单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28534 篇文献，本页显示第 11201 - 11220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11201 | 2024-08-09 |
Deciphering the immune-metabolic nexus in sepsis: a single-cell sequencing analysis of neutrophil heterogeneity and risk stratification
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398719
PMID:39108261
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了脓毒症中的免疫细胞景观及其与代谢途径的关联，揭示了中性粒细胞在脓毒症代谢紊乱中的作用及其异质性 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，本研究首次揭示了脓毒症中中性粒细胞的复杂交互作用和其在代谢紊乱中的关键角色，并开发了一种新的风险评分模型用于预测脓毒症预后 | NA | 旨在深入理解脓毒症中的免疫代谢相互作用，并开发新的预后和治疗策略 | 脓毒症中的免疫细胞和代谢途径 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 11202 | 2024-08-09 |
Concurrent delivery of immune checkpoint blockade modulates T cell dynamics to enhance neoantigen vaccine-generated antitumor immunity
2022-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00352-7
PMID:35393580
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研究论文 | 本文研究了新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤特异性T细胞反应的影响 | 通过单细胞测序揭示了联合治疗诱导的特定CD8 T细胞群体的特征，这些细胞具有活跃的趋化因子信号、较低的共抑制受体表达和较高的细胞毒性 | NA | 探讨新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤控制的有效性及其机制 | 新抗原疫苗生成的T细胞与免疫检查点阻断的协同作用 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 超过100,000个T细胞 |
| 11203 | 2024-08-09 |
Blocking LAIR1 signaling in immune cells inhibits tumor development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.996026
PMID:36211388
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研究论文 | 本文研究了通过阻断免疫细胞中的LAIR1信号来抑制肿瘤发展的效果 | 开发了特异性的拮抗性抗LAIR1单克隆抗体，并研究了其在癌症治疗中的免疫激活作用 | NA | 探索新的癌症免疫学分子靶点和治疗策略 | 免疫细胞中的LAIR1信号阻断对肿瘤发展的影响 | 癌症免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了同源人类LAIR1转基因小鼠模型 |
| 11204 | 2024-08-09 |
Research Techniques Made Simple: Use of Imaging Mass Cytometry for Dermatological Research and Clinical Applications
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.12.008
PMID:33752807
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研究论文 | 本文介绍了成像质谱流式细胞术（IMC）在皮肤病学研究和临床应用中的潜力 | IMC技术能够同时分析多达40种蛋白质标记物，生成高维图像，保留组织结构和细胞间空间关系 | NA | 强调IMC在皮肤病学研究和临床应用中的潜在用途 | 皮肤病学领域的组织和细胞 | 数字病理学 | NA | 成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 图像 | NA |
| 11205 | 2024-08-09 |
Leukocyte dynamics after intracerebral hemorrhage in a living patient reveal rapid adaptations to tissue milieu
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145857
PMID:33749664
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对一名参与微创手术联合溶栓治疗脑内出血试验的患者进行了血液和脑血肿流出物的纵向分析，揭示了脑内出血后白细胞的动态适应性变化 | 首次在单细胞分辨率下描述了活体患者脑内出血期间的局部细胞反应 | 仅基于单一病例的研究，可能缺乏普遍性 | 探索脑内出血后脑部免疫反应的动态变化 | 脑内出血患者的血液和脑血肿流出物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 单一病例 |
| 11206 | 2024-08-09 |
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-311000/v1
PMID:33758834
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研究论文 | 研究旨在描述母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫系统的调节作用 | 研究仅限于第三孕期的新生儿，且未观察到垂直传播 | 探究母体SARS-CoV-2感染对胎儿及儿童健康的潜在影响 | 母体SARS-CoV-2感染的第三孕期新生儿及其脐带血单个核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA | 母体感染SARS-CoV-2的新生儿脐带血单个核细胞 |
| 11207 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Healthy and Diseased Brain: Insights from Single-Cell Omics
2021-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22063027
PMID:33809675
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术研究了健康和疾病状态下大脑中微胶质细胞的多样性 | 利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术，揭示了微胶质细胞在生理和病理条件下的未被发现的异质性 | NA | 总结单细胞组学研究在微胶质细胞功能多样性方面的发现，并探讨其在未来免疫调节治疗设计中的重要性 | 大脑中的微胶质细胞及其在健康和疾病状态下的多样性 | NA | 神经退行性疾病，中风，抑郁症，脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | 数千个单个细胞 |
| 11208 | 2024-08-09 |
Efficient IL-2R signaling differentially affects the stability, function, and composition of the regulatory T-cell pool
2021-02, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00599-z
PMID:33408345
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研究论文 | 研究通过分析一种自发突变小鼠品系，探讨了IL-2R信号在调节Treg细胞稳定性、功能及其组成中的作用 | 首次揭示了IL-2R信号的部分丧失如何影响Treg细胞池的维持、异质性和抑制功能 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨IL-2R信号在不同条件下对Treg细胞稳态、谱系稳定性和功能的影响 | Treg细胞及其在非炎症和炎症环境下的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Cd25小鼠的Treg细胞 |
| 11209 | 2024-08-09 |
Cell type prioritization in single-cell data
2021-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0605-1
PMID:32690972
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Augur的方法，用于在单细胞数据中优先考虑对生物扰动最敏感的细胞类型 | Augur采用机器学习框架量化高维空间中扰动和未扰动细胞的可分离性，并在单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据集上验证了其方法，显示出优于基于差异基因表达的现有方法 | NA | 开发和验证一种新的方法来优先考虑单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 单细胞数据 | 涉及小鼠脊髓神经刺激后的神经回路样本 |
| 11210 | 2024-08-09 |
The use and limitations of single-cell mass cytometry for studying human microglia function
2020-11, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.12909
PMID:33058349
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综述 | 本文综述了单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）和成像质谱流式细胞术（IMC）在研究人小胶质细胞功能中的应用及其局限性 | 介绍了CyTOF和IMC技术在单细胞水平上对高维度蛋白质表达的分析能力，以及它们在结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行综合分析时的优势 | 讨论了CyTOF和IMC技术的局限性及未来发展方向 | 总结近期使用CyTOF和IMC技术研究人小胶质细胞（huMG）的进展 | 人小胶质细胞在健康和疾病大脑中的功能 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF），成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 蛋白质表达数据 | 涉及超过60个目标分子的高通量定量分析 |
| 11211 | 2024-08-09 |
Lineage analysis reveals an endodermal contribution to the vertebrate pituitary
2020-10-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba4767
PMID:33093109
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和时间流逝成像技术，在斑马鱼中发现了垂体前叶（腺垂体）的形成不仅依赖于已知的表皮来源，还涉及内皮细胞的贡献 | 首次揭示了内皮细胞对脊椎动物垂体的贡献，并通过单细胞RNA测序证实了内皮和表皮上皮在产生所有内分泌细胞类型方面的相似能力 | NA | 探讨脊椎动物垂体的形成过程中内皮细胞的贡献 | 斑马鱼的垂体前叶（腺垂体） | NA | NA | 谱系追踪、时间流逝成像、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 11212 | 2024-08-09 |
Gene editing and elimination of latent herpes simplex virus in vivo
2020-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17936-5
PMID:32811834
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研究论文 | 本文评估了使用腺相关病毒（AAV）递送的巨核酸酶在已建立的小鼠模型中编辑单纯疱疹病毒（HSV），作为一种潜在的治愈方法来治疗HSV潜伏感染 | 本文展示了AAV递送的巨核酸酶而非CRISPR/Cas9能够高度有效地编辑HSV，消除超过90%的潜伏病毒 | 需要进一步优化巨核酸酶的递送和活性，以实现更完全的HSV消除 | 探索使用基因编辑技术治愈HSV潜伏感染的可能性 | 单纯疱疹病毒（HSV）在小鼠模型中的基因编辑 | 基因编辑 | 单纯疱疹病毒感染 | AAV递送的巨核酸酶 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型中的颈上神经节 |
| 11213 | 2024-08-09 |
Contribution of Immune Cells to Glucocorticoid Receptor Expression in Breast Cancer
2020-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21134635
PMID:32629782
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研究论文 | 研究免疫细胞在乳腺癌中对糖皮质激素受体表达的贡献及其对预后的影响 | 首次探讨了肿瘤微环境中免疫细胞对糖皮质激素受体表达的贡献，并分析了其对乳腺癌预后的影响 | 研究依赖于现有数据库和公开的单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨免疫细胞在乳腺癌中对糖皮质激素受体表达的贡献及其对预后的影响 | 乳腺癌患者的免疫细胞和糖皮质激素受体表达 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA表达数据 | 使用了来自METABRIC和TCGA的数据，以及GSE75688和GSE114725的单细胞测序数据 |
| 11214 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Human Retina Identifies Evolutionarily Conserved and Species-Specific Mechanisms Controlling Development
2020-05-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.04.009
PMID:32386599
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类视网膜发育过程中的细胞类型多样性和转录网络 | 发现了进化保守和物种特异性的基因表达模式，以及ATOH7在视网膜发育后期调控光感受器分化的意外作用 | NA | 识别控制人类视网膜发育的转录网络 | 人类视网膜发育过程中的细胞类型和转录网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16个发育中的视网膜时间点和4个早期视网膜类器官分化阶段 |
| 11215 | 2024-08-08 |
A novel model combining genes associated with disulfidptosis and glycolysis to predict breast cancer prognosis, molecular subtypes, and treatment response
2024-Sep, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24329
PMID:38747344
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研究论文 | 本文开发了一种新型模型，结合与二硫化物死亡和糖酵解相关的基因，用于预测乳腺癌的预后、分子亚型和治疗反应 | 首次探讨了二硫化物死亡和糖酵解相关基因在乳腺癌中的作用机制及其预后价值 | NA | 开发一种能够准确预测乳腺癌预后、肿瘤微环境及药物治疗反应的模型 | 乳腺癌及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及正常和乳腺癌组织中的差异表达基因 |
| 11216 | 2024-08-08 |
Neutrophil Heterogeneity Is Modified during Acute Lung Inflammation in Apoa1-/- Mice
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300459
PMID:38912868
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研究论文 | 本研究评估了载脂蛋白A-I是否通过改变中性粒细胞异质性来减轻急性气道炎症的机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了Apoa1-/-小鼠在LPS+HDM诱导的急性肺炎症中中性粒细胞和巨噬细胞群的特定增加以及共同促炎基因表达的增强 | NA | 探讨载脂蛋白A-I在急性气道炎症中对中性粒细胞异质性的影响 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠在LPS+HDM诱导的急性肺炎症中的中性粒细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠的支气管肺泡灌洗液中的细胞 |
| 11217 | 2024-08-08 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-Aug-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
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研究论文 | 本文通过建立一个基于细胞谱系的模型，研究了植物分枝过程中体细胞表观遗传漂移的现象 | 提出了一个特殊的分离分生组织模型，其中前体细胞从茎顶端分生组织（SAM）外围随机采样，以最大化细胞谱系独立性 | NA | 研究植物分枝过程中体细胞表观遗传漂移及其对DNA甲基化异质性的影响 | 植物分枝过程中的体细胞表观遗传漂移 | 数字病理学 | NA | NA | 细胞谱系模型 | NA | NA |
| 11218 | 2024-08-08 |
scTab: Scaling cross-tissue single-cell annotation models
2024-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51059-5
PMID:39098889
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTab的自动化细胞类型预测模型，专门针对表格数据，并使用一种新颖的数据增强方案在大量单细胞RNA-seq数据集上进行训练 | scTab模型能够处理大规模数据集，并在跨组织细胞注释中表现出良好的泛化能力，同时数据增强方案提高了模型的泛化性能 | NA | 开发一种能够在大规模单细胞RNA-seq数据集上进行跨组织细胞类型预测的自动化模型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 表格数据 | 2220万细胞 |
| 11219 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome reveals the region-specific genes and pathways regulated by Satb2 in neocortical development
2024-Aug-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10672-w
PMID:39095712
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫染色技术，系统研究了Satb2基因在不同新皮质区域发育中的区域特异性基因调控。 | 首次全面描绘了Satb2基因在新皮质发育中的空间调控途径，并揭示了其在不同区域的具体调控基因和通路。 | 研究主要集中在胚胎阶段的Satb2+/+和Satb2-/-小鼠，未涉及成年阶段或其他相关基因的影响。 | 探究Satb2基因在新皮质发育中的区域特异性基因调控及其相关通路。 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的新皮质区域，包括室管膜区（VZ）、室下区（SVZ）、中间区（IZ）和皮质板（CP）。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，免疫染色 | NA | 转录组数据 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的胚胎阶段样本 |
| 11220 | 2024-08-08 |
Genome-wide CRISPR screening identifies tyrosylprotein sulfotransferase-2 as a target for augmenting anti-PD1 efficacy
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02068-x
PMID:39095793
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选，发现酪氨酰蛋白磺基转移酶-2（TPST2）是增强抗PD1疗效的潜在靶点 | 首次揭示了TPST2在癌症免疫中的抑制作用，并提出其作为免疫检查点疗法治疗靶点的可能性 | NA | 探索影响抗PD1反应性的肿瘤细胞内在因素，并评估TPST2在癌症免疫中的具体作用 | TPST2在癌症免疫中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | NA | NA | CRISPR筛选，共免疫沉淀，质谱分析，RNA测序 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，RNA数据 | 在人源化小鼠中进行实验，使用同基因小鼠肿瘤模型进行验证 |