单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 11161 - 11180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11161 | 2024-08-05 |
Anoikis-related gene signature is associated with immune infiltration and predicts the prognosis of non-small cell lung cancer
2024-02-07, Aging
DOI:10.18632/aging.205522
PMID:38329444
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研究论文 | 本文探讨了与anoikis相关的基因签名与非小细胞肺癌的免疫浸润相关，并预测其预后 | 提出了一个基于与anoikis相关的基因的预后模型，并分析了其与免疫特征的相关性 | 未详细讨论其他可能影响免疫浸润的因素 | 探讨anoikis在非小细胞肺癌患者中的预后价值和治疗指导 | 研究对象为非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了来自RNA测序的数据集，样本量未具体说明 |
| 11162 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data revealed disulfidptosis genes-based molecular subtypes and a prognostic signature in lung adenocarcinoma
2024-02-05, Aging
DOI:10.18632/aging.205509
PMID:38319721
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研究论文 | 本文进行了一项单细胞和bulk RNA测序数据的综合分析，揭示了基于二硫化物凋亡基因的分子亚型和预后特征 | 本文首次提出并验证了基于二硫化物凋亡基因的预后风险模型DRG评分，推动了肺腺癌的免疫治疗和化疗研究 | 研究中可能存在样本量限制和数据来源的偏倚 | 探索二硫化物凋亡基因在肺腺癌中的作用及其预后价值 | 本研究主要针对肺腺癌患者样本，通过单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归和LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA样本和GSE131907数据集中的单细胞样本 |
| 11163 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of LAG3 immune signature and identification of a LAG3-related genes prognostic signature in kidney renal clear cell carcinoma
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205476
PMID:38277212
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研究论文 | 本研究分析了LAG3在肾透明细胞癌中的免疫特征及其预后相关基因标志。 | 揭示了LAG3在KIRC中的表达模式及其与预后和免疫相关组分的关系 | 未提及其他相关替代疗法的比较分析 | 探讨LAG3在肾透明细胞癌（KIRC）中的功能及其作为预后生物标志的潜力 | 主要研究KIRC患者的LAG3表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序及单细胞测序 | NA | RNA-seq | 利用TCGA_KIRC数据集，样本量未具体说明 |
| 11164 | 2024-08-05 |
FABP6 serves as a new therapeutic target in esophageal tumor
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205448
PMID:38277205
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研究论文 | 本研究探讨FABP6在食道肿瘤中的作用，作为新的治疗靶点 | 揭示FABP6在食道肿瘤中的高表达及其潜在的代谢和肿瘤生长相关性 | 未详细探讨FABP6作为治疗靶点的具体机制和临床应用 | 改善食道癌患者的生存率，寻找新的诊断和治疗靶点 | 食道肿瘤微环境中细胞组成及其异质性 | 数字病理学 | 食道癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 使用了初级食道肿瘤的多个细胞群 |
| 11165 | 2024-08-05 |
Identification of molecular characteristics of FUT8 and alteration of core fucosylation in kidney renal clear cell cancer
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205482
PMID:38277230
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研究论文 | 本文研究了KIRC中FUT8的分子特征和核心富糖基化的变化 | 首次识别出KIRC中的两种与核心富糖基化相关的亚型，并探讨了其预后差异 | 研究中没有提及样本量和潜在的临床应用 | 探讨核心富糖基化在肾透明细胞癌中的作用及FUT8的分子特征 | 集中于肾透明细胞癌（KIRC）及其核心富糖基化相关基因 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11166 | 2024-08-04 |
The integration of multi-omics analysis and machine learning for the identification of prognostic assessment and immunotherapy efficacy through aging-associated genes in lung cancer
2024-01-22, Aging
DOI:10.18632/aging.205464
PMID:38261733
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研究论文 | 本研究整合了多组学分析和机器学习，评估与衰老相关基因在肺癌中的预后评估和免疫疗法有效性 | 首次结合多组学分析和机器学习来构建预后模型，特别关注与衰老相关的基因 | 尚未明确关键分子在肺癌发病和进展中的确切作用 | 评估肺癌患者的预后和免疫疗法有效性 | 涉及与免疫相关的关键基因及其在肺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, WGCNA, Lasso-Cox方法, ssGSEA | NA | 基因数据 | NA |
| 11167 | 2024-08-05 |
Malignant cell receptor-ligand subtypes guide the prediction of prognosis and personalized immunotherapy of liver cancer
2024-01-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205453
PMID:38244584
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA分析识别肝癌患者的恶性细胞受体-配体亚型 | 通过恶性细胞受体-配体基因识别亚群，提供个性化免疫治疗的新见解 | 未详细说明样本来源和具体的临床应用数据 | 识别基于恶性细胞受体-配体基因的肝癌亚群以发展个性化免疫治疗 | 肝癌患者的恶性细胞及其相关的受体-配体基因 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 16个基因表达水平 |
| 11168 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the substantia nigra reveals microglial activation in a model of MPTP
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1390310
PMID:38952478
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研究论文 | 这项工作揭示了MPTP小鼠黑质中小胶质细胞的功能变化、信号通路和关键基因 | 首次在MPTP模型中详细分析了小胶质细胞的激活状态及其功能变化 | 研究可能仅限于特定的细胞类型和小鼠模型，结果可能无法完全外推至其他类型的帕金森病 | 探索MPTP对帕金森病相关细胞和基因的影响 | 使用单细胞RNA测序分析MPTP小鼠的黑质 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MPTP小鼠的单细胞样本 |
| 11169 | 2024-08-04 |
Combined analysis of single-cell sequencing and bulk transcriptome sequencing reveals new mechanisms for non-healing diabetic foot ulcers
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306248
PMID:38950058
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序和大规模转录组测序，揭示了非愈合糖尿病足溃疡的新的机制 | 揭示了愈合与非愈合糖尿病足溃疡之间的细胞组成和基因表达的差异，特别是不同成纤维细胞亚群的独特生物学功能 | 研究依赖于已有的公共转录组测序数据，可能存在数据的局限性和偏倚 | 深入了解非愈合糖尿病足溃疡与愈合糖尿病足溃疡之间的生物学差异 | 研究对象为非愈合和愈合的糖尿病足溃疡患者的细胞成分与基因表达 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11170 | 2024-08-05 |
Dysfunctional Epithelial Barrier Is Characterized by Reduced E-Cadherin in Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-01, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30951
PMID:37565709
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研究论文 | 本研究旨在表征特发性喉下狭窄瘢痕上皮的分子特征和功能表型 | 首次使用单细胞RNA测序分析特发性喉下狭窄瘢痕上皮的变化，发现E-钙黏蛋白表达减少与屏障功能失常相关 | 样本量较小，仅包括6个瘢痕样本，可能限制结果的普遍性 | 研究特发性喉下狭窄的上皮分子特征和功能，以及其与上皮屏障功能的关系 | 特发性喉下狭窄（iSGS）患者的气管活检样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫印迹，免疫荧光 | NA | 活检组织样本 | 6个iSGS瘢痕样本和6个匹配的非瘢痕区域 |
| 11171 | 2024-08-04 |
Neuronal types in the mouse amygdala and their transcriptional response to fear conditioning
2023-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01469-3
PMID:37884748
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研究论文 | 本文探讨了小鼠杏仁核中的神经元类型及其对恐惧条件反射的转录响应 | 提供了小鼠杏仁核细胞类型的详细分类，并识别出130种神经元类型及其在恐惧学习中的转录响应 | 研究主要集中在小鼠模型，结果可能无法完全适用于其他物种 | 研究小鼠杏仁核中神经元类型及其在恐惧学习和记忆巩固中的转录变化 | 采用了基因标记和单细胞转录组学对小鼠进行研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对野生型和经过恐惧条件训练的小鼠进行了研究 |
| 11172 | 2024-08-05 |
VarID2 quantifies gene expression noise dynamics and unveils functional heterogeneity of ageing hematopoietic stem cells
2023-06-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02974-1
PMID:37353813
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研究论文 | VarID2量化了基因表达噪声动态，并揭示了衰老造血干细胞的功能异质性 | 开发了VarID2工具以单细胞分辨率量化生物噪声，揭示了传统分析方法无法识别的噪声动态 | 未在摘要中提及具体限制 | 研究基因表达噪声如何影响造血干细胞的衰老与功能 | 衰老小鼠的造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 衰老小鼠中的造血干细胞 |
| 11173 | 2024-08-05 |
Synergising single-cell resolution and 4sU labelling boosts inference of transcriptional bursting
2023-06-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02977-y
PMID:37328900
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研究论文 | 本研究提出了一种数学模型和贝叶斯推断方法，旨在提高转录突发的分析能力 | 提出了一种结合单细胞分辨率和4sU标记的新方法，能够同时估计基因组范围内的参数 | 缺乏足够的实验数据支持该方法的全面验证 | 探索利用单细胞分辨率和4sU标记分析转录突发的有效方法 | 应用于已发布的4sU scRNA-seq数据及其与ChIP-seq数据的关联分析 | 数字病理学 | NA | 4sU标记 | 贝叶斯推断模型 | 基因组数据 | 利用已发布的4sU scRNA-seq数据 |
| 11174 | 2024-08-05 |
Distinct functional properties of murine perinatal and adult adipose progenitor subpopulations
2022-08, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00613-w
PMID:35982290
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研究论文 | 本文揭示了小鼠外源性与成年脂肪前体细胞亚群的功能差异 | 本研究首先通过单细胞转录组学揭示了围产期和成年脂肪前体细胞之间在分子和功能上的重要差异 | 研究仅集中于小鼠模型，结果的可推广性仍需进一步验证 | 探讨围产期和成年白色脂肪组织中的脂肪前体细胞的功能特性 | 研究对象为小鼠中围产期和成年白色脂肪组织中的脂肪前体细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 男性小鼠的围产期和成年脂肪组织亚群 |
| 11175 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell Transcriptomics With a High Throughput Functional Screening Assay to Resolve Cell Type, Growth Kinetics, and Stemness Heterogeneity Within the Comma-1D Cell Line
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.894597
PMID:36630696
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研究论文 | 本研究利用高通量单细胞测序与功能筛选，分析Comma-1D细胞系的细胞类型、生长动力学和干性异质性 | 首次集成高通量单细胞 assays 研究细胞系内的克隆异质性，并提出了一种新的自动化细胞识别平台 | 当前细胞分离方法在功能上存在显著局限性，影响了对细胞特性的深入理解 | 研究Comma-1D细胞系中的细胞异质性及其生长动力学特征 | Comma-1D小鼠细胞系以及其中的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, 单细胞功能表型检测 | NA | 基因组数据 | 5,195个测序细胞 |
| 11176 | 2024-08-04 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals metastasis-associated CAFs in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122768
PMID:38851417
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAFs)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)转移中的作用 | 首次识别出与HNSCC转移相关的CAFs中的基因，具体验证了TIMPI1在转移CAF中的上调及其对HNSCC细胞转移的影响 | 未详细探讨CAFs在HNSCC转移中的其他潜在机制 | 识别与HNSCC转移相关的CAFs中的基因，并评估其对转移的影响 | 主要研究头颈部鳞状细胞癌的CAFs及其转移相关基因 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞和大规模RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA序列数据 | 来自转移性和非转移性CAFs的细胞和组织样本 |
| 11177 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptional atlas of human adenomyosis deciphered by the integration of single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics
2024-Jul-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae012
PMID:38486356
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研究论文 | 本研究揭示了人类腺肌症的转录组特征，整合了单细胞RNA测序和空间转录组学 | 首次识别腺肌症病灶中的独特上皮和侵袭性基质亚群体，支持病因学中的‘内陷’与‘化生’理论的复杂相互作用 | 对腺肌症的研究仍处于起步阶段，相关理论存在争议 | 揭示腺肌症的转录组变化，为准确诊断与治疗策略的发展提供基础 | 研究了正常内膜、病灶及内膜-肌层交界处的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 11178 | 2024-08-05 |
Deficiency of Secreted Phosphoprotein 1 Alleviates Hyperoxia-induced Bronchopulmonary Dysplasia in Neonatal Mice
2024-Jun-29, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02088-1
PMID:38951356
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研究论文 | 该研究探讨了分泌型磷蛋白1(SPP1)在缺氧诱导的支气管肺发育不良(BPD)中的作用 | 研究首次揭示了SPP1在BPD进展中的重要作用，表明其可能作为新的治疗靶标 | 没有具体提到研究的样本量限制或实验条件的详细限制 | 探索SPP1在缺氧诱导的支气管肺发育不良中的作用及其机制 | 新生小鼠以及在不同氧气条件下的肺组织和细胞 | 数字病理 | 肺部疾病 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 组织样本 | 新生小鼠及人类BPD患者组织样本 |
| 11179 | 2024-08-05 |
Mesenchymal stem cells-extracellular vesicles alleviate pulmonary fibrosis by regulating immunomodulators
2024-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i6.670
PMID:38948098
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞外泌体（MSC-EVs）在减轻肺纤维化中的治疗潜力 | 本研究首次系统评估了MSC-EVs对肺纤维化、氧化应激和免疫炎症的影响 | 研究中未明确描述MSC-EVs的具体分子机制和长期效果 | 研究MSC-EVs在治疗肺纤维化及其相关病理过程中的潜力 | 研究对象包括A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和小鼠肺组织样本 | 使用A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 |
| 11180 | 2024-08-05 |
Microglia-astrocyte crosstalk in the amyloid plaque niche of an Alzheimer's disease mouse model, as revealed by spatial transcriptomics
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114216
PMID:38819990
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研究论文 | 本文探讨了阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块环境下小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用 | 本文利用高分辨率空间转录组学平台揭示了淀粉样斑块环境的细胞组成和信号扰动的异质性 | 研究仅限于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 研究淀粉样斑块环境中小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及其对神经元信号的影响 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |