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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-10-05 |
Imputing abundance of over 2,500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-Sep-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.08.006
PMID:39243755
|
研究论文 | 提出一种名为SPIDER的上下文无关零样本深度集成模型，用于从单细胞转录组数据预测超过2,500种表面蛋白的丰度 | 开发了首个上下文无关的零样本深度集成模型，能够大规模预测表面蛋白丰度并在不同背景下具有更好的泛化能力 | 未明确说明模型在更广泛疾病类型和组织中的验证情况 | 开发能够从单细胞转录组数据准确预测表面蛋白丰度的计算方法 | 单细胞表面蛋白和转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | 深度集成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1102 | 2025-10-05 |
Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics
2024-Aug, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2024-100067
PMID:39149129
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析慢性乙型肝炎患者肝活检样本，揭示HBV与HDV/HIV共感染时的肝内转录景观和免疫特征 | 首次应用空间转录组学技术系统分析HBV与HDV/HIV共感染患者的肝内转录组特征和细胞组成 | 样本量较小（仅3例初治患者），属于原理验证性研究 | 评估空间转录组学在表征HBV与HDV/HIV共感染患者肝内转录景观、细胞组成和生物通路中的应用价值 | 慢性HBV感染患者的福尔马林固定石蜡包埋肝活检样本 | 空间转录组学 | 乙型肝炎 | 空间转录组学，数字空间分析 | 加权基因共表达网络分析 | 空间转录组数据 | 3例初治慢性HBV与HDV/HIV共感染患者 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx数字空间分析平台 | GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas检测 |
| 1103 | 2025-10-05 |
Reproducible single cell annotation of programs underlying T-cell subsets, activation states, and functions
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592310
PMID:38746317
|
研究论文 | 开发了T细胞注释工具TCAT，用于在单细胞水平量化T细胞的基因表达程序 | 提出了TCAT分析框架，能够同时量化预定义的基因表达程序，揭示了46个可重复的T细胞功能程序 | NA | 改进T细胞特征分析框架，解决传统分类与单细胞数据连续状态不匹配的问题 | T细胞亚群、激活状态和功能 | 单细胞分析 | COVID-19, 癌症 | 单细胞RNA测序 | TCAT分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 170万个T细胞，来自700名个体的38种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1104 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-01-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1105 | 2025-10-05 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高脂饮食对小鼠垂体转录组的影响，揭示性别差异在氧化应激反应中的作用 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞转录组学分析垂体细胞对肥胖应激的性别特异性反应 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景 | 探究肥胖引起的氧化应激对垂体细胞功能的性别特异性影响 | FVB.129P品系雄性和雌性小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10-15周高脂饮食处理的雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1106 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-11-02, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad159
PMID:37897495
|
研究论文 | 本研究通过建立内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，揭示了脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型乳腺癌的治疗脆弱点 | 首次建立了两种不同表型的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，并发现GPX4抑制剂与抗HER2药物联合可显著诱导细胞死亡 | 研究仅基于体外细胞模型，尚未进行体内动物实验验证 | 识别内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱点 | BT-474和MDA-MB-361乳腺癌细胞系及其长期雌激素剥夺耐药变体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 2种乳腺癌细胞系及其耐药变体 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 1107 | 2025-10-05 |
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2023-100020
PMID:38074919
|
综述 | 概述慢性肝病（酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌）的发病机制研究进展及潜在治疗靶点 | 重点探讨非编码RNA、自噬、肝外信号传导和巨噬细胞在肝病中的作用，并讨论单细胞RNA测序技术的应用 | 基于学术会议内容整理，未涉及原始研究数据 | 深入理解慢性肝病的发病机制并探索治疗靶点 | 酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌 | 肝病学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1108 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554116
PMID:37662291
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研究论文 | 本研究开发并表征了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型，以识别潜在的治疗脆弱性 | 建立了两种不同的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，首次发现脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型耐药乳腺癌的脆弱性 | 研究基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证 | 识别内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱性 | HER2+/ER+乳腺癌细胞系 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 两种乳腺癌细胞系(BT-474和MDA-MB-361)及其长期雌激素剥夺衍生株 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 1109 | 2025-10-05 |
Cellular Atlas of Senescent Lineages in Radiation- or Immunotherapy-Induced Lung Injury by Single-Cell RNA-Sequencing Analysis
2023-08-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.02.005
PMID:36792015
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了放疗或免疫疗法诱导肺损伤中衰老细胞谱系的细胞图谱 | 首次系统识别了肺损伤中30种不同细胞亚群，发现衰老样成纤维细胞是主要的共同病理机制 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明免疫疗法和放疗诱导肺损伤的细胞机制 | C57/BL6小鼠肺组织、人类和小鼠细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、多重免疫组织化学 | Seurat, Cellchat, Monocol, SCENIC | 单细胞转录组数据、组织染色图像 | 75,396个细胞，多个时间点(7,30,60天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1110 | 2025-10-05 |
CCL5-producing migratory dendritic cells guide CCR5+ monocytes into the draining lymph nodes
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20222129
PMID:36946983
|
研究论文 | 本研究揭示了分泌CCL5的迁移性树突状细胞通过CCR5引导单核细胞进入引流淋巴结的新机制 | 首次发现迁移性cDCs通过分泌CCL5引导表达CCR5的单核细胞进入淋巴结，突破了仅CCR7依赖迁移的传统认知 | 研究主要基于小鼠模型，在人体中的适用性需要进一步验证 | 探究单核细胞在缺乏CCR7表达情况下如何进入引流淋巴结的机制 | 树突状细胞、单核细胞、淋巴结单核吞噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用多种基因缺陷小鼠模型（Ccl5、Ccr2、Ccr5、Ccr7、Batf3缺陷型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1111 | 2025-10-05 |
Diagnostic Evidence GAuge of Single cells (DEGAS): a flexible deep transfer learning framework for prioritizing cells in relation to disease
2022-02-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01012-2
PMID:35105355
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研究论文 | 提出一种名为DEGAS的深度迁移学习框架，可将疾病信息从患者层面迁移到细胞层面 | 引入'印象'概念作为可迁移信息，将个体细胞与疾病属性关联 | 仅使用模拟数据和有限的实际数据集进行验证 | 开发能够将疾病信息从患者迁移到细胞的深度学习框架 | 单细胞和患者批量组织转录组数据 | 机器学习 | 多形性胶质母细胞瘤,阿尔茨海默病,多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 深度迁移学习 | 转录组数据 | 十个不同的单细胞和患者批量组织转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1112 | 2025-10-05 |
IV Immunoglobulin Is Associated With Epigenetic, Ribosomal, and Immune Changes in Pediatric Acute-Onset Neuropsychiatric Syndrome
2025-Nov, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200467
PMID:40953324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析静脉注射免疫球蛋白对儿童急性发作神经精神综合征患者外周免疫细胞基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示PANS患者接受IVIg治疗前后的表观遗传、核糖体和免疫通路变化 | 样本量较小（5例患者，4例对照），采用开放性标签设计 | 研究IVIg对PANS患者细胞特异性基因表达的影响 | 儿童急性发作神经精神综合征患者的外周免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 儿童急性发作神经精神综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5名PANS儿童患者（治疗前后配对样本）和4名对照儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1113 | 2025-10-05 |
Chd4 remodels chromatin to control retinal cell type specification and lineage termination
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204697
PMID:40905097
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研究论文 | 本研究通过构建视网膜特异性Chd4条件性敲除小鼠，揭示了Chd4依赖的核小体重塑在视网膜细胞类型时序性生成和谱系终止中的关键作用 | 首次证明Chd4通过重塑染色质可及性调控视网膜发育的时序性转换，特别是对谱系终止过程的特异性调控 | 研究主要聚焦于Chd4在视网膜发育中的作用，未涉及其他神经发育过程；机制研究主要基于基因组可及性分析，功能验证有待深入 | 探究染色质重塑因子Chd4在神经前体细胞时序性分化中的调控机制 | 小鼠视网膜发育过程中的神经前体细胞和分化细胞类型 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN-seq, ATAC-seq, 单细胞转录组测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因组可及性数据，单细胞转录组数据 | 视网膜特异性Chd4条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 1114 | 2025-10-05 |
APOE deficiency inhibits amyloid-facilitated (A) tau pathology (T) and neurodegeneration (N), halting progressive ATN pathology in a preclinical model
2025-Oct, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03036-7
PMID:40307424
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研究论文 | 本研究通过临床前模型证明APOE缺陷可抑制淀粉样蛋白驱动的tau病理和神经退行性变 | 首次在ATN模型中系统证明APOE缺陷通过多效性机制抑制淀粉样蛋白驱动的tau病理进展 | 研究基于小鼠模型，需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究APOE在淀粉样蛋白促进的tau病理和神经退行性变中的作用机制 | 5xFAD与TauP301S杂交小鼠构建的ATN模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,组织染色 | 动物模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1115 | 2025-10-05 |
Functional defects in FOXG1 variants predict the severity of brain anomalies in FOXG1 syndrome
2025-Oct, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03077-y
PMID:40524015
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研究论文 | 本研究通过分析FOXG1基因变异的功能缺陷与大脑异常严重程度之间的关联，建立了FOXG1综合征患者分层预测模型 | 首次结合蛋白表达、COUP-TFI抑制能力和神经元迁移功能评估，建立了能够预测FOXG1综合征严重程度的患者分层范式 | 样本量较小（仅14名患者），需要在更大队列中验证模型的普适性 | 探究FOXG1基因变异功能缺陷与大脑异常严重程度的关系，建立患者分层预测方法 | 14名FOXG1变异患者、小鼠胚胎大脑 | 神经发育疾病研究 | FOXG1综合征 | 荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA测序、子宫内电穿孔 | NA | 基因测序数据、蛋白表达数据、脑成像数据 | 14名FOXG1变异患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1116 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics exploration of the primary neuroblastoma microenvironment in archived FFPE samples unveils novel paracrine interactions
2025-Oct, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6457
PMID:40778592
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索存档FFPE样本中神经母细胞瘤微环境的细胞间通讯 | 首次在存档FFPE样本中应用空间转录组学技术，发现神经母细胞瘤微环境中新的旁分泌相互作用和信号轴 | 研究仅基于两名患者的样本，样本量有限 | 探索神经母细胞瘤微环境的空间异质性和细胞间通讯机制 | 高风险神经母细胞瘤患者的存档FFPE组织样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 2名患者（未经治疗和化疗治疗的高风险神经母细胞瘤） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1117 | 2025-10-05 |
The immune landscape of pediatric (extra)cranial solid tumors: A systematic review and integration of immunohistochemistry and single-cell RNA sequencing data
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115708
PMID:40857838
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系统综述 | 通过整合免疫组织化学和单细胞RNA测序数据，系统分析儿童颅内外实体肿瘤的免疫景观 | 首次系统整合IHC和sc/snSeq数据，提供儿童肿瘤免疫景观的综合图谱，并与成人肿瘤进行对比 | 分析方法存在变异性，部分肿瘤类型样本量有限 | 阐明儿童实体肿瘤的独特免疫特征，为改进儿童免疫治疗策略提供依据 | 儿童颅内外实体肿瘤 | 数字病理学 | 儿童实体肿瘤 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 图像,基因表达数据 | 47项IHC研究(2187个肿瘤样本),26项sc/snSeq研究(272个肿瘤样本),共35种儿童肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 1118 | 2025-10-05 |
Screening and Validation of Genes Associated With Lysosomal-Dependent Cell Death in Colorectal Cancer
2025-Sep-18, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70024
PMID:40964747
|
研究论文 | 本研究通过筛选与溶酶体依赖性细胞死亡相关的基因，构建了结直肠癌预后风险模型 | 首次系统分析溶酶体依赖性细胞死亡相关基因在结直肠癌中的预后价值，并构建包含ATP6V0A4、CLU和IL13RA2的多基因风险模型 | 研究基于公共数据库和有限临床样本，需要进一步实验验证 | 鉴定结直肠癌中与溶酶体依赖性细胞死亡相关的潜在治疗靶点和预后标志物 | 结直肠癌患者和正常组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序，Cox回归分析，LASSO分析，富集分析 | Cox风险比例模型，LASSO回归模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA-CRC和GSE17538数据集，外加临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1119 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics of intraductal carcinoma of the prostate
2025-Sep-18, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15551
PMID:40964799
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析前列腺导管内癌的基因表达谱和拷贝数变异 | 首次使用Visium空间基因表达平台对前列腺导管内癌进行空间转录组学分析，揭示了IDC-P的独特分子特征 | 样本量较小(n=6)，需要更大规模研究验证 | 表征前列腺导管内癌的分子特征及其与预后的关系 | 前列腺导管内癌组织和邻近非导管内癌组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学，拷贝数变异分析，差异基因表达分析 | 主成分分析，InferCNV | 空间基因表达数据 | 6例前列腺癌患者样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium Spatial Gene Expression平台 |
| 1120 | 2025-10-05 |
KC1036, a multi-kinase inhibitor with anti-angiogenic activity, can effectively suppress the tumor growth of Ewing sarcoma
2025-Sep-18, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10008-6
PMID:40965696
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析绘制尤文肉瘤细胞通讯网络，并验证多激酶抑制剂KC1036在临床前模型中的抗肿瘤效果 | 首次绘制尤文肉瘤单细胞水平的细胞通讯网络图谱，并发现新型多激酶抑制剂KC1036对尤文肉瘤具有显著抑制作用 | 研究仅限于临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 开发尤文肉瘤的替代治疗策略 | 尤文肉瘤细胞系、细胞系来源异种移植模型和患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | CDX模型, PDX模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |