单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 11221 - 11240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
11221 2025-10-07
Single-cell multi-omics analysis reveals cooperative transcription factors for gene regulation in oligodendrocytes
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过整合单细胞多组学数据识别少突胶质细胞中协同转录因子对基因表达的调控机制 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq数据系统识别少突胶质细胞中协同转录因子,并开发深度学习模型量化TF-TF相互作用对靶基因表达的贡献 研究主要基于计算预测,实验验证仅限于部分TF对的共富集分析 解析少突胶质细胞中转录因子协同调控基因表达的分子机制 少突胶质细胞及其基因调控网络 生物信息学 脑部疾病 scRNA-seq, scATAC-seq, ChIP-seq, 深度学习 深度学习模型 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
11222 2025-10-07
Single-cell RNA sequencing reveals the altered innate immunity in immune checkpoint inhibitor-related myocarditis
2024-06, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示免疫检查点抑制剂相关心肌炎中先天免疫系统的改变 首次构建了ICI相关心肌炎外周血单核细胞的细胞图谱,并发现S100A蛋白家族作为潜在血清标志物 样本量较小,仅包含肺鳞状细胞癌患者 探究免疫检查点抑制剂相关心肌炎的转录组特征和发病机制 肺鳞状细胞癌患者的外周血单核细胞 单细胞组学 心肌炎 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 4组患者(具体人数未明确说明) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
11223 2025-10-07
Early life vaccination reprograms the metabolism and function of myeloid cells in neonates
2024-06, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示早期接种卡介苗通过mTOR/HIF1a信号通路和糖酵解重编程新生儿髓系细胞功能 首次发现BCG疫苗接种通过代谢重编程改变新生儿髓系细胞的免疫抑制功能 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类新生儿中验证 探究疫苗接种对新生儿免疫系统发育的影响机制 新生小鼠的髓系来源抑制细胞 免疫学 免疫相关疾病 单细胞转录组测序,代谢物分析,功能分析 NA 基因表达数据,代谢数据 新生小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
11224 2025-10-07
TRPV4-Expressing Tissue-Resident Macrophages Regulate the Function of Collecting Lymphatic Vessels via Thromboxane A2 Receptors in Lymphatic Muscle Cells
2024-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了表达TRPV4通道的组织驻留巨噬细胞通过血栓素A2受体调控淋巴管收缩功能的机制 首次发现TRPV4阳性组织驻留巨噬细胞通过TXA2-TXA2R信号轴调控淋巴管功能,为淋巴水肿治疗提供新靶点 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究TRPV4通道在淋巴管中的表达及其对淋巴管收缩功能的调控机制 收集淋巴管、组织驻留巨噬细胞、淋巴肌细胞 免疫学 淋巴水肿 单细胞RNA测序, 压力肌动描记术 NA 基因表达数据, 生理功能数据 小鼠、大鼠和非人灵长类动物的淋巴管样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11225 2025-10-07
Immune regulatory genes impact the hot/cold tumor microenvironment, affecting cancer treatment and patient outcomes
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析33种癌症的免疫特征,建立了区分热/冷肿瘤的框架,并发现可将冷肿瘤转化为热肿瘤的潜在药物 开发了定制化免疫图谱来区分热/冷肿瘤,识别了调控肿瘤微环境的关键枢纽基因,并通过药物敏感性分析发现可转化冷肿瘤的候选药物 热/冷肿瘤的临床相关定义尚未达成共识,研究结果需要在更多癌症类型中进一步验证 研究免疫调控基因对热/冷肿瘤微环境的影响及其对癌症治疗和患者预后的作用 33种癌症类型的肿瘤样本和胰腺腺癌临床队列患者 生物信息学 多种癌症 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 基因集变异分析, 分子对接分析 CIBERSORT算法 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 33种癌症类型的数据集和胰腺腺癌临床队列 NA 单细胞RNA-seq, 多重免疫组织化学 NA NA
11226 2025-02-07
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Feb-05, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本文研究了染色体18q缺失如何影响人类胚胎干细胞(hESCs)向视网膜祖细胞分化的能力,并探讨了TGFβ信号通路在此过程中的作用 首次揭示了18q缺失通过影响TGFβ信号通路,导致hESCs在前后神经外胚层命运决定中的异常 研究仅限于实验室条件下的hESCs,未涉及体内环境或临床样本 探究染色体异常对hESCs分化能力的影响,特别是18q缺失对神经外胚层命运决定的作用 人类胚胎干细胞(hESCs) 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 具有复杂核型的hESCs细胞系 NA NA NA NA
11227 2025-02-07
SCovid v2.0: a comprehensive resource to decipher the molecular characteristics across tissues in COVID-19 and other human coronaviruses
2025-Feb-04, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 SCovid v2.0是一个更新的数据库,旨在通过转录组测序帮助研究人员揭示2019冠状病毒病(COVID-19)在不同组织中的分子特征 SCovid v2.0相较于其前身,增加了全面的数据、实用的功能,并重建了分析流程,包括更多的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据,以及与其他人类冠状病毒的比较分析 NA 揭示COVID-19在不同组织中的分子特征,并进行与其他人类冠状病毒的比较分析 COVID-19及其他人类冠状病毒的分子特征 生物信息学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq) NA RNA测序数据 3,544,360个细胞来自45个单细胞RNA测序数据集,涵盖15个组织的789个样本;1,688个样本来自12个组织的62个COVID-19批量RNA测序数据;7个与其他人类冠状病毒相关的批量RNA测序数据集 NA NA NA NA
11228 2025-02-07
Development of a prognostic model based on four genes related to exhausted CD8+ T cell in triple-negative breast cancer patients: a comprehensive analysis integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-Feb-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究旨在开发基于与耗竭CD8+ T细胞相关的四个基因的三阴性乳腺癌(TNBC)预后模型,并探讨其临床和免疫相关性 通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,筛选出与TNBC患者生存显著相关的四个基因,构建了一个新的预后模型 研究主要依赖于公开数据集,缺乏独立的外部验证队列 开发一个基于耗竭CD8+ T细胞相关基因的TNBC预后模型,并评估其临床和免疫相关性 三阴性乳腺癌(TNBC)患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) 预后模型 RNA测序数据 TCGA队列和外部队列的TNBC患者数据 NA NA NA NA
11229 2025-02-07
EMT-driven plasticity prospectively increases cell-cell variability to promote therapeutic adaptation in breast cancer
2025-Feb-03, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本文研究了上皮-间质转化(EMT)驱动的细胞可塑性在三阴性乳腺癌(TNBC)治疗适应中的作用 首次揭示了EMT驱动的可塑性如何增加细胞间表型多样性,并在化疗前产生罕见的预适应状态 研究仅基于体外模型,未涉及体内环境 探讨EMT驱动的可塑性在TNBC治疗适应中的作用 三阴性乳腺癌(TNBC)细胞 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 两个TNBC体外模型 NA NA NA NA
11230 2025-02-06
Single-cell transcriptomics and metabolomic analysis reveal adenosine-derived metabolites over-representation in pseudohypoxic neuroendocrine tumours
2025-Feb, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11231 2025-02-07
Application of deep learning models on single-cell RNA sequencing analysis uncovers novel markers of double negative T cells
2024-12-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究应用深度学习模型分析单细胞RNA测序数据,揭示了C57BL/6小鼠脾脏双阴性T细胞的新标记物 使用深度学习模型scVI捕捉非线性基因表达模式,发现了新的双阴性T细胞亚群标记物,并通过流式细胞术验证 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证较少 揭示双阴性T细胞的新标记物及其在自身免疫中的潜在作用 C57BL/6小鼠和MRL/lpr小鼠的双阴性T细胞 生物信息学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Single Cell Variational Inference (scVI) 基因表达数据 C57BL/6小鼠和MRL/lpr小鼠的双阴性T细胞样本 NA NA NA NA
11232 2025-02-07
STCGAN: a novel cycle-consistent generative adversarial network for spatial transcriptomics cellular deconvolution
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为STCGAN的新型循环一致性生成对抗网络,用于空间转录组学中的细胞去卷积 STCGAN首次采用循环一致性生成对抗网络(CGAN)在空间转录组数据上进行预训练,确保从ST数据到潜在空间的映射及其反向映射的一致性,从而捕捉复杂的空间基因表达模式并学习鲁棒的潜在表示 尽管STCGAN在模拟和真实数据集上表现出色,但其在更广泛的组织类型和更复杂的组织架构中的适用性仍需进一步验证 提高空间转录组数据中细胞类型去卷积的准确性,以更精确地描绘组织架构 空间转录组数据(ST数据)和单细胞RNA测序数据(scRNA-seq数据) 数字病理学 NA 空间转录组技术 CGAN(循环一致性生成对抗网络) 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 五个模拟和真实数据集 NA NA NA NA
11233 2025-02-05
Correction to: STCGAN: a novel cycle-consistent generative adversarial network for spatial transcriptomics cellular deconvolution
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11234 2025-02-07
Single-cell omics and machine learning integration to develop a polyamine metabolism-based risk score model in breast cancer patients
2024-Oct-23, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究结合单细胞组学和机器学习,开发了一种基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型 首次将单细胞组学与机器学习结合,开发基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型,揭示了肿瘤微环境的异质性 未提及样本的具体数量,可能影响模型的泛化能力 开发一种基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型,以个性化预后评估 乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 bulk RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) SuperPC模型 RNA测序数据 NA NA NA NA NA
11235 2025-02-07
A prospective diagnostic model for breast cancer utilizing machine learning to examine the molecular immune infiltrate in HSPB6
2024-Oct-23, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究利用机器学习技术分析乳腺癌中的分子免疫浸润,特别是HSPB6基因,以开发一种前瞻性诊断模型 通过机器学习模型识别乳腺癌诊断的关键基因,并揭示HSPB6在细胞迁移、增殖和凋亡中的作用 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步在体内模型中验证 深入了解乳腺癌的分子机制,并识别与疾病相关的关键基因 乳腺癌相关数据集和MCF7细胞 机器学习 乳腺癌 差异基因表达分析、基因集富集分析(GSEA)、加权共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 乳腺癌相关数据集和MCF7细胞 NA NA NA NA
11236 2025-10-07
Leukocyte-and Platelet-Rich Fibrin for enhanced tissue repair: an in vitro study characterizing cellular composition, growth factor kinetics and transcriptomic insights
2024-Sep-04, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过体外实验深入分析白细胞和富血小板纤维蛋白的细胞组成、生长因子动力学和转录组特征 首次在细胞、蛋白质组和转录组水平上全面表征L-PRF,揭示了单核细胞向巨噬细胞分化的过程 样本量较小(流式细胞术n=4,单细胞RNA测序n=5),仅为体外研究 深入了解L-PRF的组成及其在组织愈合中的可能机制作用 人类L-PRF膜和液体L-PRF胶 组织工程 组织修复 流式细胞术,单细胞RNA测序,RT-qPCR,ELISA NA 细胞计数数据,基因表达数据,蛋白质浓度数据 流式细胞术4个样本,单细胞RNA测序5个样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11237 2025-10-07
A unique human cord blood CD8+CD45RA+CD27+CD161+ T-cell subset identified by flow cytometric data analysis using Seurat
2024-09, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究将原本用于单细胞RNA测序分析的Seurat软件包成功应用于高维流式细胞术数据分析,并鉴定出脐带血中独特的CD8+CD45RA+CD27+CD161+ T细胞亚群 首次将Seurat软件包重新用于流式细胞术数据分析,并发现脐带血中特有的T细胞亚群 方法验证相对有限,仅与另一种分析包和传统手动分析进行了比较 开发高维流式细胞术数据分析方法并鉴定新型免疫细胞亚群 成人血液和脐带血中的T细胞 临床免疫学 NA 流式细胞术, 单细胞RNA测序 Seurat, Spectre 流式细胞术数据, 单细胞RNA测序数据 成人血液和脐带血样本 NA 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 NA 20标记抗体panel
11238 2025-10-07
Oral Cannabidiol Treatment Is Associated with an Anti-Inflammatory Gene Expression Signature in Myeloid Cells of People Living with HIV
2024-Aug, Cannabis and cannabinoid research IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析HIV感染者接受口服大麻二酚治疗后髓系细胞的基因表达变化 首次在HIV感染者中通过单细胞RNA测序揭示大麻二酚治疗与髓系细胞抗炎基因表达特征的关联 样本量较小(仅3名HIV感染者),观察时间较短(27-60天) 探究大麻二酚治疗对HIV感染者外周血单个核细胞基因表达的影响 HIV感染者的外周血单个核细胞 单细胞基因组学 HIV感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 3名HIV感染者,约41,000个外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11239 2025-02-07
Transcription factor KLF2 is associated with the dysfunctional status of NK cells and the prognosis of pediatric B-ALL patients
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了转录因子KLF2与NK细胞功能失调状态及儿童B-ALL患者预后的关系 首次在单细胞水平上揭示了B-ALL患者骨髓微环境中NK细胞的分子遗传学特征,并发现KLF2在NK细胞中的表达与B-ALL患者的不良预后相关 样本量相对较小,且仅针对儿童B-ALL患者,未涵盖其他类型的白血病 研究B-ALL患者骨髓微环境中NK细胞的分子遗传学特征及其功能抑制机制 43名健康志愿者和104名儿童B-ALL患者的外周血样本,以及139名B-ALL患者的骨髓样本 分子遗传学 B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL) 单细胞RNA测序(scRNAseq) 无监督聚类 RNA测序数据 147名样本(43名健康志愿者和104名儿童B-ALL患者),以及139名B-ALL患者的骨髓样本 NA NA NA NA
11240 2025-10-07
Disruption of cortical cell type composition and function underlies diabetes-associated cognitive decline
2023-08, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了2型糖尿病引起大脑皮层细胞类型组成和功能紊乱的分子机制 首次在2型糖尿病模型中应用单细胞转录组测序技术系统分析大脑皮层细胞组成变化及其与认知功能下降的关联 研究样本量相对有限,且主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩大 探索2型糖尿病相关认知功能下降的病理基础 db/db糖尿病模型小鼠和2型糖尿病患者的大脑皮层组织 数字病理学 2型糖尿病 单细胞转录组测序,免疫组织化学,代谢评估,行为学测试 NA 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据,行为学数据 db/db糖尿病模型小鼠和对照小鼠,2型糖尿病患者(74.3±5.5岁)和对照个体(87.0±8.5岁) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部