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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2026-06-05 |
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525673123
PMID:41665992
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研究论文 | 结合组织病理学分析、空间转录组学和单核RNA测序,绘制人类小脑伯格曼胶质细胞的发育图谱,揭示其时空组织动态及分子特征 | 首次揭示人类小脑伯格曼胶质细胞在11孕周出现,并发现其与浦肯野细胞形成独特的三层结构(含层间分离层),该结构可能为人类特有 | 研究主要基于组织样本的转录组分析,未进行功能验证实验 | 解析人类小脑发育过程中伯格曼胶质细胞的时空起源、分子身份及细胞谱系 | 人类小脑发育过程中的伯格曼胶质细胞及其前体细胞 | 数字病理学, 单细胞组学 | 神经发育疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 组织病理学, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 多个发育时间点的人类小脑组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学平台, 10x Chromium 单核RNA测序平台 |
| 1102 | 2026-06-05 |
TNF-⍺-mediated myeloid-instructed CD14+CD4+ T cells are associated with poor survival in lung adenocarcinoma
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102593
PMID:41666923
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研究论文 | 本文通过空间多组学分析非小细胞肺癌,发现TNF-α介导的CD14+CD4+ T细胞与患者生存率低相关 | 首次发现髓系细胞通过吞噬作用诱导形成CD14+CD4+ T细胞,并揭示TNF-α信号在此过程中的关键作用 | 未明确描述局限性 | 探究髓系驱动的免疫抑制机制,为改善肺癌免疫治疗提供新靶点 | 非小细胞肺癌组织及邻近非恶性肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、空间多组学 | NA | 图像、文本 | 非小细胞肺癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1103 | 2026-06-05 |
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03726-1
PMID:41664072
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研究论文 | 研究发现GPR35通过与Raf1的CR2结构域结合,在缺血性脑卒中中保护免受再灌注损伤 | 首次揭示GPR35通过与Raf1的CR2结构域直接结合来调节Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路,从而减轻缺血再灌注损伤和神经炎症 | 该研究主要基于小鼠模型,有待在人体中验证;且未完全阐明GPR35活化的下游分子机制细节 | 探究GPR35在缺血性脑卒中小鼠模型再灌注损伤中的作用及其分子机制 | 缺血性脑卒中小鼠模型中的小胶质细胞 | 生物医学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞测序,共免疫沉淀 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1104 | 2026-06-05 |
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01419-8
PMID:41665703
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research paper | 通过整合多组学数据和机器学习,识别出TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 | 首次探究血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用多组学整合和机器学习方法鉴定出关键衰老相关基因TGFB1和SERPINE1 | TGFB1和SERPINE1的具体机制仍需进一步研究和验证 | 识别颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的关键调控基因及潜在生物标志物 | 颅内动脉瘤患者和弹性蛋白酶诱导的小鼠动脉瘤模型 | machine learning | cerebrovascular disease | RNA-seq | NA | single-cell RNA sequencing data, bulk RNA sequencing data, microarray data | 小鼠颅内动脉瘤模型(GSE193533)和人类组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1105 | 2026-06-05 |
Combining Spatial Transcriptomics and Machine Learning Unravels Fibroblast-Related Biomarkers in Ulcerative Colitis
2026-Feb-10, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02387-1
PMID:41665828
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研究论文 | 结合空间转录组学和机器学习揭示溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关的生物标志物 | 首次将空间转录组学与机器学习联合分析,鉴定出成纤维细胞相关生物标志物ANGPTL2,并通过体内外实验验证其作为非侵入性诊断指标和治疗靶点的潜力 | 未提供明确的局限性说明 | 探索成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的作用并鉴定诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者和DSS诱导的UC小鼠模型 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 机器学习, IF, ELISA, WB | 机器学习模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个数据集(GSE114374, GSE231993, GSE189184)及UC患者血清样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1106 | 2026-06-05 |
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68802-9
PMID:41667466
|
研究论文 | 通过报告基因追踪和单细胞转录组学,揭示了海葵中成年神经发生的两种不同机制 | 首次在海葵中发现两种不同的成年神经发生模式:多能祖细胞直接分化为肽能神经元,以及刺细胞(特化的刺胞动物神经细胞)的逐步成熟过程 | 对神经命运决定过程中转录调控机制的详细解析仍有待深入 | 阐明刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录程序 | 海葵(Nematostella vectensis) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年海葵样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1107 | 2026-06-05 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
|
研究论文 | 提出了Seq-Scope-X技术,通过组织膨胀突破光学分辨率限制,实现了亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 首次将组织膨胀与亚微米级空间测序结合,显著减少转录扩散效应并将空间特征密度提高一个数量级,同时兼容空间蛋白质组学分析 | 未详细说明组织膨胀对RNA完整性的潜在影响及不同组织类型的适用性差异 | 开发超越光学分辨率的超高通量空间组学技术以解析细胞微环境 | 小鼠肝脏、脑、结肠组织及人类扁桃体组织中的单细胞和空间亚细胞结构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学,组织膨胀技术 | NA | 空间基因表达数据,空间蛋白标记数据 | 小鼠肝脏、脑、结肠组织样本及人类扁桃体组织样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于Seq-Scope平台的亚微米分辨率空间组学技术,结合组织膨胀实现超越光学分辨率的分析 |
| 1108 | 2026-06-05 |
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06788-1
PMID:41667502
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据集分析了小鼠创伤性脑损伤及基于NeuroD1的基因治疗的效果 | 首次利用单细胞RNA测序揭示NeuroD1基因治疗在创伤性脑损伤中对细胞组成和星形胶质细胞亚型的显著影响,并阐明了其恢复线粒体和代谢功能、抑制异常突触和髓鞘化过程的分子机制 | 论文未明确说明局限性,但可能包括样本量较小、仅使用小鼠模型以及未完全阐明所有潜在机制 | 阐明创伤性脑损伤中基于NeuroD1的基因治疗的分子和细胞机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型及NeuroD1基因治疗后的脑组织细胞 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用皮质刺伤小鼠模型的创伤性脑损伤样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1109 | 2026-06-05 |
ICE: robust detection of cellular senescence from weak single-cell signatures using imputation-based marker refinement
2026-Feb-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03997-0
PMID:41668152
|
研究论文 | 提出了一种基于插值的细胞衰老检测框架ICE,用于从弱单细胞信号中稳健识别衰老细胞 | 通过整合表达插值与标记物细化,克服了经典衰老标记物表达弱且非特异性的限制,实现了对单细胞RNA-seq数据中衰老细胞的准确检测 | 可能依赖于特定插值方法,且在异质性较高的组织中的表现有待进一步验证 | 开发一种能可靠检测单细胞RNA-seq数据中衰老细胞的计算方法 | 胰腺β细胞和阿尔茨海默病样本中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 计算框架(插值与标记物细化) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1110 | 2026-06-05 |
Mouse skeletal muscle satellite cells co-opt the tenogenic gene Scleraxis to instruct regeneration
2026-Feb-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95854
PMID:41660703
|
研究论文 | 本研究揭示小鼠骨骼肌卫星细胞利用腱生成相关基因Scleraxis指导肌肉再生过程 | 首次证明腱生成相关转录因子Scx在成体肌肉干细胞中激活并功能性地调控肌肉再生,为肌肉再生与肌腱发育共享分子机制提供新视角 | 仅基于小鼠模型,尚需验证在人类肌肉再生中的保守性;未完全解析Scx在卫星细胞与其他细胞类型间的协同机制 | 探究腱生成相关基因Scleraxis在成体骨骼肌再生中的表达模式与功能作用 | 成年小鼠骨骼肌卫星细胞及其再生过程中的肌肉、肌腱组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、CUT&RUN | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1111 | 2026-06-05 |
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09659-y
PMID:41663685
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研究论文 | DANST框架利用深度域对抗神经网络实现空间转录组学中的细胞类型反卷积 | 首次将深度域对抗神经网络应用于空间转录组学细胞类型反卷积,通过整合单细胞RNA测序与推断空间坐标构建伪空间数据,并利用变分自编码器和域对抗架构实现特征对齐与准确标签迁移 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够从混合基因表达数据中恢复细胞类型比例的空间转录组学反卷积框架 | 人类和小鼠数据集 | 机器学习 | 肿瘤微环境分析 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 深度域对抗神经网络, 变分自编码器 | 基因表达数据, 空间坐标 | 人类和小鼠数据集(未提供具体样本数量) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1112 | 2026-06-05 |
Loss of mechanical stress induces synovitis, fibrosis and articular cartilage degeneration via distinct synovial cell subsets
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39416-4
PMID:41663755
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研究论文 | 本研究揭示了机械应力缺失如何通过不同的滑膜细胞亚群导致滑膜炎、纤维化和关节软骨退化 | 利用最小机械应力小鼠模型首次阐明滑膜和软骨变化的时序机制,并识别出Lrrc15肌成纤维细胞和Mmp9巨噬细胞作为关键亚群 | 未说明具体限制 | 探究机械应力缺失导致关节功能障碍的分子机制 | 最小机械应力小鼠模型的关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 组织学检查 | NA | 基因表达数据, 组织学图像 | 小鼠模型,具体样本数量未说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于bulk RNA-seq和scRNA-seq的测序平台 |
| 1113 | 2026-06-05 |
A novel nanotherapeutic strategy: rescuing nucleus pulposus cells from fatty acid metabolic disorder and pyroptosis through ACOT13 by Chinese herbal formula nanoparticles
2026-Feb-08, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04104-y
PMID:41656235
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research paper | 通过单细胞测序和多组学分析,研究脂肪酸代谢在椎间盘退变中的作用,并开发基于中药方剂的纳米颗粒治疗策略 | 首次发现ACOT13通过抑制AMPK/ACC信号通路导致脂肪酸代谢紊乱和细胞焦亡,加速椎间盘退变;创新性利用中药方剂自组装纳米颗粒调控ACOT13功能 | 未提及 | 探索脂肪酸代谢在椎间盘退变中的新机制并开发基于中药纳米颗粒的逆转退变疗法 | 临床样本中的髓核细胞 | machine learning | 椎间盘退变 | 单细胞测序, 多组学分析, 分子动力学模拟 | NA | 序列数据, 临床样本数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 1114 | 2026-06-05 |
Integrating multi-omics analysis identifies DNA damage-related gene CLSPN as a biomarker in gastric cancer
2026-Feb-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39387-6
PMID:41656416
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研究论文 | 通过多组学分析识别胃腺癌中DNA损伤相关基因CLSPN作为生物标志物 | 首次整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和免疫组化实验,系统筛选并验证CLSPN在胃腺癌中的诊断潜力,突出其细胞类型特异性表达 | 仍需在临床评估中进一步验证其在胃腺癌管理策略中的实际价值 | 探索DNA损伤相关基因与胃腺癌的关联,为其分子机制和潜在生物标志物提供见解 | 胃腺癌患者样本 | 机器学习、数字病理学 | 胃腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 多种机器学习方法(未具体指定) | 基因表达数据,单细胞表达数据,免疫组化图像 | NA | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1115 | 2026-06-05 |
Spatial transcriptomics identifies IL-32 as a lipid droplet-associated cytokine linked to tubular injury in human diabetic kidney disease
2026-Feb-07, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02192-y
PMID:41653322
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研究论文 | 通过空间转录组学技术发现脂滴相关细胞因子IL-32与人糖尿病肾病肾小管损伤相关 | 首次将IL-32鉴定为脂滴相关细胞因子,并揭示其作为脂质代谢与炎症反应之间的分子桥梁在糖尿病肾病进展中的作用 | NA | 探究脂质积累与炎症信号在糖尿病肾病肾小管损伤中的分子联系 | 不同病理等级的糖尿病肾病患者肾活检样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、数字空间分析、RNA scope、免疫荧光显微镜 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 14例不同病理等级的糖尿病肾病患者样本 | NA | 空间转录组学、单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1116 | 2026-06-05 |
Mitochondria-targeted nanozyme system for psoriasis treatment
2026-Feb-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04068-z
PMID:41652629
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研究论文 | 开发了一种多功能脂质体水凝胶纳米平台用于银屑病的靶向治疗,通过抗氧化和抗炎双重机制发挥作用 | 首次将线粒体靶向纳米酶与网络药理学、转录组学和单细胞测序技术相结合,揭示ROS/mTOR/HIF-1α轴在银屑病中性粒细胞调控中的关键作用 | 研究仅基于IMQ诱导的银屑病小鼠模型,尚需在人类临床样本中验证疗效 | 开发一种新型纳米治疗策略用于银屑病及相关慢性炎症性皮肤病的治疗 | 银屑病样皮肤炎症的机制及CMH@lip@Res-TCeO纳米平台的疗效 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 转录组学 | NA | 转录组数据 | IMQ诱导的银屑病样小鼠模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1117 | 2026-06-05 |
Ex vivo long-term expansion of human hematopoietic stem and progenitor cells as a tool for modeling vector integration sites and clonality
2026-Feb-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07700-6
PMID:41654907
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研究论文 | 本研究利用小分子APU实现人类造血干祖细胞的离体长期扩增,以模拟载体整合位点及克隆性,用于基因治疗前的基因毒性评估 | 首次使用APU组合小分子实现人脐带血HSPCs的长期离体扩增和培养,结合整合位点分析动态追踪致突变性载体插入导致的克隆扩增,替代传统小鼠模型进行人类特异的基因毒性测试 | 离体模型与体内骨髓环境的克隆多样性尚有差异,且仅验证了脐带血来源的HSPCs,其他来源细胞(如骨髓或动员外周血)未提及 | 开发基于人类HSPCs的新型体外基因毒性检测方法,通过长期培养监测整合位点克隆性变化,预测插入突变风险 | 人脐带血来源的造血干祖细胞 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 慢病毒转导, 单细胞RNA测序, 整合位点分析, 异种移植 | NA | 基因表达数据, 整合位点序列数据 | 脐带血来源HSPCs(未明确定量),5周体外培养和1次异种移植(小鼠骨髓样本) | 10x Genomics, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, 10x Chromium | 单细胞RNA测序采用10x Chromium平台进行文库构建 |
| 1118 | 2026-06-05 |
Azoospermia phenotype and scRNA-seq reveal hnRNPK as a factor essential for male germ cell development in mice
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag108
PMID:41665013
|
研究论文 | 通过生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型结合多组学分析,发现hnRNPK是维持分化精原细胞正常发育的关键因子,揭示其在转录后水平调控雄性生殖细胞发育的机制 | 首次阐明hnRNPK在分化精原细胞中通过细胞质(与DAZL互作调控翻译起始)和细胞核(参与剪接)双重机制调控生殖细胞发育,填补了转录后调控在精子发生中的认识空白 | 当前信息未提及具体局限性,但基于模型可能包括:仅在小鼠模型验证、未探究人类患者中hnRNPK突变、多组学整合深度有限等 | 研究hnRNPK在雄性生殖细胞发育中的功能及分子机制 | 生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型的分化精原细胞 | 机器学习 | 无精症 | scRNA-seq, 多组学分析, 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 翻译效率数据, 剪接数据 | 成年生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠与对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1119 | 2026-06-05 |
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signalling, in Aged Hippocampus
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70232
PMID:41656949
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研究论文 | 该研究探讨了鼻内给予人类诱导多能干细胞衍生的神经干细胞胞外囊泡对老年小鼠海马神经炎症的影响 | 首次证明鼻内给予hiPSC-NSC-EVs可通过miRNA抑制NLRP3和cGAS-STING信号通路,减轻老年海马神经炎症并改善认知功能 | NA | 评估鼻内给予hiPSC-NSC-EVs对中年晚期小鼠海马神经炎症的治疗效果及其机制 | 18月龄C57BL6/J小鼠(雄性和雌性) | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、胞外囊泡治疗 | NA | 基因表达数据 | 18月龄小鼠,接受两次鼻内给药后于20.5月龄分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序7天后进行转录组分析 |
| 1120 | 2026-06-05 |
Integrative cross-tissue and spatially resolved single-cell profiling uncovers tumour-educated inflammatory remodelling of tissue-resident macrophage ecosystem with immunotherapeutic prognostic significance in pan-cancer
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70608
PMID:41655028
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研究论文 | 通过整合跨组织和空间分辨的单细胞图谱,揭示泛癌组织中组织驻留巨噬细胞受肿瘤教育后的炎症重塑及免疫治疗预后意义 | 首次构建跨组织单细胞图谱揭示组织驻留巨噬细胞在泛癌中的保守炎症表型,发现组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞在肿瘤微环境中趋同分化形成炎症表型,并开发具有临床转化潜力的预后生物标志物 | 未提及具体局限性,但研究主要依赖公共数据库,且验证样本类型有限 | 阐明组织驻留巨噬细胞在肿瘤微环境中的功能重编程机制及其对免疫治疗预后的影响 | 从五种恶性肿瘤中收集的139万单细胞转录组数据和2318个批量RNA-seq样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量RNA-seq数据 | 139万单细胞和2318个批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |