单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11181 - 11200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11181 | 2025-10-07 |
CoTF-reg reveals cooperative transcription factors in oligodendrocyte gene regulation using single-cell multi-omics
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07570-6
PMID:39910206
|
研究论文 | 开发了一个整合单细胞多组学数据的分析框架，用于识别少突胶质细胞中协同调控基因的转录因子对 | 提出了coTF-reg分析框架，首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据识别协同转录因子，并采用深度学习模型预测靶基因表达 | NA | 揭示少突胶质细胞中转录因子协同调控基因的机制 | 少突胶质细胞中的转录因子及其靶基因 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ChIP-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 11182 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity in small cell neuroendocrine cervical carcinoma
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07605-y
PMID:39910262
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性 | 首次绘制SCNECC的单细胞图谱，识别出四种上皮细胞亚型及其关键转录因子，发现两种不同的致癌途径 | 样本量较小（仅6个样本），需要更大规模验证 | 探索小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性和分子特征 | SCNECC癌灶和正常邻近宫颈组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，western blotting，免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质印迹数据，免疫组化数据 | 6个单细胞测序样本（68,455个高质量细胞），66例患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11183 | 2025-10-07 |
IL-23 Promotes γδT Cell Activity in Dry Eye Disease Progression
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.10
PMID:39903182
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-23通过促进γδT细胞活性在干眼病进展中的作用机制 | 首次发现结膜IL-23表达通过与其受体IL-23R相互作用调控γδT细胞增殖，从而介导干眼病炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明IL-23在干眼病发病机制中对γδT细胞的调控作用 | 小鼠结膜γδT细胞、人类γδT细胞、干眼病患者眼表细胞 | 免疫学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 野生型和γδT缺陷型小鼠模型，视觉显示终端综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 11184 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals Heterogeneity and Interactions Between Epithelial Cells and Fibroblasts in Post-ESD Oesophageal Stricture
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70411
PMID:39910700
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析食管狭窄组织的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平揭示食管ESD术后狭窄组织中上皮细胞与成纤维细胞的异质性及其相互作用机制 | 样本量有限，未能进行功能验证实验 | 探究食管ESD术后狭窄形成的分子机制 | 食管狭窄组织和正常对照组织 | 单细胞测序分析 | 食管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管狭窄样本和正常对照样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11185 | 2025-10-07 |
MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633094
PMID:39868215
|
研究论文 | 开发了一个名为MetaLigand的数据库工具，用于预测非肽配体介导的细胞间通讯 | 首个专门针对非肽配体的数据库工具，整合了从头合成和补救合成途径，改进了预测准确性 | NA | 研究非肽配体介导的细胞间通讯机制 | 233种非肽配体及其生物合成酶、转运蛋白基因和受体基因 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 转录组数据分析，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 11186 | 2025-10-07 |
Epithelial and immune transcriptomic characteristics and possible regulatory mechanisms in asthma exacerbation: insights from integrated studies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512053
PMID:39917297
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序分析哮喘急性加重期的上皮细胞和免疫细胞特征，并鉴定关键调控基因 | 首次系统性地整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示哮喘急性加重期上皮细胞和免疫细胞的异质性及关键调控基因 | 研究样本量未明确说明，需要进一步实验验证关键基因的功能机制 | 探索哮喘急性加重的上皮细胞和免疫细胞转录组特征及调控机制 | 哮喘患者的上皮细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11187 | 2025-10-07 |
Case study of a neuroendocrine tumor of uncertain origin: single-cell transcriptomics unravels potential primary location
2024-Dec-31, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06071-z
PMID:39738894
|
案例研究 | 通过单细胞转录组学技术确定一例来源不明的神经内分泌肿瘤的原发部位 | 首次将单细胞RNA测序和全外显子组测序结合用于神经内分泌肿瘤的原发部位鉴定 | 仅为一例个案研究，需要更大样本量验证 | 确定非器官局限性神经内分泌肿瘤的原发来源以指导精准诊疗 | 一例位于十二指肠和胰头之间的腹膜后非功能性神经内分泌肿瘤 | 单细胞转录组学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | 分子基因特征分类模型 | 单细胞转录组数据, 外显子组数据 | 1例神经内分泌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 11188 | 2025-10-07 |
Identification of psoriasis-associated immune marker G3BP2 through single-cell RNA sequencing and meta analysis
2024-12, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13851
PMID:39267394
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和荟萃分析识别与银屑病相关的免疫标志物G3BP2 | 首次结合单细胞RNA测序和荟萃分析方法，在细胞水平阐明银屑病潜在机制并识别关键免疫调控标志基因 | 样本量相对有限（12例患者），机制研究主要基于生物信息学分析 | 探索银屑病发病机制并识别有效治疗靶点 | 银屑病患者皮肤组织样本 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 荟萃分析, WGCNA, LASSO回归, ROC分析 | PCA, tSNE, WGCNA, LASSO | 基因表达数据 | 12例银屑病患者皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11189 | 2025-10-07 |
ITGA5+ synovial fibroblasts orchestrate proinflammatory niche formation by remodelling the local immune microenvironment in rheumatoid arthritis
2024-Nov-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225778
PMID:39486872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学鉴定了一种新型ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群，并揭示了其在类风湿关节炎炎症微环境形成中的作用机制 | 首次鉴定出CD45-CD31-PDPN+ITGA5+滑膜成纤维细胞新亚群，发现其通过分泌TGF-β1诱导naïve CD4+ T细胞分化为CXCL13hiPD-1hi外周辅助T细胞，从而重塑促炎微环境 | 研究样本量相对有限，需要更大规模队列验证；动物模型结果向人类临床转化的有效性需进一步确认 | 研究滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在类风湿关节炎炎症反应中的作用 | 骨关节炎、持续缓解期和活动期类风湿关节炎患者的滑膜组织和细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,免疫组织化学,多重免疫荧光,流式细胞术,细胞共培养,过继转移,RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 包含PEAC和R4RA两个队列的患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 11190 | 2025-10-07 |
Cell and transcriptomic diversity of infrapatellar fat pad during knee osteoarthritis
2024-Oct-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225928
PMID:39375009
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了膝关节骨关节炎中髌下脂肪垫的细胞和转录组多样性 | 首次提供了人类髌下脂肪垫的全面细胞和转录组图谱，确定了与膝关节骨关节炎、性别和肥胖状态相关的成纤维细胞关键作用 | 样本量相对有限（21个样本），需要进一步验证 | 确定髌下脂肪垫在膝关节骨关节炎中的作用及其与性别和肥胖状态的关系 | 人类髌下脂肪垫组织 | 单细胞生物学 | 膝关节骨关节炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 21个髌下脂肪垫样本（6个健康对照，15个膝关节骨关节炎供体），共82,924个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 11191 | 2025-10-07 |
NR3C2 affects the proliferation and invasiveness of colon cancer cells through the Wnt/β-Catenin signaling pathway
2024-Sep-05, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05935-8
PMID:39237674
|
研究论文 | 本研究探讨NR3C2通过Wnt/β-Catenin信号通路调控结肠癌细胞增殖和侵袭的机制 | 首次揭示NR3C2通过调控Wnt/β-Catenin信号通路影响结肠癌细胞增殖、侵袭、自噬和凋亡的分子机制 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要更多临床样本验证 | 探索NR3C2与结肠癌预后的相关性及其作用机制 | 结肠癌组织、结肠癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 生物信息学分析、慢病毒转染、CCK-8检测、Transwell实验、Western blot | 动物移植瘤模型、细胞模型 | mRNA表达数据、单细胞转录组数据、临床数据 | TCGA数据库结肠癌数据、GEO数据库单细胞数据、3对新鲜结肠癌及癌旁样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11192 | 2025-10-07 |
Stellate cells are in utero markers of pancreatic disease in cystic fibrosis
2024-Aug-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00871-2
PMID:39112965
|
研究论文 | 本研究利用绵羊囊性纤维化模型探究胰腺疾病在妊娠期的演变过程 | 首次在囊性纤维化动物模型中通过单细胞RNA测序鉴定出星状细胞在妊娠期显著过度富集 | 研究仅限于动物模型，需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究囊性纤维化胰腺疾病的发病机制和演变过程 | 囊性纤维化绵羊模型的胎儿胰腺组织 | 单细胞组学 | 囊性纤维化 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 妊娠期6个时间点的胎儿胰腺样本（从50天到足月） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11193 | 2025-10-07 |
Unravelling CD4+ T cell diversity and tissue adaptation of Tregs in abdominal aortic aneurysms through single-cell sequencing
2024-08, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13796
PMID:38637948
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的多样性及调节性T细胞的组织适应性 | 首次发现腹主动脉瘤中调节性T细胞的组织特异性表型是在主动脉中获得的，并识别了其前体细胞 | NA | 探究腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的异质性和调节性T细胞的发育机制 | 从腹主动脉瘤主动脉和脾脏分离的CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11194 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of bronchoalveolar cells reveals a Th17 signature in neutrophilic severe equine asthma
2024-04, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13745
PMID:38153159
|
研究论文 | 通过单细胞mRNA测序分析马支气管肺泡细胞，揭示中性粒细胞性重度马哮喘中存在显著的Th17免疫特征 | 首次在重度马哮喘中通过单细胞测序发现显著的Th17免疫反应特征，并鉴定出单核-淋巴细胞复合物及CXCL13在中间单核细胞中的上调 | 样本量较小（11匹马），使用冷冻保存的细胞可能影响细胞活性 | 揭示重度马哮喘的免疫驱动机制 | 温血马的支气管肺泡细胞 | 单细胞测序分析 | 哮喘 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 11匹温血马（5匹对照，6匹SEA患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11195 | 2025-10-07 |
Modeling primitive and definitive erythropoiesis with induced pluripotent stem cells
2024-03-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011708
PMID:38290102
|
研究论文 | 利用诱导多能干细胞建模原始和终末红细胞生成过程 | 首次通过同源基因背景的iPSCs直接比较原始和终末红细胞的差异，并利用KLF1突变模型验证终末红细胞特异性表型变化 | 研究主要基于体外分化系统，可能与体内真实发育环境存在差异 | 比较原始和终末红细胞生成的功能特性和分子机制差异 | 人诱导多能干细胞分化的红细胞和胎儿肝脏来源的红细胞 | 干细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11196 | 2025-10-07 |
Investigating adverse genomic and regulatory changes caused by replacement of the full-length CFTR cDNA using Cas9 and AAV
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102134
PMID:38384445
|
研究论文 | 评估使用Cas9和AAV替换CFTR全长cDNA引起的基因组和调控变化的安全性 | 首次全面评估CFTR基因替换策略的基因组安全性，结合CAST-seq、ATAC-seq和scRNA-seq多组学分析 | 研究样本量有限，主要关注特定基因座的变化，长期安全性仍需验证 | 评估基于Cas9和AAV的CFTR基因替换治疗策略的安全性 | 囊性纤维化患者的气道基底干细胞 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR-Cas9基因编辑, AAV载体, CAST-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组测序数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 11197 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041
PMID:39916959
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3技术揭示葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性，并识别预后生物标志物 | 首次构建葡萄膜黑色素瘤特异性基因特征，结合单细胞分辨率的细胞因子反应词典和AlphaFold 3蛋白结构预测 | 样本量有限，主要基于TCGA-UVM和GSE84976队列验证 | 阐明葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性并识别预后生物标志物 | 原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, ROC曲线分析, 伪时间轨迹映射, CRISPR-Cas9筛选, AlphaFold 3结构预测 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | TCGA-UVM和GSE84976队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11198 | 2025-10-07 |
M2 macrophages drive leukemic transformation by imposing resistance to phagocytosis and improving mitochondrial metabolism
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8522
PMID:37058562
|
研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞通过降低吞噬活性和增强线粒体代谢促进急性髓系白血病转化的机制 | 首次发现M2巨噬细胞通过线粒体转移和代谢重编程保护白血病原始细胞免受吞噬，增强其体内转化潜能 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步深入 | 探究肿瘤微环境中免疫细胞如何促进急性髓系白血病的恶性进展 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病原始细胞 | 肿瘤免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | 急性髓系白血病患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11199 | 2025-10-07 |
Piezo inhibition prevents and rescues scarring by targeting the adipocyte to fibroblast transition
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535302
PMID:37066136
|
研究论文 | 本研究揭示了脂肪细胞通过机械传感转化为成纤维细胞驱动伤口纤维化的机制 | 首次证明机械力足以驱动脂肪细胞向成纤维细胞转化，并发现Piezo抑制可预防和挽救疤痕形成 | 研究主要基于小鼠模型和新型人源异种移植伤口模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究脂肪细胞在疤痕形成中的作用及其治疗潜力 | 脂肪细胞、成纤维细胞、伤口愈合过程 | 细胞生物学 | 皮肤疤痕 | 克隆谱系追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学、CODEX多标检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多标成像数据 | 小鼠伤口模型和人类异种移植伤口模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 11200 | 2025-10-07 |
SK3 in POMC neurons plays a sexually dimorphic role in energy and glucose homeostasis
2022-Oct-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00907-2
PMID:36210455
|
研究论文 | 本研究揭示了POMC神经元中SK3通道在能量和葡萄糖稳态中具有性别二态性作用 | 首次发现SK3在POMC神经元中对能量和葡萄糖稳态的调控存在性别差异，且与体重控制无关 | 研究仅限于小鼠模型，具体分子机制尚未完全阐明 | 探究POMC神经元中SK3通道在能量和葡萄糖稳态中的性别二态性作用 | 小鼠POMC神经元 | 神经科学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,Cre-loxP基因敲除技术,电生理记录 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,电生理数据,行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |