单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 11201 - 11220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11201 | 2025-10-07 |
A novel Bayesian framework for harmonizing information across tissues and studies to increase cell type deconvolution accuracy
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac616
PMID:36631398
|
研究论文 | 提出一种新颖的贝叶斯框架tranSig，通过整合跨组织和研究的信息来提高细胞类型反卷积的准确性 | 开发了首个利用跨组织和研究的共享细胞类型特异性表达模式的贝叶斯框架来改进scRNA-seq签名矩阵推断 | NA | 提高从单细胞RNA测序数据推断细胞类型签名矩阵的准确性，以改进细胞类型反卷积分析 | 外周血、支气管肺泡灌洗液和主动脉的批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 11202 | 2025-10-07 |
The regenerating skeletal muscle niche drives satellite cell return to quiescence
2022-Jun-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104444
PMID:35733848
|
研究论文 | 本研究揭示了骨骼肌再生过程中卫星细胞重返静止状态的机制及时间窗口 | 首次确定了卫星细胞在肌肉损伤后5-10天重返静止状态的时间窗口，并发现非细胞自主信号网络调控卫星细胞命运决定 | 未详细阐明具体的信号分子机制 | 探究骨骼肌再生过程中卫星细胞重返静止状态的时机和调控机制 | 骨骼肌卫星细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉再生障碍 | 单细胞测序，细胞移植实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11203 | 2025-10-07 |
Distinct Injury Responsive Regulatory T Cells Identified by Multi-Dimensional Phenotyping
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.833100
PMID:35634302
|
研究论文 | 通过多维表型分析技术鉴定损伤响应性调节性T细胞的独特特征 | 首次通过多组学技术全面表征损伤响应性CD44+ Treg细胞，揭示其克隆扩增和功能特异性 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 解析损伤响应性调节性T细胞的分子特征和功能机制 | 小鼠CD4+调节性T细胞（Tregs） | 免疫学 | 组织损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR repertoire分析, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 11204 | 2025-10-07 |
Cobolt: integrative analysis of multimodal single-cell sequencing data
2021-12-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02556-z
PMID:34963480
|
研究论文 | 提出Cobolt方法用于整合分析多模态单细胞测序数据 | 不仅能分析联合模态平台的数据，还提供了整合不同模态测量的多个数据集的一致框架 | NA | 开发多模态单细胞测序数据的整合分析方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学单细胞测序 | NA | NA |
| 11205 | 2025-10-07 |
RETRACTION: Prognostic Value and Potential Mechanism of Cellular Senescence and Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma: Insights From Bulk Transcriptomics and Single-Cell Sequencing Analysis
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24453
PMID:39584580
|
撤稿声明 | 本文宣布撤回一篇关于肝细胞癌中细胞衰老与肿瘤微环境预后价值的研究论文 | NA | 该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿 | NA | NA | NA | 肝细胞癌 | 批量转录组学，单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11206 | 2025-10-07 |
Revolutionizing prognosis: Introducing cell death index (CDI) as a powerful prognostic tool for CSCC patients
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24265
PMID:39887534
|
研究论文 | 本研究构建了细胞死亡指数(CDI)作为宫颈鳞癌的新型预后预测工具 | 首次提出细胞死亡指数的概念，并基于23个基因构建预后模型 | 使用公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 开发宫颈鳞癌的预后预测指标 | 宫颈鳞癌患者 | 生物信息学 | 宫颈癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 预后模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的训练和验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11207 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic analysis identifies epithelium-macrophage crosstalk in endometriotic lesions
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111790
PMID:39935459
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示了子宫内膜异位病灶中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现浅表腹膜子宫内膜异位病灶上皮细胞通过补体3驱动炎症信号并促进巨噬细胞向促修复表型转化 | 仅关注浅表腹膜病灶，未涉及其他类型子宫内膜异位病变 | 阐明子宫内膜异位病灶中细胞类型特异性基因表达变化及细胞间通讯机制 | 子宫内膜异位病灶和患者匹配的在位子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 患者匹配的子宫内膜异位病灶和在位子宫内膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11208 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing in synovial joint: insights of new progenitors and targets in joint development and disease
2025-Feb-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf008
PMID:39957282
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在滑膜关节发育和疾病研究中的应用与进展 | 系统总结了单细胞测序技术在揭示滑膜关节细胞异质性、发育机制和疾病病理方面的新见解 | NA | 探讨单细胞转录组测序在滑膜关节发育和疾病研究中的应用价值 | 滑膜关节（包括膝关节、颞下颌关节和脊柱关节） | 单细胞组学 | 骨关节炎、类风湿关节炎、椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11209 | 2025-10-07 |
Peptide amphiphiles alleviate myocardial endoplasmic reticulum stress to enhance cardiomyocyte-macrophage communication and promote macrophage M2 polarization
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.042
PMID:39710208
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向受损心肌细胞的级联响应药物递送系统CT-PA@Sal，通过缓解内质网应激改善心肌细胞-巨噬细胞通讯并促进巨噬细胞M2极化 | 首次利用肽两亲性分子构建靶向受损心肌细胞的级联响应药物递送系统，实现内质网应激抑制剂Salubrinal的特异性释放 | 未明确说明样本规模及临床前研究的具体局限性 | 开发治疗心肌缺血再灌注损伤的靶向药物递送策略 | 心肌细胞和巨噬细胞的细胞间通讯 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11210 | 2025-02-18 |
Spatial transcriptomics reveals regional characteristics of lupus nephritis in murine kidneys and immune response to prednisolone or Gancao Nourishing-Yin decoction therapies
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70236
PMID:39956926
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11211 | 2025-10-07 |
TIMD4hiMHCⅡhi Macrophages Preserve Heart Function Through Retnla
2025-Jan, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2024.08.009
PMID:39906591
|
研究论文 | 研究发现TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞通过Retnla基因保护心脏功能 | 首次确认TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞亚群的存在及其通过Retnla/RELMα保护心脏功能的新机制 | NA | 探究TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞在心脏功能保护中的作用机制 | 心脏组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序，遗传命运图谱 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11212 | 2025-10-07 |
CBX1 is involved in hepatocellular carcinoma progression and resistance to sorafenib and lenvatinib via IGF-1R/AKT/SNAIL signaling pathway
2024-Oct, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-024-10696-0
PMID:38769286
|
研究论文 | 本研究探讨CBX1在肝细胞癌进展及对索拉非尼和乐伐替尼耐药性中的作用机制 | 首次揭示CBX1通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路促进肝细胞癌进展和酪氨酸激酶抑制剂耐药性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需要进一步临床验证 | 探究CBX1在泛癌及肝细胞癌中的表达特征、功能作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western Blotting、免疫组化、组织芯片、CCK-8、集落形成、Transwell侵袭、划痕实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 肝细胞癌组织及癌旁组织、多种癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11213 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomic Analysis Identifies Epithelium-Macrophage Crosstalk in Endometriotic Lesions
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586434
PMID:38798560
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了子宫内膜异位病变中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现浅表腹膜子宫内膜异位病变上皮细胞通过补体3驱动炎症信号并促进巨噬细胞向促修复表型转化 | 仅分析了浅表腹膜病变，未涉及其他类型子宫内膜异位病变 | 阐明子宫内膜异位病变中细胞类型特异性基因表达变化及细胞间通讯机制 | 子宫内膜异位病变组织和患者匹配的在位子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 患者匹配的病变组织和正常组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11214 | 2025-10-07 |
Transcriptomic landscape of endothelial cells: Key tumor microenvironment components indicating variable clinical outcomes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23881
PMID:37449672
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺导管腺癌中内皮细胞的异质性及其对临床预后的影响 | 首次在胰腺导管腺癌中系统鉴定出7个不同的内皮细胞亚群，并阐明其与肿瘤恶性进展和患者预后的关联 | 样本量相对有限（24个肿瘤和11个正常胰腺），需要更大规模的研究验证 | 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境中内皮细胞的异质性及其对临床结局的影响 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织和正常胰腺组织中的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 24个PDAC肿瘤样本和11个正常胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11215 | 2025-10-07 |
Interferon-γ signaling in eosinophilic esophagitis has implications for epithelial barrier function and programmed cell death
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.26.577407
PMID:38352458
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外器官模型探讨了干扰素-γ信号在嗜酸性粒细胞性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示EoE患者食管上皮细胞中干扰素反应特征基因上调，并通过器官模型证实IFN-γ可破坏上皮分化和屏障完整性并诱导细胞凋亡 | 研究样本量有限，主要依赖体外模型验证，需要进一步在体实验确认 | 阐明嗜酸性粒细胞性食管炎中免疫细胞与上皮细胞间的相互作用机制 | 嗜酸性粒细胞性食管炎患者的食管上皮细胞和免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 器官模型培养 | NA | 基因表达数据 | 嗜酸性粒细胞性食管炎患者食管活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11216 | 2025-10-07 |
Inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia decreases neuroinflammation after spinal cord injury
2025-Oct-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01933
PMID:39610106
|
研究论文 | 本研究通过抑制小胶质细胞中神经酰胺合酶5的表达，有效减轻脊髓损伤后的神经炎症反应 | 首次发现MG1亚群在脊髓损伤急性/亚急性期出现，并揭示神经酰胺合酶5通过NLRP3信号通路介导细胞焦亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统，人类临床应用的转化价值仍需进一步验证 | 探究小胶质细胞在脊髓损伤后神经炎症反应中的分子调控机制 | 小鼠脊髓损伤模型、PC12-BV2细胞共培养系统、小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、siRNA鞘内注射、分子抑制剂、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11217 | 2025-10-07 |
Multi-omics profiles reveal immune microenvironment alterations associated with PD-L1 checkpoint in acute pancreatitis in the early phase
2025-Mar-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151451
PMID:39922059
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示急性胰腺炎早期免疫微环境变化与PD-L1检查点的关联 | 首次整合单细胞RNA测序、数字空间分析和质谱流式细胞术系统研究急性胰腺炎早期免疫微环境变化 | 样本来源包括小鼠模型和人类患者，可能存在物种差异 | 探究急性胰腺炎早期免疫检查点PD-1/PD-L1在免疫调节中的作用机制 | 雨蛙素诱导的急性胰腺炎小鼠模型和急性胰腺炎患者 | 多组学分析 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序, 数字空间分析, 质谱流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠胰腺和血液样本，急性胰腺炎患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 质谱流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11218 | 2025-10-07 |
Deconvolution and inference of spatial communication through optimization algorithm for spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07625-8
PMID:39948133
|
研究论文 | 提出一种结合单细胞RNA测序和空间信息的空间转录组解卷积方法NODE | 开发了同时整合细胞类型特异性信息和细胞间通讯的空间解卷积算法 | NA | 改进空间转录组数据的细胞类型解卷积和空间通讯推断 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非负最小二乘法, 优化搜索算法 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11219 | 2025-10-07 |
Cryoablation-induced modulation of Treg cells and the TGF-β pathway in lung adenocarcinoma: implications for increased antitumor immunity
2025-Feb-14, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03926-1
PMID:39948553
|
研究论文 | 本研究探讨了冷冻消融通过调节Treg细胞和TGF-β通路增强肺腺癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次通过单细胞测序和动物模型系统揭示冷冻消融通过TGF-β通路抑制Treg细胞增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究样本量有限，临床观察时间较短，需要更大规模临床试验验证 | 探索冷冻消融对肺腺癌局部免疫微环境的影响及其抗肿瘤免疫机制 | 肺腺癌患者组织样本、小鼠肿瘤模型、体外细胞培养 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 细胞冷冻消融, 小鼠皮下肿瘤移植模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确具体样本数量，包括患者组织、外周血样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11220 | 2025-10-07 |
Interpretable AI for inference of causal molecular relationships from omics data
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk0837
PMID:39951525
|
研究论文 | 提出一种可解释AI方法CIMLA，用于从组学数据中推断因果分子关系 | 证明了在特定假设下，流行的特征归因模型能够估计反映变量间直接影响的因果量平均值，并基于此提出了基因调控关系的精确定义 | 需要特定假设条件才能保证因果推断的有效性 | 从高维组学数据中发现因果分子关系，识别不同生物条件下基因调控网络的差异 | 基因调控网络，阿尔茨海默病相关基因调控关系 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |