后 | 首次整合多组学数据分析和体外验证,揭示了糖原代谢在胃癌中的关键作用,并开发了一个新的糖原风险评分模型 | 研究中使用的数据集主要来自公开数据库,可能缺乏某些特定人群的代表性 | 研究胃癌中的糖原代谢及其对预后的影响 | 胃癌患者及其相关数据 | 生物信息学 | 胃癌 | ssGSEA方法、共识聚类分析、单细胞测序 | 糖原风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 33种肿瘤类型的患者表达谱、4个胃癌批量测序数据集、1个单细胞测序数据集、IMvigor210免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
11277 | 2025-02-05 |
Crotonylation-Related Prognostic Model of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Based on Transcriptome Analysis and Single-Cell Sequencing Analysis
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S493800
PMID:39895826
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探讨了crotonylation相关基因在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的作用,并构建了预后模型 | 首次在ESCC中研究了crotonylation相关基因的作用,并利用单细胞测序分析评估了细胞通讯和伪时间动态 | 研究依赖于公开数据集,未进行实验验证 | 探讨crotonylation相关基因在ESCC中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 转录组分析、单细胞测序分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个ESCC数据集,包含24个crotonylation相关基因 | NA | NA | NA | NA |
11278 | 2025-02-05 |
Sonic hedgehog medulloblastoma cells in co-culture with cerebellar organoids converge towards in vivo malignant cell states
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae218
PMID:39896075
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研究论文 | 本研究通过将Sonic hedgehog髓母细胞瘤(SHH-MB)细胞与小脑类器官共培养,探讨了非恶性肿瘤微环境对SHH-MB细胞表型特性的影响 | 开发了一种新型的体外SHH-MB模型,揭示了微环境对肿瘤细胞状态的非细胞自主性诱导作用 | 研究仅基于两种SHH-MB细胞系,可能无法完全代表所有SHH-MB亚型的特性 | 识别由非恶性肿瘤微环境驱动的SHH-MB细胞表型特性 | Sonic hedgehog髓母细胞瘤(SHH-MB)细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 两种SHH-MB细胞系与小脑类器官共培养 | NA | NA | NA | NA |
11279 | 2025-02-05 |
Single-cell analysis reveals islet autoantigen's immune activation in type 1 diabetes patients
2025-Jan, Journal of clinical biochemistry and nutrition
IF:2.0Q3
DOI:10.3164/jcbn.24-86
PMID:39896168
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术,全面检测了1型糖尿病患者外周血单核细胞在GAD、IA-2和胰岛素抗原重叠肽刺激下的基因表达和T细胞受体库 | 首次在单细胞水平上揭示了1型糖尿病患者胰岛自身抗原的免疫激活机制,并发现了T细胞受体β链在特定配对中的单克隆增加 | 样本量较小,仅包括20名男性患者,且仅对其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | 研究1型糖尿病的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 | 1型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 单细胞测序 | 1型糖尿病 | 单细胞测序,T细胞受体库分析 | NA | 单细胞基因表达数据,T细胞受体序列数据 | 20名男性1型糖尿病患者,其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | NA | NA | NA | NA |
11280 | 2025-02-05 |
CLEC11A-Driven Molecular Mechanisms in Intervertebral Disc Degeneration: A Comprehensive Multi-Omics Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505296
PMID:39897524
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CLEC11A在椎间盘退变(IVDD)中的分子机制 | 结合MR、转录组测序和单细胞转录组学,首次揭示了CLEC11A通过调控炎症介质ARTN和血清代谢物在IVDD中的关键作用 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内实验验证 | 揭示IVDD的遗传发病机制和关键驱动因素 | 椎间盘退变(IVDD) | 生物信息学 | 椎间盘退变 | MR、转录组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |