单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 11201 - 11220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11201 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome dissecting the microenvironment remodeled by PD1 blockade combined with photodynamic therapy in a mouse model of oral carcinogenesis
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.636
PMID:38962427
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研究论文 | 本研究揭示了PD1阻断联合光动力疗法在小鼠口腔癌发生模型中重塑微环境的效果 | 创新之处在于通过单细胞转录组测序揭示了口腔癌进展过程中微环境的失调，并提出了一种新的治疗策略 | 本研究的局限性在于模型仅使用小鼠，未在临床中进行验证 | 探讨有效的策略以阻止口腔潜在恶性疾病向口腔鳞状细胞癌的进展 | 建立小鼠口腔癌发生模型，研究PD1阻断与光动力疗法的联合效果 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 11202 | 2024-08-04 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
|
研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M，一个用于空间转录组学的组织病理图像-基因表达数据集 | STimage-1K4M 数据集通过为小tile图像提供基因组特征，填补了现有医学图像文本数据集中信息不足的空白 | NA | 旨在促进多模态数据分析及其在计算病理学中的应用 | 包含来自空间转录组数据的1,149幅图像和4293195对小tile图像与基因表达 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 1149幅图像，4293195对小tile图像与基因表达 |
| 11203 | 2024-08-04 |
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
2024-06-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03309-4
PMID:38898465
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研究论文 | 本研究生成了神经母细胞瘤细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的单细胞RNA-seq图谱 | 提出了一种无监督机器学习方法(acNMF)来比较临床与前临床模型中的基因表达程序 | 未详细研究弱表达的间充质样基因表达与药物耐受机制之间的关系 | 更好地理解患者肿瘤异质性与前临床模型之间的关系 | 聚焦于神经母细胞瘤细胞系及其前临床模型的基因表达程序 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 无监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的多个样本 |
| 11204 | 2024-08-05 |
CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity
2024-Jun-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06784-6
PMID:38898023
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研究论文 | 本研究探讨了CXCR7在胶质母细胞瘤中重塑CXCL12介导的免疫反应，以激发抗PD-L1抗体。 | 揭示了CXCR7作为CXCL12的负调节因子，并通过靶向激活CXCR7来增强抗肿瘤免疫反应。 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需要进一步验证。 | 提高胶质母细胞瘤免疫疗法的有效性。 | 胶质母细胞瘤细胞与相关巨噬细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析 | 小鼠模型 | 基因数据 | 多个复发性胶质母细胞瘤样本及小鼠实验相结合 |
| 11205 | 2024-08-04 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
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评论 | 本研究讨论了空间生物学在乳腺癌中的应用及其影响 | 探讨了空间转录组学和蛋白质组学以及新兴的多重成像技术对乳腺癌研究的贡献 | 未具体提及具体研究数据或样本限制 | 旨在探索空间方法对乳腺癌进展和治疗的理解 | 涉及乳腺癌相关的空间关系及其生物学机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 多重成像技术 | NA | NA | NA |
| 11206 | 2024-08-05 |
Soluble PD-L1 reprograms blood monocytes to prevent cerebral edema and facilitate recovery after ischemic stroke
2024-02, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.007
PMID:38070624
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研究论文 | 这篇文章探讨了可溶性PD-L1如何通过重新编程血液单核细胞来预防脑水肿并促进缺血性中风后的恢复。 | 相关研究首次展示了PD-1阳性单核细胞作为sPD-L1的治疗靶点的潜力。 | 研究在小鼠模型中进行，实际临床应用的效果和安全性仍需进一步验证。 | 研究PD-L1在急性缺血性中风恢复中的治疗潜力。 | 研究对象为急性缺血性中风患者的循环单核细胞以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 小鼠中动脉闭塞（MCAO）模型 | 生物样本 | 涉及人类患者和小鼠模型，具体样本量未列明 |
| 11207 | 2024-08-04 |
Deciphering the shared mechanisms of Gegen Qinlian Decoction in treating type 2 diabetes and ulcerative colitis via bioinformatics and machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1406149
PMID:38962743
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研究论文 | 本研究探讨了葛根芩莲汤在治疗2型糖尿病和溃疡性结肠炎中的共享机制 | 揭示了T2DM和UC之间的共病机制，并识别了新的生物标志物和治疗策略 | 缺乏临床试验数据以验证研究结果 | 探究T2DM与UC之间的共享致病机制，并阐明葛根芩莲汤的作用机制 | 研究对象包括2型糖尿病和溃疡性结肠炎的相关靶点 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 溃疡性结肠炎 | 生物信息学和机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 11208 | 2024-08-04 |
SlowMoMan: a web app for discovery of important features along user-drawn trajectories in 2D embeddings
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae095
PMID:38962404
|
研究论文 | 本文提出了SlowMoMan，一个Web应用程序，用于发现用户绘制的二维嵌入中的重要特征 | 该应用程序解决了非线性低维嵌入与原始高维数据之间关系的难题，并提供了一种可视化和排序功能 | 未提及具体的限制 | 研究如何在二维嵌入中识别和排序重要特征 | 研究对象包括轨迹推断、空间转录组学和细胞分类等应用场景 | 计算机视觉 | NA | 非线性低维嵌入 | NA | 高维数据 | NA |
| 11209 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram model and subtype classification in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1399856
PMID:38962008
|
研究论文 | 本文整合多重数据集，探讨类风湿性关节炎（RA）中T细胞的异质性及其相关的诊断模型 | 建立了一种与T细胞相关的诊断模型，提供了RA免疫治疗的新方法 | 研究未提及样本的年龄或性别对不同T细胞模式的影响 | 探讨类风湿性关节炎中的T细胞机制及其分类 | 研究对象为582个与类风湿性关节炎相关的T细胞亚型 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq、bulk RNA-seq、孟德尔随机化（MR）和eQTL | XGB机器学习 | 细胞数据 | 分析了10,211个细胞 |
| 11210 | 2024-08-05 |
Activation of non-classical Wnt signaling pathway effectively enhances HLA-A presentation in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1336106
PMID:38962268
|
研究论文 | 本研究识别了急性淋巴细胞白血病（AML）中造血干细胞前体（HSC-Prog）的克隆异质性，并探讨了与AML免疫逃逸相关的分子通路 | 首次揭示非经典Wnt信号通路在AML中与HLA-A呈现的关系 | 未明确涉及样本的多样性或实验结果的临床应用 | 识别AML中造血干细胞前体的克隆异质性并探讨与免疫逃逸相关的分子机制 | 急性髓性白血病（AML）患者的造血干细胞前体 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA（mRNA） | 样本数量未具体说明 |
| 11211 | 2024-08-05 |
A mitochondria-related genes associated neuroblastoma signature - based on bulk and single-cell transcriptome sequencing data analysis, and experimental validation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415736
PMID:38962012
|
研究论文 | 本文建立了一种与线粒体相关基因相关的神经母细胞瘤标志，通过数据分析和实验验证进行了研究 | 提出了一个新的预测工具，能够有效评估神经母细胞瘤患者的预后和对化疗药物的敏感性 | 研究可能未涵盖所有类型的神经母细胞瘤患者，且数据集的多样性有限 | 旨在分析线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的重要性及其在患者预后中的应用 | 本研究对象为神经母细胞瘤患者及其相关的线粒体相关基因 | 数字病理 | 神经母细胞瘤 | 转录组测序 | 一致性聚类和机器学习算法 | 单细胞和整体转录组数据 | NA |
| 11212 | 2024-08-05 |
Elucidating the role of angiogenesis-related genes in colorectal cancer: a multi-omics analysis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1413273
PMID:38962272
|
研究论文 | 本研究通过综合多组学分析阐明了血管生成相关基因在结直肠癌中的重要性 | 研究中识别了结直肠癌中的两种血管生成相关亚型及其四个关键基因，为个性化治疗提供了新见解 | 在基因突变与亚型的关联方面未发现显著性 | 探索血管生成相关基因在结直肠癌中的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其血管生成相关基因的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RT-PCR, scRNA-seq | LASSO, Xgboost, 决策树 | 基因表达数据 | NA |
| 11213 | 2024-08-05 |
Border-associated macrophages mediate the neuroinflammatory response in an alpha-synuclein model of Parkinson disease
2023-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39060-w
PMID:37365181
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研究论文 | 这篇文章探讨了边界相关巨噬细胞在帕金森病α-突触核蛋白模型中的神经炎症反应中的作用 | 揭示了边界相关巨噬细胞在神经炎症反应中的关键作用，尤其是在抗原呈递和CD4 T细胞反应中的独特地位 | 尚不清楚边界相关巨噬细胞在其他神经退行性疾病中的作用 | 研究边界相关巨噬细胞在帕金森病神经炎症中的作用 | 边界相关巨噬细胞以及它们在α-突触核蛋白引发的神经炎症中的角色 | 数字病理 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从后期死亡的帕金森病大脑中关于巨噬细胞和T细胞的位置特征进行的研究 |
| 11214 | 2024-08-05 |
High-throughput total RNA sequencing in single cells using VASA-seq
2022-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01361-8
PMID:35760914
|
研究论文 | 本文开发了VASA-seq技术，以检测单细胞中的整体转录组 | VASA-seq能够捕获所有RNA分子的总转录组，克服了传统方法无法检测许多长非编码 RNA及非多腺苷酸化转录本的限制 | 本文未提到具体的限制因素 | 研究单细胞转录组，并分析不同发育阶段的RNA动态 | 在小鼠胚胎的胚胎发生和器官发生早期阶段研究超过30,000个单细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | 超过30,000个单细胞 |
| 11215 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of senescent epithelia reveals targetable mechanisms promoting fibrosis
2022-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154124
PMID:36509292
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了促纤维化的可靶向机制。 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了衰老上皮细胞在促进纤维化中的作用及其潜在的治疗靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型，具体在人类疾病中的机制需要进一步验证。 | 探讨衰老细胞如何影响器官纤维化和修复的机制。 | 研究对象包括小鼠模型和人类的肾脏与肝脏疾病。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了2个小鼠模型及验证人类样本 |
| 11216 | 2024-08-05 |
Estimation of tumor cell total mRNA expression in 15 cancer types predicts disease progression
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01342-x
PMID:35697807
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研究论文 | 本文提出了一种从肿瘤样本中量化特定肿瘤总mRNA表达的方法 | 该研究开发了一种考虑转录物比例、纯度和倍性的新方法，以量化肿瘤特异性总mRNA表达 | 技术和分析挑战仍然存在，可能会影响大规模的全癌症总mRNA内容检查 | 研究总mRNA表达与肿瘤表型和临床结果之间的关系 | 6,590个患者肿瘤，涵盖15种癌症类型 | 数字病理学 | NA | bulk sequencing | NA | 转录组数据 | 6,590例患者肿瘤 |
| 11217 | 2024-08-05 |
LSD1/KDM1A and GFI1B repress endothelial fate and induce hematopoietic fate in induced pluripotent stem cell-derived hemogenic endotheliums
2024-Jul-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285214
PMID:38961746
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子GFI1B及其共因子LSD1/KDM1A在胚胎内皮转化过程中的作用 | 揭示了LSD1/KDM1A和GFI1B在不同细胞亚群中的时间点功能对血液生成的影响 | 未能在未分化的HE细胞中检测到GFI1B的表达 | 理解诱导多能干细胞转化为血液生成细胞的机制 | 使用患者来源的iPSC线和健康的iPSC线进行对比研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多条患者来源的iPSC线和健康iPSC线 |
| 11218 | 2024-08-04 |
Spatial Dissection of the Immune Landscape of Solid Tumors to Advance Precision Medicine
2024-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0699
PMID:38657223
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综述 | 本论文概述了在实体肿瘤中空间免疫景观的分析方法，以促进精准医疗。 | 介绍了空间转录组学和蛋白质组学的最新进展及其在肿瘤免疫细胞组成分析中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 深入了解实体肿瘤的异质性免疫景观，以改善预后和治疗反应预测 | 重点研究实体肿瘤中的免疫细胞成分及其在肿瘤微环境中的角色 | 数字病理学 | 固体恶性肿瘤 | 空间多组学技术 | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |
| 11219 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing: Technological Progress and Biomedical Application in Cancer Research
2024-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00777-0
PMID:37322261
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用 | 强调了scRNA-seq在肿瘤异质性分析和个性化医学中的潜在应用 | 未提及具体的技术局限性 | 探讨单细胞RNA测序在癌症研究中的应用和技术进展 | 单细胞RNA测序技术及其对癌症和疾病的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 11220 | 2024-08-04 |
Comprehensive investigation of malignant epithelial cell-related genes in clear cell renal cell carcinoma: development of a prognostic signature and exploration of tumor microenvironment interactions
2024-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05426-x
PMID:38951896
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研究论文 | 本文全面研究了透明细胞肾细胞癌中的恶性上皮细胞相关基因及其临床相关性 | 建立了一个预后模型MECRGS，并在多个队列中显示出优越的预测性能 | 未提及具体的样本来源和大小 | 探讨恶性上皮细胞相关基因在透明细胞肾细胞癌中的功能和临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌中的219个恶性上皮细胞相关基因 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA |