单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 11181 - 11200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11181 | 2024-08-04 |
Single-cell Profiling of Reprogrammed Human Neural Stem Cells Unveils High Similarity to Neural Progenitors in the Developing Central Nervous System
2024-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10698-3
PMID:38519702
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研究论文 | 该论文分析了转化的人类诱导神经干细胞(iNSCs)与发育中中枢神经系统神经前体细胞的相似性 | 首次通过单细胞转录组分析全面探讨了iNSCs与其生理对应物之间的关系 | 缺乏与初级来源和胚胎干细胞衍生的神经干细胞的比较分析 | 研究直接转化的iNSCs在中枢神经系统发育中的生理相关性 | 转化的人类诱导神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11182 | 2024-08-04 |
Harnessing spatial transcriptomics for advancing plant regeneration research
2024-Jul, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.02.004
PMID:38418271
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究番茄愈伤组织中不同细胞的分子特征 | 本研究展示了空间转录组学在植物生物学中推进植物再生研究的潜力 | NA | 探讨植物再生中的分子机制 | 番茄愈伤组织中的不同类型细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11183 | 2024-08-04 |
10× single-cell sequencing revealed cellular composition heterogeneity in cardiac myxoma with malignant glandular properties
2024-07, Microvascular research
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.mvr.2024.104697
PMID:38801942
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研究论文 | 本研究揭示了心脏粘液瘤的细胞组成异质性及其恶性腺体特性 | 首次通过10×单细胞测序分析心脏粘液瘤的细胞成分及其基因表达 | 样本数量有限，仅来源于4例手术切除的心脏粘液瘤 | 探究心脏粘液瘤细胞成分及其基因表达在肿瘤发展中的作用 | 4例手术切除的心脏粘液瘤样本，包含1例腺体粘液瘤和3例非腺体粘液瘤 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 10×单细胞测序 | NA | 活细胞 | 4例心脏粘液瘤样本 |
| 11184 | 2024-08-05 |
What Single Cell RNA Sequencing Has Taught Us about Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Jul, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2024.0001
PMID:38369875
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评论 | 本文概述了单细胞RNA测序技术及其在慢性阻塞性肺病中的应用和所得教训 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示慢性阻塞性肺病的细胞和分子网络 | 缺乏对慢性阻塞性肺病的病理生物学的深入理解和指导治疗的生物标志物稀缺 | 探讨慢性阻塞性肺病的分子机制和细胞网络以支持治疗发现 | 研究慢性阻塞性肺病（COPD）中的细胞和分子网络 | 数字病理学 | COPD | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11185 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of immune cells from the coronary sinus reveals immune mechanisms of the progression of persistent atrial fibrillation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110127
PMID:38966571
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研究论文 | 该文章探讨了来自冠状窦的免疫细胞在持续性心房颤动进程中的作用 | 首次通过单细胞测序揭示了持续性心房颤动患者冠状窦中免疫细胞的异质性及其与心房颤动复发的相关性 | 研究未明确提及样本量及潜在的临床应用限制 | 探索免疫细胞在持续性心房颤动进展中的作用及机制 | 持续性心房颤动患者的冠状窦免疫细胞 | 数字病理学 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞 | NA |
| 11186 | 2024-08-04 |
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae316
PMID:38960406
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研究论文 | 本研究提出了一种新的方法STGAT，利用图注意网络提高了基因表达的空间分辨率。 | STGAT方法结合了空间转录组学和大规模RNA测序数据，可以在近细胞级别预测基因表达，填补了现有数据的空白。 | 目前仅在乳腺癌样本中进行了测试，可能不适用于其他类型的癌症。 | 本研究旨在通过空间转录组学与大规模RNA测序数据结合，改进基因表达的预测。 | 研究对象为肿瘤组织样本，特别是只有WSI和大规模RNA测序数据的患者样本。 | 数字病理 | 乳腺癌 | RNA-seq | GAT | 图像 | 两个乳腺癌空间转录组数据集 |
| 11187 | 2024-08-04 |
ALKBH5-mediated m6A modification of IL-11 drives macrophage-to-myofibroblast transition and pathological cardiac fibrosis in mice
2024-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46357-x
PMID:38443404
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研究论文 | 本研究揭示了ALKBH5介导的m6A修饰如何驱动小鼠心脏巨噬细胞向肌成纤维细胞的转变及病理性心脏纤维化 | 本研究首次揭示了ALKBH5在心脏巨噬细胞转变和心脏纤维化中的作用机制，并识别了IL-11 mRNA作为ALKBH5介导的m6A去甲基化的靶标 | 本研究的结果主要基于小鼠模型，可能在临床应用上需要进一步验证 | 研究心脏巨噬细胞转变和心脏纤维化过程中ALKBH5的作用 | 心脏巨噬细胞及其在高血压诱导的病理条件下的转变 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、旁体共生技术 | NA | mRNA | 小鼠模型 |
| 11188 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-sequencing in uveal melanoma: advances in heterogeneity, tumor microenvironment and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427348
PMID:38966635
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序在葡萄膜黑色素瘤中的应用，重点关注异质性、肿瘤微环境和免疫治疗进展 | 结合生物信息学分析的单细胞RNA测序为理解肿瘤内异质性和微环境提供了新的视角，有助于发现与预后相关的分子指标 | 由于葡萄膜黑色素瘤的特殊生物学特性，免疫治疗的效果有限 | 提高葡萄膜黑色素瘤患者免疫治疗的疗效 | 葡萄膜黑色素瘤患者的肿瘤特征和微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11189 | 2024-08-05 |
A secretagogin locus of the mammalian hypothalamus controls stress hormone release
2015-Jan-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201488977
PMID:25430741
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研究论文 | 这篇文章探讨了下丘脑分泌素基因座对压力激素释放的调控机制 | 首次定义了一个新的分泌素神经元基因座和分子轴，揭示了其在压力响应中的作用 | 关于分泌素在更多类型神经元中的功能及其对长期压力反应的影响仍不明确 | 阐明调控下丘脑-垂体-肾上腺轴中CRH释放的分子机制 | 研究小型细胞与大细胞之间的相互作用以及分泌素神经元在CRH释放中的角色 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析, 蛋白质相互作用组分析 | NA | NA | NA |
| 11190 | 2024-08-04 |
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes
2024-Jul-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7402
PMID:38959321
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研究论文 | 本文研究了使用CSI-Microbes从单细胞RNA测序数据中识别微生物的管道 | 首次系统评估了多种单细胞RNA测序技术在恢复微生物唯一分子标识符的有效性 | 未提供关于样本多样性或外部验证的数据 | 开发计算管道以识别和分析肿瘤微生物组中的微生物 | 主要分析食管癌和结直肠癌患者的样本 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 食管癌和结直肠癌患者的样本 |
| 11191 | 2024-08-04 |
Leveraging a neutrophil-derived PCD signature to predict and stratify patients with acute myocardial infarction: from AI prediction to biological interpretation
2024-Jul-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05415-0
PMID:38956669
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研究论文 | 本文提出了一种中性粒细胞衍生的程序性细胞死亡（PCD）特征，旨在预测和分层急性心肌梗死（AMI）患者 | 创新地利用机器学习生成了一种预测性的中性粒细胞衍生PCD特征，并探讨了其生物机制 | 虽然探讨了中性粒细胞相关PCD的临床意义，但生物机制尚未完全阐明 | 旨在通过预测和分层急性心肌梗死患者来改善治疗管理 | 研究对象为急性心肌梗死患者的外周血样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 机器学习，单细胞转录组学，孟德尔随机化 | 随机森林 | 微阵列数据 | 五个独立的微阵列队列 |
| 11192 | 2024-08-04 |
A unified model-based framework for doublet or multiplet detection in single-cell multiomics data
2024-Jul-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49448-x
PMID:38956023
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研究论文 | 本文提出了一种基于复合泊松模型的框架，用于在单细胞多组学数据中检测多细胞聚集体。 | 创新之处在于使用复合泊松模型来检测细胞聚集体，并利用实验细胞哈希结果作为多细胞状态的真实数据。 | 本研究的局限性在于尚未涵盖所有单细胞多组学技术的整合应用。 | 研究的目的是在单细胞多组学数据中准确检测和消除多细胞聚集体。 | 研究对象为280,123个液滴的单细胞多组学数据。 | 数字病理学 | NA | DOGMA-seq | 复合泊松模型 | 数据集包含液滴信息 | 280,123个液滴来自两个组织 |
| 11193 | 2024-08-04 |
NOX4-mediated astrocyte ferroptosis in Alzheimer's disease
2024-Jul-02, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01266-w
PMID:38956702
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研究论文 | 本研究探讨了NADPH氧化酶4（NOX4）在阿尔茨海默病（AD）中对铁介导的星形胶质细胞死亡的作用 | 研究首次揭示了NOX4在阿尔茨海默病星形胶质细胞铁死亡中的关键作用 | 研究可能受到样本选择和实验条件的限制 | 研究NOX4与阿尔茨海默病相关的星形胶质细胞铁死亡机制 | 本研究的对象为阿尔茨海默病中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了AD的单细胞RNA测序数据 |
| 11194 | 2024-08-05 |
Pig blastocyst-like structure models from embryonic stem cells
2024-Jul-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00693-w
PMID:38956027
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研究论文 | 该文章报道了从猪胚胎干细胞生成类似囊胚的结构模型 | 创新点在于开发了一种新的三维两步分化策略，能够从猪胚胎干细胞生成具有胚胎特征的囊胚模型 | 该研究未提及对大型动物囊胚模型的潜在伦理问题及其在实际应用中的局限性 | 研究的目的是开发一种能够模拟早期胚胎发育的猪胚胎模型 | 研究的对象是从猪胚胎干细胞中生成的囊胚状结构 | 数字病理学 | NA | 体外培养，三维分化 | NA | 细胞，胚胎模型 | 使用了数量未具体说明的猪胚胎干细胞样本 |
| 11195 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer and scRNA-seq analyses identify a prognostic coagulation-related gene signature associated with tumor microenvironment in lower-grade glioma
2024-Jul-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01114-w
PMID:38955935
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研究论文 | 该文章通过整合泛癌症和单细胞RNA测序分析，识别出与下级别胶质瘤肿瘤微环境相关的预后凝血相关基因特征 | 本研究创新性地结合了临床特征与基因表达分析，提出了用于下级别胶质瘤预后的凝血相关基因签名 | 研究主要集中在特定癌症类型，对其他癌症类型的适用性尚需进一步验证 | 探讨凝血路径与下级别胶质瘤患者预后的关系 | 本研究聚焦于下级别胶质瘤及其他癌症类型的患者 | 数字病理 | NA | 单样本基因集富集分析（ssGSEA），LASSO回归，CIBERSORT，单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 11196 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling unveils insights into ovarian fibrosis in obese mice
2024-Jul-02, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00496-9
PMID:38956667
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研究论文 | 本研究建立了肥胖小鼠模型以探讨肥胖对卵巢微环境的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术构建了肥胖小鼠卵巢组织的单细胞图谱，揭示了功能失衡的细胞亚群和其相互作用 | 研究只在小鼠模型中进行，尚需在人类身上验证 | 探讨肥胖如何影响卵巢微环境及其与生育健康的关系 | 肥胖小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 18周饲喂的成年雌性小鼠 |
| 11197 | 2024-08-05 |
Identification of unique cell type responses in pancreatic islets to stress
2024-Jul-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49724-w
PMID:38956087
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研究论文 | 该文章分析了胰岛细胞对糖尿病相关压力的特定反应 | 通过多重单细胞RNA测序，定义了暴露于内质网和炎症压力的原代人胰岛细胞的转录特征 | 未提及具体的样本数量和来源 | 更好地表征细胞类型特异性的压力反应 | 主要研究原代人胰岛细胞在不同糖尿病相关压力下的基因表达变化 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11198 | 2024-08-04 |
Building and analyzing metacells in single-cell genomics data
2024-Jul, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00045-6
PMID:38811801
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评论 | 本文回顾了单细胞基因组学数据中元细胞的构建和分析方法 | 介绍了元细胞的概念及其在简化单细胞基因组学数据中的应用 | 未具体提到元细胞的局限性 | 探讨如何利用元细胞分析单细胞基因组学数据 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 11199 | 2024-08-04 |
Mapping the complexity and diversity of tertiary lymphoid structures in primary and peritoneal metastatic gastric cancer
2024-Jul-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009243
PMID:38955417
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研究论文 | 本文探讨了原发性胃癌和腹膜转移性胃癌中三级淋巴结构的复杂性和多样性。 | 该研究揭示了胃癌中三级淋巴结构的细胞组成和成熟状态在不同肿瘤位置和免疫环境中的显著差异。 | 该研究未讨论长时间随访的影响，可能无法全面捕捉TLS的动态变化。 | 研究三级淋巴结构对胃癌抗肿瘤免疫及预后的影响。 | 分析胃癌原发肿瘤及腹膜转移样本中的免疫细胞组成和功能。 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学和免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了来自胃癌原发肿瘤和腹膜转移的存档切除标本 |
| 11200 | 2024-08-04 |
Heterogeneous pseudobulk simulation enables realistic benchmarking of cell-type deconvolution methods
2024-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03292-w
PMID:38956606
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研究论文 | 该文章展示了一种异质性伪混合物模拟方法，以改进细胞类型去卷积方法的基准评估 | 提出了一种异质性模拟策略，以创建更具生物学变异的合成混合样本，从而增强基准测试的可靠性 | 标准方法使用随机选取的单细胞，未考虑细胞间的内在差异，导致合成混合物缺乏适当的生物学变异 | 旨在改进和评估细胞类型去卷积方法的基准测试 | 研究对象为不同去卷积方法在多个数据集上的表现 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 回归方法 | 数据集 | 八个不同的数据集 |