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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 11121 - 11140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11121 | 2025-02-21 |
FastTENET: an accelerated TENET algorithm based on manycore computing in Python
2024-11-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae699
PMID:39570606
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研究论文 | 本文提出了一种基于多核计算的加速版TENET算法，称为FastTENET，用于从单细胞RNA测序数据中重建基因调控网络 | FastTENET通过数组计算优化了TENET算法，使其在多核处理器（如GPU）上加速，性能提升高达973倍 | 尽管FastTENET显著提升了计算速度，但其性能提升依赖于硬件（如GPU）的支持 | 解决TENET算法在处理大规模单细胞RNA测序数据时计算时间过长的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | TENET算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11122 | 2025-02-21 |
Microfluidic Chip-Based Automatic System for Sequencing Patient-Derived Organoids at the Single-Cell Level
2024-10-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05111
PMID:39399894
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于微流控芯片的自动系统MASSO，用于在单细胞水平上对患者来源的类器官进行测序 | MASSO系统通过在单一微流控芯片上执行所有必要步骤，避免了珍贵PDO的损失，并确保了单PDO细胞的全基因组扩增的高质量，自动化操作过程消除了人为错误，提高了数据重复性 | NA | 解决现有单细胞测序技术在处理临床组织样本来源的PDO时效率低下的问题 | 患者来源的类器官（PDOs） | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11123 | 2025-02-21 |
DEPICT-seq: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Rare Cell Subsets Isolated via Nucleic Acid Cytometry
2024-10-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03075
PMID:39287475
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DEPICT-seq的高通量液滴核酸细胞计数方法，用于分离和分析基于核酸标记的稀有细胞亚群 | DEPICT-seq方法结合了批量细胞固定、双乳液数字PCR细胞分选和单细胞分辨率下的全长转录组分析，能够针对感兴趣的核酸标记进行细胞分选和转录组分析 | NA | 开发一种能够深入分析稀有细胞亚群的方法，以理解组织生理学和病理学 | 稀有细胞亚群，特别是T细胞受体（TCR）工程化的T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 双乳液数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11124 | 2025-02-21 |
Correlation of LLT-1 and NLRC4 inflammasome and its effect on glioblastoma prognosis
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04750-y
PMID:38907949
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研究论文 | 本研究探讨了LLT-1与NLRC4炎症小体在胶质母细胞瘤（GBM）组织中的表达及其相互作用，揭示了它们与肿瘤恶性程度和预后的潜在关联 | 揭示了LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的共表达及其与肿瘤炎症和进展的潜在关联，提出了新的NK细胞介导的抗胶质瘤途径 | 研究样本量相对较小，且主要基于中国人群数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的表达及其相互作用，以揭示其与肿瘤恶性程度和预后的关联 | 胶质母细胞瘤（GBM）组织 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序（RNA-seq）、免疫荧光实验、单细胞RNA测序分析 | NA | RNA-seq数据、免疫荧光图像 | 296名患者来自中国胶质瘤基因组图谱，52名患者来自CHA医疗记录 | NA | NA | NA | NA |
| 11125 | 2025-10-07 |
OneSC: A computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596831
PMID:38895453
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研究论文 | 开发了一个用于模拟细胞状态转换的计算平台OneSC | 不同于当前网络推断方法，OneSC优先生成能够产生忠实细胞状态转换和稳定细胞状态的布尔网络 | NA | 开发计算平台以在计算机中模拟细胞状态转换 | 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机微分方程系统，布尔网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11126 | 2025-10-07 |
The transcription factor Aiolos restrains the activation of intestinal intraepithelial lymphocytes
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01693-w
PMID:38049581
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Aiolos通过调控肠道上皮内淋巴细胞活化来限制其效应功能 | 首次发现Aiolos作为IELs活化的调节因子，并阐明其通过影响IL-15信号通路和染色质可及性来调控效应功能 | Ikzf3缺陷仅部分解释观察到的表型，表明存在其他调控机制 | 探究Aiolos在肠道上皮内淋巴细胞活化调控中的作用机制 | 小鼠肠道上皮内淋巴细胞 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析，组蛋白乙酰化检测 | NA | 基因表达数据，表观遗传数据 | Ikzf3+/+和Ikzf3-/-小鼠IELs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11127 | 2025-10-07 |
A single-cell analysis of thymopoiesis and thymic iNKT cell development in pigs
2022-07-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111050
PMID:35793622
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建青春期早期猪胸腺细胞图谱，揭示猪胸腺细胞生成和iNKT细胞发育特征 | 首次建立猪胸腺单细胞图谱，发现猪iNKT细胞功能多样性显著不同于小鼠的iNKT0/1/2/17亚群分化模式 | 仅针对早期青春期猪胸腺进行研究，其他发育阶段和组织的免疫特征仍需探索 | 表征猪免疫系统特征，为改善猪健康和作为临床前模型提供基础 | 青春期早期猪胸腺细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过11,000个分化中的iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11128 | 2025-10-07 |
Immunostimulatory Cancer-Associated Fibroblast Subpopulations Can Predict Immunotherapy Response in Head and Neck Cancer
2022-05-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3570
PMID:35262677
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定头颈癌中免疫刺激性癌症相关成纤维细胞亚群及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次在头颈癌中识别出能够预测PD-1抑制剂反应的特定癌症相关成纤维细胞亚群，并揭示其功能机制 | 样本量较小（4例患者进行单细胞测序），需要更大规模研究验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚群在头颈癌免疫治疗反应中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 4例患者治疗前后配对样本（单细胞测序），28例患者队列（批量转录组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11129 | 2025-10-07 |
Recent advances in spatially resolved transcriptomics: challenges and opportunities
2022-Mar, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:35168703
|
综述 | 本文综述空间分辨转录组学技术的最新进展、挑战与机遇 | 系统比较成像技术与捕获技术的特点，强调整合计算方法在克服技术局限性中的关键作用 | NA | 探讨空间转录组学技术的发展现状及其在生物医学研究中的应用潜力 | 空间转录组学技术及其在组织分析中的应用 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 成像技术（单分子分辨率）, 捕获技术（55-100 μm分辨率） |
| 11130 | 2025-10-07 |
The pancreatic tumor microenvironment of treatment-naïve patients causes a functional shift in γδ T cells, impairing their anti-tumoral defense
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2466301
PMID:39945298
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境对γδ T细胞功能的抑制作用 | 首次使用治疗初治患者的类器官条件培养基证明PDAC肿瘤微环境导致γδ T细胞功能转变 | 样本量有限，主要依赖体外实验验证 | 研究胰腺癌肿瘤微环境如何影响γδ T细胞的抗肿瘤功能 | 治疗初治胰腺导管腺癌患者的γδ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,类器官培养 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 治疗初治PDAC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11131 | 2025-10-07 |
Key RNA-binding proteins in renal fibrosis: a comprehensive bioinformatics and machine learning framework for diagnostic and therapeutic insights
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2463560
PMID:39957043
|
研究论文 | 通过综合生物信息学和机器学习方法识别与肾纤维化相关的关键RNA结合蛋白，并建立诊断模型 | 首次整合生物信息学、机器学习方法和单细胞RNA测序技术系统鉴定肾纤维化中的关键RNA结合蛋白 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，需要进一步临床验证 | 识别肾纤维化中的关键RNA结合蛋白，开发诊断模型并探索治疗靶点 | 肾纤维化患者样本和正常肾脏样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，机器学习建模 | lasso回归，logistic回归 | 基因表达数据 | 175个肾纤维化样本和99个正常肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11132 | 2025-10-07 |
Unveiling ferroptosis genes and inhibitors in diabetic retinopathy through single-cell analysis and docking simulations
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101932
PMID:39968183
|
研究论文 | 通过单细胞分析和分子对接模拟揭示糖尿病视网膜病变中的铁死亡相关基因和抑制剂 | 首次通过单细胞RNA测序结合分子对接模拟系统鉴定糖尿病视网膜病变中的铁死亡相关基因，并发现地塞米松作为潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 探索铁死亡在糖尿病视网膜病变中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者样本 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11133 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the multidimensional dynamic heterogeneity from primary to metastatic gastric cancer
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111843
PMID:39967875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胃癌从原发到转移过程中的多维动态异质性 | 首次系统描绘了胃癌从原发灶到器官特异性转移灶的多维特征动态变化，鉴定了卵巢转移的30基因标志物和关键配体-受体相互作用 | 未明确说明样本规模和具体技术平台细节 | 探究胃癌从原发到转移过程中肿瘤微环境的动态异质性特征 | 胃癌原发肿瘤和器官特异性转移灶 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11134 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and spatial transcriptomics reveals fibroblast subtypes in hepatocellular carcinoma: spatial distribution, differentiation trajectories, and therapeutic potential
2025-Feb-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06192-0
PMID:39966876
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了肝细胞癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型的空间分布、分化轨迹及其治疗潜力 | 首次系统鉴定肝细胞癌中三种成纤维细胞亚群的空间分布特征，发现VEGFA+CAF在缺氧微环境诱导下通过促进肿瘤血管生成影响预后 | 研究样本量相对有限，需要更大规模队列验证；机制研究主要基于转录组数据，缺乏功能性实验验证 | 解析肝细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其临床意义 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 训练队列88例HCC样本，验证队列94例HCC样本，总计超过120万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11135 | 2025-02-20 |
Publisher Correction: Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2025-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02152-8
PMID:39966937
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11136 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals that EGR1 promotes epithelial IL33 production in T2 asthma
2025-Feb-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06116-y
PMID:39966984
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证，揭示了转录因子EGR1在T2型哮喘中直接调控上皮细胞IL33产生的机制 | 首次发现EGR1作为上皮细胞源基因直接调控IL33表达，为T2型哮喘的分子机制提供了新见解 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，需要在人类临床样本中进一步验证 | 探究过敏原暴露触发气道上皮细胞释放IL33的分子机制 | BEAS-2B细胞系和HDM诱导的小鼠哮喘模型 | 生物信息学 | 哮喘 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-PCR, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11137 | 2025-10-07 |
Uncovering endothelial to mesenchymal transition drivers in atherosclerosis via multi-omics analysis
2025-Feb-17, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04571-5
PMID:39956907
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研究论文 | 通过整合多组学数据识别动脉粥样硬化中内皮间质转化的新型调控因子 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据，系统识别动脉粥样硬化中内皮间质转化的七个新型候选基因 | 研究主要依赖生物信息学分析，实验验证仅限于qPCR和western blotting，缺乏更深入的功能验证 | 识别动脉粥样硬化中内皮间质转化的调控因子 | 人类动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列, qPCR, western blotting | UMAP, limma包 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE159677, GSE118446, GSE56309) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 11138 | 2025-10-07 |
Age-Associated B Cells in Autoimmune Diseases: Pathogenesis and Clinical Implications
2025-Feb-17, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-025-09021-w
PMID:39960645
|
综述 | 本文综述了年龄相关B细胞在自身免疫性疾病中的致病机制和临床意义 | 系统总结了ABCs的异质性特征、分化调控机制及其在多种自身免疫病中的诊断和治疗潜力 | 需要进一步探索和验证针对ABCs的靶向治疗策略 | 探讨年龄相关B细胞在自身免疫性疾病中的致病作用和临床应用价值 | 年龄相关B细胞及其在自身免疫疾病中的作用机制 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11139 | 2025-10-07 |
Molecular subtyping combined with multiomics analysis to study correlation between TACE refractoriness and tumor stemness in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01955-z
PMID:39961903
|
研究论文 | 本研究通过分子分型与多组学分析探讨肝细胞癌中TACE抵抗性与肿瘤干性之间的相关性 | 首次系统性地将TACE抵抗性与肿瘤干性联系起来，并建立了基于肿瘤干性基因的新型分子分型系统 | 研究基于回顾性数据集分析，需要进一步实验验证 | 探索肝细胞癌中TACE抵抗性与肿瘤干性之间的相关性及其临床意义 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序，微阵列，单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据，临床数据 | 多个HCC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 11140 | 2025-10-07 |
Analysis of fatty acid metabolism in prostate cancer and discovery of a new programmed cell death-associated luminal cell subpopulation
2025-Feb-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01982-w
PMID:39961915
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析前列腺癌中脂肪酸代谢的作用，发现与程序性细胞死亡相关的管腔细胞亚群 | 发现前列腺癌中脂肪酸代谢活性显著升高的管腔细胞亚群，并揭示其与程序性细胞死亡和肿瘤侵袭性的关联 | NA | 研究脂肪酸代谢在前列腺癌中的作用机制 | 前列腺癌组织中的细胞亚群，特别是管腔细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, NMF, 反卷积分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |