单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2026-05-03 |
Novel biallelic MCMDC2 variants were associated with meiotic arrest and nonobstructive azoospermia
2025-03-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202495
PMID:39789727
|
研究论文 | 通过全外显子组测序发现MCMDC2基因双等位基因变异与减数分裂停滞和非梗阻性无精症相关 | 首次在非梗阻性无精症患者中鉴定了MCMDC2基因的四种双等位基因有害变异，并揭示其导致减数分裂停滞和精子发生障碍 | 研究样本量有限（768名患者），仅发现0.5%的变异频率，且未在其他人群中进行验证 | 探索非梗阻性无精症的遗传病因，鉴定MCMDC2基因变异与男性不育的关联 | 非梗阻性无精症患者 | 机器学习 | 男性不育 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 苏木精-伊红染色 | NA | 基因序列数据, 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 768名非梗阻性无精症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1102 | 2026-05-03 |
Molecular heterogeneity and development of the ventral tegmental area
2025-Feb, Current opinion in behavioral sciences
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cobeha.2024.101478
PMID:41908169
|
研究论文 | 使用单细胞测序技术研究腹侧被盖区的分子异质性和发育过程 | 通过单细胞测序技术揭示多巴胺能神经元在发育过程中的高异质性和分子复杂性 | NA | 研究多巴胺能中脑（包括腹侧被盖区和黑质）在胚胎发育和成年期的转录特征 | 多巴胺能神经元 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1103 | 2026-05-03 |
<italic>PDIA5</italic> and <italic>ARFIP1</italic> as Immunogenetic Biomarkers and Therapeutic Targets in Pancreatic Neuroendocrine Neoplasms: A Multi-Omics Study Integrating MR, Gene Expression Microarray, and Single-Cell Transcriptomics
2025, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000548070
PMID:41129479
|
研究论文 | 通过多组学方法（包括孟德尔随机化、基因表达微阵列和单细胞转录组学）鉴定胰腺神经内分泌肿瘤的免疫遗传学生物标志物和治疗靶点 | 首次结合血浆蛋白质组学MR、WGCNA、单细胞RNA测序及免疫介导分析，系统识别PDIA5和ARFIP1作为胰腺神经内分泌肿瘤的潜在生物标志物和治疗靶点 | 需要进一步的实验验证和临床探索 | 识别胰腺神经内分泌肿瘤的分子靶点和生物标志物以改善患者预后 | 胰腺神经内分泌肿瘤（PanNENs） | 机器学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 孟德尔随机化、基因表达微阵列、单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1104 | 2026-05-03 |
Aging-induced immune microenvironment remodeling fosters melanoma in male mice via γδ17-Neutrophil-CD8 axis
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55164-3
PMID:39738047
|
科研论文 | 通过单细胞RNA测序揭示雄性小鼠中衰老诱导的免疫微环境重塑通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进黑色素瘤转移 | 首次发现衰老通过下调S1pr1驱动γδ17细胞扩增，进而招募促肿瘤中性粒细胞抑制CD8+T细胞功能，形成γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究衰老免疫系统如何促进肿瘤转移的机制 | 年轻与年老雄性小鼠的肺免疫微环境 | 单细胞转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及年轻和年老雄性小鼠的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1105 | 2026-05-03 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
|
综述 | 该文章综述了空间生物学方法（包括空间转录组学和蛋白质组学）如何促进对乳腺癌进展和治疗的理解，并探讨了新兴多重成像技术的影响 | 强调了空间生物学方法在揭示乳腺癌空间关系中的创新性应用，以及多重成像技术如何推动该领域未来发展 | 未明确提及具体局限性，但作为综述，可能依赖于现有研究并缺乏新实验数据 | 总结空间生物学方法在乳腺癌研究中的贡献，并展望未来研究方向 | 乳腺癌的空间生物学 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，蛋白质组学 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1106 | 2026-05-03 |
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.009
PMID:32991841
|
研究论文 | 本文探讨了克罗恩病中活的肠道微生物向肠系膜脂肪组织的易位如何驱动“爬行脂肪”的形成 | 首次发现肠道内特定菌群（如无害梭菌）能够存活并易位至肠系膜脂肪组织，进而诱导爬行脂肪的形成，揭示了微生物易位在CD肠外表现中的中心作用 | 未明确提及研究局限性 | 探究克罗恩病中微生物易位是否为爬行脂肪形成的关键信号 | 克罗恩病患者回肠手术切除标本中的黏膜相关肠道菌群及肠系膜脂肪组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者回肠手术切除标本及无菌小鼠实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1107 | 2026-05-03 |
Mapping developmental trajectories and subtype diversity of normal and glaucomatous human retinal ganglion cells by single-cell transcriptome analysis
2020-10-01, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3238
PMID:32557945
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析描绘正常和青光眼人类视网膜神经节细胞的发育轨迹和亚型多样性 | 利用疾病在培养皿中的干细胞模型，结合单细胞转录组分析，揭示SIX6风险等位基因对RGC发育轨迹和亚型组成的影响，并确定mTOR和Notch信号通路的失调机制 | 未提及具体局限性 | 研究青光眼患者RGC对变性的发育易感性，为治疗策略提供依据 | SIX6风险等位基因原发性开角型青光眼患者特异性及对照人类视网膜神经节细胞（hRGCs） | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞转录组分析 | 干细胞模型（疾病在培养皿中） | 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1108 | 2026-05-02 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomic data to construct a risk model for histidine metabolism-related epithelial cell features in lung adenocarcinoma, predicting prognosis and immune landscape
2026-Dec-31, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2662721
PMID:42003422
|
研究论文 | 整合批量与单细胞转录组数据构建基于组氨酸代谢相关上皮细胞特征的肺腺癌风险模型，用于预测预后和免疫微环境 | 首次通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，聚焦于组氨酸代谢相关的上皮细胞亚群，构建了具有预后意义的风险模型，并鉴定了七个关键基因 | 未在独立外部队列中验证模型的通用性，且未进行功能性实验验证基因的生物学机制 | 构建基于组氨酸代谢相关上皮细胞特征的肺腺癌预后风险模型，并评估其与免疫微环境的关系 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归模型 | 转录组数据 | 多组公共数据集中的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | UCSC Xena, Code Ocean | NA |
| 1109 | 2026-05-02 |
Nigrostriatal dopaminergic vulnerability in Parkinson's disease: Neuroprotective strategies
2026-Aug-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00380
PMID:40808403
|
综述 | 综述帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的机制及神经保护策略 | 整合单核RNA测序和空间转录组学揭示的多巴胺能亚型特异性转录应激特征，并提出基于亚型选择性的精准靶向治疗策略 | 未详细讨论不同神经保护策略的临床试验结果或转化障碍 | 理解黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的分子和细胞机制，并评估新兴神经保护策略 | 帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元及其亚型（如AGTR1+/SOX6+和RIT2+群体） | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1110 | 2026-05-02 |
Aquaporin 4 knockdown alleviates traumatic brain edema and reduces neuronal axonal growth cone collapse via the RhoA/ROCK pathway
2026-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107390
PMID:41967652
|
研究论文 | 通过调控AQP4表达，探讨其对创伤性脑损伤后脑水肿及神经修复的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AQP4敲低通过减少星形胶质细胞分泌Sema3A，经RhoA/ROCK通路减轻神经元轴突生长锥塌陷，从而发挥神经保护作用 | NA | 阐明AQP4过表达引起的水肿对神经元修复的影响机制，并评估其作为临床治疗靶点的潜力 | 创伤性脑损伤小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 创伤性脑损伤 | scRNA-seq, DTI-MRI | NA | 单细胞转录组数据, 磁共振成像数据 | 创伤性脑损伤小鼠，样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1111 | 2026-05-02 |
Tet2 deficiency alters CD4+ T cell function and promotes T cell lymphoma with a TFH cell immunophenotype
2026-Jun-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250194
PMID:42047684
|
研究论文 | Tet2缺失改变CD4+ T细胞功能并促进具有TFH细胞免疫表型的T细胞淋巴瘤发生 | 首次揭示了Tet2缺失通过表观遗传改变导致TFH样淋巴瘤转化的机制，并发现ICOS(L)-PI3K信号通路在其中的关键作用 | NA | 探究Tet2突变如何通过表观遗传失调启动恶性T细胞转化 | Tet2基因敲除的CD4+ T细胞及小鼠T细胞淋巴瘤模型 | 机器学习 | T细胞淋巴瘤 | scRNA-seq, 转录组学, 表观遗传学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Tet2缺失小鼠及人类CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1112 | 2026-05-02 |
Screening of metabolic-related biomarkers linking intervertebral disc degeneration and type 2 diabetes based on comprehensive bioinformatics analysis and machine learning
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102593
PMID:42064579
|
研究论文 | 基于生物信息学分析和机器学习筛选椎间盘退变与2型糖尿病相关的代谢生物标志物 | 首次综合运用多种机器学习算法（Boruta、随机森林、支持向量机、XGBoost）和单细胞测序技术鉴定IVDD与T2D的共同生物标志物AMBP，并验证其与BCAA代谢及免疫细胞浸润的相关性 | 缺少对AMBP在两种疾病中直接因果机制的深入实验验证，且因数据库限制可能有数据偏差 | 识别椎间盘退变（IVDD）和2型糖尿病（T2D）的共同生物标志物并评估其诊断价值 | 椎间盘退变组织和2型糖尿病患者样本 | 机器学习, 生物信息学 | 椎间盘退变, 2型糖尿病 | 差异表达分析, 机器学习（Boruta、RF、SVM、XGBoost）, CYBERSORT免疫浸润分析, 单细胞测序, 临床样本验证 | Boruta, 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 基因表达数据（GEO数据库）, 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1113 | 2026-05-02 |
Impact of enteric neuronal loss on intestinal cell composition
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115491
PMID:42063560
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究肠神经元缺失对野生型和突变型斑马鱼肠道细胞组成的影响，并验证于人类HSCR组织 | 首次系统揭示肠神经系统缺失对肠道细胞组成的影响，包括免疫细胞增加、上皮细胞代谢紊乱及ECM产生细胞纤维化标志物富集，并验证了临床相关性 | 未提及具体局限 | 探究肠神经元缺失对肠道稳态维持的影响及其潜在机制 | 野生型和突变型（HSCR模型）斑马鱼以及人类HSCR组织 | 数字病理学 | 先天性巨结肠 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，包括野生型和突变型斑马鱼及人类HSCR组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1114 | 2026-05-02 |
Wnt3-mediated fibrosis and carcinogenesis of lung squamous cell carcinoma in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115667
PMID:42063567
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示特发性肺纤维化相关肺鳞癌中Wnt3介导的纤维化与癌变机制 | 首次利用单细胞RNA测序和数字空间分析，阐明IPF相关LUSC起源于AT2细胞转分化的化生基底细胞，并揭示Wnt3在此过程中的关键作用 | 样本量较小（仅7例UIP患者），且机制验证主要依赖细胞系模型，需进一步在体内模型中确认 | 探索IPF增加LUSC风险的分子机制，特别是Wnt信号在纤维化与癌变关联中的作用 | 伴有寻常型间质性肺炎的肺鳞癌标本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、数字空间分析、多组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 7例UIP患者的LUSC标本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1115 | 2026-05-02 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies matrisome-related biomarkers for prognostic stratification and immune landscape in lung adenocarcinoma
2026-May-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
DOI:10.4196/kjpp.25.293
PMID:41496514
|
研究论文 | 整合scRNA-seq与bulk RNA-seq数据，识别与基质体相关基因相关的生物标志物，用于肺腺癌预后分层及免疫景观分析 | 通过整合单细胞与批量转录组数据，构建了一个七基因风险模型（ANGPTL4, C1QTNF6, CCL20, CLEC3B, FCN1, LAMA3, PRELP），能够有效区分肺腺癌患者的生存风险，并揭示免疫微环境特征 | 未提及 | 探索基质体相关基因（MRGs）在肺腺癌肿瘤微环境和免疫调控中的作用，构建预后分层模型并指导个体化治疗 | 肺腺癌患者的转录组及临床数据，包括TCGA、GEO（GSE31210）和单细胞数据（GSE189357） | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | LASSO-Cox风险比例模型 | 基因表达数据 | 多个数据集，具体例数未明确报告 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1116 | 2026-05-02 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-Targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
|
研究论文 | 通过分析循环肿瘤细胞上的DLL3表达，预测双特异性抗体塔拉他单抗在小细胞肺癌中的治疗效果 | 首次证明循环肿瘤细胞上的DLL3表达水平可预测塔拉他单抗的临床获益，且具有高敏感性和特异性，并揭示了获得性耐药的两种机制 | 前瞻性队列样本量较小（20例患者），可能限制结果的推广性；未提及长期随访数据 | 探究循环肿瘤细胞作为生物标志物预测塔拉他单抗在SCLC中的疗效和耐药机制 | 小细胞肺癌患者及循环肿瘤细胞 | 机器学习 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，循环肿瘤细胞分析 | NA | 单细胞转录组数据，循环肿瘤细胞定量数据 | 20例小细胞肺癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1117 | 2026-05-02 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Distinct Tumor and Immunosuppressive T-Cell Phenotypes in Patients with CLL Treated with Ibrutinib
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3349
PMID:42018044
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析揭示ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病患者中肿瘤和免疫抑制性T细胞的不同表型 | 首次在单细胞水平上揭示了ibrutinib敏感和耐药CLL患者的肿瘤和免疫微环境的转录异质性，并发现T细胞耗竭和单核细胞极化与耐药性相关 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量较小或缺乏对耐药机制的进一步功能验证 | 理解ibrutinib敏感和耐药CLL细胞及其免疫微环境的差异，以确定控制BTKi治疗期间残留疾病的治疗策略 | 接受ibrutinib治疗的CLL患者的外周血单核细胞 | 自然语言处理 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自ibrutinib治疗患者的多个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1118 | 2026-05-02 |
GPR183 contributes to renal macrophage infiltration and fibrosis in kidney injury
2026-May-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00037.2026
PMID:41954905
|
研究论文 | 本研究首次揭示了GPR183在肾损伤中促进巨噬细胞浸润和纤维化的作用及机制 | 首次发现GPR183作为肾损伤中巨噬细胞表型的关键调控因子，并证实oxysterol-GPR183轴通过NF-κB信号促进M1型巨噬细胞极化和肾纤维化 | 未提及具体研究局限性 | 探究GPR183在肾损伤中对巨噬细胞浸润和纤维化的作用 | 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病和叶酸诱导的肾病小鼠模型 | 机器学 | 肾病 | NA | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公开人类慢性肾病患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1119 | 2026-05-02 |
Single-Cell Analysis of Preeclamptic Cord Blood Mononuclear Cells Revealed Activation of Heme-Associated Signalling Pathways
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71150
PMID:42050777
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫脐带血单核细胞，揭示血红素相关信号通路的激活 | 首次对先兆子痫妊娠的脐带血细胞进行单细胞RNA测序研究，发现血红素相关信号通路在多种细胞类型中被激活 | 需要进一步研究以阐明这些机制与胎盘血红素代谢之间的直接关系 | 探究先兆子痫脐带血单核细胞的分子变化及其在疾病中的作用 | 先兆子痫和对照组脐带血单核细胞 | 自然语言处理 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，生物信息学分析，批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 先兆子痫组和对照组的脐带血样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1120 | 2026-05-02 |
Novel Approaches for Investigating Host Responses to HIV Infection in Ex Vivo Human Genital Tissues
2026-May, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70240
PMID:42053961
|
综述 | 概述利用离体人类生殖组织研究HIV感染宿主反应的新型方法 | 重点介绍空间转录组学和多重成像等高分辨率技术在分析生殖组织黏膜免疫反应和结构变化中的创新应用 | 当前空间转录组学和生物成像平台存在分辨率限制和高成本等问题 | 阐明生殖组织黏膜屏障的局部免疫反应和结构完整性，以加深对HIV性传播易感性和慢性感染发病机制的理解 | 离体人类生殖组织 | 机器学习 | 人类免疫缺陷病毒感染 | 空间转录组学, 多重成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |