单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-10-05 |
Personalised immunotherapy strategies informed by single cell profiling in thyroid cancer: a mini review
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1651088
PMID:40959084
|
综述 | 本文综述了单细胞分析技术如何指导甲状腺癌个性化免疫治疗策略的发展 | 整合单细胞生物学、免疫学和内分泌肿瘤学，识别诊断盲点，发现药物再利用机会，为个性化免疫治疗绘制路线图 | NA | 通过单细胞分析技术改进甲状腺癌免疫治疗策略 | 甲状腺癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CITE-seq | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | 超过150,000个肿瘤和免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 1102 | 2025-10-05 |
A multi-omic analysis reveals a predictive value of tertiary lymphoid structures in improving the prognosis of colorectal cancer patients with BRAF mutation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662573
PMID:40959083
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨三级淋巴结构对BRAF突变结直肠癌患者预后的预测价值 | 首次系统评估三级淋巴结构在抵消BRAF突变不良预后影响中的作用，并构建了10基因预后模型 | 样本量相对有限，需要更多前瞻性研究验证 | 研究三级淋巴结构能否改善BRAF突变结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者，特别是BRAF突变患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, LASSO回归, Cox回归, 免疫浸润分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据, 临床病理数据 | 200例结直肠癌患者组织样本，多个公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1103 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq reveals a repair pattern in cystic lesions in steroid induced osteonecrosis of the femoral head
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626337
PMID:40959091
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了类固醇诱导的股骨头坏死中囊性病变的细胞异质性和修复机制 | 首次在SIONFH囊性病变中鉴定出8种细胞类型，并将软骨细胞分为5个亚群，发现CLIC3+表达的肥大软骨细胞群在骨矿化和成骨分化中的关键作用 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究类固醇诱导的股骨头坏死中囊性病变的转录组景观和修复机制 | 类固醇诱导的股骨头坏死患者的囊性病变组织 | 单细胞基因组学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像 | 3例SIONFH患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1104 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover SIRPα-CD47 immune checkpoint and glycolysis-driven immune evasion in cardiac myxoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652645
PMID:40959090
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示心脏粘液瘤中SIRPα-CD47免疫检查点和糖酵解驱动的免疫逃逸机制 | 首次在心脏粘液瘤中发现ap-CAF细胞通过趋化因子招募免疫细胞形成免疫微环境，证实肿瘤细胞来源于间充质干细胞，并揭示糖酵解通路激活和SIRPα-CD47免疫检查点在免疫逃逸中的关键作用 | 研究样本量有限，作为罕见疾病研究可能缺乏大规模验证 | 探究心脏粘液瘤的肿瘤微环境组成、细胞生长机制和免疫逃逸策略 | 心脏粘液瘤组织样本 | 单细胞组学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,Western blot,类器官模型 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1105 | 2025-10-05 |
Spermidine potentiates anti-tumor immune responses and immunotherapy sensitivity in breast cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.113235
PMID:40959110
|
研究论文 | 本研究探讨亚精胺通过调节CD8⁺ T细胞功能增强乳腺癌抗肿瘤免疫反应和免疫治疗敏感性的机制 | 首次通过整合多组学分析揭示肿瘤内亚精胺水平与CD8⁺ T细胞浸润和活化的正相关性，并证实外源性亚精胺补充可直接促进CD8⁺ T细胞活化 | 亚精胺在乳腺癌中的具体作用机制和治疗潜力仍需进一步明确 | 探究亚精胺在乳腺癌抗肿瘤免疫反应和免疫治疗敏感性中的作用 | 乳腺癌标本和CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学、多重免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1106 | 2025-10-05 |
Comprehensive analytical approach identifies a subtype of CTCF+ tumor-associated neutrophils associated with CRC development and as a biomarker for immunotherapy
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.111529
PMID:40959269
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定出结直肠癌中CTCF+肿瘤相关中性粒细胞亚型及其在肿瘤进展和免疫治疗抵抗中的作用机制 | 首次发现并表征了CTCF+肿瘤相关中性粒细胞亚型，揭示了其通过CTCF-MIEN1-IL-1β轴驱动肿瘤进展和免疫抑制的新机制 | NA | 探究结直肠癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的功能机制 | 结直肠癌患者样本中的肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1107 | 2025-10-05 |
Senescent Tumoral HLA-E Reshapes Microenvironment through Impairing NK Cell-Dendritic Cell-T Cell Network in Malignant Pleural Effusion from Lung Cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.116499
PMID:40959273
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析恶性胸腔积液中衰老肿瘤细胞通过HLA-E抑制NK细胞功能并破坏免疫细胞网络的机制 | 首次揭示衰老肿瘤细胞通过HLA-E介导的免疫逃逸机制重塑恶性胸腔积液微环境 | 样本量有限，机制验证需要进一步实验 | 探究恶性胸腔积液中肿瘤细胞衰老对免疫微环境的影响机制 | 肺癌患者恶性胸腔积液样本中的癌细胞、NK细胞、树突状细胞和T细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,Luminex,ELISA,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质定量数据,组织染色数据 | 心力衰竭和肺癌-MPE患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1108 | 2025-10-05 |
Integration of multi-omics data reveals dysregulated RNA methylation in retinal pigment epithelium drives age-related macular degeneration
2025, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2025.09.03
PMID:40881439
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了视网膜色素上皮细胞中RNA甲基化失调在年龄相关性黄斑变性发病机制中的作用 | 首次在单细胞水平系统分析AMD患者视网膜色素上皮细胞中RNA甲基化相关基因表达谱，并采用孟德尔随机化和机器学习方法验证因果关系 | 样本量相对有限，正常供体11例，AMD患者23例（单细胞数据）及31例正常供体和37例AMD患者（Bulk RNA数据） | 研究RNA甲基化在视网膜色素上皮细胞中对年龄相关性黄斑变性的作用机制 | 年龄相关性黄斑变性患者和正常对照的视网膜色素上皮细胞 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组测序, Bulk RNA测序, 全基因组关联研究, 多组学数量性状位点分析 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, Bulk RNA测序数据, GWAS数据, QTL数据 | 单细胞数据：34个样本（11正常+23 AMD）；Bulk RNA数据：68个样本（31正常+37 AMD） | NA | 单细胞RNA-seq, Bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1109 | 2025-10-05 |
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619760
PMID:39484623
|
研究论文 | 本研究利用等位基因包含现象学习抗体序列约束，通过单细胞测序数据识别异常序列并训练机器学习模型 | 首次大规模发现等位基因包含的幼稚B细胞，并利用这些细胞学习抗体序列约束，模型性能优于现有方法 | 研究主要关注轻链，对重链的研究仅限于小鼠模型 | 探索抗体序列的约束机制及其与抗体功能特性的关系 | 人类和小鼠的B细胞及其表达的抗体序列 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | 数千个幼稚B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1110 | 2025-10-05 |
Imputing abundance of over 2,500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-Sep-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.08.006
PMID:39243755
|
研究论文 | 提出一种名为SPIDER的上下文无关零样本深度集成模型，用于从单细胞转录组数据预测超过2,500种表面蛋白的丰度 | 开发了首个上下文无关的零样本深度集成模型，能够大规模预测表面蛋白丰度并在不同背景下具有更好的泛化能力 | 未明确说明模型在更广泛疾病类型和组织中的验证情况 | 开发能够从单细胞转录组数据准确预测表面蛋白丰度的计算方法 | 单细胞表面蛋白和转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | 深度集成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1111 | 2025-10-05 |
Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics
2024-Aug, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2024-100067
PMID:39149129
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析慢性乙型肝炎患者肝活检样本，揭示HBV与HDV/HIV共感染时的肝内转录景观和免疫特征 | 首次应用空间转录组学技术系统分析HBV与HDV/HIV共感染患者的肝内转录组特征和细胞组成 | 样本量较小（仅3例初治患者），属于原理验证性研究 | 评估空间转录组学在表征HBV与HDV/HIV共感染患者肝内转录景观、细胞组成和生物通路中的应用价值 | 慢性HBV感染患者的福尔马林固定石蜡包埋肝活检样本 | 空间转录组学 | 乙型肝炎 | 空间转录组学，数字空间分析 | 加权基因共表达网络分析 | 空间转录组数据 | 3例初治慢性HBV与HDV/HIV共感染患者 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx数字空间分析平台 | GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas检测 |
| 1112 | 2025-10-05 |
Reproducible single cell annotation of programs underlying T-cell subsets, activation states, and functions
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592310
PMID:38746317
|
研究论文 | 开发了T细胞注释工具TCAT，用于在单细胞水平量化T细胞的基因表达程序 | 提出了TCAT分析框架，能够同时量化预定义的基因表达程序，揭示了46个可重复的T细胞功能程序 | NA | 改进T细胞特征分析框架，解决传统分类与单细胞数据连续状态不匹配的问题 | T细胞亚群、激活状态和功能 | 单细胞分析 | COVID-19, 癌症 | 单细胞RNA测序 | TCAT分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 170万个T细胞，来自700名个体的38种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1113 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-01-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1114 | 2025-10-05 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高脂饮食对小鼠垂体转录组的影响，揭示性别差异在氧化应激反应中的作用 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞转录组学分析垂体细胞对肥胖应激的性别特异性反应 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景 | 探究肥胖引起的氧化应激对垂体细胞功能的性别特异性影响 | FVB.129P品系雄性和雌性小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10-15周高脂饮食处理的雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1115 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-11-02, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad159
PMID:37897495
|
研究论文 | 本研究通过建立内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，揭示了脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型乳腺癌的治疗脆弱点 | 首次建立了两种不同表型的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，并发现GPX4抑制剂与抗HER2药物联合可显著诱导细胞死亡 | 研究仅基于体外细胞模型，尚未进行体内动物实验验证 | 识别内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱点 | BT-474和MDA-MB-361乳腺癌细胞系及其长期雌激素剥夺耐药变体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 2种乳腺癌细胞系及其耐药变体 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 1116 | 2025-10-05 |
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2023-100020
PMID:38074919
|
综述 | 概述慢性肝病（酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌）的发病机制研究进展及潜在治疗靶点 | 重点探讨非编码RNA、自噬、肝外信号传导和巨噬细胞在肝病中的作用，并讨论单细胞RNA测序技术的应用 | 基于学术会议内容整理，未涉及原始研究数据 | 深入理解慢性肝病的发病机制并探索治疗靶点 | 酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌 | 肝病学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1117 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554116
PMID:37662291
|
研究论文 | 本研究开发并表征了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型，以识别潜在的治疗脆弱性 | 建立了两种不同的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，首次发现脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型耐药乳腺癌的脆弱性 | 研究基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证 | 识别内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱性 | HER2+/ER+乳腺癌细胞系 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 两种乳腺癌细胞系(BT-474和MDA-MB-361)及其长期雌激素剥夺衍生株 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 1118 | 2025-10-05 |
Cellular Atlas of Senescent Lineages in Radiation- or Immunotherapy-Induced Lung Injury by Single-Cell RNA-Sequencing Analysis
2023-08-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.02.005
PMID:36792015
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了放疗或免疫疗法诱导肺损伤中衰老细胞谱系的细胞图谱 | 首次系统识别了肺损伤中30种不同细胞亚群，发现衰老样成纤维细胞是主要的共同病理机制 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明免疫疗法和放疗诱导肺损伤的细胞机制 | C57/BL6小鼠肺组织、人类和小鼠细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、多重免疫组织化学 | Seurat, Cellchat, Monocol, SCENIC | 单细胞转录组数据、组织染色图像 | 75,396个细胞，多个时间点(7,30,60天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1119 | 2025-10-05 |
CCL5-producing migratory dendritic cells guide CCR5+ monocytes into the draining lymph nodes
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20222129
PMID:36946983
|
研究论文 | 本研究揭示了分泌CCL5的迁移性树突状细胞通过CCR5引导单核细胞进入引流淋巴结的新机制 | 首次发现迁移性cDCs通过分泌CCL5引导表达CCR5的单核细胞进入淋巴结，突破了仅CCR7依赖迁移的传统认知 | 研究主要基于小鼠模型，在人体中的适用性需要进一步验证 | 探究单核细胞在缺乏CCR7表达情况下如何进入引流淋巴结的机制 | 树突状细胞、单核细胞、淋巴结单核吞噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用多种基因缺陷小鼠模型（Ccl5、Ccr2、Ccr5、Ccr7、Batf3缺陷型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1120 | 2025-10-05 |
Diagnostic Evidence GAuge of Single cells (DEGAS): a flexible deep transfer learning framework for prioritizing cells in relation to disease
2022-02-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01012-2
PMID:35105355
|
研究论文 | 提出一种名为DEGAS的深度迁移学习框架，可将疾病信息从患者层面迁移到细胞层面 | 引入'印象'概念作为可迁移信息，将个体细胞与疾病属性关联 | 仅使用模拟数据和有限的实际数据集进行验证 | 开发能够将疾病信息从患者迁移到细胞的深度学习框架 | 单细胞和患者批量组织转录组数据 | 机器学习 | 多形性胶质母细胞瘤,阿尔茨海默病,多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 深度迁移学习 | 转录组数据 | 十个不同的单细胞和患者批量组织转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |