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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11161 | 2025-10-07 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路调控糖尿病认知功能障碍的分子机制 | 首次发现miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对靶向调控PRG-1在糖尿病认知障碍中的作用机制 | 研究主要基于体外HT22细胞模型,需要进一步在体实验验证 | 探究PRG-1在糖尿病诱导认知功能障碍中的分子机制和细胞异质性 | 海马体细胞、HT22细胞系、I型螺旋神经节神经元 | 单细胞测序分析 | 糖尿病认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, RNA转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11162 | 2025-10-07 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法,用于在单细胞水平同时分析细胞质和核蛋白及其翻译后修饰 | 提出简化的台式抗体偶联方法创建大型定制神经聚焦抗体面板,实现蛋白质与scATAC-seq的同时分析 | NA | 开发能够量化细胞内蛋白质动态并与顺式调控元件和转录靶标连接的多模态单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄视网膜和脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞ATAC-seq, 转录组测量, 抗体偶联 | NA | 蛋白质组, 表观基因组, 转录组 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |
11163 | 2025-10-07 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法揭示了骨桥蛋白在小鼠视网膜M2和M4型内在光敏视网膜神经节细胞中的表达模式 | 首次发现骨桥蛋白不仅表达于M4-ipRGCs,还在M2-ipRGCs中表达,挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs特异性标志物的传统认知 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠视网膜,尚未在其他物种或病理条件下验证 | 表征骨桥蛋白在ipRGCs各亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs) | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 神经突追踪 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | C57BL/6J小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11164 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of SEPN1 in glioma: Prognostic roles, functional implications, and potential therapeutic interventions
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318501
PMID:39919065
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研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了SEPN1在胶质瘤中的预后价值、功能作用及潜在治疗干预 | 首次系统阐明SEPN1在胶质瘤中的致癌作用,开发了SEPN1相关风险评分(SRS),并基于此识别潜在抗胶质瘤药物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证SEPN1的具体分子机制 | 探究SEPN1在泛癌中的表达特征和预后意义,特别聚焦于胶质瘤 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA、CGGA、GEO和ZN-GC多个队列的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11165 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌肿瘤微环境的瘤内异质性 | 首次构建包含54,055个细胞的乳腺癌单细胞转录组图谱,识别了恶性上皮细胞的六种共同表达程序和六种亚型特异性表达程序 | 样本量较小(仅4例恶性患者和4例非恶性患者),需要更大规模研究验证 | 研究乳腺癌异质性在单细胞转录组中的形成机制和作用 | 乳腺癌临床标本中的细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞,来自4例恶性和4例非恶性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11166 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
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研究论文 | 本研究通过整合分析构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的风险特征,用于三阴性乳腺癌的预后预测和免疫特征分析 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别TAM簇并构建8基因风险特征,开发了整合分期和TAM风险特征的新型列线图 | NA | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特征,构建预后风险特征并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,逆转录聚合酶链反应,Western blot,免疫组织化学 | LASSO回归,单变量Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11167 | 2025-10-07 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 本研究揭示了外周CD8+ T细胞耐受检查点触发了一种由蛋白质翻译缺陷定义的独特分化状态 | 首次证明外周耐受触发与耗竭、记忆和功能效应细胞完全不同的分化状态,并发现该状态由蛋白质翻译缺陷维持 | 研究主要关注早期分化阶段(60小时内),长期耐受状态的维持机制需要进一步探索 | 阐明外周CD8 T细胞耐受检查点的分子机制和细胞状态特征 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11168 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸氢盐测序揭示牦牛植入前胚胎发育的表观遗传调控机制 | 首次在牦牛胚胎发育中结合单细胞转录组和DNA甲基化分析,鉴定出43个候选甲基化驱动基因和关键表观遗传调控因子 | 研究聚焦特定物种(牦牛),结果在其他哺乳动物的普适性需要进一步验证 | 探究高原牦牛植入前胚胎发育过程中的DNA甲基化作用和表观遗传重编程机制 | 牦牛卵母细胞和不同发育阶段的植入前胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸氢盐测序 | NA | 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 | 卵母细胞和系列发育阶段胚胎的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
11169 | 2025-10-07 |
Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication
2024, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20514.2
PMID:39640372
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研究论文 | 本研究通过分析胎盘细胞对SARS-CoV-2的易感性和病毒释放能力,揭示了病毒很少从母体传播给胎儿的机制 | 首次系统量化了不同胎盘细胞类型对SARS-CoV-2的感染率和病毒释放能力,发现原代滋养层细胞病毒释放水平极低 | 研究主要基于体外实验,可能无法完全模拟体内复杂的胎盘环境 | 探究胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性和病毒释放能力 | 人类早期妊娠和足月胎盘细胞,包括滋养层细胞、成纤维细胞、巨噬细胞以及JEG-3、JAR和HUVEC细胞系 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,体外感染实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,病毒感染数据 | 多个胎盘细胞类型和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11170 | 2025-10-07 |
Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models
2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04589-4
PMID:36346530
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综述 | 本文通过整合评估人滋养层干细胞模型与体内样本的转录组数据,分析这些模型的适用性 | 首次系统整合人滋养层干细胞模型、人类囊胚样结构、干细胞和胚胎的单细胞RNA测序数据,评估模型对早期滋养层发育的再现能力 | 基于现有转录组数据的回顾性分析,缺乏实验验证 | 评估人滋养层干细胞模型的转录组特征及其在再现早期滋养层发育方面的适用性 | 人滋养层干细胞模型、人类囊胚样结构、干细胞和胚胎样本 | 发育生物学 | 生殖医学 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11171 | 2025-10-07 |
CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04606-6
PMID:36315271
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪揭示CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用 | 首次系统描绘CD34+细胞在不同器官中的细胞图谱,并发现表达Pi16的CD34+细胞可转化为肌成纤维细胞参与器官纤维化 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和功能 | CD34+细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 遗传谱系追踪小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11172 | 2025-10-07 |
Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04608-4
PMID:36316529
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综述 | 概述单细胞测序技术在癌症免疫治疗中的整合见解与临床应用进展 | 系统阐述单细胞测序如何揭示肿瘤微环境复杂性及推动个体化免疫治疗方案开发 | 单细胞技术的临床转化研究尚不深入,尤其在免疫治疗应用方面仍需突破 | 探讨单细胞测序技术对癌症免疫治疗的机制解析和临床指导价值 | 肿瘤微环境中的细胞异质性、细胞组成与相互作用、肿瘤耐药机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
11173 | 2025-10-07 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Feb-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
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研究论文 | 通过先进单细胞转录组学分析识别囊性纤维化新型治疗靶点 | 采用增强分析方法整合多源数据,发现与CF气道疾病相关的新基因和调控网络 | 未明确说明样本规模和技术平台的具体限制 | 深入理解囊性纤维化相关基因表达机制,识别新型治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺部细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序 | 共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11174 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11175 | 2025-10-07 |
Identification of potential immunologic resilience in the healing process of diabetic foot ulcers
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14465
PMID:37926487
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研究论文 | 通过生物信息学和单细胞RNA测序分析糖尿病足溃疡愈合过程中的免疫学特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CD8 T细胞在糖尿病足溃疡愈合过程中的关键作用,并识别出与免疫恢复相关的基因模块 | 依赖公共数据库数据,样本来源可能有限;需要进一步实验验证关键基因的功能机制 | 探索糖尿病足溃疡愈合过程中的免疫学机制 | 糖尿病足溃疡患者的基因表达数据和细胞群体 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术, 生物信息学分析 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11176 | 2025-10-07 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-Mar, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞测序研究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症的关联机制 | 首次发现CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变人类疱疹病毒6比例影响多发性硬化进展 | 未明确说明样本规模和研究人群特征 | 探究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症的因果关系及潜在感染病原体 | 多发性硬化症患者和对照受试者的免疫细胞 | 生物医学 | 多发性硬化症 | 孟德尔随机化分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11177 | 2025-02-09 |
Unveiling heterogeneity in rare cells by combining RNA-based sorting and scRNA-seq
2025-Feb-07, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02073-2
PMID:39920268
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11178 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity, gene expression profiles, and pathway dynamics in acne vulgaris
2025-Feb-07, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-03894-9
PMID:39920471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析痤疮皮损组织的细胞异质性、基因表达谱和通路动态 | 首次在单细胞水平揭示痤疮皮损组织的细胞异质性、异常细胞间通讯和代谢通路改变 | 样本量较小(仅6例患者),数据来源于公共数据库 | 探索痤疮发病的细胞和分子机制 | 痤疮患者的皮损和非皮损皮肤组织 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例痤疮患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11179 | 2025-10-07 |
Exploring molecular disparities of H-type vasculature endothelial cells in osteonecrosis of the femoral head through single-cell analysis
2025-Feb-06, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-08267-3
PMID:39910554
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子差异 | 首次在单细胞水平揭示ONFH中H型血管内皮细胞的分子特征及铁死亡和parthanatos死亡模式的作用 | 样本量较小(仅9个样本),数据为公开数据的重新分析 | 探索股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子变化 | 股骨头样本中的H型血管内皮细胞 | 单细胞分析 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 9个股骨头样本(3个HOA、3个ONFH 3A期、3个ONFH 4期) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11180 | 2025-10-07 |
Identification of mitochondrial carrier homolog 2 as an important therapeutic target of castration-resistant prostate cancer
2025-Feb-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07406-5
PMID:39910035
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研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2在去势抵抗性前列腺癌中的表达及其功能作用 | 首次揭示MTCH2通过维持线粒体功能促进去势抵抗性前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为去势抵抗性前列腺癌治疗靶点的潜力 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、原代CRPC细胞和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、shRNA基因沉默、CRISPR-sgRNA基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 多种原代人CRPC细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |